首个野生大豆高质量参考基因组被解析
近日,香港中文大学林汉明教授团队及华大基因等多家国内外机构合作完成了全球首个野生大豆高质量参考基因组解析,该成果为挖掘野生大豆遗传资源和改良、优化栽培大豆品种提供了重要工具。相关研究成果近日在线发表于《自然-通讯》。图片来源于网络 基因组信息是当前作物改良计划的重要基础。过往大豆基因组研究主要依赖美国科学家完成的栽培大豆Williams 82 的参照基因组进行,未能深入研究野生大豆独有的基因信息。虽然有野生大豆的基因组测序报告,但组装成的基因组包括大量碎片段,具有可读的基因序列连续性低,未有高质量、可作为野生大豆参考基因组的产生。 “大豆的基因组含大量的重复区,组装时困难重重,我们整合了几种最新测序方法产生的大量数据,才最终把问题解决。”林汉明告诉《中国科学报》。 他带领的团队在2010年率先完成了31个野生大豆和栽培大豆的测序,说明野生大豆的生物多样性和基因组研究对了解大豆的重要性;随后在2014年首次成功利用基因测......阅读全文
PacBio构建目前最高质量的植物基因组参考序列
来自中科院遗传与发育生物学研究所,四川农业大学的研究人员发表了题为“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章,对一个籼稻基因组蜀恢498(R498)进行PacBio单分子测序,结合遗传图谱和
水生所发布高质量AB品系斑马鱼参考基因组
斑马鱼是生命科学、健康科学和环境科学等研究领域的重要模式生物之一。常见的两种实验室斑马鱼品系分别是Tubingen品系和AB品系。其中,AB品系斑马鱼被国内外很多实验室作为研究对象。然而,却缺乏一个高质量的AB品系斑马鱼参考基因组。 由于不同品系斑马鱼来源不同,各品系之间存在着大量基因序列上的
Frontiers-in-Genetics首个非性逆转黄鳝高质量基因组参考图谱
中国水产科学研究院长江水产研究所水产养殖与遗传育种研究室科研人员在国际期刊《遗传学前沿》(Frontiers in Genetics)发表题为《Chromosome-Scale, Haplotype-Resolved Genome Assembly of Non-Sex-Reversal Fem
大豆进化与驯化表观遗传调控规律获揭示
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454973.shtm 近日,南京农业大学多倍体团队在《植物细胞》上发表研究论文。该研究整合三维基因组、染色质可及性、组蛋白修饰、DNA甲基化和转录组,深入解析了在大豆多倍化、二倍化与人工驯化过程中,三
首个三倍体栽培香蕉T2T参考基因组发布
近日,中国科学院华南植物园、热带作物生物育种全国实验室–中国农业科学院深圳农业基因组研究所和广西民族大学合作,首次报道了三倍体栽培香蕉的高质量分型参考基因组。相关成果在线发表于《园艺研究》。 香蕉是当今世界产量最高的水果。三倍体香蕉是全球栽培香蕉的主力军,其中Cavendish香蕉因为易于运输
具有独特浓郁风味的中国水蜜桃高质量参考基因组发布
近日,北京市农林科学院在《自然·通讯》上发表了研究论文,公布了具有独特浓郁风味的中国水蜜桃高质量参考基因组,阐释了以水蜜桃为代表的优质资源对于全球桃现代育成品种遗传贡献;揭示了桃风味改良过程中,东、西方对甜度趋同选择和酸度分化选择的模式,解析了重要基因在果实有机酸和可溶性糖积累中的功能。该研究提
《自然》发表中国人泛基因组参考图谱,26家单位联合研究
近日,复旦大学、西安交大、中国医学科学院等26家单位联合发布了中国人群泛基因组联盟(CPC)一期研究进展。6月14日,相关成果以《基于36个族群的中国人泛基因组参考图谱》为题发表于《自然》(Nature)主刊。这是我国学者领导的人群基因组研究首次发表在《自然》主刊。这项研究初步构建了我国人群的泛基因
遗传发育所等鉴定大豆百粒重调控基因
大豆是我国重要的粮食作物和经济作物,是植物蛋白和油分的重要来源。百粒重是大豆产量的重要构成因子,因此是大豆育种的重要目标性状。由于栽培大豆品种遗传基础狭窄,在育种过程中某些栽培大豆品种中优异等位的丢失,阻碍了大豆百粒重和产量的进一步增加。近年来研究人员对大豆百粒重遗传位点的研究较多,目前SoyB
香港与内地科学家协力发现野生大豆耐盐基因
香港中文大学(中大)团队与内地合作,通过野生大豆的基因图谱发现并复制出耐盐基因。这项由两地三代科学家共同努力的研究成果,将有利于培养大豆适应盐渍化等贫瘠土地环境,提高优质耐盐大豆产量,为中国及全球农业作出贡献。 中大大豆研究中心主任、生命科学学院教授林汉明教授在22日的发布会上介绍,由他领
植物所在大豆果实驯化生物学研究中取得突破
果实落粒抗性作为古代人类首先选择的重要农艺性状被认为是作物驯化的里程碑。栽培大豆是人类最重要的植物油和蛋白来源,其果实的裂荚抗性是重要的驯化性状。20世纪90年代以来,人们一直在利用多种手段试图找到这一性状的控制基因,但均未取得突破。 中国科学院植物研究所王印政研究组针对栽培大豆果实裂荚抗
植物所在大豆果实驯化生物学研究中取得突破
果实落粒抗性作为古代人类首先选择的重要农艺性状被认为是作物驯化的里程碑。栽培大豆是人类最重要的植物油和蛋白来源,其果实的裂荚抗性是重要的驯化性状。20世纪90年代以来,人们一直在利用多种手段试图找到这一性状的控制基因,但均未取得突破。 中国科学院植物研究所王印政研究组针对栽培大豆果实裂荚抗
中科院等发现不同作物驯化中存在基因平行选择
9月24日在《自然-遗传学(Nature Genetics)》在线发表的一篇论文中,中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员田志喜课题组、储成才课题组联合美国乔治亚大学教授Scott A. Jackson等研究团队,报道了一个种子休眠调控基因在不同科作物驯化中受到平行选择的现象,该成果加深了人们对
首个近完整黄瓜参考基因组及多组学综合数据库发布
近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队在黄瓜基因组学方面取得重要进展,首次完成接近完整的黄瓜参考基因组组装和基因注释,搭建了第一个黄瓜多组学综合数据库。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》(IF5 year = 21.4)上。黄瓜(Cucumis s
小小角苔-会“借”基因——首个高质量角苔参考基因组发布
中国科学院植物研究所研究员陈之端团队通过一系列精细设计的去污染流程,得到了119 Mb的芽胞角苔基因组组装结果,获得了第一个高质量的角苔参考基因组,填补了苔藓类植物相关研究的空白。相关成果2月10日作为封面文章在线发表于国际学术期刊《自然—植物》(Nature Plants)上。图片来源于网络
科学家首次发布银鲳高质量染色体水平参考基因组
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519516.shtm近日,中国科学院海洋研究所在银鲳基因组学研究方面取得新进展,首次发布了我国重要名贵经济鱼类——银鲳的高质量染色体水平参考基因组,相关研究成果在《自然》子刊《科学数据》在线发表。银鲳隶属
科学家构建出目前最高质量的植物基因组参考序列
随着PacBio单分子实时(SMRT)测序技术的发展,利用它已能够独立完成高质量基因组草图的组装。然而,这些草图序列中仍然存在多种错误,比如序列中会包含有很多嵌合体(即不同位置的序列连接到了一起)或是组装质量比较差的区域等,特别是重复序列区域有的没有组装出来,有的组装出来多个序列,而且这些错误通
利用PacBioRS绘制出棉花四倍体栽培种的参考基因组
来自华中农业大学棉花遗传改良团队的研究人员发表了题为“Referencegenome sequences of two cultivated allotetraploid cottons, Gossypiumhirsutum and Gossypium barbadense”的文章,介绍了整合多
我国科学家发布海带高质量染色体水平参考基因组
近日,中国科学院海洋研究所海藻种质库团队在大型海藻基因组学研究方面取得重要突破,成功构建了海带的高质量染色体水平参考基因组。该成果发表在国际期刊《科学数据》。这是该团队在海洋经济藻类基因组研究领域取得的又一重要成果,为海带的遗传改良和基因组学研究提供了关键资源。海带孤雌生殖孢子体基因组组装 海洋
一文读懂类胡萝卜素的合成——参考胡萝卜基因组
一、类胡萝卜素( carotenoids): 1.是有一系列共轭双键和甲基支链基本结构的一类高度不饱和化合物的总称,四萜化合物。典型的类胡萝卜素是由8个异戊二烯单位首尾相连形成。类胡萝卜素的颜色因共轭双键的数目不同而变化。共轭双键的数目越多, 颜色越偏向红色。 2.类胡萝卜素是体内维生素A的主要
中国获首个染色体级别橡胶树参考基因组图谱-利于育种
从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的染色体进化
血沉参考值和参考范围
1、魏氏法 (1)50岁:男性0~20mm/h,女性O~30mm/h. (3)>85岁:男性0~30mm/h,女性O~42mm/h. (4)儿童:O~1Omm/h 2、潘氏法:成人:男性0~1Omm/h,女性0~12mm/h.
使用自动型凯氏定氮仪测定桐柏野生大豆蛋白质含量
野生大豆分布在我国从寒温带到亚热带的广大地区,喜水耐湿,多生于山野以及河流沿岸、湿草地、湖边、沼泽附近或灌木丛中。近年来使用自动型凯氏定氮仪测定野生大豆的蛋白质含量发现,野生大豆含有丰富的蛋白质,而且其油脂含量低,有很高的营养价值。其貌不扬的野生大豆,蕴藏着各种可利用的抗性基因—如抗虫、
二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通量测
二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代
BMC-Plant-Biology测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆,野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱,碱,盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究,将有助于栽培大豆的遗传改良。近日,华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通
参考瓦
参考瓦 在反射测量中需要使用参考瓦,对于漫反射测量推荐使用WS-2参考瓦,对于镜面反射则推荐使用RS-2参考瓦。 WS-2白参考瓦由白色漫反射材料PTFE制成,可以满足对漫反射率要求很高的领域。WS-2大多被用于色度学应用,这类应用要求在反射测量时先测参考信号。由于PTF
补全中国人“拼图”-《自然》发表中国人群泛基因组参考图谱
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502872.shtm6月14日,《自然》期刊在线发表了西安交通大学、复旦大学、中国医学科学院等26家单位联合发布的中国人泛基因组联盟(CPC)一期研究进展——《基于36个族群的中国人泛基因组参考图谱》。人
历时6年-获首个染色体级别的橡胶树参考基因组图谱
记者16日从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的
两种南瓜基因组图谱绘制成功为育种改良提供遗传学参考
南瓜不仅是西方万圣节用来点缀节日的装饰,对世界上多数人来说,更是一种必不可少的营养主食。最新出版的10月刊《分子植物学》杂志以封面文章形式介绍了中美科学家的合作成果:他们对两种重要南瓜品种进行了完整基因组测序,不仅揭示了南瓜与众不同的进化史,更可为南瓜育种改良提供遗传学方面的参考。 据物理学家
科研人员绘制出陆地棉和海岛棉的参考基因组
解码棉花基因组能深入了解棉花种的起源进化及棉花重要农艺性状形成的遗传基础,华中农业大学棉花遗传改良团队联合海外研究团队,共同解析了异源四倍体栽培种陆地棉和海岛棉的参考基因组序列,为棉花基因组进化和功能基因研究提供了重要参考。国际权威期刊《自然-遗传学》3日在线发表了这一最新研究成果。 陆地棉和