放射性标记的探针与固定在膜上的核酸的Southern杂交
Southern 杂交获得的信号强度取决于若干因素,包括固定的 DNA 与探针互补的比例、探针的大小及特异活性以及转移到膜上的基因组 DNA 的数量。在最佳条件下,这种方法的敏感度足以检测到与 32P 标记的高度特异(>109 cpm/μg)的探针互补的<0.1 pg 的 DNA。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理Southern 杂交获得的信号强度取决于若干因素,包括固定的 DNA 与探针互补的比例、探针的大小及特异活性以及转移到膜上的基因组 DNA 的数量。在最佳条件下,这种方法的敏感度足以检测到与 32P 标记的高度特异(>109 cpm/μg)的探针互补的 <0.1 pg 的 DNA。实验材料固定于膜上的 DNA无菌水配的 poly (A) RNADNA 或 RNA 探针鲑鱼精 DNA试剂、试剂盒磷酸-SDS 洗液预杂交 杂交液水相......阅读全文
Southern杂交的基本概念
Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则特异性地杂交形成双链。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,
Southern杂交技术的方法和步骤
Southern杂交可用来检测经限制性内切酶切割后的DNA片段中是否存在与探针同源的序列,它包括下列步骤:(1) 酶切DNA, 凝胶电泳分离各酶切片段,然后使DNA原位变性。(2) 将DNA片段转移到固体支持物(硝酸纤维素滤膜或尼龙膜)上。(3) 预杂交滤膜,掩盖滤膜上非特异性位点。(4) 让探针与
关于Southern杂交的探针标记简介
用于Southern印迹杂交的探针可以是纯化的DNA片段或寡核苷酸片段。探针可以用放射性物质标记或用地高辛标记,放射性标记灵敏度高,效果好;地高辛标记没有半衰期,安全性好。人工合成的短寡核苷酸可以用T4多聚核苷酸激酶进行末端标记。探针标记的方法有随机引物法、切口平移法和末端标记法。
痘苗DNA检测实验——Southern-杂交法
实验方法原理以前,用 HindIII 限制性内切核酸酶消化鉴定痕苗病毒 DNA。大部分的外源基因插入重组病毒的 TK 基因中,TK 基因位于 HindIII 5.1 kb 的 J 片段上。这样在重组病毒中,如果插入片段上没有 HindIII 内切酶位点,则J片段就会增大。如果缺乏 HindIII 5
southern印迹杂交的方法步骤
以哺乳动物基因组DNA为例,介绍Southern印迹杂交的基本步骤。一、 待测核酸样品的制备(一)制备待测DNA基因组DNA是从动物组织(或)细胞制备。1.采用适当的化学试剂裂解细胞,或者用组织匀浆器研磨破碎组织中的细胞;2.用蛋白酶和RNA酶消化大部分蛋白质和RNA;3.用有机试剂(酚/氯仿)抽提
关于Southern杂交的转膜的介绍
即将凝胶中的单链DNA片段转移到固相支持物上。而此过程最重要的是保持各DNA片段的相对位置不变。DNA是沿与凝胶平面垂直的方向移出并转移到膜上,因此,凝胶中的DNA片段虽然在碱变性过程已经变性成单链并已断裂,转移后各个DNA片段在膜上的相对位置与在凝胶中的相对位置仍然一样,故而称为印迹(blot
基因组DNA-Southern杂交操作步骤
1)基因组DNA Southern印迹的制备 预备 1.用适当的限制性内切酶消化基因组DNA样品(10μg)。 2.进行琼脂糖凝胶电泳。一般用0.7~1.0%的琼脂糖凝胶分离基因组DNA,它在1~15kb的范围内有较好的分辨率,可选用TBE或TAE缓冲液。琼脂糖凝胶电泳需在1V/cm的电
Southern杂交的基本原理介绍
转印后的滤膜在预杂交液中温育4-6h,即可加入标记的探针DNA(探针DNA预先经加热变性成为单链DNA分子),即可进行杂交反应。杂交是在相对高离子强度的缓冲盐溶液中进行。杂交过夜,然后在较高温度下用盐溶液洗膜。离子强度越低,温度越高,杂交的严格程度越高,也就是说,只有探针和待测顺序之间有非常高的
Southern杂交待测核酸样品的制备
(一)制备待测DNA 基因组DNA是从动物组织(或)细胞制备。1.采用适当的化学试剂裂解细胞,或者用组织匀浆器研磨破碎组织中的细胞;2.用蛋白酶和RNA酶消化大部分蛋白质和RNA;3.用有机试剂(酚/氯仿)抽提方法去除蛋白质。 (二) DNA限制酶消化 基因组DNA很长,需要将其切割成大小
Southern杂交一般操作方法
一 基因组酶切和电泳在200 μl 微量离心管中加入:25 μl DNA样品(约10μg),3μl 限制性内切酶(MBI,10 U/ μl)5 μl 相应的10×buffer,补水到50μl。然后加一滴矿物油覆盖, 稍微离心后放于37℃水浴8-12小时。酶切完后,取5μl 酶切DNA样品于0.8%的
关于Southern杂交的洗膜的介绍
取出NC膜,在2×SSC溶液中漂洗5min,然后按照下列条件洗膜: 2×SSC/0.1% SDS,42℃,10min; 1×SSC/0.1% SDS,42℃,10min; 0.5×SSC/0.1% SDS,42℃,10min; 0.2×SSC/0.1% SDS,56℃,10min; 0
northern,southern,western杂交的具体步骤
所用于分析的对象不同。 Northern杂交用于分析RNA; Southern杂交用于分析DNA; Western杂交用于分析蛋白质。大致过程如下: (1) 酶切DNA, 凝胶电泳分离各酶
southern印迹杂交的基本概念
Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则特异性地杂交形成双链。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干
Southern-杂交操作步骤及注意事项
Southern 杂交是分子生物学的经典实验方法。其基本原理是将待检测的DNA样品固定在固相载体上,与标记的核酸探针进行杂交,在与探针有同源序列的固相DNA的位置上显示出杂交信号。通过Southern杂交可以判断被检测的DNA样品中是否有与探针同源的片段以及该片段的长度。该项技术广泛被应用在遗传病
Southern-Blot杂交的原理、步骤及应用
原理Southern印迹杂交技术是分子生物学领域中最常用的具体方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原 则形成双链,此杂交过程是高度特异的。由于核酸分子的高度特异性及检测方 法的灵敏性,综合凝胶电泳和 核酸内切限制酶分析的结果,便可绘制出DNA分子的限制图
Southern杂交电泳凝胶预处理的原理
DNA样品在制备和电泳过程中始终保持双链结构。为了进行有效地实现Southern印迹转移,对电泳凝胶做预处理十分必要。分子量超过10kb的较大的DNA片段与较短的小分子量DNA相比,需要更长的转移时间。所以为了使DNA片段在合理的时间内从凝胶中移动出来,必须将最长的DNA片段控制在大约2kb以下
Southern印迹杂交实验原理和方法3
真空转移法的最大优点是迅速,可在转膜的同时进行DNA变性与中和整个过程约需30~60分钟。但在操作中应注意两个问题,一是真空压力不能太大,若压力过大,凝胶被压缩,转移效率会降低;二是真空转移液要密封严,防止漏气影响压力的产生。下表列出了不同的印迹方法。表10-2 不同印迹方法的比较表五、探针标记用于
Southern印迹杂交实验原理和方法1
实验原理核酸分子杂交技术是分子生物学领域中最常用的具体方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。由于核酸分子的高度特异性及检测方法的灵敏性,综合凝胶电泳和核酸内切限制酶分析的结果,便可绘制出DNA分子的限制图谱。但为了进一
Southern印迹杂交实验原理和方法2
(一) 细管虹吸印迹法此法是利用浓盐酸转移缓冲液的推动作用将凝胶中的DNA转移到固相支持物上,转移方式见图10-1:容器中的转移缓冲液含有高浓度的NaCl和柠檬酸钠,上层吸水纸的虹吸作用使缓冲液通过滤纸桥、滤纸、凝胶、硝酸纤维素膜或尼龙膜向上运动,同时带动凝胶中的DNA片段垂直向上运动而滞留在膜上。
Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验
Southern 印迹 放射性标记的探针与固定化核酸进行杂交 实验方法原理 硝酸纤维膜或尼龙滤膜对单链DNA的吸附能力很强,当电泳后凝胶经过DNA变
Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验
实验材料 基因组 DNA试剂、试剂盒 限制性缓冲液仪器、耗材 琼脂糖凝胶实验步骤 1. 7~20 μg 基因组 DNA 稀释到 500 μl 合适的限制性缓冲液中。4℃ 过夜。2. 每管加 10~20 单位限制性酶。孵育 4~6 小时。10 μl 消化液在小琼脂糖凝胶上电泳检测消化的程度。如果需要,
Southern杂交电泳凝胶预处理的基本步骤
1. 如果靶序列>5kb,则需进行脱嘌呤处理。 (1) 把凝胶浸在0.25mol/L HCl中,室温轻轻晃动,直到溴酚蓝从蓝变黄。 注意:处理人类基因组DNA≤10分钟;处理植物基因组DNA≤20分钟。 (2) 把凝胶浸在灭菌双蒸水中 2. 如果靶序列
核酸杂交技术(Northern-Blot、Southern-Blot和探针标记)
(一)Southern Blot原理:将待检测的DNA分子用/不用限制性内切酶消化后,通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,继而将其变性并按其在凝胶中的位置转移到硝酸纤维素薄膜或尼龙膜上,固定后再与同位素或其它标记物标记的DNA或RNA探针进行反应。如果待检物中含有与探针互补的序列,则二者通过碱基互补的原理进
Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验
放射性标记的探针与固定化核酸进行杂交试剂、试剂盒预杂交液SSCSDS仪器、耗材硝酸纤维素滤膜实验步骤1. 准备适合即将进行的工作的杂交溶液。每平方厘米硝酸纤维素滤膜或尼龙膜大约需要 0.2 ml 预杂交液。预杂交液:用于检测低丰度序列:或者6x SSC ( 或 6x SSPE)5 x Denhard
outhern印迹及基因组DNA杂交技术实验——Southern-印迹
实验方法原理硝酸纤维膜或尼龙滤膜对单链DNA的吸附能力很强,当电泳后凝胶经过DNA变性处理,覆以上述滤膜,再于其上方压上多层干燥的吸水纸,借助它对深盐溶液的上吸作用,凝胶上的单链DNA将转移到滤膜上。转移是原位的,即DNA片段的位置保持不变。转移结束后,经过80℃烘烤的DNA,将原位地固定于膜上。实
核酸蛋白转移电泳及杂交(Southern-Blot、Northern-Blot和...2
(10)倒去预杂交液,加入含探针的杂交液封口,42℃ 6h或过夜。 (11)取出转移膜,按以下条件洗膜 1×SSC,0.1%SDS室温2×15分钟 0.25SSC,0.1%SDS,42℃ 2×15分钟,气中干燥。 (12)将杂交后的膜曝光于X光片,暗盒中放射自显影2~
核酸蛋白转移电泳及杂交(Southern-Blot、Northern-Blot和...1
一、DNA Southern Blot及杂交 本技术可用于基因组DNA特定序列定位,尤其可分析某些基因的限制性内切酶长度多态性,对遗传性疾病的早期基因诊断、产前诊断或基因变异等方面的研究有应用价值,其过程包括:样品DNA内切酶水解、水解片断的琼脂糖凝胶电泳分离、分离后水解片断的转移(固定)、特异
分子生物学里的Northern-Southern杂交的原理
①Southern印迹杂交:用于分析DNA,包括两个主要过程:一是印迹,即将待测定核酸分子通过一定的方法转移并结合到一定的固相支持物(硝酸纤维素膜或尼龙膜)上;二是退火,与固定于膜上的同位素标记的探针进行分子杂交,并进行显影观察,这样即可查找所需DNA的位点.②Northern印迹杂交:将RNA从琼
基本方案2-直接-Southern-杂交检测异常扩增和甲基化实验
实验材料基因组DNA试剂、试剂盒5 X 限制性缓冲液10 X Ficoll载样缓冲液1 X TAE 缓冲液变性缓冲液转性缓冲液中性缓冲液杂交缓冲液仪器、耗材Whatman 3MM 滤纸Nytran SuPercharge Turboblotter Rapid Downward Transfer 系统
Southern-Blot
1. Run gel (0.8 -1.0% agarose is best). For yeast chromosomal Southerns, digest 20 μg DNA. Use 50 ml minigel for most purposes. Photograph gel, but mi