基因组中“暗物质”关键调控机制

中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组与南方科技大学Andrew P. Hutchins课题组合作,以小鼠胚胎干细胞为模型,揭示了基因组中转座元件的关键表观遗传调控机制,相关成果以Transposable elements are regulated by context-specific patterns of chromatin marks in mouse embryonic stem cells 为题于1月3日发表在国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)上。 人基因组中,总共含有30亿对碱基,但仅有极少部分能够编码成蛋白质,而接近一半的序列由转座子组成,小鼠基因组中也基本类似。转座子最早在玉米基因组中被发现,并证明通过“跳跃”调控玉米粒的颜色。转座子与常规的基因相比,由于其重复序列和多拷贝的特性,一直以来是科学研究的难点,直至目前科学家们关于转座子的功能仍知之甚少,所以转......阅读全文

基因组中“暗物质”关键调控机制

   中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组与南方科技大学Andrew P. Hutchins课题组合作,以小鼠胚胎干细胞为模型,揭示了基因组中转座元件的关键表观遗传调控机制,相关成果以Transposable elements are regulated by context-specif

揭秘基因组“暗物质”

记国家自然科学基金重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”  在人类遗传信息传递过程中,非编码RNA不参与编码蛋白质,占全部RNA的98%,如同宇宙中神秘的“暗物质”,是生命活动调控的“幕后推手”。  2014年起,中国科学家发起重大研究计划,并于2023年底完成结束评估。  在

揭秘基因组“暗物质”

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516832.shtm非编码核糖核酸(以下简称非编码RNA)在生命活动调控的各个方面发挥着重要作用。研究非编码RNA对了解生命调控的本质不可或缺,是当前生命科学研究前沿热点。2014年,国家自然科学基金重大

利用CRISPR研究基因组“暗物质”

  超过98%的人类基因组由非编码基因组成。这些非编码基因被称为基因组的“暗物质”,它们能调控编码基因的表达,从而影响人类健康和疾病进程。自从人类基因组序列被公开发表以来,科学家们努力解析基因中的功能元件,包括非编码调节区——参与转录调节的顺式调节区和非编码RNA(ncRNA)。转录因子在整个基因组

用“正能量”破解生命调控“暗物质”

  王秀杰是典型的“别人家孩子”。  她18岁加入中国共产党;27岁博士毕业加入中国科学院遗传与发育生物学研究所,成为当时中科院最年轻的研究员;30岁生日前成为我国生命科学领域最年轻的“国家杰出青年科学基金”获得者;36岁成为国家重大科学研究计划首席科学家;40岁这一年又当选了党的十九大代表。  “

PNAS:探查癌症基因组ncRNA“暗物质”

  来自西奈山Icahn医学院的研究人员在癌细胞中发现了一组可以激发免疫反应的非编码RNA分子,它们具有与病原体相似的一些特征。由于这些分子在癌症中表达并扩增,它们造成的免疫反应有可能影响了癌症的生长。这项研究发布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。  研究人员是通过探查基因组“暗物质”组成部分

基因组所肥胖调控机制合作研究获重要进展

  肥胖相关基因FTO主要作用底物是RNA中的6甲基腺嘌呤  近日,中国科学院北京基因组研究所“百人计划”研究员杨运桂与美国芝加哥大学何川教授合作,发现了肥胖相关基因FTO(Fat mass and obesity-associated protein)主要作用底物是RNA中的6甲基

解码基因组“暗物质”,拓宽生命认知疆域

  人类约有2万个基因,仅占DNA的2%,剩下的98%是什么?这些区域如同基因组中的“暗物质”,有待科学家去发现。非编码RNA(核糖核酸)是基因组“暗物质”中的一类重要分子,最近十几年才被发现。它们不仅在生命活动中发挥功能,还与许多疾病息息相关。  作为国际上较早从事长非编码RNA研究的科学家之一,

蓖麻胚乳基因组印记的表观调控机制研究获进展

  被子植物特有的双受精事件产生了三倍体的胚乳(两份母源基因组和一份父源基因组,2m:1p),为胚的发育和种子的萌发提供了营养,为被子植物在陆地植被中占据主导地位奠定了重要的物质基础。同时,由于胚乳中父母源基因组剂量的失衡,产生了一系列非孟德尔遗传现象特别是基因组印记(genomic imprint

多养分添加下基因组大小调控草地群落机制获揭示

近日,中科院植物研究所研究员韩兴国团队与合作者揭示了多养分添加下基因组大小调控草地群落的新机制。相关研究成果发表于《新植物学家》。 资源与植物生产力、多样性之间的关系是生态学长期关注的核心问题之一,资源的增加通常会在提高植物群落生产力的同时降低其植物多样性。草地生态系统是全球最重要的陆地生态系统

多养分添加下基因组大小调控草地群落机制获揭示

  近日,中科院植物研究所研究员韩兴国团队与合作者揭示了多养分添加下基因组大小调控草地群落的新机制。相关研究成果发表于《新植物学家》。  资源与植物生产力、多样性之间的关系是生态学长期关注的核心问题之一,资源的增加通常会在提高植物群落生产力的同时降低其植物多样性。草地生态系统是全球最重要的陆地生态系

北京基因组所揭示RNA甲基化调控基因剪接机制

  中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂课题组在研究m6A甲基化修饰调节mRNA选择性剪接规律过程中,发现了读码器YTHDC1通过招募前体mRNA剪接因子SRSF3同时抑制剪接因子SRSF10与RNA的结合,促进外显子被保留的分子机制。该研究结果于2016

西安交大观测到基因组中的“暗物质”

  10月6日,西安交通大学电信学院教授叶凯等在人类基因组变异研究领域取得阶段性突破结果,成果发表于《自然—通讯》。该研究具备的一套较为完整的基因组变异集合,为人们提供了研究大型基因组结构变异影响的可能性。  研究表明,在鉴定出的190万个大型的基因组变异中,包括大片段DNA缺失、跳转DNA或者凭空

美研究者完成“生命暗物质”基因组测序

  正当物理学家苦苦寻找宇宙暗物质之际,美国研究人员10日报告说,他们完成了对“生命暗物质”的基因组测序。   1996年,科学家首次发现了一种名为“候选门TM6”的细菌。这种细菌广泛存在于水环境中,却无法在实验室中培养,除了其标志性的16S基因外,科学界对它的生命活动特点几乎一无所知。

基因组合调控的作用

组合调控:一个调控元件不仅能控制一个基因的表达,还能同时控制其他基因的表达。作用:可以结合在基因上,启动多个基因的共同表达。

生物物理所揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制

  7月12日,中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《自然》(Nature)上,在线发表了题为Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究论文。  转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中,增

北京基因组所合作揭示RNA-m6A修饰调控抗肿瘤免疫机制

  免疫治疗是对抗肿瘤的前沿阵地,其治疗成功的关键是引发针对肿瘤抗原的自发性T细胞反应。许多病人的免疫系统无法有效识别肿瘤抗原,难以引发持续性的T细胞应答并清除肿瘤。研究免疫系统识别肿瘤抗原的分子机制有望发现新型药物靶点,提高免疫治疗效果。  中国科学院北京基因组研究所韩大力团队与清华大学徐萌团队、

研究团队在干细胞基因组稳定性调控机制研究中取得进展

  干细胞是机体发育和组织稳态维持的基础,基因组稳定是干细胞干性维持和再生医学应用的前提。研究干细胞如何维持基因组稳定,有助于推动干细胞的安全应用和理解相关发育疾病的致病机理。中国科学院昆明动物研究所研究员郑萍团队长期关注干细胞维持基因组稳定性的独特机制。前期工作中,该研究团队鉴定胚胎干细胞基因组稳

疱疹病毒基因组装稳定释放“压力感应和调控”分子机制

  人巨细胞病毒(human cytomegalovirus, HCMV)属于疱疹病毒科β亚家族,是一种在人类中广泛传播的双链DNA包膜病毒。HCMV感染会给免疫能力低下的人群(如器官移植患者或艾滋病人)带来致命危害,此外,还会引发胎儿死亡和新生儿出身缺陷等后果。HCMV具有典型的疱疹病毒三层架构:

基因组调控的定义和作用

中文名称基因组调控英文名称genomic control定  义在DNA水平上调节基因的活性方式。其中两种重要的方式是DNA甲基化和DNA重排。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞分化与发育(二级学科)

-美研究员报告称完成“生命暗物质”基因组测序

  正当物理学家苦苦寻找宇宙暗物质之际,美国研究人员10日报告说,他们完成了对“生命暗物质”的基因组测序。   1996年,科学家首次发现了一种名为“候选门TM6”的细菌。这种细菌广泛存在于水环境中,却无法在实验室中培养,除了其标志性的16S基因外,科学界对它的生命活动特点几乎一无所知。正因此,“

基因组“暗物质”挑战遗传学中心法则?

1953年,DNA双螺旋模型的提出标志着近代分子生物学的诞生。1957年,弗朗西斯·克里克进一步提出了经典的遗传学中心法则,开启了分子生物学时代。经过几十年的研究,科学家对于非编码RNA的认知极大丰富了人类对中心法则的理解。从广义上讲,非编码RNA在真核生物转录组中占据了非常大的部分,包括小RNA、

研究发现新“暗物质蛋白”作为胚胎发育命运的细胞质“开关”

  翻译与代谢的相互调控是细胞可塑性的基础。胚胎早期发育可分为着床前和着床后两个阶段,对应体外培养时两种稳定且可互相转变的多能性干细胞状态:原始态(Naïve)与始发态(Primed)。早期发育与多能干细胞命运在表观遗传、转录、代谢等层次已有研究,而在翻译阶段,此前主要聚焦于已知蛋白的翻译,基因组中

北京基因组所等发现RNA甲基化调控基因出核新机制

  中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂研究组和郑州大学第一附属医院生殖与遗传专科医院孙莹璞研究组、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究组合作研究,揭示了m5C(5-甲基胞嘧啶)修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。该研究成果以5-

北京基因组所等揭示肥胖相关基因FTO调控能量代谢新机制

  肥胖相关基因(FTO)是第一个被发现在肥胖中发挥重要作用的基因,在调节体重和脂肪含量方面具有重要作用,但具体的分子机制以及是否能够利用小分子化合物抑制FTO活性来治疗肥胖相关的代谢类疾病一直以来并不清楚。  中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队与北京生命科学研究所黄牛和张二荃团队合作发现,恩他卡

血脂稳态调控新机制

  10月9日,国际学术期刊JCI Insight在线发表了中国科学院广州生物医药与健康研究院李尹雄研究组的最新研究成果“Hypomorphic ASGR1 modulates lipid homeostasis via INSIG1-mediated SREBP signaling suppres

Cell揭示节律活动调控机制

  宾夕法尼亚大学Perelman医学院神经科学教授Amita Sehgal博士,在《细胞》(Cell)杂志上的一篇论文中描述了控制果蝇日常节律性作息行为的一个大脑回路。新研究还发现,人类大脑蛋白CRF的果蝇版本是这一回路中的一个重要协调分子。   果蝇中的CRF叫做DH44为休息/活动周期循

Cell揭示重要发育调控机制

  鲁汶大学VIB研究所的Bassem Hassan研究小组发现了从前未知的一种机制,这一机制在物种间高度保守,通过精确地时间控制对大脑发育至关重要的一个蛋白质家族:proneural蛋白的活性调控了神经发生。这一机制——一种简单的可逆的化学修饰对于生成充足数量的神经元、它们的分化及中枢神经系统的发

心力衰竭关键调控机制

    近日,心血管基础研究专业期刊Circulation Research(《循环研究》)特别为一项来自中国的关于心力衰竭的研究成果配发述评,称赞该发现揭示了心力衰竭病理过程的关键调控机制。    这项研究成果便是北京大学第三医院徐明教授等与北大生命科学院王世强教授实验室、中科院遗传发育研究所等单

研究揭示棉花株型调控机制

近日,中国农业科学院棉花研究所棉花分子遗传改良创新团队开展了棉花株型调控基因挖掘及其调控通路的研究,揭示了miRNA164及其靶标基因介导植物激素脱落酸控制棉花株型的分子机制,为创制适宜机采的棉花品种提供优异基因和种质资源。相关研究结果发表于《植物生物学》(Plant Biotechnology J