植物所等破译构树基因组

构树(Broussonetia papyrifera)又称纸皮树、肥猪树,为桑科构属多年生阔叶乔木,自然分布于我国大部分地区和东南亚,是一种典型的乡土树种和先锋植物。构树雌雄异株,种子数量多,易繁殖,生长快,表型性状和遗传多样性丰富,基因组紧凑,可作木本植物研究的模式材料。同时,构树有着悠久的开发历史,是一种多用途资源植物。然而,以往关于构树的研究主要集中在构树纤维特点、制浆造纸的工艺、饲用价值和饲喂方法、生态绿化、环境适应性等方面,缺乏对构树基础生物学深入系统的研究,从而严重影响构树应用价值的开发。 近日,中国科学院植物研究所沈世华研究组与多家单位合作,利用二代Illumina和三代PacBio单分子测序技术,结合mate-pair大片段文库、光学图谱、遗传图谱以及Hi-C等辅助组装策略,报告了一个高质量的、染色体级别的构树基因组(2n = 2x = 26)。该基因组序列386.83Mb,覆盖度接近100%,其中99.2......阅读全文

迄今最完整植物测序之一高质量现代月季基因组图“开花”

  科技日报北京5月2日电 英国《自然·遗传学》杂志1日在线发表了一个法国联合研究团队的论文,公布了现代月季的基因组序列,这是迄今最完整的植物基因组序列之一。现代月季的基因组非常难以破译,该研究成果将帮助人们从分子角度了解其背后的基因和代谢流程。   现代月季(Rosa chinensis)拥有独

澳大利亚CSIRO机构与中科院将在植物基因组学进行合作

  据GenomeWeb记者报道,2011年3月10日—澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)今天宣布,将在下周与中科院共同探索在植物基因组研究上的合作计划。  这项研究合作,将重点放在水稻和小麦农作物上。水稻和小麦将同玉米一并成为在世界上种植最广泛的三大农作物;来自两个研

昆明植物所等在蔷薇类系统发育基因组学研究中取得进展

  蔷薇类(rosids)和菊类(asterids)是真双子叶植物的两个主干分支,其中蔷薇类包括17个目,140个科,约70,000个物种,呈现了丰富的形态多样性,并具有重要的经济价值。近十几年以来,对叶绿体基因序列的分析支持蔷薇类分为豆类分支和锦葵类分支。其中,豆类分支包括固氮支系(由葫芦目Cuc

石松类和蕨类植物的基因组大小与进化研究中取得新进展

  基因组的大小与物种进化之间的关系一直以来都受到学者广泛关注。作为遗传信息的载体,基因组大小不可避免地逐步增加。已有研究显示,基因组的大小同物种的进化程度之间存在一定的正相关关系。从大尺度的分类水平来看,基因组大小和物种复杂程度在总的趋势上呈正相关性。然而随着研究的深入,人们发现基因组的大小和物种

武汉植物园在昆栏树目叶绿体基因组研究方面取得新进展

  真双子叶植物基部类群昆栏树目(Trochodendrales)仅包含两个单种属,水青树属(Tetracentron)和昆栏树属(Trochodendron),是研究被子植物系统与进化的重要和关键类群之一。   与大多数被子植物相比,昆栏树目植物叶绿体DNA的反向重复区(IRs)包含了更多的基因

武汉植物园等在金豆的叶绿体全基因组解析研究中获进展

  金豆【Fortunella venosa(Champ. ex Benth.) C.C.Huang】是芸香科中一种多年生常绿灌木。此物种为我国特有,分布区域与金柑【《中国植物志》 Fortunella hindsii (Champ. ex Hook.) Swingle】略有重叠,且范围狭窄,主要分

植物基因组学国家重点实验室2014夏季青年学术论坛召开

  中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因组学国家重点实验室2014年度夏季青年学术论坛于7月24日至25日成功召开。实验室的职工、博士后、研究生以及客座人员等共350余人参加了此次论坛。实验室副主任储成才研究员致开幕词,指出实验室青年学术论坛进一步推动了实验室的内部交流,希望青年人员以此为平台,

华南植物园等完成麻疯树基因组组装及高密度遗传图谱构建

  麻疯树(Jatropha curcas L.)为大戟科木本油料植物,是生产生物柴油的重要能源植物之一。  中国科学院华南植物园研究员吴国江团队联合国内多家单位完成了麻疯树全基因组测序和组装,组装基因组大小为320.5 Mbp,在基因组中共发现了27,172个蛋白编码基因。另外研究人员构建了以麻疯

冷泉港推出两个精选新方法-分别用于分析基因组和植物细胞

基因组分析法: 2008年6月冷泉港报:人类基因组计划后时代推动了其他个体基因组拷贝序列测定的发展,令人惊讶的是大量的基因拷贝数和DNA系列在个体之间存在很大的差异。这些拷贝数变异(CNV)是产生生物多样性的主要原因,也是导致诸多遗传疾病的元凶。本月的冷泉港期刊Cold Spring Habor

谁在先?“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”

是先有鸡还是先有鸡蛋?这个问题相当恼人,恐怕很难说清楚。现在,研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题:是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中,那个是第一个产生的?那些被复制了? 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据,这种

植物基因组学国家重点实验室2012年度青年学术论坛

  植物基因组学国家重点实验室2012年度青年学术论坛于2013年1月10日至11日召开。实验室课题组长、工作人员和研究生共计450余人出席了此次论坛。实验室主任左建儒研究员代表实验室学术委员会主任方荣祥院士致开幕词。左建儒研究员引用“他山之石,可以攻玉”、“三人行,必有吾师”,充分肯定了

华南植物园等发布首个三倍体栽培香蕉T2T参考基因组

香蕉是产量颇高的水果,也是热带、亚热带地区的主要粮食作物之一。栽培香蕉起源复杂,基因组杂合度高、分型困难,导致香蕉的基因组研究相对落后于其他栽培作物。三倍体香蕉是全球栽培香蕉的主力军,其中Cavendish香蕉(AAA)因易于运输而被大量栽种,其产量约占据香蕉市场的50%。Cavendish香蕉高质

华南植物园等发布首个三倍体栽培香蕉T2T参考基因组

香蕉是产量颇高的水果,也是热带、亚热带地区的主要粮食作物之一。栽培香蕉起源复杂,基因组杂合度高、分型困难,导致香蕉的基因组研究相对落后于其他栽培作物。三倍体香蕉是全球栽培香蕉的主力军,其中Cavendish香蕉(AAA)因易于运输而被大量栽种,其产量约占据香蕉市场的50%。Cavendish香蕉高质

基于108种樟目植物基因组及序列构建九分支系统进化树

  樟科(Lauraceae)是被子植物木兰亚纲(Magnoliidae)的重要类群,约有60属3500种,占木兰类植物种类的三分之一。当前,樟科分类系统问题尚未解决,先前基于部分形态学特征建立的无根藤亚科和樟亚科,以及樟亚科中的厚壳桂族、鳄梨族和月桂族备受争议。  为了确定樟科植物的族(tribe

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

叶绿体基因组

叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器,叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初,人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的,但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA,ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子,其大小在1

全基因组的比较基因组杂交技术介绍

Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a

GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组

多伦多大学的科学家们发现,作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白(C2H2-ZF)实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究,有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员,是规模最大的一种人类蛋白。然而,人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-

植物细胞结构与植物徒手切片

[目的要求] 1.掌握植物徒手切片技术。 2.观察认识植物细胞的基本结构,质体的形态。 3.认识和鉴定植物细胞内常见的后含物。 [材料用品] 材料:洋葱鳞茎或番茄果实、葫芦藓叶、红辣椒、鸭跖草叶片、马铃薯块茎、蓖麻种子、花生种子。

关于植物固醇的植物来源介绍

  植物油是植物固醇含量最高的一类食物。以常见的植物油为例,每100克大豆油中植物固醇含量约300毫克;花生油约250毫克;芝麻油和菜籽油为500毫克以上;玉米胚芽油中含量最高,可达到1000毫克以上。可以说,植物油是膳食中植物固醇的一个重要来源。  营养建议:每天植物油摄入量以25克为宜。植物油摄

中国新生儿基因组、胚胎基因组计划启动

  为从根本上实现新生儿遗传病的早发现、早诊断、早干预,7日,中国遗传学会遗传咨询分会联合复旦大学附属儿科医院在上海发起中国新生儿基因组计划。  中国新生儿基因组计划将在未来的5年内开展10万例样本的新生儿基因检测,旨在构建中国新生儿基因组数据库,建立新生儿遗传病基因检测标准,促进新生儿遗传病基因检

《基因组研究》:首张猫基因组草图绘就

猫是研究人类失明和艾滋病模型之一,因此测序结果大有用处 一只名为“肉桂”(Cinnamon)的4岁雌性阿比西尼亚猫有幸成为第一只完成基因组测序草图的猫。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在内的基因组“俱乐部”。相关论文11月1日在线发表于《基因组研究》(Genome Research)杂

植物表型成像系统植物表型和植物表型组学的概念

  植物表型分析是理解植物基因功能及环境效应的关键环节,随着植物功能基因组学和作物分子育种研究的深入,传统的表型观测已经成为制约其发展的主要瓶颈,而高通量的植物表型组分析技术和植物表型组学研究是解决这一困境的有效途径。虽然植物表型组分析正在成为国内外研究的热点,相关概念仍然较为模糊,阻碍了这一新兴学

基因组构的定义

中文名称基因组构英文名称gene organization定  义(1)单个基因的组成结构。一般包含启动子、增强子、非翻译序列、编码序列等。真核生物和原核生物的一个显著区别是前者具有内含子。(2)广义指一个完整的生物个体内基因的组织排列方式。原核和真核生物的一个显著区别是原核生物的结构基因成串分布,

基因组文库法

基因组文库法一)基因组DNA分离、纯化和加工[Mbo I酶检测]1.准备1.5ml小试管4个;每管内含有:基因组DNA(在TE或水中)             10.0μg10×Mbo I缓冲液                         2.5μlH2O                    

基因组的定义

在分子生物学和遗传学领域,基因组是指生物体所有遗传物质的总和。这些遗传物质包括DNA或RNA(病毒RNA)。基因组包括编码DNA和非编码DNA、线粒体DNA和叶绿体DNA。研究基因组的科学称为基因组学。

基因组的分类

病毒基因组病毒基因组可以由RNA或DNA组成。 RNA病毒的基因组包含单链或双链RNA,也包含一种或多种单独的RNA分子。 DNA病毒基因组可以是单链或双链DNA。大多数DNA病毒基因组由单个线性DNA分子组成,但有些由DNA病毒基因组由环状DNA分子组成  。原核基因组原核生物和真核生物基因组由D

基因组印记

这是根据我写的一个PPT摘录的,希望能有朋友讨论这方面的问题。并拓宽这个领域,讨论epigenetics更广泛的问题。毕竟epigenetics是现在动物功能基因组研究的主流和一个重要方向。1. 印迹基因的概念及重要意义概念:基因组印迹是特指来源于亲本的等位基因进行不对称后成修饰后而导致的单等位基因

基因组构的定义

中文名称基因组构英文名称gene organization定  义(1)单个基因的组成结构。一般包含启动子、增强子、非翻译序列、编码序列等。真核生物和原核生物的一个显著区别是前者具有内含子。(2)广义指一个完整的生物个体内基因的组织排列方式。原核和真核生物的一个显著区别是原核生物的结构基因成串分布,

烟草基因组计划

生物技术和生命科学将成为21世纪引发新科技革命的重要推动力量。实施基因组计划可以获得一批具有自主知识产权的烟草重要性状功能基因,全面揭示种质资源的遗传背景,确立我国在烟草基因组研究上的核心优势,对提升烟草育种工作整体水平、实现烟草品种的根本性突破、培育烟草新兴产业、更好地发挥烟草模式作物的基础研究作