Southern杂交电泳凝胶预处理的原理
DNA样品在制备和电泳过程中始终保持双链结构。为了进行有效地实现Southern印迹转移,对电泳凝胶做预处理十分必要。分子量超过10kb的较大的DNA片段与较短的小分子量DNA相比,需要更长的转移时间。所以为了使DNA片段在合理的时间内从凝胶中移动出来,必须将最长的DNA片段控制在大约2kb以下。DNA的大片段必须被打成缺口以缩短其长度。因此,通常是将电泳凝胶浸泡在0.25mol/L 的HCl溶液短暂的脱嘌呤处理之后,移至于碱性溶液中浸泡,使DNA变性并断裂形成较短的单链DNA片段,再用中性pH的缓冲液中和凝胶中的缓冲液。这样,DNA片段经过碱变性作用,亦会使之保持单链状态而易于同探针分子发生杂交作用。......阅读全文
Southern杂交电泳凝胶预处理的原理
DNA样品在制备和电泳过程中始终保持双链结构。为了进行有效地实现Southern印迹转移,对电泳凝胶做预处理十分必要。分子量超过10kb的较大的DNA片段与较短的小分子量DNA相比,需要更长的转移时间。所以为了使DNA片段在合理的时间内从凝胶中移动出来,必须将最长的DNA片段控制在大约2kb以下
Southern杂交电泳凝胶预处理的基本步骤
1. 如果靶序列>5kb,则需进行脱嘌呤处理。 (1) 把凝胶浸在0.25mol/L HCl中,室温轻轻晃动,直到溴酚蓝从蓝变黄。 注意:处理人类基因组DNA≤10分钟;处理植物基因组DNA≤20分钟。 (2) 把凝胶浸在灭菌双蒸水中 2. 如果靶序列
Southern杂交分析原理和操作
【原理】Southern杂交是分子生物学的经典实验方法。其基本原理是将待检测的DNA样品固定在固相载体上,与标记的核酸探针进行杂交,在与探针有同源序列的固相DNA的位置上显示出杂交信号。通过Southern杂交可以判断被检测的DNA样品中是否有与探针同源的片段以及该片段的长度。一.基因组DNA的限制
Southern杂交
Southern杂交可用来检测经限制性内切酶切割后的DNA片段中是否存在与探针同源的序列,它包括下列步骤: (1) 酶切DNA, 凝胶电泳分离各酶切片段,然后使DNA原位变性。 (2) 将DNA片段转移到固体支持物(硝酸纤维素滤膜或尼龙膜)上。 (3) 预杂交滤膜,掩盖滤膜上非特异性
Southern杂交
实验概要本实验介绍了Southern杂交的基本流程。主要试剂细菌基因组DNA抽提试剂盒,限制性内切酶,变性溶液,中和溶液,10 X SSC,杂交缓冲液(200mM磷酸钠缓冲液,PH7.2,1 mM EDTA,50%甲酞胺,1% BSA,7% SDS),随机引物标记试剂盒,洗脱缓冲液(2 X SSC,
Southern-Blot杂交的原理、步骤及应用
原理Southern印迹杂交技术是分子生物学领域中最常用的具体方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原 则形成双链,此杂交过程是高度特异的。由于核酸分子的高度特异性及检测方 法的灵敏性,综合凝胶电泳和 核酸内切限制酶分析的结果,便可绘制出DNA分子的限制图
Southern杂交的基本原理介绍
转印后的滤膜在预杂交液中温育4-6h,即可加入标记的探针DNA(探针DNA预先经加热变性成为单链DNA分子),即可进行杂交反应。杂交是在相对高离子强度的缓冲盐溶液中进行。杂交过夜,然后在较高温度下用盐溶液洗膜。离子强度越低,温度越高,杂交的严格程度越高,也就是说,只有探针和待测顺序之间有非常高的
Southern-杂交鉴定
1) 取10ul待测DNA,于一定浓度的琼脂糖凝胶上进行电泳。(20mL,1.0%凝胶,)2) 凝胶用溴化乙锭染色,切掉凝胶四周多余部分,并在凝胶的一角作一记号, 拍照记录电泳结果(拍照时, 凝胶旁放一尺子)。3) 杂交用胶的制备 (做以下步骤两组合一)A. 将凝胶浸没入30mL 0.25mol
Southern杂交技术
SOUTHERN BLOT1. Run the gel as normal. Often for genomic southerns it is desirable to run long gels (18cm) over 4-6hrs.2. Photograph the gel with a r
Southern杂交步骤
Southern杂交可用来检测经限制性内切酶切割后的DNA片段中是否存在与探针同源的序列,它包括下列步骤:(1) 酶切DNA, 凝胶电泳分离各酶切片段,然后使DNA原位变性。(2) 将DNA片段转移到固体支持物(硝酸纤维素滤膜或尼龙膜)上。(3) 预杂交滤膜,掩盖滤膜上非特异性位点。(4) 让探针与
southern杂交与northern杂交的区别
研究的对象不同。southern主要的对象是DNA,northern研究的对象是RNA。Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上。
southern杂交与northern杂交的区别
研究的对象不同。southern主要的对象是DNA,northern研究的对象是RNA。Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上。
Southern-blot杂交鉴定
1)取10ul待测DNA,于一定浓度的琼脂糖凝胶上进行电泳。(20mL,1.0%凝胶,)2) 凝胶用溴化乙锭染色,切掉凝胶四周多余部分,并在凝胶的一角作一记号, 拍照记录电泳结果(拍照时, 凝胶旁放一尺子)。3) 杂交用胶的制备 (做以下步骤两组合一)A.将凝胶浸没入30mL 0.25mol/L H
Southern印迹杂交
实验原理核酸分子杂交技术是分子生物学领域中zui常用的具体方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。由于核酸分子的高度特异性及检测方法的灵敏性,综合凝胶电泳和核酸内切限制酶分析的结果,便可绘制出DNA分子的限制图谱。但为
Southern-杂交技术1
Southern技术是指以Southern名字命名的DNA转移杂交技术。它可用于基因组特定DNA序列的定位,可以测定相关片段的同源性、可以从c库、基因组文库中筛选完整基因等。用一种或多种限制性内切酶对基因组DNA加以切割,通过琼脂糖凝胶电泳分离酶切片段,随后,使DNA在原位变性,并从凝胶转移至固相膜
Southern杂交实验2
③转移按凝胶的大小剪裁NC膜或尼龙膜并剪去一角作为标记,水浸湿后,浸入转移液中5min。剪一张比膜稍宽的长条Whatman 3mm滤纸作为盐桥,再按凝胶的尺寸剪3-5张滤纸和大量的纸巾备用。按下图所示进行转移。(转移过程一般需要8-24hr,每隔数hr换掉已经湿掉的纸巾。转移液用20×SSC。注
Southern-杂交技术2
三:操作(一)转膜1电泳2切胶 在紫外下,切取凝胶有条带部分3脱嘌啉0.25NHCL浸泡凝胶10分钟,蒸馏水洗胶(大于15kb的DNA片段转移时做此步骤)4变性,变性液(0.5MNaOH、1.5MNaCL)浸泡凝胶2次,每次15分钟,蒸馏水洗胶5中和,中和液(0.5Mtris-HCL,pH7.0、3
Southern杂交实验1
[实验原理] Southern 杂交是分子生物学的经典实验方法。其基本原理是将待检测的DNA样品固定在固相载体上,与标记的核酸探针进行杂交,在与探针有同源序列的固相DNA的位置上显示出杂交信号。通过Southern杂交可以判断被检测的DNA样品中是否有与探针同源的片段以及该片段的长度。
关于Southern杂交的预杂交的介绍
将固定于膜上的DNA片段与探针进行杂交之前,必须先进行一个预杂交的过程。因为能结合DNA片段的膜同样能够结合探针DNA,在进行杂交前,必须将膜上所有能与DNA结合的位点全部封闭,这就是预杂交的目的。预杂交是将转印后的滤膜置于一个浸泡在水浴摇床的封闭塑料袋中进行,袋中装有预杂交液,使预杂交液不断在
southern杂交分析的作用
由于核酸分子杂交的高度特异性及检测方法的灵敏性,它已成为分子生物学中最常用的基本技术,被广泛应用于基因克隆的筛选,酶切图谱的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突变的检测等。其基本原理是具有一定同源性的原条核酸单链在一定的条件下(适宜的温室度及离子强度等)可按碱基互补原成双链。杂交的双方是待测核酸序
Southern杂交的结果分析
在膜上阳性反应呈带状。实验中应注意以下问题:转膜必需充分,要保证DNA已转到膜上。杂交条件及漂洗是保证阳性结果和背景反差对比好的关键。洗膜不充分会导致背景太深,洗膜过度又可能导致假阴性。若用到有毒物质,必需注意环保及安全。 (1)出现斑点 解决方法:①加热至合适的温度;离心或过滤除去颗粒。②
分子杂交技术Southern杂交的操作步骤
(1) 约50μl体积中酶切10pg-10μg的DNA, 然后在琼脂糖凝胶中电泳12-24小时(包括DNA分子量标准物)。 (2) 500ml水中加入25μl 10mg/ml溴化乙锭,将凝胶放置其中染色30分钟, 然后照相。 (3) 依次用下列溶液处理凝胶,并轻微摇动: 500ml 0.2m
分子杂交技术Southern杂交的相关介绍
Southern杂交可用来检测经限制性内切酶切割后的DNA片段中是否存在与探针同源的序列,它包括下列步骤: (1) 酶切DNA, 凝胶电泳分离各酶切片段,然后使DNA原位变性。 (2) 将DNA片段转移到固体支持物(硝酸纤维素滤膜或尼龙膜)上。 (3)预杂交滤膜,掩盖滤膜上非特异性位点。
Southern印迹杂交实验原理和方法3
真空转移法的最大优点是迅速,可在转膜的同时进行DNA变性与中和整个过程约需30~60分钟。但在操作中应注意两个问题,一是真空压力不能太大,若压力过大,凝胶被压缩,转移效率会降低;二是真空转移液要密封严,防止漏气影响压力的产生。下表列出了不同的印迹方法。表10-2 不同印迹方法的比较表五、探针标记用于
Southern印迹杂交实验原理和方法2
(一) 细管虹吸印迹法此法是利用浓盐酸转移缓冲液的推动作用将凝胶中的DNA转移到固相支持物上,转移方式见图10-1:容器中的转移缓冲液含有高浓度的NaCl和柠檬酸钠,上层吸水纸的虹吸作用使缓冲液通过滤纸桥、滤纸、凝胶、硝酸纤维素膜或尼龙膜向上运动,同时带动凝胶中的DNA片段垂直向上运动而滞留在膜上。
Southern印迹杂交实验原理和方法1
实验原理核酸分子杂交技术是分子生物学领域中最常用的具体方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。由于核酸分子的高度特异性及检测方法的灵敏性,综合凝胶电泳和核酸内切限制酶分析的结果,便可绘制出DNA分子的限制图谱。但为了进一
核酸蛋白转移电泳及杂交(Southern-Blot、Northern-Blot和...1
一、DNA Southern Blot及杂交 本技术可用于基因组DNA特定序列定位,尤其可分析某些基因的限制性内切酶长度多态性,对遗传性疾病的早期基因诊断、产前诊断或基因变异等方面的研究有应用价值,其过程包括:样品DNA内切酶水解、水解片断的琼脂糖凝胶电泳分离、分离后水解片断的转移(固定)、特异
核酸蛋白转移电泳及杂交(Southern-Blot、Northern-Blot和...2
(10)倒去预杂交液,加入含探针的杂交液封口,42℃ 6h或过夜。 (11)取出转移膜,按以下条件洗膜 1×SSC,0.1%SDS室温2×15分钟 0.25SSC,0.1%SDS,42℃ 2×15分钟,气中干燥。 (12)将杂交后的膜曝光于X光片,暗盒中放射自显影2~
分子杂交——Southern基因检测
实验概要将待检测的DNA样品固定在固相载体上,与标记的核酸探针进行杂交,在与探针有同源序列的固相DNA的位置上显示出杂交信号。通过Southern杂交可以判断被检测的DNA样品中是否有与探针同源的片段以及该片段的长度。该项技术广泛被应用在遗传病检测、DNA指纹分析和PCR产物判断等研究中。但由于该技
小麦Southern杂交分析方法
预杂交液的制备:根据要杂交的膜的数量配制预杂交液,每25 ml预杂交液(1~2张膜)的成分组成如下: H2O 15 ml 20×SSPE 6