5.3NorthernBlot(一)
NorthernBlot 是一项用于检测特异性 RNA 的技术, 在变性琼脂糖凝胶中将 RNA 分子按大小分开后,将其转移至硝酸纤维素膜或尼龙膜上,用一个放射性同位素标记或酶标记 DNA 或 RNA 榇针与固定的 RNA 进行杂交。探针通过配对序列仅与特异的 RNA 结合,杂交 RNA 的大小和 RNA 量可通过放射性肖显影或酶促反应的颜色来显示。试剂、试剂盒20XMOPS 缓冲液20XSSC50XDenhardt 液杂交液10%SDS仪器、耗材水平电泳装置水浴硝酸纤维素膜或尼龙膜3 MM 滤纸紫外交联仪杂交管杂交炉[32P] 标记的 DNA 或 RNA 探针实验步骤一、材料与设备1) 水平电泳装置2) 水浴3) 硝酸纤维素膜或尼龙膜4)3 MM 滤纸5) 紫外交联仪6) 杂交管7) 杂交炉8)[32P] 标记的 DNA 或 RNA 探针9)20XMOPS 缓冲液:4l.86 gMOPS,8 g 乙酸钠,72 gEDTA,加 D......阅读全文
Northern杂交
实验概要本实验介绍了Northern杂交的基本流程。主要试剂液氮,TRIzol (Invitrogen),DEPC水,氯仿,异丙醇,70%酒精,酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),水饱和酚(PH4.3),无水乙醇,NaOAc,抽提缓冲液(0.02M NaOAc,1 mM EDTA,0.5% SD
Northern杂交
Northern杂交1.在10~20 ml 预杂交液中68℃温育膜2h。2.若使用双链探针,在100℃下加热32P标记的双链DNA 5 min,使之变性,然后迅速移至冰水中冷却。3.把变性的或单链放射性标记的探针直接加到预杂交液中,在合适的温度下继续温育12~16h。4.杂交后,将膜从塑料袋中取出,
Northern杂交
实验方法原理 转移并固定到膜上的 RNA 样品可以与特异的探针杂交,从而用来对所感兴趣的 RNA 进行定位。视实验人员和条件的差异,可以从多种方法中选择任意一种来标记和检测探针。用抑制非特异吸收探针的封闭试剂处理膜之后,在适于探针和固定的
Northern杂交技术
经乙二醛和二甲基亚砜变性处理后进行的RNA电泳这一方法原于McMaster和Carmichael(1977)。 含有乙二醛-DMSO的凝胶比含有甲醛的凝胶更难于进行电泳,因为前者泳动速率较慢而且需将电泳液时行循环以避免电泳过程中形成过高的H+梯度。尽管上述两种凝胶具有近乎相等的分辨率(Miller,
Northern印迹和总RNA杂交实验——Northern印迹分析
试剂、试剂盒甲醛凝胶溶液RNA 电泳缓冲液仪器、耗材凝胶模梳齿凝胶用具实验步骤1. 用肥皂和水彻底清洗凝胶模,梳齿和凝胶用具。2. 准备甲醛凝胶溶液。甲醛凝胶溶液(300 ml 1% 琼脂糖凝胶):琼脂糖,3.0 g10x RNA 电泳缓冲液,30 ml Milli-Q 或用玻璃器皿蒸馏过的
Northern杂交试验指导手册(6)-Northern-印迹杂交
A. 探针准备DIG标记的RNA探针与DNA探针相比,显示较强的杂交信号和较地的非特异性背景,因此,只要可能选用RNA探针可以比DNA探针获得更好的杂交结果。如果必须使用DNA探针,建议使用高SDS杂交缓冲液或DIG Easy Hyb以减少背景。在正式杂交试验之前,优化杂交探针浓度是避免颜色背景所必
OsAGAP的Northern杂交
实验概要本实验参照Sambrook等(1989)的方法进行转膜,杂交。实验步骤1. RNA样品的电泳转膜将适量的琼脂糖溶于水,微波炉加热使之完全溶解,并冷却至60℃;将甲醛溶液、琼脂糖水溶液、5X甲醛凝胶电泳缓冲液按1:3.5:1.1比例混合,灌制凝胶。将不同材料的上样量调成一致,均为35ug,与样
Northern-印迹分析实验
试剂、试剂盒 琼脂糖凝胶 菌落裂解缓冲液 蒸馏水 甲醛 甲酰胺预杂交 杂交液 HotPrime cDNA Labeling Kit
Northern-印迹分析实验
试剂、试剂盒 琼脂糖凝胶菌落裂解缓冲液蒸馏水甲醛甲酰胺预杂交 杂交液HotPrime cDNA Labeling Kit矿物油MOPS 缓冲液MOPS乙酸钠EDTAPCR 缓冲液SSCNaClSDSNaClNaH2PO4[a-32P]dATPLgh Rgh 引物鲑鱼精 DNATaq DNA
Northern-blotting操作步骤
1. 取RNA2. 将电泳槽和板,梳齿浸泡在3%H2O2中20-30分钟,并吹干3. 跑 1%琼脂糖凝胶,检测样本RNA含量4. 变性胶在桌面上利用保险膜铺出一块干净的区域,将1.95g 琼脂糖加入 110ml 的 DEPC-H2O (加热前可在三角瓶上做一个记号,在加热后把蒸发的水分补足)加热
Northern-印迹分析实验
为了确认所选择 cDNA 确实是差异表达的,建议使用 Northern 印迹分析,而不要用其他的确认技术,比如反向 Northern 杂交(Zhangetal.1996) 或定量 RT-PCR。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒琼脂糖凝胶菌落裂解缓冲液蒸馏水甲
组织印迹的Northern杂交
组织印迹的Northern杂交1)硝酸纤维素膜或尼龙膜上的组织印迹1.在塑料板上放置两层Whatman 1号滤纸,在滤纸上方放上一张普通纸,然后铺上一层尼龙膜。2.用双面刀片从植物组织如大豆的茎上切取一块切片(厚度约为1mm)。如果组织表面是湿的,则在Kimwipes纸上轻轻吸干或先用蒸馏水洗涤几秒
我作NORTHERN的心得
我们试验室作NORTHERN的一些总结,欢迎指正,谢谢。Northern杂交准备物品:50ml量筒1个 100ml量筒1个 300ml烧杯1个 250ml 烧杯1个 250ml的锥形瓶1个 10ml 离心管2个 大小盘各1个 镊子1把 剪刀1把 DEPC水500ml 2,瓶玻璃棒1根 电泳槽、转膜槽
Northern-Blotting反应方法步骤
Northern杂合反应的步骤主要包括:(1) 加入核酸探针,使与固定于尼龙膜上的特定RNA 进行杂合反应;(2) 待杂合反应结束后以含盐缓冲液与SDS 洗掉非专一性结合于尼龙膜上的核酸探针。 进行反应时应注意下列几个问题:a. 实验操作过程仍应尽可能避免RNase 的污染;b. 反应前应先进行杂合
Northern-protocol(RULES-FOR-RNA-WORK)
1. Wear gloves at all time including filling pipet tip in racks, filling jars with Eppendorf tubes, and weighing chemicals to prepare solution
Northern杂交试验指导手册
Northern杂交试验指导手册DIG标记的Northern杂交试验指导一、 RNA提取方法一、改良异硫氰酸胍提取法试剂及其配制异硫氰酸胍变性液:贮存液-在含484ml 水(经DEPC处理), 17.6ml 0.75mol/L柠檬酸钠(pH7.0)和26.4ml10%Sarkosyl的溶液中加入25
Northern-Blotting-实验操作指南
实验概要本文介绍了Northern Blotting实验详细操作流程。实验材料1. 试剂盒提供NorthernMax (Formaldehyde-Based System for Northern Blots)[Catlog#1940]6ml -20℃ Formaldehyde Loa
Northern杂交步骤和过程
Northern杂交与Southern杂交很相似。主要区别是被检测对象为RNA,其电泳在变性条件下进行,以去除RNA中的二级结构,保证RNA完全按分子大小分离。变性电泳主要有3种:乙二醛变性电泳、甲醛变性电泳和羟甲基汞变性电泳。电泳后的琼脂糖凝胶用与Southern转移相同的方法将RNA转移到硝酸纤
分子杂交——Northern基因检测
实验概要Northern杂交采用琼脂糖凝胶电泳,将分子量大小不同的RNA分离开来,随后将其原位转移至固相支持物(如尼龙膜、硝酸纤维膜等)上,再用放射性(或非放射性)标记的DNA或RNA探针,依据其同源性进行杂交,最后进行放射自显影(或化学显影),以目标RNA所在位置表示其分子量的大小,而其显影强度则
Northern杂交分析操作步骤
【操作】1.RNA的提取见前。2.变性胶的制备:取琼脂糖0.2g,加入 DEPC H2O 12.4ml,加热熔化,冷却至 60℃时加入5×甲醛凝胶电泳缓冲溶液4.0 、37%甲醛3.6ml、混匀、制胶。待胶凝固后,置于1×甲醛凝胶电泳缓冲溶液中预电泳5min。3.样品制备 取总RNA4.5 ,加入5
蛋白质印迹法
值得一提的是,western blot这个名称的由来很有意思。最开始做印迹工作的是一个叫做Edwin Southern的科学家,但印迹的对象是DNA链,他把这种技术称为Southern blot,后来类似的出现了两个过程相似,但是对象不同的印迹方法,一个针对RNA,一个针对蛋白质,人们分别把这两种技
Northern杂交、Southern杂交和Western杂交有什么区别
区别:研究的对象不同。southern主要的对象是DNA,northern研究的对象是RNA,而western研究的对象为蛋白质。1、Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段
Northern杂交、Southern杂交和Western杂交有什么区别
区别:研究的对象不同。southern主要的对象是DNA,northern研究的对象是RNA,而western研究的对象为蛋白质。1、Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段
Northern杂交、Southern杂交和Western杂交有什么区别
区别:研究的对象不同。southern主要的对象是DNA,northern研究的对象是RNA,而western研究的对象为蛋白质。1、Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段
Southern-Blot
1. Run gel (0.8 -1.0% agarose is best). For yeast chromosomal Southerns, digest 20 μg DNA. Use 50 ml minigel for most purposes. Photograph gel, but mi
Northern杂交试验指导手册(1)
一、RNA提取方法一、改良异硫氰酸胍提取法试剂及其配制异硫氰酸胍变性液:贮存液-在含484ml 水(经DEPC处理), 17.6ml 0.75mol/L柠檬酸钠(pH7.0)和26.4ml10%Sarkosyl的溶液中加入250g异硫氰酸胍,加热至60~65℃并持续搅拌使之充分溶解。贮存液室温保存备
Northern的杂交有哪些过程
Northern杂交的总体过程与Southern杂交相似,只不过在印迹(Blotting)过程中转移的是RNA而不是DNA,这种将RNA样品从凝胶转移滤膜的方法,其设计者为之起了一个与Southern:blotting对应的名称Northern:blotting。其分子杂交过程与Southern分子
Northern杂交试验指导手册(3)
A. 载体选择为了获得能够在体外转录RNA探针的DNA模板,其克隆载体必须带有可供选择的特异转录启动子,同时,为了获得理想的Northern杂交试验结果,载体选择带有两种不同类型而方向相反启动子的载体,以便在RNA探针制备时同时得到两条链的转录探针。常用的这类载体有:pGEM-3/pGEM-4 (
Northern杂交试验指导手册(3)
试验程序1.在纯净工作台上将5ml含AP的LB液体培养基加入到一10~15ml通气良好的试管中,然后将前述经鉴定含有目的 DNA片断的转化细菌接种其中,37℃下振荡培养过夜。2.取1.5ml培养物置于一微量离心管中,在4℃下12000rpm离心2min.,弃去上清液,使细菌沉淀尽可能干燥。3.将细菌
Northern杂交试验指导手册(2)
RNA样品质量分析:完整的总RNA样品应呈现出三条条带,分别为28S rRNA、18S rRNA、5S rRNA。其中28S rRNA条带的亮度应约为18S rRNA条带亮度的2倍,这表明RNA样品比较完整,基本无降解。如果两条带的亮度反过来,则说明RNA样品已发生降解。如果在点样槽内或槽附近有