双杂交和其他双成分系统实验(三)
第三阶段 阳性相互作用的再次确定材料缓冲液和溶液乙酸铵(7.5 ml/L)氯仿乙醇异丙醇裂解液酶解酶 100T 以 2~5 mg/ml 溶解于拯救缓冲液中或β-葡糖醛酸酶 100000 单位/ml(Sigma)按 1:50 稀释于拯救缓冲液中每次使用均需配置新鲜的溶液。酚(早衡至 pH8.0)拯救缓冲液50 mmol/LTris-Cl(pH7.5)10 mmol/LEDTA0.3%β-巯基乙醇每次使用均需配置新鲜的溶液。SDS(10%,m/V)STES 裂解液100 mmol/LNaCl10 mmol/L Tris-Cl(pH8.0)1 mmol/LEDTA0.1%(m/V)SDSTE(pH8.0)酶和缓冲液限制性内切核酸酶 Eco RI,XtoⅠ,Hae Ⅲ凝胶琼脂糖凝胶请参见步骤 5。培养基CM 选择培养基利用表 18-3 估计所需培养基的量,并根据表 18-9 制备所需的选择培养基。无氨基酸的酵母氮源(YNB)......阅读全文
酵母双杂交系统逆双杂交系统的介绍
在研究蛋白质的结构功能特点、作用方式过程中,有时还要通过突变、加抑制剂等手段破坏蛋白质间的相互作用。针对实际工作中的这种需要,Vidal等人发展了所谓的逆双杂交系统(reverse two-hybrid system)。这项技术的关键是报道基因URA3的引入。URA3基因在这里起到了反选择的作用
酵母双杂交系统
· Yeast Two-Hybrid System (Finley Lab)This is one of the most comprehensive and detailed guide to yeast two-hybrid system technique with intro
酵母双杂交实验
实验概要本实验构建了Bait载体和prey载体,酵母双杂交后,应用CPRG法定量测试了蛋白质相互作用。实验步骤1. Bait载体的构建将高保真PCR扩增的OsCCTlb(引物为OsCCT1bEcoRI5'和OsCCTlbXhoI3')和OsCNTlb(引物为OsCNTlb Eco
酵母双杂交系统简介
酵母双杂交系统酵母双杂交系统是在真核模式生物酵母中进行的,研究活细胞内蛋白质相互作用,对蛋白质之间微弱的、瞬间的作用也能够通过报告基因的表达产物敏感地检测得到,它是一种具有很高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术。大量的研究文献表明,酵母双杂交技术既可以用来研究哺乳动物基因组编码的蛋白质之间的互作,也可
酵母双杂交系统的应用
酵母双杂交系统能在体内测定蛋白质的结合作用,具有高度敏感性。主要是由于:①采用高拷贝和强启动子的表达载体使杂合蛋白过量表达。②信号测定是在自然平衡浓度条件下进行, 而如免疫共沉淀等物理方法为达到此条件需进行多次洗涤,降低了信号强度。③杂交蛋白间稳定度可被激活结构域和结合结构域结合形成转录起始复合物而
简述酵母双杂交系统的应用
酵母双杂交系统能在体内测定蛋白质的结合作用,具有高度敏感性。 主要是由于: ①采用高拷贝和强启动子的表达载体使杂合蛋白过量表达。 ②信号测定是在自然平衡浓度条件下进行, 而如免疫共沉淀等物理方法为达到此条件需进行多次洗涤,降低了信号强度。 ③杂交蛋白间稳定度可被激活结构域和结合结构域结合
关于酵母双杂交系统的简介
酵母双杂交系统是将待研究的两种蛋白质分别克隆(融合)到酵母表达质粒的转录激活因子(如GAL4等)的DNA结合结构域(DNA-BD)和转录激活域(AD)上,构建成融合表达载体,从表达产物分析两种蛋白质相互作用的系统。
酵母双杂交系统的技术步骤
1.将待测基因与Gal4或LexA或其他合适蛋白的DNA结合域融合构建诱饵质粒;2.将诱饵质粒转化缺乏报告基因启动子的酵母细胞株中,选择被转化的酵母;3.再将文库质粒转化到酵母中;4.通过报告基因的功能筛选相互作用的蛋白。
酵母双杂交系统的研究过程
Fields等人的工作标志双杂交系统的正式建立。他们以与调控SUC2基因有关的两个蛋白质Snf1和Snf2为模型,将前者与Gal4的BD结构域融合,另外一个与Gal4的AD结构域的酸性区域融合,由BD和AD形成的融合蛋白一般分别称之为“诱饵”(bait)和“猎物”或靶蛋白(prey or targe
双杂交系统的定义和应用
中文名称双杂交系统英文名称two-hybrid system定 义分别带有转录激活功能域与DNA结合功能域的两个杂合蛋白在酵母细胞内相互作用重组成转录因子,可报告基因转录表达,从而检测蛋白质之间相互作用的一种实验系统。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
酵母双杂交系统的实验步骤
酵母双杂交系统的实验步骤 1. 将报告基因p8op-LacZ转化酵母EGY48菌株,用培养基SD/-Ura筛选。2. 同时构建DNA文库,并纯化足够的质粒以转化酵母细胞。3. 构建DNA-BD/靶蛋白质粒pLexA-X,作为钓饵(bait)。4. 将上述钓饵质粒pLexA-X转化EGY48(p8op
逆双杂交系统的应用介绍
在研究蛋白质的结构功能特点、作用方式过程中,有时还要通过突变、加抑制剂等手段破坏蛋白质间的相互作用。针对实际工作中的这种需要,Vidal等人发展了所谓的逆双杂交系统(reverse two-hybrid system)。这项技术的关键是报道基因URA3的引入。URA3基因在这里起到了反选择的作用,它
酵母双杂交实验常见问题
酵母双杂交实验常见问题 1.如果诱饵蛋白对酵母细胞是有毒的,该怎么办? 在某些情况下,在液体培养基中培养不好的菌珠可以在固体培养基上生长得很好。首先重悬克隆于1ml的SD/–Trp,接着将重悬液平铺于5 个100-mm的SD/–Trp平板,在30℃下温浴,直至平板上的克隆相互粘在一起。用5ml 0
酵母双杂交系统的研究过程
Fields等人的工作标志双杂交系统的正式建立。他们以与调控SUC2基因有关的两个蛋白质Snf1和Snf2为模型,将前者与Gal4的BD结构域融合,另外一个与Gal4的AD结构域的酸性区域融合,由BD和AD形成的融合蛋白一般分别称之为“诱饵”(bait)和“猎物”或靶蛋白(prey or tar
简述酵母双杂交系统的技术步骤
1.将待测基因与Gal4或LexA或其他合适蛋白的DNA结合域融合构建诱饵质粒; 2.将诱饵质粒转化缺乏报告基因启动子的酵母细胞株中,选择被转化的酵母; 3.再将文库质粒转化到酵母中; 4.通过报告基因的功能筛选相互作用的蛋白。
酵母双杂交系统的发展和应用
随着对多种重要生物的大规模基因组测序工作的完成,基因工程领域又迎来了一个新的时代---功能基因组时代。它的任务就是对基因组中包含的全部基因的功能加以认识。生物体系的运作与蛋白质之间的互相作用密不可分,例如:DNA合成、基因转录激活、蛋白质翻译、修饰和定位以及信息传导等重要的生物过程均涉及到蛋白质复合
双杂交系统的技术方法和应用
双杂交系统是在体内检测蛋白-蛋白相互作用的极强有力方法。 双杂交系统的基础是在一些转录因子上发现的模域(modular domains):一个DNA结合域,它可以结合一段特异的DNA序列,和一个转录激活域,这个转录激活域与基础转录机制相作用。一个转录激活域联合一个DNA结合域可能在TATA盒启动RN
关于酵母双杂交系统的发展介绍
发展起来的各种双杂交系统大多是以Fields等人建立的系统为基础的。这些新系统主要对报道基因、“诱饵”表达载体以及“猎物”表达载体等做了一些改进。其中一个重要改进是引入额外的报道基因,如广泛采用的HIS3基因。经过改造带有HIS3报道基因的酵母细胞,只有当HIS3被启动表达才能在缺乏组氨酸的选择
LexA酵母双杂交系统的设计原理
LexA酵母双杂交系统的设计原理 报告质粒p8op-LacZ的GAL4 UAS编码序列被完全去除,因此在缺乏LexA融合激活剂的情况下,报告基因LacZ的转录活性为零,该基因的筛选标志为URA3,可以作为有自主复制能力的质粒存在于酵母EGY48菌株中,也可以被整合到EGY48基因组DNA上。质粒p
酵母双杂交检测的原理及应用
检测原理:酵母双杂交系统(Yeast two-hybrid assay)是用于体内研究蛋白相互作用的一种非常便利的工具,常用的如GAL4为基础的系统,使用酵母转录因子GAL4来检测转录激活后的蛋白相互作用。某些转录因子(如GAL4)由两个可以分开,功能上相互独立的结构域组成,N端有一个147个氨
酵母双杂交实验常见疑难解答
问:如果诱饵蛋白对酵母细胞是有毒的,该怎么办?答:在有些情况下,在液体培养基中培养不好的菌珠可以在固体培养基上生长得很好。重悬克隆于1ml的SD/–Trp,接着将重悬液平铺于5 个100-mm的SD/–Trp平板。在30℃下温浴,直至平板上的克隆互相粘在一起。用5ml 0.5X YPDA刮下每块板上
酵母双杂交原理(蛋白相互作用)
概述酵母双杂交系统由Fields和Song等首先在研究真核基因转录调控中建立。典型的真核生长转录因子, 如GAL4、GCN4、等都含有二个不同的结构域: DNA结合结构域(DNA-binding domain)和转录激活结构域(transcription-activating domain)。前者
酵母双杂交系统的基本内容介绍
酵母双杂交系统(Yeast two-hybrid system)的建立是基于对真核生物调控转录起始过程的认识。细胞起始基因转录需要有反式转录激活因子的参与。反式转录激活因子,例如酵母转录因子 GAL4在结构上是组件式的(modular),往往由两个或两个以上结构上可以分开,功能上相互独立的结构域
双杂交和其他双成分系统实验
实验材料 载体和酵母菌 试剂、试剂盒 缓冲液和溶液 SDS 凝胶上样缓冲液 SDS 聚丙烯酰胺凝胶
酵母双杂交系统的功能特点和应用
酵母双杂交系统是将待研究的两种蛋白质分别克隆(融合)到酵母表达质粒的转录激活因子(如GAL4等)的DNA结合结构域(DNA-BD)和转录激活域(AD)上,构建成融合表达载体,从表达产物分析两种蛋白质相互作用的系统。
双杂交和其他双成分系统实验(一)
实验材料 载体和酵母菌试剂、试剂盒 缓冲液和溶液SDS 凝胶上样缓冲液SDS 聚丙烯酰胺凝胶核酸和寡核苷酸抗体培养基仪器、耗材 专用设备实验步骤 第一阶段 诱饵-LexA 融合蛋白的鉴定材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到适当浓度。2XSDS 凝胶上样缓冲液100 mmol/L Tris-Cl(pH6.
双杂交和其他双成分系统实验(二)
方法诱饵-LexA 融合蛋白的构建1.将编码诱饵蛋白的靶 DNA 克隆到 LexA 融合载体(如,pMW101 或 pMW103) 的多聚接头处,以合成一种框架内的 LexA 融合基因。确定诱饵序列的羧基端存在翻译终止序列。形成的质粒作为 pBait。2. 采用下列 LexA 融合基因和报道质粒的组
双杂交和其他双成分系统实验(二)
第二阶段 筛选一个相互作用子材料缓冲液和溶液将贮存液稀释至适当的浓度二甲基亚砜(DMSO)乙醇可选择,请参见步骤 9。冻存转化体用的无菌甘油溶液65% 无菌甘油0.1mol/LMgS0425 mmol/L Tris-Cl(pH8.0)TE(pH7.5)(无菌)TE(pH7.5),含 0.1mol/
双杂交和其他双成分系统实验(五)
离心机和转子Sorvall RT6000 离心机,H1000B MPC 和 H6000A MPC 转子(离心微量滴定板用)专用设备玻璃珠(直径 0.45 mm, 无菌;Sigma)微量滴定板(24 孔或 96 孔 [可选])重复用移液管可选,请参见步骤 1。附加试剂此方案的步骤 2 需要第 1 章方
双杂交和其他双成分系统实验(三)
第三阶段 阳性相互作用的再次确定材料缓冲液和溶液乙酸铵(7.5 ml/L)氯仿乙醇异丙醇裂解液酶解酶 100T 以 2~5 mg/ml 溶解于拯救缓冲液中或β-葡糖醛酸酶 100000 单位/ml(Sigma)按 1:50 稀释于拯救缓冲液中每次使用均需配置新鲜的溶液。酚(早衡至 pH8.0)拯救