PNAS：探查癌症基因组ncRNA“暗物质”
来自西奈山Icahn医学院的研究人员在癌细胞中发现了一组可以激发免疫反应的非编码RNA分子，它们具有与病原体相似的一些特征。由于这些分子在癌症中表达并扩增，它们造成的免疫反应有可能影响了癌症的生长。这项研究发布在《美国国家科学院院刊》（PNAS）上。 研究人员是通过探查基因组“暗物质”组成部分——称作为卫星DNA的区域来获得这一研究发现的。这一区域生成了大量有别于编码基因和mRNA的非编码RNA (ncRNA)。这些神秘的RNA分子大多不生成蛋白质，但具有重要的调控功能。 这项研究的高级研究员、Icahn医学院Tisch癌症研究所助理教授Benjamin Greenbaum博士说：“这些ncRNAs存在于人类和小鼠癌细胞中。过去这些区域被称作为‘垃圾DNA’，在过去的5年里研究人员开始认识到这是许多功能重要ncRNAs的居所。” 共同高级研究员、Icahn医学院Tisch癌症研究所免疫疗法主任、血液学与内科肿瘤学教授N......阅读全文
PNAS：探查癌症基因组ncRNA“暗物质”
来自西奈山Icahn医学院的研究人员在癌细胞中发现了一组可以激发免疫反应的非编码RNA分子，它们具有与病原体相似的一些特征。由于这些分子在癌症中表达并扩增，它们造成的免疫反应有可能影响了癌症的生长。这项研究发布在《美国国家科学院院刊》（PNAS）上。 研究人员是通过探查基因组“暗物质”组成部分
揭秘基因组“暗物质”
记国家自然科学基金重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制” 在人类遗传信息传递过程中，非编码RNA不参与编码蛋白质，占全部RNA的98%，如同宇宙中神秘的“暗物质”，是生命活动调控的“幕后推手”。 2014年起，中国科学家发起重大研究计划，并于2023年底完成结束评估。 在
揭秘基因组“暗物质”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516832.shtm非编码核糖核酸（以下简称非编码RNA）在生命活动调控的各个方面发挥着重要作用。研究非编码RNA对了解生命调控的本质不可或缺，是当前生命科学研究前沿热点。2014年，国家自然科学基金重大
动物所piRNA的高精度预测算法研究获得突破
第二代测序技术又称作深度测序技术，应用到RNA上统称作RNA-seq或RNA测序，它已成为基因表达和转录组分析的重要手段。第二代转录组测序数据中含有大量不编码蛋白质的ncRNA序列，因为它们像宇宙中的暗物质一样难以识别和有重要功能，也被称为“基因组暗物质”。由于数据量巨大，保守性差
利用CRISPR研究基因组“暗物质”
超过98%的人类基因组由非编码基因组成。这些非编码基因被称为基因组的“暗物质”，它们能调控编码基因的表达，从而影响人类健康和疾病进程。自从人类基因组序列被公开发表以来，科学家们努力解析基因中的功能元件，包括非编码调节区——参与转录调节的顺式调节区和非编码RNA（ncRNA）。转录因子在整个基因组
基因组中“暗物质”关键调控机制
中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组与南方科技大学Andrew P. Hutchins课题组合作，以小鼠胚胎干细胞为模型，揭示了基因组中转座元件的关键表观遗传调控机制，相关成果以Transposable elements are regulated by context-specif
解码基因组“暗物质”，拓宽生命认知疆域
人类约有2万个基因，仅占DNA的2%，剩下的98%是什么？这些区域如同基因组中的“暗物质”，有待科学家去发现。非编码RNA（核糖核酸）是基因组“暗物质”中的一类重要分子，最近十几年才被发现。它们不仅在生命活动中发挥功能，还与许多疾病息息相关。 作为国际上较早从事长非编码RNA研究的科学家之一，
出人意料的新才能：非编码RNA
在《来自基因组暗物质的lncRNA、ciRNA和miRNA》一文中我们提到：人类基因组中也存在大量被称为基因组“暗物质（dark matter）”的非编码序列，包括基因间非编码序列、内含子非编码序列等。所谓基因组“暗物质”，其实就是基因组中的非编码RNA——不包含用于制造蛋白质的版图，构成了超过
西安交大观测到基因组中的“暗物质”
10月6日，西安交通大学电信学院教授叶凯等在人类基因组变异研究领域取得阶段性突破结果，成果发表于《自然—通讯》。该研究具备的一套较为完整的基因组变异集合，为人们提供了研究大型基因组结构变异影响的可能性。 研究表明，在鉴定出的190万个大型的基因组变异中，包括大片段DNA缺失、跳转DNA或者凭空
美研究者完成“生命暗物质”基因组测序
正当物理学家苦苦寻找宇宙暗物质之际，美国研究人员10日报告说，他们完成了对“生命暗物质”的基因组测序。 1996年，科学家首次发现了一种名为“候选门TM6”的细菌。这种细菌广泛存在于水环境中，却无法在实验室中培养，除了其标志性的16S基因外，科学界对它的生命活动特点几乎一无所知。
带你认识RNA军团中“非正规军”——非编码RNA
人类的每一个细胞随时都像在进行着一场无止尽的战争，细胞核是司令部，细胞质是战场。六十年前，弗朗西斯·克里克（Francis Crick）的“中心法则”（ DNA转录成RNA，再翻译成蛋白质）现在一直是细胞作战的绝对军规，军事机密（遗传信息）必须从司令DNA先到RNA军团，再到“武器弹药”蛋白质。司令
在肝癌中发挥作用的ncRNA
研究发现，越来越多的非编码RNA（ncRNA）与各种人类疾病有关，包括癌症，但是，肝细胞癌（HCC）的ncRNA转录组在很大程度上还是未知的。 最近，由日本理化学研究所（RIKEN）和法国国家健康与医学研究院（INSERM）带领的一个国际研究团队发现，逆转录病毒长末端重复序列 （LTR）启动子
Cell子刊：超保守lncRNA的重要功能
谈到遗传物质，我们往往指的是从父母那儿继承到的DNA（脱氧核糖核酸）。这些DNA会转录成为RNA，进而指导各种蛋白质的合成，例如血红蛋白或胰岛素。除了这些RNA之外，细胞中还存在着大量神秘的非编码RNA。 MicroRNA是最广为人知的一种非编码RNA，这种微小的分子控制着众多基因的启动和关闭
－美研究员报告称完成“生命暗物质”基因组测序
正当物理学家苦苦寻找宇宙暗物质之际，美国研究人员10日报告说，他们完成了对“生命暗物质”的基因组测序。 1996年，科学家首次发现了一种名为“候选门TM6”的细菌。这种细菌广泛存在于水环境中，却无法在实验室中培养，除了其标志性的16S基因外，科学界对它的生命活动特点几乎一无所知。正因此，“
基因组“暗物质”挑战遗传学中心法则？
1953年，DNA双螺旋模型的提出标志着近代分子生物学的诞生。1957年，弗朗西斯·克里克进一步提出了经典的遗传学中心法则，开启了分子生物学时代。经过几十年的研究，科学家对于非编码RNA的认知极大丰富了人类对中心法则的理解。从广义上讲，非编码RNA在真核生物转录组中占据了非常大的部分，包括小RNA、
研究人员观测到人类基因组新的“暗物质”
人类对基因组变异的认识又向前推进一大步：西安交通大学日前传出消息，该校叶凯青年科学家工作室团队与荷兰、美国、德国的20个科研机构，通过开发新的计算机算法和分析处理流程，分析并报道了在250个健康家庭的基因组中的所有类型变异，其中包括以前从未观测到的大量复杂型变异，即基因组中的“暗物质”。 据介
非编码RNA(ncRNA)在前列腺癌发生发展中的作用机制
人类基因组计划的研究结果显示, 仅有2.5万~3万个蛋白质编码基因, 占总基因组序列不到3%, 其余基因组序列转录产生的RNA都是非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA). ncRNA与恶性肿瘤发生发展关系密切. 近年来, 关于ncRNA中的长链非编码RN(lncRNA)以及环
美国地下暗物质实验发现暗物质初步线索
据物理学家组织网、英国BBC新闻网消息称，继本月初丁肇中团队公布阿尔法磁谱仪项目首批研究暗物质成果后，美国明尼苏达州的地下暗物质实验——超级低温暗物质搜寻计划(Super-CDMS)日前报告了3个疑似暗物质事例，计算结果表明其是大质量弱相互作用粒子(WIMP)的可能性为99.81%，不
我国发现一类新型长非编码RNA－基因组“暗物质”不断“正名”
国际著名学术期刊Molecular Cell近日在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新进展。该研究发现，一类新型长非编码RNA，或与小胖威利综合征的发生发展密切相关。 人类基因组中存在大量被称为基因组“暗物质”的非编码序列，包括基因
中国学者Cell子刊揭示基因组“暗物质”中环状RNA新分子
9月27日，国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)发表了中科院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲组与计算生物学所杨力组的最新合作研究论文，发现来源于基因内含子区域的环形RNA新分子，揭示其成环机制及在基因转录调控中的重要功能。 众所周知，人类基因组中存在大量被称为基因组
ncRNA－UICLM通过ceRNA机制调控结直肠癌的肝转移
中山大学附属肿瘤医院院长、主任医师徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗领域及抗癌药物研究，在消化道肿瘤的转移与转归、化疗药物耐受及其机制和优化临床治疗方面具有国际领先的创新性成果。近期，该课题组应用Arraystar lncRNA芯片在肝转移的结直肠癌组织中分析了lncRNAs的表达情况。课题组筛
美国暗物质研究专家：中国走上寻找暗物质的最前沿
“熊猫计划”的暗物质探测器 由清华大学主导的中国暗物质实验合作组近日在美国《物理评论D》上发表最新实验结果称，获得了点电极高纯锗探测器在10吉电子伏特以下能区里最灵敏的暗物质实验结果，并利用这一技术确定性地排除了美国CoGeNT实验组几年前给出的暗物质存在区域。 无独有偶，由上海交通大学牵头的“
硬实力！杨辉团队Cell，Nature系列子刊等发表8项研究成果
近一年来中国科学院神经研究所杨辉团队连续取得突破，在Cell， Protein & Cell，Nature Communications ，Nature Cell Biology，Nature Protocol，Nature Methods 等杂志上发表了8项重要研究成果，在基因编辑领域取得重大
ncRNA在精子发生过程中的关键作用研究
Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中发挥重要作用一直被很多科学家认为是真核生物基因组进化中“垃圾”信息的非编码RNA（ncRNA），既不编码蛋白质，又缺乏生物学功能的遗传学证据，近几年得到了“平反”，越来越多的研究表明ncRNA 在剂量补偿效应(Dosage comp
科学家有望破解占比98％的人类基因组暗物质的奥秘
2003年研究人员完成了人类基因组计划项目，共对人类基因组中所有30亿个碱基对进行了测序，很多人认为我们机体的DNA是一本开放的百科全书，但一个令人困惑的问题很快也会出现，尽管科学家们对这本书进行了翻译，但仅仅只是解释了其中很少一部分内容。 机体中有高达98%的DNA并不会编码产生蛋白质，很多
Nature－Methods：RNA牛人用CRISPR打造研究利器
非编码RNA（ncRNA）是指不编码蛋白质的RNA。从上世纪六十年代的tRNA、八十年代的rRNA、到九十年代的microRNA，ncRNA在不断给人们制造惊喜。科学家们也逐渐意识到ncRNA并不是垃圾，而是许多基础生命过程的核心，有着广泛的生物学功能。 为了更好的研究ncRNA功能，哈佛大学
“暗物质”DNA影响大脑发育
实验室小鼠帮助研究人员探寻令人困惑的“暗物质”DNA。图片来源：Alexander Badyaev/naturepl.com 十多年来，由基因组中的“暗物质”片段（没有明显功能的缠绕在一起的DNA长链）带来的谜题一直困扰着科学家。如今，一个团队最终破解了这个谜题。 这个谜题集中在不编
科学家用电脑模拟暗物质模型－更形象理解暗物质
三位来自美国和法国不同大学的物理学家近日利用一种经验函数，通过计算机模拟了暗物质中的泡泡状空间，更好地描述了暗物质的密度情况。模型显示，这种泡泡空间的大小和年龄非常多样，而泡泡边缘密度最高。相关论文发表在最近出版的《物理评论快报》上。 迄今为止，人们对暗物质的情况还知之甚少。根据来自万有引力研
Cell：“暗物质”DNA影响大脑发育
十多年来，由基因组中的“暗物质”片段（没有明显功能的缠绕在一起的DNA长链）带来的谜题一直困扰着科学家。如今，一个团队最终破解了这个谜题。 这个谜题集中在不编码蛋白质但在很多动物中保持相同的DNA序列。通过删除其中一些“超保守元素”，研究人员发现，这些序列能微调编码蛋白质的基因表达，进而指导大
太阳核心可能“潜伏”着暗物质
据每日科学网8月5日报道，英国伦敦大学皇家霍洛威学院一名科学家的最新研究结果，与上个月公布的“太阳内部或正积聚暗物质”的报告不谋而合。该科学家宣称，太阳内部中心不但“潜伏”了暗物质，且在逐渐冷却太阳的核心温度。 7月2日，《物理评论快报》杂志的一篇论文阐述了来自牛津大学宇宙