用质谱数据对肽段从头测序实验（一）
实验方法原理单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱，但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生，由 C 未端或N未端断裂。测定N末端序列的化学方法应用Edman化学反应，用MS或 MS/MS 读出产生的变短的肽。这一方法通常被称为“阶梯测序＇。在这种方法上发展了两种变化方式。实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤第一种方法是任每一测序循环开始时，在多肽／蛋白质底物内加 Edman 试剂，每一个循环中有一小部分的底物袚 N 末端封闭，末端封闭后的肽在下一个循环中不会参加反应，这祥就产生了序列阶梯，最终反应产物混合物经 MALDI-MS 分析，其质量数之差反映了氨基酸残基的质量数。......阅读全文
用质谱数据对肽段从头测序实验（一）
实验方法原理单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱，但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生，由 C 未端或N未端断
用质谱数据对肽段从头测序实验
方案一 方案二 方案三 实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALD
用质谱数据对肽段从头测序实验
实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱，但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生，由 C 未端或N未端
用质谱数据对肽段从头测序实验（三）
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤另外一种便于人工解析 CID 谱及从头测序的化学方法是对肽段的羧基实行甲酯化。这个反应使肽段每一个羧基质量增加 14u, 包括未修饰的（末端、 Asp 和 Glu上的羧基。如果肽段中没有酸性残基，同时C未端没有被修饰，那么只有 y 系列离子及其中性丢失离子会表
用质谱数据对肽段从头测序实验（二）
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤第二种方法，也称为"nested peptide secquendng", 是在一个 Edman 降解循环中多次加入多肽/蛋白质底物心在此法中加入过量易挥发的 Edman 试剂以使反应完全，每一循环中的过显试剂可通过蒸发被除去。经 MALDI-MS 分析得到肽
指尖“质谱”：纳米孔技术打造便携肽段质谱仪
质谱仪对蛋白质研究来说可谓是无价之宝，但是它们通常体积庞大，价格昂贵，局限于专门的实验室。当下，生物医学领域的下一个革命直指蛋白质组学——对不同细胞类型中表达的蛋白质进行大规模分析。尽管你的身体里每一个细胞似乎都携带相同的DNA，但不同细胞类型的蛋白质表达差异很大。此外，蛋白质生产出来后会被修饰
肽段
· Designing Your Peptide (Genosys)· Handling & Storage of Peptides (Genosys)Two Dimensional Peptide Mapping (Sefton Lab) Synthesizi
蛋白质内序列分析用肽段的分离与纯化实验
分子生物学中最重要的环节之一是对微量蛋白质进行分析，使对编码待研究蛋白的 cDNA 序列的克隆成为可能。为有效地做到这一点，通常需要知道蛋白质的内序列。在这一方面，肽段的有效分离是极重要的。本实验来源于蛋白质纯化与鉴定实验指南，作者：朱厚础。试剂、试剂盒考马斯亮蓝 G乙酸甲醇Achromobacte
蛋白质内序列分析用肽段的分离与纯化实验
试剂、试剂盒 考马斯亮蓝 G乙酸甲醇Achromobacter 胰蛋白酶 I 三氟乙酸乙腈2-丙醇仪器、耗材 SpeedVac 型旋转浓缩器Tween-20UltrafreeTM MC 滤器C18 反相 HPLC 柱实验步骤 材料与设备考马斯亮蓝 G(0.05% 的乙酸-20% 甲醇溶液）乙酸 (5
蛋白质内序列分析用肽段的分离与纯化实验
试剂、试剂盒 考马斯亮蓝 G 乙酸 甲醇 Achromobacter 胰蛋白酶 I 三氟乙酸 乙腈 2-丙醇
质谱实验质量控制之数据质控
质谱实验的QC方法包括：样品准备、液相色谱、质谱采集以及谱图质量等。前两期关于质谱污染物的防控，大部分是属于样品准备阶段的质控工作。质控专题共分三期内容：1. 质谱污染的来源与防控篇2. 质谱原始数据中的污染物信息篇3. 质谱数据质控篇——Quic软件介绍点击目录链接可以回顾往期，本期质控专题进行到
一种氦质谱检漏用双流道喷枪的设计及实验
西北核技术研究所 作者：冯晓 为解决普通喷枪在检漏时对漏孔定位能力低的问题，设计了一种钟罩式双流道喷枪，并对其开展了测试实验。结果表明：喷氦法检漏时，利用钟罩式双流道喷枪可分辨出相距15mm 的相邻
单一同位素肽段质量和平均同位素肽段质量有什么不同？
单一同位素肽段质量（monoisotopic peptide mass）和平均同位素肽段质量（average peptide mass）有什么不同？组成蛋白质的原子在自然界中存在着不同比例的同位素（见下表）。所以含有这些同位素原子的肽段的质量比不含任何同位素的肽段的质量要大。不含任何同位素的肽段的质
布鲁克新品发布@USHUPO
#摘要# 应用在免疫肽组学的PaSER™ Novor，具有更快速、实时从头测序的特点 使用PaSER 2023b蛋白质组学软件实现无需构建谱图库的dia-PASEF数据分析（Library-free dia-PASEF®） 与Mass Dynamics合作, 实现4D-Proteomics
Pepfinder软件对单克隆抗体进行肽图分析（一）
1前言在蛋白质药物产品的质控要求中，肽图分析是其中重要的一环。肽图分析包括对蛋白氨基酸序列进行确证及相关修饰的鉴定和定量。根据蛋白药物质谱分析特点和生物制药应用的特殊需求，Thermo Fisher与Amgen联合开发了PepFinderTM 软件。 PepFinder不仅具有最基本的肽段序列确证、
质谱解析（一）
质谱图的组成 质谱图由横坐标、纵坐标和棒线组成。 横坐标标明离子质荷比(m/z)的数值， 纵坐标标明各峰的相对强度， 质谱术语 基峰(Base peak) 质谱图中离子
SCIEX学堂新课－|－质谱及数据的底层逻辑第2期—质谱数据概览
质谱进阶不用愁，短视频轻松看“质谱攻略之质谱和数据的底层逻辑”，是“SCIEX 学堂”平台中一个专注于分享质谱知识的实用技巧小课程。 亲爱的质谱友友们，你是否曾对生命科学、药物研发、食品、司法、环境监测等领域中的复杂的化合物分析或结构确认感到困惑？现在，让我们一起探索质谱技术的奥秘，带你深入了解质谱
董梦秋：化学交联质谱让结构生物学研究如虎添翼
在蛋白质组学分析方法中，质谱获得的是多肽序列结构的信息；那么用质谱是否可研究大分子蛋白的结构信息？近几年来，董梦秋实验室在中国做出了多项先驱性工作，主要集中在化学交联质谱领域。在用单颗粒冷冻电镜技术研究结构生物学屡创佳绩的当下，很多研究者都把样品一分为二，一份做冷冻电镜，一份做交联质谱。那么交联
品茗论谱－|－第一届杭州西子质谱沙龙——大数据背景下的质谱组学研究
2024年4月2日，SCIEX举办的“第一届杭州西子质谱沙龙——大数据背景下的质谱组学研究”在春意盎然的西湖畔顺利落幕。来自复旦大学的特聘教授唐惠儒教授和西湖大学郭天南教授、浙江大学的徐飞教授和王保红教授等浙江省内30余位质谱专家学者莅临沙龙；来自SCIEX全球和中国区的领导也参加沙龙交流。 沙龙伊
磷酸化蛋白鉴定实验
实验材料测序级膜蛋白酶试剂、试剂盒二硫苏糖醇碘代乙酰胺乙酸溶液甲酸乙酰氯仪器、耗材螯合琼脂糖凝胶层析介质实验步骤这里所述的方法概括为下列几个步骤：胰蛋白酶水解消化膜和可溶性组分中的蛋白质（见 24. 3.1 )；固相金属螯合亲和层析（IMAC) 富集磷酸肽（见 24. 3. 2 )；用串联质谱对磷酸
磷酸化蛋白鉴定实验
实验材料测序级膜蛋白酶 试剂、试剂盒二硫苏糖醇 碘代乙酰
磷酸化蛋白鉴定实验
实验材料 测序级膜蛋白酶试剂、试剂盒 二硫苏糖醇碘代乙酰胺乙酸溶液甲酸乙酰氯仪器、耗材 螯合琼脂糖凝胶层析介质实验步骤 这里所述的方法概括为下列几个步骤：胰蛋白酶水解消化膜和可溶性组分中的蛋白质（见 24. 3.1 )；固相金属螯合亲和层析（IMAC) 富集磷酸肽（见 24. 3. 2 )；用串
各类实验室用质谱仪质谱的功能特点对比
四极杆质谱仪 QMS是最常见的质谱仪器，定量能力突出，在GC-MS中QMS占绝大多数。 优点： 结构简单、成本低、维护简单； SIM功能的定量能力强，是多数检测标准中采用的仪器设备。 缺点： 无串极能力，定性能力不足； 分辨力较低（单位分辨），存在同位素和其他m/z近似的
MassWorks：进入每一个质谱实验室，让每位质谱用户获益
分析测试百科网讯 MassWorks软件曾获得Pittcon创新产品奖，并以封面文章发表于Anal. Chem.分析化学期刊，其独特的精确质量和谱图准确度校正方法，使得人们在使用单四极杆质谱时，也可获得被国际期刊认可的精确质量和元素组成。2017 ASMS期间，分析测试百科网编辑采访了思路生科C
AB－SCIEX成功举办2012年质谱新品发布会
AB SCIEX公司孙世新博士 来自AB SCIEX公司孙世新博士为大家介绍了AB SCIEX质谱技术在蛋白质组学领域的最新应用。 TripleTOF™ 5600+系统在MS和MS/MS，以及定性和定量模式下，都能够同时具备高分辨率、高质量准确度、高采集
一小时DDA鉴定DIA定量4000个Hela蛋白（一）
引言数据非依赖性的扫描模式（data-independent acquisition, DIA）是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式[1]。它的理念是用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量。 DIA 扫描模式中，超高分辨质谱对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子，并
布鲁克US－HUPO会议最新发布|－4D免疫肽组学、4D糖组学、血蛋白组学、实时数据库检索重大升级
· Novor V2.0软件采用了一种针对HLA肽段优化的先进机器学习算法，能从从头测序的多肽中发掘免疫肽段信息，并进一步提升鉴定水平 · TwinScapeTM结合iRTTM标准多肽的数字化监测技术智能反馈功能确保 timsTOF最高性能 – 远远超出“正常运行时间” · 新型glyco-
方案15标准条件下肽段的反相－HPLC实验
实验材料通过蛋白质消化得到的肽段混合物试剂、试剂盒乙腈去离子水蛋白质标准品三氟乙酸（TFAHPLC级）仪器、耗材HPLC 层析系统带帽的聚丙烯试管反相层析柱实验步骤展开
列举对真空分析质谱计的一般要求
真空分析质谱计的一般要求为： ①仪器探头尺寸小、质量轻、易于安装； ②对于磁偏转型仪器和摆线型仪器来说，仪器的杂散磁场必须很小； ③仪器探头应具有互换性，成本低，允许一机可配用数个探头； ④探头能经受400℃烘烤，离子源能用电子轰击除气，以减小“记忆效应”： ⑤仪器的质量标度最好为线
一小时－DDA－鉴定－DIA－定量－4000－个－Hela－蛋白（一）
引言数据非依赖性的扫描模式（data-independent acquisition, DIA）是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式[1]。它的理念是用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量。DIA 扫描模式中，超高分辨质谱对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子，并快