单细胞测序揭示肺癌肿瘤免疫细胞亚型的细胞图谱
最近免疫疗法的出现标志着多种癌症的研究和护理发生了巨大变化,给世界各地的患者和家庭带来了新的希望。对于那些对治疗有反应的人来说,结果可能是激动人心的。激活病人的癌症免疫系统可以杀死或缩小肿瘤,在某些情况下,会导致完全缓解。 尽管取得了重大进展,但只有少数人从免疫治疗中获益,原因尚不清楚。 免疫治疗研究主要集中在T细胞上,T细胞是一种学习识别特定蛋白并发动攻击的免疫细胞。然而,肿瘤是多种不同细胞类型的复杂混合物,包括其他免疫细胞,这些免疫细胞统称为肿瘤浸润性髓细胞。这些细胞是免疫治疗的替代靶点,但它们在肿瘤中的作用仍不清楚。 为了对这些免疫细胞家族进行了深入研究,哈佛医学院的研究人员在布拉瓦尼克研究所、马萨诸塞州总医院、贝丝以色列女执事医疗中心、布里格姆妇女医院等地使用单细胞测序来绘制肺癌患者肿瘤中骨髓细胞的细胞谱系。 该研究发表在Immunity杂志上,揭示了25个骨髓细胞亚群,许多以前未被描述过,具有不同的基因表达......阅读全文
单细胞测序揭示肺癌肿瘤免疫细胞亚型的细胞图谱
最近免疫疗法的出现标志着多种癌症的研究和护理发生了巨大变化,给世界各地的患者和家庭带来了新的希望。对于那些对治疗有反应的人来说,结果可能是激动人心的。激活病人的癌症免疫系统可以杀死或缩小肿瘤,在某些情况下,会导致完全缓解。 尽管取得了重大进展,但只有少数人从免疫治疗中获益,原因尚不清楚。 免
单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就
今天,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺
单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就
今天,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺
单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就
今天,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺
单细胞RNA测序发现新的免疫细胞
最近在《Nature Immunology》发表的一项新研究,详细检测了一组新发现的免疫细胞(被称为ILC)。通过对单个扁桃体细胞的基因表达进行分析,瑞典卡罗林斯卡学院的科学家们,发现了三个以前未知的ILC子群,并揭示了关于“这些细胞在人体中如何发挥功能”的更多信息。 先天淋巴细胞(ILC)是
单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用
单细胞测序技术在肿瘤研究中有以下多方面的应用:肿瘤细胞异质性研究鉴定肿瘤内不同的细胞亚群,包括具有不同基因突变、转录组特征和表型的细胞。揭示肿瘤细胞之间的差异对肿瘤进展、转移和治疗反应的影响。肿瘤微环境分析解析肿瘤微环境中免疫细胞、基质细胞等的组成和功能状态。研究肿瘤细胞与微环境中其他细胞的相互作用
基于单细胞测序绘制肿瘤微环境相关细胞代谢图谱
肿瘤作为一个异常复杂的“生态系统”,不同类型的肿瘤细胞与非肿瘤细胞共同构成了肿瘤微环境。肿瘤存在肿瘤间异质性和肿瘤内异质性,可以说肿瘤内每种细胞都存在于不同的微环境中,每种细胞都可能有不同的代谢状态。由于异质性,肿瘤细胞会通过改变自身代谢模式(即“代谢重编程”)来适应不同的微环境,以满足其对能量
新型单细胞测序方法可有效追踪癌症免疫细胞
澳大利亚加文医学研究所的科学家开发了一种新的单细胞测序方法RAGE-Seq(Repertoire and Gene Expression by Sequencing),该方法兼备高通量、靶向、长读长和单细胞测序特征,能够高准确度和灵敏度的识别全长抗原受体序列,追踪与癌症免疫反应相关的免疫细胞。7
单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例
以下是一些单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用案例: **案例一:乳腺癌** 研究人员利用单细胞测序技术对乳腺癌肿瘤组织进行分析,发现了不同亚型乳腺癌细胞之间的基因表达差异和肿瘤细胞的异质性。他们鉴定出了具有干细胞特性的肿瘤细胞亚群,这些细胞可能与肿瘤的复发和耐药性有关。这为开发更有针对性的治疗
Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序
2018年11月,Namocell与CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞,并且将其进行单细胞测序,为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序(scRNA-s
单细胞测序方法汇总
单细胞生物学研究一直是当今的热门话题,而且-前沿的领域就是单细胞RNA测序了(scRNA-seq)。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序,并给出平均差异,但并没有两个细胞是完全一样的,而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变,甚至这种技术还能够阐明完整
什么是单细胞测序?
单细胞测序是一种能够在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观遗传组等进行分析的技术。通过单细胞测序,可以:揭示细胞的异质性:了解即使是看似相同的细胞群体中,每个细胞在基因表达、染色质可及性等方面的独特特征。发现新的细胞类型和状态:识别出传统方法难以区分的稀有细胞类型以及细胞在不同生理或病理条件下的特殊
Nature:单细胞测序(上)
Nicholas Navin所需要的就只是一个细胞――问题是如何得到它。这是在2010年,冷泉港实验室的博士后研究员正在探究驱动乳腺癌的遗传改变。此前的大部分癌症基因组研究都是碾碎少量的肿瘤组织,一并将这些DNA进行测序,生成的是一张癌症基因组的一致图像。但Navin想要解析来自单个细胞的序
如何-解读-单细胞-测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
如何-解读-单细胞-测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
单细胞测序方法介绍
单细胞RNA测序(scRNA-seq)作为一种全基因组测序的方式,在单细胞层面广泛用于确定细胞类型和细胞变异的鉴定。Namocell单细胞分离仪可以通过细胞标记CD27以及一种细胞活性的染料,来分选出单个活的B细胞。通过分析分离后的单细胞基因表达情况,对比静息记忆B细胞,可以从单细胞层面研究基因表达
Nature:单细胞测序(下)
随着技术的飞速发展,成本大大降低,使得基因组测序成为常规技术。然而,大多数的人类基因组、癌症或其他仍然是通过从多个细胞中抽提DNA来进行测序,它所忽略的细胞间的差异对于控制基因表达、细胞行为和药物反应却有可能是至关重要的。 该研究小组也观测了其他类型的乳腺癌。将肿瘤作为一个整体测序,研究小
如何-解读-单细胞-测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
如何-解读-单细胞-测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。
人类胸腺单细胞图谱助力肿瘤免疫治疗
胸腺是T细胞的分化、发育和成熟的场所,是组成免疫系统的重要器官。到目前为止,还不清楚在整个生命过程中,人体胸腺中的早期免疫前体细胞如何发育为T细胞。尽管已通过各种动物模型对胸腺进行了广泛的研究,但是还未有详细的人类胸腺细胞图谱得以报道。 由来自VIB炎症研究中心(VIB Center for
微流控芯片技术的肺癌循环肿瘤细胞检测及单细胞分析
我国是肺癌高发国家,近十年肺癌的发病率分别占男性和女性恶性肿瘤的第一和第二位,并且发病年龄有下降的趋势。肺癌的死亡率在恶性肿瘤中始终居于首位,根本原因是肺癌的高转移能力。因为肺癌具有极强的侵袭性及转移能力,大多数患者就诊时已处于晚期(III期、IV期),失去最佳的治疗机会。因此,提高肺癌检出率、控制
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术的差异
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术主要在以下方面存在区别:空间信息获取普通单细胞测序技术:通常不提供细胞在原始组织中的空间位置信息。时空分辨单细胞测序技术:能够同时获取细胞的基因表达等信息以及它们在组织内的空间位置。细胞间相互作用分析普通单细胞测序技术:难以直接推断细胞间基于空间位置的相互作
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术的区别
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术主要有以下区别:空间信息获取传统单细胞测序:通常无法获取细胞在组织中的空间位置信息,只是对分离出的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序:能够在测定单细胞基因表达等信息的同时,明确细胞在原始组织中的具体空间位置。细胞互作研究传统单细胞测序:难以直观地揭示基于
单细胞测序技术在肿瘤研究中的发展趋势
单细胞测序技术在肿瘤研究中的发展趋势包括以下几个方面:多组学整合分析不仅局限于对肿瘤细胞的基因组和转录组测序,还将结合表观基因组、蛋白质组、代谢组等多组学数据,更全面地揭示肿瘤细胞的特征和调控机制。更高的分辨率和精度不断改进技术,以检测更微量的核酸物质,更准确地识别低频突变和罕见的细胞亚群,提高对肿
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用
时空分辨单细胞测序技术在肿瘤研究中有以下应用:肿瘤发生的早期检测能够追踪肿瘤起始细胞在早期阶段的变化,发现潜在的肿瘤发生标志,从而实现更早期的诊断。肿瘤异质性解析明确肿瘤内部不同细胞在空间位置上的基因表达差异,深入了解肿瘤异质性的形成机制和演化过程。肿瘤微环境研究分析肿瘤微环境中各种细胞(如免疫细胞
单细胞测序——“刻画”肝癌免疫微环境的动态特征
肝细胞癌是世界范围内死亡率排名第三的癌症,其中中国的肝癌发病率居世界之首【1】。HBV的慢性感染是中国肝细胞癌发生的主要原因,其感染导致肿瘤微环境常伴随慢性炎症。免疫逃逸被认为是癌症发展的标志之一,目前研究表明,肿瘤存在多种免疫逃逸机制,提出了研究肿瘤微环境中不同免疫细胞状态的重要性【2】。而单
单细胞分离对单细胞测序领域的作用
单细胞分离可以采用特制的毛细管在载玻片的琼脂涂层上选取单孢子并切割下来,然后移到合适的培养基进行培养,分离法对操作技术有比较高的要求,多限于高度专业化的科学研究中采用。 它不仅仅可以用于分离单细胞,还可以用于nl级别试剂的分配和磁珠的分选,对于单细胞测序领域有着很大的帮助。快速高效接种单个活细胞至
单细胞测序需要准备什么再去测序
DNA测序的测序原理: DNA测序是指分析特定DNA片段的碱基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术有何不同?
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术主要有以下几个方面的不同:空间信息获取传统单细胞测序技术通常无法提供细胞在组织中的空间位置信息,只是对分离的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序技术能够在获取单个细胞基因表达等信息的同时,明确细胞在组织中的具体位置。细胞间相互作用研究传统技术难以直接揭示细
单细胞测序技术在癌症研究中的应用案例分享
以下是一些单细胞测序技术在癌症研究中的应用案例: 1. 胶质母细胞瘤:通过单细胞 RNA 测序,发现了肿瘤细胞中的不同亚型,以及肿瘤微环境中免疫细胞的特征。这有助于理解肿瘤的异质性和免疫细胞的功能状态,为开发更有效的治疗策略提供了依据。 2. 乳腺癌:研究人员利用单细胞测序揭示了肿瘤细胞在转移过