小小角苔会“借”基因——首个高质量角苔参考基因组发布

中国科学院植物研究所研究员陈之端团队通过一系列精细设计的去污染流程,得到了119 Mb的芽胞角苔基因组组装结果,获得了第一个高质量的角苔参考基因组,填补了苔藓类植物相关研究的空白。相关成果2月10日作为封面文章在线发表于国际学术期刊《自然—植物》(Nature Plants)上。图片来源于网络 陈之端研究组于2008年启动了角苔基因组测序计划,经过多年攻关,终于在角苔基因组的解析上获得了突破。该研究通过系统发育基因组学分析进一步确定了苔藓类植物的单系性,并支持角苔类位于苔藓类分支的最基部。 研究人员发现,在植物登陆过程中,角苔可谓“轻装上阵”,具有一套与其简单的形态结构相匹配的低冗余度的小基因组;同时其基因组又不失功能的完备性,包含了与植物发育相关的基本转录调控工具包。与之相对,在角苔基因组当中与RNA编辑、UV耐受以及抗脱水等环境适应相关的基因家族却通过串联重复获得了扩张,同时角苔还受益于从土壤细菌和真菌转移而来的基因......阅读全文

小小角苔-会“借”基因——首个高质量角苔参考基因组发布

  中国科学院植物研究所研究员陈之端团队通过一系列精细设计的去污染流程,得到了119 Mb的芽胞角苔基因组组装结果,获得了第一个高质量的角苔参考基因组,填补了苔藓类植物相关研究的空白。相关成果2月10日作为封面文章在线发表于国际学术期刊《自然—植物》(Nature Plants)上。图片来源于网络 

我国学者攻破高质量角苔参考基因组

  苔藓类包括苔、藓和角苔三大分支,是现存最早的陆生植物,代表了植物演化过程中从水生到陆生的过渡类群。长久以来关于早期陆地植物的起源与植物登陆一直存在诸多争论和未解之谜。近年来,人们利用组学数据将早期陆地植物的系统位置争论聚焦到了角苔类上。角苔类以其难解的系统位置、衍生与原始兼具的形态特征、与细菌和

芸苔的概述

  芸薹(拉丁学名:Brassica campestrisL.),十字花科芸苔属植物。它为二年生草本,高30~90厘米,叶柄宽,长2~6厘米,基部抱茎。其总状花序在花期成伞房状,以后伸长;花鲜黄色,直径7~10毫米;萼片长圆形,长3~5毫米,直立开展,顶端圆形,边缘透明,稍有毛。它产于陕西、江苏、安

芸苔的简介

  芸薹(拉丁学名:Brassica campestrisL.),十字花科芸苔属植物。它为二年生草本,高30~90厘米,叶柄宽,长2~6厘米,基部抱茎。其总状花序在花期成伞房状,以后伸长;花鲜黄色,直径7~10毫米;萼片长圆形,长3~5毫米,直立开展,顶端圆形,边缘透明,稍有毛。它产于陕西、江苏、安

基因编辑技术让奶牛不长角

  在美国,每年近80%的奶牛的角要被移除,以保护操作工人和其他奶牛。不过,这一做法既痛苦又昂贵,因此受到动物权益保护者越来越多的关注。  如今,科学或许能施以援手:一群研究人员日前宣称,他们成功编辑了奶牛基因组,能使奶牛不长角。科学家利用转录激活子样效应因子核酸酶DNA编辑技术,将一种同不长角存在

科学家发表苔藓多样性、系统发育和适应性综述

近日,中国科学院植物研究所科研人员与合作者在《实验植物学杂志》上发表了基于基因组和转录组数据针对苔藓植物的多样性、系统发育和适应性研究的综述,该综述对目前已经发布的14个苔藓植物的基因组和151个苔藓植物的转录组进行了总结和梳理。 苔藓植物包括苔、藓和角苔三大分支,是现存最早的陆生植物,为

濒危植物报春苣苔交配系统转变基因组效应获揭示

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/10/488438.shtm 近日,中国科学院华南植物园植物科学研究中心研究员康明团队以苦苣苔科报春苣苔(Primulina tabacum)为对象,研究揭示了濒危植物报春苣苔交配系统由异交向自交转变的基因

首个葡萄完整参考基因组发布

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503617.shtm近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所作物组学大数据与应用创新团队联合国外科研团队,绘制了首个葡萄完整参考基因组图谱。研究成果以封面文章发表在《园艺研究》(Horticulture

首个葡萄完整参考基因组发布

  记者从中国农科院获悉, 该院的深圳农业基因组研究所作物组学大数据与应用创新团队联合国外科研团队,于近日绘制了首个葡萄完整参考基因组图谱。  该研究成果作为封面文章发表在《园艺研究(Horticulture Research)》上,以致敬沃森和克里克提出DNA双螺旋结构模型七十周年。  据介绍,该

芸苔素内酯的作用特性

  芸苔素内酯是甾体化合物中生物活性较高的一种,他们广泛存在于植物体内。在植物生长发育各阶段中,既可促进营养生长,又能利于受精作用。人工合成的芸苔素内酯活性较高,可经由植物的叶、茎、根吸收,然后传导到起作用的部位,有的认为可增加RNA聚合酶的活性,增加RNA、DNA含量,有的认为可增加细胞膜的电势差

华南植物园在报春苣苔属叶绿体基因组装研究取得进展

  报春苣苔属是典型的喀斯特岩溶洞穴植物,具有非常丰富的物种多样性和特有性,是研究喀斯特植物适应性进化和物种形成的理想模式。图1. 报春苣苔属叶绿体基因组一致性圈图  中科院华南植物园植物科学研究中心冯超博士等人在康明研究员的指导下,以报春苣苔属植物为材料,率先搭建了该属三个完整的叶绿体基因组并进行

-震惊!Genbank参考基因组序列多处错误!

 震惊!Genbank参考基因组序列多处错误!   随着基因组测序技术的飞速发展以及测序成本的快速降低,全基因组数据也在急速增加。尽管参考基因组数据是非常有价值的资源,但是由于测序过程中的外源污染或者研究者对数据组装方法的误用,使得基因组数据面临很多问题。  近日,约翰霍

Nature:系统解析斑马鱼参考基因组

  斑马鱼(Zebrafish)是研究发育生物学的新兴模式动物。斑马鱼由于具有饲育容易、胚胎透明、体外受精、突变种多、遗传学工具成熟等诸多优点,近年来已成为研究脊椎动物发育与人类遗传疾病的新兴模式动物。   近日,英国桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)

长瓣马铃苣苔的概述

  长瓣马铃苣苔(拉丁学名:Oreocharis auricula),别名绢毛马铃苣苔、绒毛马铃苣苔。苦苣苔科马铃苣苔属多年生无茎草本植物。  长瓣马铃苣苔叶全部基生,具柄;叶长圆状椭圆形,上面被贴伏短柔毛,下面被淡褐色绢状绵毛至近无毛,花序梗被褐色绢状绵毛;聚伞花序2次分枝,苞片长圆状披针形;花梗

芸苔素内酯的实用功效

  具有生根、促进生长、提苗、壮苗、保苗、黄叶病叶变绿、促进受精、保花保果、促进果实膨大早熟、减轻病害缓解药害、协调营养平衡、抗旱抗寒、降低作物体内农药残留、增强作物抗逆性等多重功能。对因重茬、病害、药害、冻害等原因造成的死苗、烂根、立枯、猝倒现象急救效果显著,施用12—24小时即明显见效,迅速恢复

长瓣马铃苣苔的简介

  长瓣马铃苣苔(拉丁学名:Oreocharis auricula),别名绢毛马铃苣苔、绒毛马铃苣苔。苦苣苔科马铃苣苔属多年生无茎草本植物。  长瓣马铃苣苔叶全部基生,具柄;叶长圆状椭圆形,上面被贴伏短柔毛,下面被淡褐色绢状绵毛至近无毛,花序梗被褐色绢状绵毛;聚伞花序2次分枝,苞片长圆状披针形;花梗

什么是长瓣马铃苣苔

  长瓣马铃苣苔(拉丁学名:Oreocharis auricula),别名绢毛马铃苣苔、绒毛马铃苣苔。苦苣苔科马铃苣苔属多年生无茎草本植物。  长瓣马铃苣苔叶全部基生,具柄;叶长圆状椭圆形,上面被贴伏短柔毛,下面被淡褐色绢状绵毛至近无毛,花序梗被褐色绢状绵毛;聚伞花序2次分枝,苞片长圆状披针形;花梗

华大基因构建全球首个小鼠肠道微生物参考基因集

  2015年9月28日,中国深圳—深圳华大基因研究院、哥本哈根大学等研究机构共同构建了全球首个小鼠肠道微生物参考基因集,为以小鼠为基础的人类疾病模型研究提供有益参考。最新研究成果今日在线发表于《自然生物技术》。  人类的肠道中居住着种类繁多,数量惊人的微生物,而在这些微生物中,细菌的比例高达90%

基因组学研究重建苔类植物演化历程获突破

深圳市仙湖植物园研究团队与合作者使用转录组数据,首次对苔类目级系统框架进行了重建,得到了高支持的系统发育树。相关研究9月8日在线发表于Annals of Botany。该论文第一作者为深圳市仙湖植物园董珊珊副研究员,通讯作者为刘阳研究员。深圳市仙湖植物园张力研究员,深圳华大生命科学研究院联合培养研究

单分子测序轻松升级参考基因组

  现代基因组学的最大需求之一,就是得到人类和模式生物的高质量完成基因组。目前,人们利用二代测序技术对越来越多的物种(从原核生物到真核生物)进行了基因组测序,取得了许多重要的研究成果。   不过大部分物种的基因组还中存在有大量的缺口gap,就目前的数据来说,各种已测序物种的基因组中缺口gap所占的

一种全新的人类参考基因组

  人类基因组计划是人类最伟大的胜利之一。这项计划所产生的基因组图谱也成为参考基因组,沿用至今。然而,据MIT Technology Review报道,一些研究人员认为这种方法已经过时了。  如今,科学家正在酝酿一种新的通用图谱。他们表示,这将结合数百人甚至数千人的基因组来创造一个能反映全人类的真正

无缺口组装!水稻完整参考基因组发布

  近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合海南崖州湾实验室、中国水稻研究所、中国农科院作物科学研究所和扬州大学等多个单位发布完整的水稻参考基因组,实现了全基因组所有染色体端粒到端粒无缺口组装,为水稻育种研究提供了新的有力工具和重要大数据基础。相关研究成果发表在《分子植物》(Molecular

染色体水平冬瓜参考基因组发布

近日,广东省农业科学院蔬菜研究所发布了染色体水平冬瓜参考基因组。相关研究发表于Scientific Data,广东省农业科学院蔬菜研究所副研究员罗文龙和副研究员闫晋强为该论文共同第一作者,广东省农业科学院蔬菜研究所研究员江彪为通讯作者。广东省农业科学院蔬菜研究所于2019年对黑皮大冬瓜B227进行基

我国科研团队发布水稻完整参考基因组

水稻是重要的粮食作物,其基因组组装对水稻育种意义重大。23日,记者从中国农业科学院深圳农业基因组研究所获悉,该所联合崖州湾实验室、中国水稻研究所、中国农科院作物科学研究所和扬州大学等多个单位发布完整的水稻参考基因组,实现了全基因组所有染色体端粒到端粒无缺口组装,为水稻育种研究提供了新的有力工具和重要

长瓣马铃苣苔的理化鉴别

  1、取该品粉末(40目)1g,加甲醇10ml置水浴上加热浸渍10分钟,过滤。取滤液1ml,加三氯化铁试液1滴,溶液显蓝绿色至蓝黑色。(鞣质)  2、薄层层析  样品制备:取该品粉末(40目)1g,加乙醚10ml,回流10分钟,过滤。取滤液5ml,挥去乙醚,加甲醇0.5ml溶解,点样20μl。对照

长瓣马铃苣苔的性状鉴别

  根茎呈类圆柱形而稍扁,略弯曲,长10~30cm,直径1~2cm。表面棕灰色至棕黑色,具密集而稍隆起的环节,节间长1~6~11mm,节上有的有棕黑色叶基残存,并有皱缩条纹及凹点状或突起的根痕。质坚实而脆,易折断,折断面类白色或粉红色,粉性,近边缘有类白色点状维管束环列,一侧点稍大,另一侧点较小,有

长瓣马铃苣苔的形态特征

  多年生草本。  叶全部基生,具柄;叶片长圆状椭圆形,长2-8.5厘米,宽1-5厘米,顶端微尖或钝,基部圆形或稍心形,或近楔形,边缘具钝齿至近全缘,上面被贴伏短柔毛,下面被淡褐色绢状绵毛至近无毛,侧脉每边7-9条,在下面隆起,密被褐色绢状绵毛;叶柄长2-4厘米,密被褐色绢状绵毛。  聚伞花序2次分

长瓣马铃苣苔的分布范围

  产广东、广西西北部、江西、湖南、贵州(梵净山)及四川(秀山)。  生于山谷、沟边及林下潮湿岩石上,海拔400-1600米。  模式标本采自江西庐山。

瓶中基因联盟将于明年初发布参考材料-首发基因型

  作为一个致力于研究人类基因组测序参考材料的团体,瓶中基因联盟(Genome in a Bottle Consortium)计划于明年初发布其首个试点参考材料、高度表征的HapMap样本以及一组高度可信的基因组检测。   该团体最近发布了一组基于公开提供的测序数据之分析进行的高度可信的基因组

高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析完成

9月22日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位,成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱,构建了栽培和野生豌豆泛基因组,解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构,为揭示豌豆起源驯化,以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支撑。