Southern印迹杂交实验原理和方法1
实验原理核酸分子杂交技术是分子生物学领域中最常用的具体方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。由于核酸分子的高度特异性及检测方法的灵敏性,综合凝胶电泳和核酸内切限制酶分析的结果,便可绘制出DNA分子的限制图谱。但为了进一步构建出DNA分子的遗传图,或进行目的基因序列的测定以满足基因克隆的特殊要求,还必须掌握DNA分子中基因编码区的大小和位置。有关这类数据资料可应用Southern印迹杂交技术获得。Southern 印迹杂交技术包括两个主要过程:一是将待测定核酸分子通过一定的方法转移并结合到一定的固相支持物(硝酸纤维素膜或尼龙膜)上,即印迹(blotting);二是固定于膜上的核酸同位素标记的探针在一定的温度和离子强度下退火,即分子杂交过程。该技术是1975年英国爱丁堡大学的 E.M.Southern首创的,Southern印迹杂交故因此而得名......阅读全文
Southern印迹杂交实验原理和方法1
实验原理核酸分子杂交技术是分子生物学领域中最常用的具体方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。由于核酸分子的高度特异性及检测方法的灵敏性,综合凝胶电泳和核酸内切限制酶分析的结果,便可绘制出DNA分子的限制图谱。但为了进一
Southern印迹杂交实验原理和方法3
真空转移法的最大优点是迅速,可在转膜的同时进行DNA变性与中和整个过程约需30~60分钟。但在操作中应注意两个问题,一是真空压力不能太大,若压力过大,凝胶被压缩,转移效率会降低;二是真空转移液要密封严,防止漏气影响压力的产生。下表列出了不同的印迹方法。表10-2 不同印迹方法的比较表五、探针标记用于
Southern印迹杂交实验原理和方法2
(一) 细管虹吸印迹法此法是利用浓盐酸转移缓冲液的推动作用将凝胶中的DNA转移到固相支持物上,转移方式见图10-1:容器中的转移缓冲液含有高浓度的NaCl和柠檬酸钠,上层吸水纸的虹吸作用使缓冲液通过滤纸桥、滤纸、凝胶、硝酸纤维素膜或尼龙膜向上运动,同时带动凝胶中的DNA片段垂直向上运动而滞留在膜上。
Southern印迹杂交
实验原理核酸分子杂交技术是分子生物学领域中zui常用的具体方法之一。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。由于核酸分子的高度特异性及检测方法的灵敏性,综合凝胶电泳和核酸内切限制酶分析的结果,便可绘制出DNA分子的限制图谱。但为
southern印迹杂交的方法步骤
以哺乳动物基因组DNA为例,介绍Southern印迹杂交的基本步骤。一、 待测核酸样品的制备(一)制备待测DNA基因组DNA是从动物组织(或)细胞制备。1.采用适当的化学试剂裂解细胞,或者用组织匀浆器研磨破碎组织中的细胞;2.用蛋白酶和RNA酶消化大部分蛋白质和RNA;3.用有机试剂(酚/氯仿)抽提
Southern-Blotting实验原理、操作步骤和注意事项1
对于大的基因组,DNA酶切图谱凭肉眼是分辨不开的(EB染色),因为大小不等的分子呈现弥散分布,只有借助灵敏的放射性同位素(或其他化学发光物质),将靶DNA在凝胶上(膜上)的带型通过特定的探针与之杂交,转换成X光片上直观的带型,才能进行相关分析。另外如果需要鉴定或寻找与已知DNA同源的 DNA片段
Southern-Blot-实验流程(包括原理/细节)1
一、DNA 的提取人和哺乳动物细胞基因组DNA的分离通常是在有EDTA、Sarkosye等一类去污剂存在下,用蛋白酶K消化细胞,随后用酚、氯仿抽提,经RNase 处理和纯化来提取DNA。(1)取单层细胞,经无钙、镁PBS洗一次,用0.25%胰蛋白酶消化,细胞悬液经PBS洗2次,弃上清,取细胞沉淀。(
Southern-Blot实验原理及方法
实验原理:Southern Blot是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,
Southern杂交实验1
[实验原理] Southern 杂交是分子生物学的经典实验方法。其基本原理是将待检测的DNA样品固定在固相载体上,与标记的核酸探针进行杂交,在与探针有同源序列的固相DNA的位置上显示出杂交信号。通过Southern杂交可以判断被检测的DNA样品中是否有与探针同源的片段以及该片段的长度。
southern印迹杂交的基本概念
Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则特异性地杂交形成双链。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干
Southern-blot实验方法和操作步骤
第一天 (restriction enzyme digestion)1.取待測的genomic DNA,用二次水稀釋10倍(30μl的DNA 加270μlddH2O→ 300μl)2.換算genomic DNA濃度(OD260),再換算取10μg所需的體積。3.取10μg DNA,用限制酵素EcoR
Southern杂交分析原理和操作
【原理】Southern杂交是分子生物学的经典实验方法。其基本原理是将待检测的DNA样品固定在固相载体上,与标记的核酸探针进行杂交,在与探针有同源序列的固相DNA的位置上显示出杂交信号。通过Southern杂交可以判断被检测的DNA样品中是否有与探针同源的片段以及该片段的长度。一.基因组DNA的限制
沉淀反应实验原理、材料和实验方法(1)
可溶性抗原(如血清中的蛋白,组织浸出液,细胞裂解液等)与其相应的抗体在溶液中或凝胶中结合,若比例合适,可形成肉眼可见的抗原-抗体复合物,这就是免疫沉淀反应。免疫沉淀反应可以在小玻璃管中或毛细玻璃管及凝胶平板中进行。在用凝胶平板做实验时,常用琼脂糖凝胶做介质,有的加电流,使反应更快更灵敏。一、环状沉淀
沉淀反应实验原理、材料和实验方法(1)
可溶性抗原(如血清中的蛋白,组织浸出液,细胞裂解液等)与其相应的抗体在溶液中或凝胶中结合,若比例合适,可形成肉眼可见的抗原-抗体复合物,这就是免疫沉淀反应。免疫沉淀反应可以在小玻璃管中或毛细玻璃管及凝胶平板中进行。在用凝胶平板做实验时,常用琼脂糖凝胶做介质,有的加电流,使反应更快更灵
Southern-Blotting实验原理、操作步骤和注意事项2
按先将水和DNA 按反应体系所需的量取至一1.5毫升离心管中,混匀,短暂离心至管底,放至100℃干浴中变性10 min,变性探针迅速置于冰浴上 5 min,按反应体系将反应混合液(dNTP,Random primer,Klenow )加入变性DNA中,在同位素操作台上,加入32P 标记的dN
Southern-杂交技术1
Southern技术是指以Southern名字命名的DNA转移杂交技术。它可用于基因组特定DNA序列的定位,可以测定相关片段的同源性、可以从c库、基因组文库中筛选完整基因等。用一种或多种限制性内切酶对基因组DNA加以切割,通过琼脂糖凝胶电泳分离酶切片段,随后,使DNA在原位变性,并从凝胶转移至固相膜
Southern印迹技术原理和操作步骤
实验原理:Southern印迹是将DNA片断从电泳凝胶上直接转移至膜支持物(如硝酸纤维素膜、尼龙膜)上,使DNA片断固定的技术。先将DNA经限制性内切酶消化成一系列片段,进行琼脂糖凝胶电泳,各片段因分子量不同而彼此分开,然后经碱处理凝胶,使DNA的片段被变性、中和并通过毛细作用在高盐缓冲液中在原位将
Southern-Blot原理及操作方法
原理:将待检测的DNA分子用/不用限制性内切酶消化后,通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,继而将其变性并按其在凝胶中的位置转移到硝酸纤维素薄膜或尼龙膜上,固定后再与同位素或其它标记物标记的DNA或RNA探针进行反应。如果待检物中含有与探针互补的序列,则二者通过碱基互补的原理进行结合,游离探针洗涤后用自显影或
Southern-Blot-实验流程(包括原理/细节)2
)标记探针检测取标记产物和普通PCR扩增产物各1μl,1.0%的琼脂糖凝胶电泳。由于大分子量的DIG掺入,标记产物泳动速度比普通PCR产物要慢。所以根据电泳图就可以判断是否标记上和有没有非特异标记!其余标记产物-20℃保存。如果要准确检测标记效率(一般不必),取标记产物1μl和Dig标记的对照DNA
Southern-Blot-实验流程(包括原理/细节)3
3)杂交:排尽预杂交液,在8.0ml 新Hyb 高效杂交液(Hyb-100)加入4.0μl 新变性好的探针(1-3ul/膜,5-20ng/ml杂交液),混匀。65℃杂交仪中杂交过夜(8-15转/分)。4)杂交完成后,将杂交液回收置于一可耐低温又可耐沸水浴的管中,贮存于-70℃以备重复使用。重复使用时
DNA印迹杂交分析实验
实验方法原理 本方案适合于用100~1 000 bp 长的放射性标记的DNA探针对Southern转印、斑点及狭线印迹进行杂交分析。实验材料 DNA试剂、试剂盒 SDSSSC仪器、耗材 水浴锅培养箱实验步骤 用6×SSC润湿带有固定了的DNA的膜。2. 将膜的DNA面朝上置于杂交管中,ATP溶
DNA印迹杂交分析实验
放射标记法 实验方法原理 本方案适合于用100~1 000 bp 长的放射性标记的DNA探针对Southern转印、斑点及狭线印迹进行杂交分析。
Southern-blot实验方法与步骤
用于检测重组DNA,也可分析DNA样品中是否有与探针序列同源的DNA片段。用于基因诊断,也可验证检测片段的分子量大小。将基因组DNA经限制性内切酶酶切,进行琼脂糖电泳,把分离后定位在凝胶上的不同分子量的DNA经碱变性处理,将凝胶中变性的DNA转移至一固相支持滤膜。利用标记的某一DNA、RNA或寡核苷
Southern-blot实验方法与步骤
用于检测重组DNA,也可分析DNA样品中是否有与探针序列同源的DNA片段。用于基因诊断,也可验证检测片段的分子量大小。将基因组DNA经限制性内切酶酶切,进行琼脂糖电泳,把分离后定位在凝胶上的不同分子量的DNA经碱变性处理,将凝胶中变性的DNA转移至一固相支持滤膜。利用标记的某一DNA、RNA或寡核苷
Southern-blot实验
Southern blot可应用于:(1)检测重组DNA;(2)分析DNA样品中是否有与探针序列同源的DNA片段;(3)验证检测片段的分子量大小。实验方法原理具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则特异性地杂交形成双链。利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶
Southern-blot实验
实验方法原理 互补的核苷酸序列通过Walson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链分子DNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。杂交的双方是所使用探针和要检测的核酸。该检测对象可以是克隆化的基因组DNA,也可以是细胞总DNA 或总RN
Southern-印迹实验
实验方法原理 本方案是专门为将琼脂糖凝胶印迹至不带电荷或带正电荷的尼龙膜上而设计的,稍作修改后同样可用于硝酸纤维素膜方法。实验材料 DNA试剂、试剂盒 HClNaClTrisNaOHSSC溴化乙锭仪器、耗材 电泳仪紫外透射仪实验步骤 一、向上毛细管转移法的转移叠层系统::图一、向上毛细管转移法的转移
Southern-印迹实验
印迹法 碱性缓冲液法 向下毛细管转移法 电转印法 实验方法原理 本方案是专门为将琼脂糖凝胶印迹至不带电荷或带正电荷的尼龙膜上而设
Southern-blot实验
实验方法原理 具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则特异性地杂交形成双链。利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线
Southern印迹法的原理和功能特点
Southernblot的基本原理是:硝酸纤维膜或尼龙滤膜对单链DNA的吸附能力很强,当电泳后凝胶经过DNA变性处理,覆以上述滤膜,再于其上方压上多层干燥的吸水纸,借助它对深盐溶液的上吸作用,凝胶上的单链DNA将转移到滤膜上。转移是原位的,即DNA片段的位置保持不变。转移结束后,经过80℃烘烤的DN