甜蜜而富有挑战性的糖基化蛋白质组学研究

写在前面的话:对于研究糖基化蛋白质组学的学者们来讲,很多人喜欢用sweet这个词来形容自己的研究课题。我个人也很喜欢这个单词,这是一个让人感到幸福而温暖的词语,会让你对你的课题充满了爱意。但回头想想,当初懵懵懂懂读到研究生,误打误撞进入蛋白质组学圈,好像也就是随大流的主动抑或是被动选择了博士阶段的课题,期间有艰苦,有迷茫,也有收获,有喜悦。话扯远了,就让我们进入今天的话题,谈一谈糖基化蛋白质组学发展到了今天,我们所能做的,和我们想要做的,希望能给领域内的研究者们带来一点点的启迪,也让不熟悉这个领域的科研工作者们对糖基化蛋白质组有个粗略的印象。 在讲糖基化蛋白质组之前,我想先提一下什么叫做蛋白质组。可能对于即便是不懂科研的老百姓来说,基因组已经是耳熟能详的词汇了。但谈到蛋白质组,好多人就懵圈了。用较为通俗易懂的话来说,蛋白质组是指一个细胞或者一种组织或者一类器官甚至是某一物种所表达的全部蛋白质。实际上,生物体内蛋白质组的......阅读全文

糖蛋白糖基化

  已上市的蛋白药物中,治疗性糖蛋白药物数量众多,糖基化是最常见的蛋白翻译后修饰。2020版《中国药典》第一增补版中,正式发布9405糖蛋白的糖基化分析指导原则。赛默飞能为糖基化分析提供业内最全方案,可根据糖蛋白的复杂性、与药物安全有效的相关性以及生产监控策略的总体设计等,为糖基化提供完整糖蛋白、糖

蛋白质糖基化分类

根据糖苷链类型,蛋白质糖基化可以分为四类,即以丝氨酸、苏氨酸、羟赖氨酸和羟脯氨酸的羟基为连接点,形成-O-糖苷键型。以天冬酰胺的酰胺基、N一末端氨基酸的 α - 氨基以及赖氨酸或精氨酸的ω - 氨基为连接点,形成-N-糖苷键型;以天冬氨酸或谷氨酸的游离羧基为连接点,形成脂糖苷键型以及以半胱氨酸为连接

蛋白质糖基化的检测实验——化学脱糖基化

实验材料蛋白样品试剂、试剂盒TFMS苯甲醚仪器、耗材玻璃器皿实验步骤1. 在冰上预冷干净、干燥的玻璃器皿。用带有 Teflon-丝帽的玻璃试管混合试剂。2. 打开或混合试剂前,在冰上预冷所有的溶液。从冰冷的原液中,TFMS:苯甲醚 ( Sigma) 以 2:1 (v/v) 的比例混合。缓慢的向试管内

蛋白质糖基化的检测实验——酶脱糖基化

实验方法原理用酶或化学脱糖基化、通过选择性标记或通过凝集素亲和层析法是检测蛋白糖基化常用方法。实验材料蛋白样品试剂、试剂盒磷酸钠缓冲液蛋白溶液β-巯基乙醇NP-40 溶液仪器、耗材SDS-PAGE玻璃器皿植物凝集素柱实验步骤一、用 PNGaseF(N-多糖酶)处理1. 以 0.1 mol/L 磷酸钠

蛋白质糖基化的过程

N-连接的糖链合成起始于内质网,完成于高尔基体。在内质网形成的糖蛋白具有相似的糖链,由Cis面进入高尔基体后,在各膜囊之间的转运过程中,发生了一系列有序的加工和修饰,原来糖链中的大部分甘露糖被切除,但又被多种糖基转移酶依次加上了不同类型的糖分子,形成了结构各异的寡糖链。糖蛋白的空间结构决定了它可以和

蛋白质糖基化的检测

试剂、试剂盒 磷酸钠缓冲液蛋白溶液β-巯基乙醇NP-40 溶液仪器、耗材 SDS-PAGE实验步骤 一、用 PNGaseF(N-多糖酶)处理1. 以 0.1 mol/L 磷酸钠(或 Tris-HCl,而不用柠檬酸)缓冲液,pH 7.4 ( 7.0~8.0 ) 配制高达 2 mg/ml 的蛋白溶液,并

糖基化对膜蛋白功能的影响

糖基化对膜蛋白功能影响常常是很重要的,对特异的生物学功能起介导作用:1,对细胞具有保护、稳定、组织及屏障等多方面作用;2,可作为外源性受体的特异性配体,某些糖链可作为各种病毒、细菌及寄生物的特异受体;3,糖链也可作为内源性受体的特异性配体,参与介导清除、周转及胞内穿行作用;4,糖链在受精过程中起着重

蛋白质糖基化的案例研究

蛋白质糖基化是一种生命活动中普遍存在的翻译后修饰,赋予蛋白质不同的生物功能和增强的物理化学稳定性。糖基化的类型根据糖苷键中涉及的特定原子进行分类:O-糖基化将糖连接到丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸残基的羟基氧上;N-糖基化将糖与天冬酰胺的酰胺氮连接;S-糖基化将糖添加到半胱氨酸的硫醇硫中,这类糖基化不太常见

9405糖蛋白的糖基化分析指导原则解析,SCIEX助力糖基化精准分析

概述日前,国家药监局、国家卫生健康委联合发布《中国药典》(2020年版)第一增补本,将于2024年3月12日起施行。其中增加了《9405 糖蛋白的糖基化分析指导原则》,本指导原则详细阐述了糖蛋白糖基化分析的理念、方法及应用和验证的相关要求,适用于糖蛋白产品结构与稳定性的表征、批次放行检测和过程控制检

糖基化蛋白质的基本信息

中文名称糖基化蛋白质英文名称glycosylated protein定  义带有共价连接糖链的蛋白质。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),糖类(二级学科)

黏蛋白的糖基化和聚集的介绍

  黏蛋白基因编码粘蛋白单体被合成为杆状核粘蛋白核心是翻译后由异常丰富改性的糖基化。  粘蛋白的致密“糖衣”给他们相当保水能力,也使它们耐蛋白水解作用,这可能是在维持重要粘膜障碍。  黏蛋白的分泌与分子质量约为1 10万大蛋白质的块状集合体。内的这些聚集体,单体被相互连接大多是由非共价的相互作用,尽

蛋白质的糖基化修饰主要分为

特征 N-连接 O-连接合成部位 粗面内质网 主要在高尔基体合成方式 来自同一个寡糖前体 一个个单糖加上去与之结合的氨基酸残基 天冬酰氨 丝氨酸、苏氨酸、羟脯、羟赖最终长度 至少5个糖残基 1-4个糖残基第一个糖残基 N-乙酰葡萄糖胺 N-乙酰半乳糖胺大概清楚了吧! 蛋白质糖基化是一种蛋白质修饰,作

蛋白质糖基化位点检测实验步骤

  用酶或化学脱糖基化、通过选择性标记或通过凝集素亲和层析法是检测蛋白糖基化常用方法。 一、用 PNGaseF(N-多糖酶)处理。  1. 以 0.1 mol/L 磷酸钠(或 Tris-HCl,而不用柠檬酸)缓冲液,pH 7.4 ( 7.0~8.0 ) 配制高达 2 mg/ml 的蛋白溶液,并含 5

关于分泌蛋白的修饰加工糖基化的介绍

  这些修饰包括糖基化、羟基化、酰基化(酰化)、二硫键形成等,其中最主要的是糖基化,几乎所有内质网上合成的蛋白质最终被糖基化。糖基化的作用是:  ①使蛋白质能够抵抗消化酶的作用;  ②赋予蛋白质传导信号的功能;  ③某些蛋白只有在糖基化之后才能正确折叠。  糖基化有两种类型:  (1)糖蛋白是由寡糖

高尔基体蛋白质糖基化的介绍

  N-连接的糖链合成起始于内质网,完成于高尔基体。在内质网形成的糖蛋白具有相似的糖链,由Cis面进入高尔基体后,在各膜囊之间的转运过程中,发生了一系列有序的加工和修饰,原来糖链中的大部分甘露糖被切除,但又被多种糖基转移酶依次加上了不同类型的糖分子,形成了结构各异的寡糖链。糖蛋白的空间结构决定了它可

新冠病毒S蛋白糖基化修饰图揭示“OFollowN”糖基化新规律

  蛋白质糖基化修饰是生物体内最重要的翻译后修饰之一,发生在细胞50%-70%的蛋白上。病毒囊膜蛋白的糖基化修饰具有广泛的功能,包括调控蛋白质稳定性、病毒的趋向性、和保护潜在的抗原表位免受免疫监视等。深入了解新型冠状病毒(SARS-CoV-2)刺突蛋白(Spike, S)的糖基化修饰对于新型冠状病毒

高尔基复合体的蛋白质糖基化

  N-连接的糖链合成起始于内质网,完成于高尔基体。在内质网形成的糖蛋白具有相似的糖链,由Cis面进入高尔基体后,在各膜囊之间的转运过程中,发生了一系列有序的加工和修饰,原来糖链中的大部分甘露糖被切除,但又被多种糖基转移酶依次加上了不同类型的糖分子,形成了结构各异的寡糖链。糖蛋白的空间结构决定了它可

陆豪杰:蛋白质糖基化的质谱解析

  分析测试百科网讯 2020年9月14日,由中国质谱学会(中国物理学会质谱分会)主办,分析测试百科网和中国质谱学会网承办的2020年中国质谱学会质谱网络研讨会(2020 CMSS)正式开幕。本届质谱网络研讨会正值中国质谱学会成立40周年,按报告内容涉及领域包括生命科学与组学、药物药理毒理分析、元素

植物蛋白质组学和糖基化(二)

4. 注释( 1 ) 每个实验均使用新鲜的 3 mol/L 甲醇- HCl 和硅烷化试剂。( 2 ) 要仔细识别蛋白质印迹,因为 WGA 既能识别 N-糖苷的 GlcNAc,也能识别 O-GlcNAc。( 3 ) 用于在硝酸纤维素印迹膜上封闭结合位点的溶液应避免糖蛋白污染。所以我们建议在这一步骤中使

植物蛋白质组学和糖基化实验

实验材料链霉亲和素-过氧化物酶                                                                  牛胰核糖核酸酶 B                                                            

植物蛋白质组学和糖基化(一)

 1. 前言与其他真核细胞一样,植物细胞中,糖基化通常发生在分泌蛋白质上,虽然在细胞质蛋白和核蛋白上也发现一些糖基化反应。根据寡糖部分和蛋白质骨架之间的连接方式,可将糖基化分为两种类型:N -糖基化和 O-糖基化。植物中 N-糖基化研究最多。1.1 N-糖基化与其他真核细胞一样,在植物细胞中,N-糖

关于糖基化血红蛋白的研究背景介绍

  1958年,Huisman 和 Meyering用色谱柱首次将糖基化血红蛋白与其它形式的血红蛋白分离开来。1968年Bookchin 和 Gallop,首次描绘了糖蛋白的特性。1969年,Samuel Rahbar和他的同事首次在糖尿病人中现发糖基化血红蛋白增加。1975年,Bunn和他的同事描

植物蛋白质组学和糖基化实验1

实验材料链霉亲和素-过氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白试剂、试剂盒DIG 糖链检测试剂TTBS 缓冲液Lectin- biotinTBS 缓冲液实验步骤3.1 这个蛋白质是糖蛋白吗只有一种方法能全面的回答“这个蛋白质是糖蛋白吗?”这个问题。这需要使用能检测并定量印记上糖蛋白的总糖

植物蛋白质组学和糖基化实验(二)

刀豆球蛋白 A (ConA)- 过氧化物酶方法(根据参考文献 20 修改的方法)。( 1 ) 通过 1D 或 2D 电泳分离,并转移到硝酸纤维素膜上。( 2 ) 用 TTBS 缓冲液浸泡印迹膜 1 h。( 3 ) 将印迹膜在含有 ConA ( 25 μg/ml)的 TTBS 缓冲液中,室温下温育 2

植物蛋白质组学和糖基化实验(五)

1. 含高甘露糖型 N-糖苷糖蛋白的鉴定本方法是我们实验室以油菜籽为实验材料建立的,本方法也适用于其他植物材料。( 1 ) 将 6 g 植物材料放入 4°C 预冷的研钵中,加入 50 ml 预冷的 TBS 缓冲液,研磨萃取蛋白质(见注释 13),接着 10000 g 离心萃取物 30 min,去

植物蛋白质组学和糖基化实验(一)

实验材料 链霉亲和素-过氧化物酶牛胰核糖核酸酶 B甲基比喃甘露糖苷卵清白蛋白试剂、试剂盒 DIG 糖链检测试剂TTBS 缓冲液Lectin- biotinTBS 缓冲液实验步骤 3.1 这个蛋白质是糖蛋白吗只有一种方法能全面的回答“这个蛋白质是糖蛋白吗?”这个问题。这需要使用能检测并定量印记上糖蛋白

植物蛋白质组学和糖基化实验(四)

3.3 我的糖基化蛋白在哪实验人员可通过这个方法获得关于糖苷在蛋白骨架上的分布及糖苷本身的结构信息。这类实验可在纯化的糖蛋白或者从 1D 或 2D 电泳胶上分离出来的蛋白上进行,首先,用蛋白内切酶消化蛋白质,通过高效液相色谱(HPLC) 分离消化后的肽和糖肽混合物。对含有糖苷的收集组分进行糖

植物蛋白质组学和糖基化实验2

3. 糖基释放后的蛋白质分析1 ) 糖基释放的化学处理方法还原性氨化反可应选择性的解离糖蛋白上的 O-糖苷(见注释 10) 。去糖基化的蛋白用 1D SDS-PAGE 分析,将其迁移情况与其糖基化形式的蛋白进行比较,电泳迁移率的增加是 O-连糖苷出现在蛋白上的证据(见注释 11)。( 1 ) 将 1

关于糖基化血红蛋白的基本信息介绍

  糖基化血红蛋白,英文名为Glycosylated hemoglobin or glycated hemoglobin(GHb),是血红蛋白的一种形式,用于反映一段时间(4~8周)前的平均血浆葡萄糖浓度。因其中以HA1c含量最多,故有时被缩写成A1C作其代名词,糖基化血红蛋白以非酶糖化形成。血红蛋

蛋白质和脂质,RNA都可以糖基化

  众所周知,糖基化是在各种酶的作用下将糖添加到蛋白质或脂质中的过程。这个过程开始于内质网,结束于高尔基体。例如,糖在糖基转移酶的作用下转移到蛋白质上,与蛋白质上的氨基酸残基形成糖苷键,最终形成糖蛋白。最近,一项名为“Small RNAs are modified with N-glycans an