BMCPlantBiology测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通量测序技术对铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因进行鉴定和系统分析，新发现了一批的野生大豆miRNA和其作用的靶基因*。该研究成果发表在10月刊的BMC Plant Biology上。 MicroRNA（miRNA）是一类调控真核生物广泛生理过程的内源性非编码小RNA，它的调控作用是通过降解靶mRNA或是阻碍其翻译来实现。植物miRNA通常与其靶基因完全或是近乎完全匹配，引起mRNA的降解。在植物中，miRNA参与调控发育全过程以及对生物或非生物胁迫的应答。要确定miRNA的功能就必须首先鉴定它们的靶基因。降解组测序是近......阅读全文
BMC－Plant－Biology测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通
二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆（Glycine soja）是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代高通量测
二代测序鉴定铝胁迫下野生大豆miRNA及其靶基因
野生大豆(Glycine soja)是世界上种植面积最广的作物之一。相比于栽培大豆，野生大豆能够更好地适应自然环境的胁迫如干旱，碱，盐胁迫。对野生大豆的性状进行系统研究，将有助于栽培大豆的遗传改良。近日，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室年海教授领衔的课题组联合使用第二代
四川农大：揭示miRNA调控玉米穗发育机制
microRNA(miRNAs)是一类内源性的非编码小RNA，在植物的多种生理过程中发挥重要调控作用，包括代谢，激素反应，转座子的表观遗传控制，胁迫应答。在模式植物如水稻和拟南芥中已进行了广泛的miRNA研究。在玉米中，胁迫应答相关miRNA和其靶基因的研究也已开展过很多。然而，关于miRNA参
华南植物园：荔枝果实衰老受miRNA调控
荔枝色泽鲜艳，营养丰富，具有较高的商业价值。然而，在采收后1-2天内荔枝就会变质，主要体现为果皮褐色。调控荔枝果实衰老的因素很复杂。MicroRNAs作为负调控因子参与了几乎所有的生理过程。在最新的一项研究中，中国科学院华南植物园植物资源保护与可持续利用重点实验室从miRNA水平探究了荔枝果实衰
如何预测和鉴定miRNA的靶基因
免疫沉淀当然，确定miRNA与mRNA之间的互作，我们还有更直接的方法，那就是从实验上寻找物理相互作用。我们可以利用RNA诱导沉默复合物（RISC）中的Argonaut（AGO）蛋白的抗体进行免疫共沉淀（co-IP）。目前更先进的方法是通过紫外线照射以交联复合物，然后开展深度测序以鉴定发现的RNA，
Chemical－Genomics－Approaches－in－Plant－Biology
Chemical genomics (i.e., genomics-scale chemical genetics) approaches are based on the ability of low-molecular-mass molecules to modify biologica
miRNA调控植物对镉的应激反应
土壤中的重金属污染是一个世界范围内严重的环境问题，主要是由于一些人为活动，如采矿，工业活动和有机磷的使用等造成。土壤中镉（Cd）可以很容易地被植物吸收，从而导致各种中毒症状，如降低生物量，叶片失绿，抑制根系生长，发生形态学改变，甚至植株死亡。大量研究表明，在植物中，microRNA（miRNA）参与
华南农大：miRNA调控植物对镉的应激反应
土壤中的重金属污染是一个世界范围内严重的环境问题，主要是由于一些人为活动，如采矿，工业活动和有机磷的使用等造成。土壤中镉（Cd）可以很容易地被植物吸收，从而导致各种中毒症状，如降低生物量，叶片失绿，抑制根系生长，发生形态学改变，甚至植株死亡。大量研究表明，在植物中，microRNA（miRNA
植物种质创新与特色农业重点实验室举行学术报告会
中科院植物种质创新与特色农业重点实验室举行第二场植物科学进展学术报告会 4月19日下午，中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室在武汉植物园举行了2011年第二场植物科学进展学术报告会。挪威农业与环境研究所刘继红博士和美国Clemson大学罗宏教授应邀分别作了题为Plastid b
江苏农科院：miRNA调控茄科抗盐胁迫
茄科包括许多重要的蔬菜作物，它们经常遭受盐胁迫。microRNA（miRNA）已被发现参与调控植物的基因表达来应答盐胁迫。然而，几乎没有关于茄科植物miRNA参与此类应答的报道。由江苏省农业科学院蔬菜研究所庄勇副研究员领衔的课题组采用小RNA测序技术对此展开了深入分析，研究成果发表在近期的Int
高通量快速验证miRNA靶基因
尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果，但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子，在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译
高立志博士担任BMC－Evolutionary－Biology副主编
昆明植物所高立志博士应邀担任BMC Evolutionary Biology副主编 应BMC Evolutionary Biology主编Herve Philippe教授的邀请，中国科学院昆明植物研究所国家大科学装置中国西南野生生物种质资源库副主任、植物种质资源与基因组学研究中心主任
科学家通过对野生大豆基因研究发现新型耐盐基因
由香港中文大学、华大基因等单位联合完成的野生大豆W05的全基因组测序工作，通过对野生大豆重要农业性状关联基因研究，发现了新的耐盐基因。7月10日，最新研究成果于《自然通讯》杂志在线发表。 大约6000至9000年前，我国就开始进行野生大豆的驯化。驯化过程中，大豆的栽培种丢失了很多与环境适应相关
测序解析miRNA调控害虫发育机制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫，据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼虫中的一组miRNA
中国农大:测序解析miRNA调控害虫发育机制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫，据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼
BMC－Biology：含Cas酶的新型转座子
转座子是一种可移动的遗传元件，能够在基因组的不同位点之间跳跃，这种DNA片段广泛存在于自然界的各种生物中。近日，科学家们在细菌和古生菌中发现了一类新型的转座子，这种转座子不仅含有Cas内切酶的编码基因，还依赖这种酶整合到新的基因组区域。 细菌一直在与病毒或入侵核酸（质粒）进行斗争，为此它们演化
整合RNA测序与ATAC测序：揭示耐盐水稻品种抗氧化防御机制，助力培育抗逆水稻新种
在广袤的农田里，水稻是人类重要的主食作物之一。然而，土壤盐渍化这一全球性难题，正严重威胁着水稻的生长与产量。据联合国粮食及农业组织相关数据显示，全球至少 10% 的土地受到盐渍化影响，这使得水稻在生长过程中面临诸多挑战。盐胁迫会导致水稻植株矮小、千粒重下降、小穗数量减少，最终造成产量大幅降低。在众多
Journal－of－Integrative－Plant－Biology－SCI影响因子上升至2.534
据美国汤森路透(Thomson Reuters)2012年6月28日发布的2011年度期刊引证报告(JCR)，Journal of Integrative Plant Biology(JIPB)的影响因子由2010年的1.603上升到2011年的2.534，在植物科学领域的190种刊物中
Genome－Biology发布菜豆基因组测序结果
菜豆（Phaseolus），是世界上最古老的作物之一。几千年前，它与玉米和木薯一起，在美国被驯养，成为世界性的主要主食。根据联合国粮食和农业组织（FAO）的研究显示，普通菜豆是最重要的粮食豆类，占世界食用豆类食品的50%，在超过5亿人的饮食中显得尤为重要。这种作物种植在拉丁美洲、非洲、中东、中国
学者提出参与香蕉冷胁迫响应的级联工作模型
中国科学院华南植物园果蔬保鲜技术研发与利用团队在国家自然科学基金、广东省自然科学基金等项目的资助下，在由microRNA介导的香蕉冷胁迫响应级联调控方面取得新进展。近日，相关成果发表于《分子园艺》（Molecular Horticulture）。 防控冷害一直是水果保鲜产业的技术难题，而解析冷
云序生物为你解密ATACseq研究方案
ATAC-seq最近几年是比较火的一种测序技术。那ATAC-seq技术到底什么呢？ATAC-seq的全称是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing, 运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的一种技术。该技术通过转座酶对某
著名学者朱健康Science子刊解析重要植物信号机制
来自中国科学院上海生命科学研究院、美国普渡大学等处的研究人员证实，ABA受体PYL8通过提高MYB77依赖性的生长素反应基因转录，促进了侧根生长。这一研究发现发表在6月3日的《科学信号》(Science Signaling)杂志上。 文章的通讯作者是中科院上海生命科学研究院的朱健康（Jian-
研究揭示水稻miR528积累的精细调控和抗RSV病毒机制
miRNA是调控植物生长、发育及环境适应性的一类重要转录后调节因子。中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组早期通过对水稻miRNA加工关键酶OsDCL1蛋白的研究，鉴定到了一系列重要的水稻miRNA成员（Liu et al., Plant Physiology, 2005）。其中，miR
张劲松研究团队发现大豆耐盐新机制
盐碱、干旱等非生物胁迫不利于作物生长，造成减产甚至导致植物死亡，是制约农业生产的主要环境因素。大豆是重要农作物，提高大豆耐盐能力有助于增强大豆对灾害的抵抗能力，并能利用低盐碱化土地增加种植面积，提高产量。最近，中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员张劲松研究团队发现核因子Y（Nuclear fa
研究发现控制大豆耐密株型的关键基因CSA1
华南农业大学农学院教授葛良法/蔡占东成功鉴定到控制大豆株型收敛性和耐密性的关键基因Compact Shoot Architecture 1（CSA1），并创制出耐密高产大豆新种质。相关成果近日发表于《植物通讯》（Plant Communications）。栽培大豆源自野生大豆。野生大豆具有分枝角度大
戚益军教授Cell子刊发布小RNA研究新发现
来自中国医学科学院、清华大学的研究人员在新研究中证实，在拟南芥中cma33 / XCT通过调节Dicer-Like（DCL）基因的转录调控了小RNA(sRNA)的生成。这一研究发现发表在8月刊的《分子植物》（Molecular Plant）杂志上。 现任职于中国医学科学院及清华大学的戚益军（Y
戚益军教授Cell子刊发布小RNA研究新发现
来自中国医学科学院、清华大学的研究人员在新研究中证实，在拟南芥中cma33 / XCT通过调节Dicer-Like（DCL）基因的转录调控了小RNA(sRNA)的生成。这一研究发现发表在8月刊的《分子植物》（Molecular Plant）杂志上。 现任职于中国医学科学院及
大豆基因组重测序表明:野生大豆遗传多样性更高
“中原有菽，庶民采之。”五千年前，华夏始祖将野生大豆驯化，变成今天的“五谷”之一。而今，一项被称为“大豆回家”的基因组研究计划在其故乡中国取得突破。 11月15日，由香港中文大学、华大基因研究院、农业部基因组重点实验室、中国农业科学院等单位合作完成的《31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和
武汉植物园调控葡萄抗寒性研究取得新进展
近日，武汉动物园园艺作物逆境生物学研究团队在VvbHLH036调控葡萄抗寒性研究中取得新进展，相关研究成果发表在Plant Physiology期刊。葡萄是全球范围内广泛栽培的果树之一，具有重要的经济价值。低温胁迫是葡萄生产中经常遭受的胁迫之一。研究葡萄低温应答机制将为改良葡萄抗寒性提供理论依据。b