NGS样品制备:来自五位专家的建议

对于新一代测序(NGS)而言,样品制备的重要性不言而喻。每次测序的成本可不低,若样品制备得不好,则实验就会彻底糊掉。在此,五位专家就如何改善NGS的样品制备过程,提出了他们的宝贵建议。 欧洲分子生物学实验室(EMBL)的技术人员Ferris Jung: 你需要密切留意起始材料的质量。无论样品制备的过程有多完美,产物的质量都不会优于起始材料。此外,你需要确保实验结果在文库制备试剂盒的参数范围内。大多数试剂盒的结果高于或低于建议的参数,但这类实验要想获得成功还是有点困难。最后,为了区分异常值,你最好将实验重复三次或以上。 Promega的高级战略组合经理Kurtis Knox: 核酸质量比以往更重要。在选择纯化方法时,你需要考虑它是否能产生大量的DNA或RNA,而且生成的产物是否切实可用。花点时间和精力去进行质控和定量,尽量避免测序浪费或结果不佳。 PacBio的产品管理总监Paul Kotturi: 在使用长读长技......阅读全文

如何提高NGS样品制备成功率

NGS样品制备指南之自动化篇编辑推荐:在经历了几年的高速发展之后,新一代测序仪终于放慢了脚步。如今,样品制备成为NGS中新的亮点。新试剂、新仪器不断涌现,以缩短时间,提高通量。同时,新方法也在不断被开发,以处理更少的样本,如单细胞。这一次,生物通带您走近NGS的样品制备,看看有哪些新工具能帮助我们应

NGS样品制备:来自五位专家的建议

  对于新一代测序(NGS)而言,样品制备的重要性不言而喻。每次测序的成本可不低,若样品制备得不好,则实验就会彻底糊掉。在此,五位专家就如何改善NGS的样品制备过程,提出了他们的宝贵建议。  欧洲分子生物学实验室(EMBL)的技术人员Ferris Jung:  你需要密切留意起始材料的质量。无论样品

DNA测序电泳的样品制备

  当在预电泳时,即可进行样品的制备,将反应完毕的样品在沸水浴中加热1~3分钟,立即置于冰上即可。如果样品长时间不用,则应重新处理。可使用4~6%聚丙烯酰胺凝胶,胶厚0.4 mm。厚度小于0.4 mm的胶可能导致信号太弱。加样时不必吸去上层覆盖的矿物油,但要小心地吸取矿物油下的蓝色样品。

康宁推出一系列产品,简化NGS样品制备

  康宁公司近日宣布,它近日推出了新的Axygen® 品牌的IMAG™手持式磁珠分离设备,用于新一代测序。   这种新型的磁珠分离设备彻底改变了生物学研究所用的手动磁珠分离过程。其应用包括核酸纯化、细胞分析、抗体纯化和蛋白纯化。IMAG磁珠分离设备可将整个分离过程的时间和劳动减少50%以上。  

NGS基因测序技术是什么

美国第三代试管婴儿的NGS基因测序技术是新一代的PGS基因筛查技术的升级技术,整体来说,NGS技术具有通量大、时间短、精确度高和信息量丰富等优点,使麦沃海外试管婴儿专家可以在短时间内对基因进行精确定位,对于临床诊断和保障麦沃试管成功率起到事半功倍的作用。NGS基因测序技术需要7~14天的时间才能出具

NGS基因测序技术是什么

美国第三代试管婴儿的NGS基因测序技术是新一代的PGS基因筛查技术的升级技术,整体来说,NGS技术具有通量大、时间短、精确度高和信息量丰富等优点,使麦沃海外试管婴儿专家可以在短时间内对基因进行精确定位,对于临床诊断和保障麦沃试管成功率起到事半功倍的作用。NGS基因测序技术需要7~14天的时间才能出具

NGS基因测序技术是什么

美国第三代试管婴儿的NGS基因测序技术是新一代的PGS基因筛查技术的升级技术,整体来说,NGS技术具有通量大、时间短、精确度高和信息量丰富等优点,使麦沃海外试管婴儿专家可以在短时间内对基因进行精确定位,对于临床诊断和保障麦沃试管成功率起到事半功倍的作用。NGS基因测序技术需要7~14天的时间才能出具

表格盘点:全国NGS测序企业全集

  无论是个性化医疗还是“精准医学”,所有以预防疾病为宗旨的新型模式的变革和颠覆都离不开革命性的技术:二代基因测序(NGS)技术。目前在中国,究竟有哪些企业从事NGS测序相关服务呢?以下是根据不完全统计所得的数据(排名不分先后),后续还会继续完善新的公司……  从目前统计的数据来看,北京49家,上海

NGS测序技术的不同检测方案

测序技术是单基因遗传病诊断应用的主要技术,针对检测基因的范围可大体分为单基因检测技术和多基因检测技术。单基因检测是指针对某一特定基因进行测序的技术,适用于具有特异疾病表型的疾病。单基因检测技术中应用最广泛的是Sanger测序,也称一代测序。Sanger测序因仅能检测一个或少数几个基因,因此适用于明确

高通量测序(NGS)的原理简介

高通量测序(High-Throughput Sequencing)又名下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS),是相对于传统的桑格测序(Sanger Sequencing)而言的。目前高通量测序的主要平台代表有罗氏公司(Roche)的454测序仪(Roch

NGS文库制备的方法比较

  近年来,新一代测序(NGS)技术的应用日益广泛。随着测序技术的不断改进,制备核酸和构建NGS文库的方法也在改进。对于各种文库制备方法,我们该如何选择?近日,美国斯克里普斯研究所的研究人员在《Biotechniques》上发表文章,比较了各种文库制备策略。   总的来说,在NGS分析之前,制备R

DNA测序技术预电泳的注意和样品的制备

  [注意]  (1). 用鲨鱼齿梳制作加样孔时,应注意将齿尖插入胶中0.5mm左右,千万注意不能使加样孔渗漏,否则得不到正确的结果。  (2). 应时刻注意上面电泳槽中的缓冲液是否渗漏,否则极易造成短路而损坏电泳仪。  样品的制备  当在预电泳时,即可进行样品的制备,将反应完毕的样品在沸水浴中加热

第二代测序(NGS)技术

  二代测序是一个强大的功能平台,它可以同时给数以万计的DNA分子进行测序。由于这种可以多个样本同时测序的能力,在个性化医疗、遗传疾病和临床诊断等方面,二代测序也就是高通量测序开创了革命性的领域。  早在1900年代就发明的Sanger测序法,成为了DNA测序的黄金法则,即便到了今天它仍被广泛用来进

NGS凭什么是应用最广的测序技术?

“基因测序技术”作为生物科学的重要技术一直都带着一层神秘的面纱。从1984年开始,来自六个国家的数千名科学家共同开启了人类基因组计划,目标是完成一个人类基因组30亿字节的测序。该计划用第一代DNA测序技术,耗时17年,耗资30亿美金,最终于2003年绘制了首个人类全基因组图谱。这是人类首次完成人体生

高通量测序(NGS)的过程及原理介绍

  高通量测序技术的一般过程是将DNA(或cDNA)随机片段化,加上接头序列,制备用于上机测序的文库,通过对文库中数以万计的克隆(colony)进行延伸反应,检测对应的信号获取序列信息,最终通过数据分析来挖掘序列中的科学问题。几种不同测序平台的原理及步骤如下:(1)Roche 454平台  Roch

样品制备技术

俄歇电子能谱仪对分析样品有特定的要求,在通常情况下只能分析固体导电样品。经过特殊处理,绝缘体固体也可以进行分析。粉体样品原则上不能进行俄歇电子能谱分析,但经特殊制样处理也可以进行分析。由于涉及到样品在真空中的传递和放置,所以待分析样品一般都需要经过一定的预处理。

TEM样品制备

  由于透射电子显微镜收集透射过样品的电子束的信息,因而样品必须要足够薄,使电子束透过。  试样分类:复型样品,超显微颗粒样品,材料薄膜样品等。  制样设备:真空镀膜仪,超声清洗仪,切片机,磨片机,电解双喷仪,离子薄化仪,超薄切片机等。

样品的制备

6 分析步骤6.1样品的制备测定前,应保证实验室样品至少在室温(20℃~25℃)下保持48h,以便使影响不溶度指数的因素,在各个样品中趋于一致。然后反复振荡和反转样品容器,混合实验室样品。如果容器太满,则将全部样品移入清洁、干燥、密闭、不透明的大容器中,如上所述彻底混合。对于速溶乳粉,应小心地混合,

TEM样品制备

样品制备由于透射电子显微镜收集透射过样品的电子束的信息,因而样品必须要足够薄,使电子束透过。l 试样分类:复型样品,超显微颗粒样品,材料薄膜样品等。l 制样设备:真空镀膜仪,超声清洗仪,切片机,磨片机,电解双喷仪,离子薄化仪,超薄切片机等。▽超细颗粒制备方法示意图来源:公开资料▽材料薄膜制备过程示意

GPC样品制备

 样品制备  对于比较样品的好坏或者控制产品质量来说,GPC分析结果的重复性非常重要。那么从样品制备方面如何保证结果的重复性呢?一般来说,大家会认为自动进样器只是提高了分析的自动化程度,更加方便。实际上自动进样器更深层次的意义在于可以提高测试结果的重复性。传统的样品制备需要外部溶样和外部过滤,人为因

TEM样品制备

样品制备由于透射电子显微镜收集透射过样品的电子束的信息,因而样品必须要足够薄,使电子束透过。l 试样分类:复型样品,超显微颗粒样品,材料薄膜样品等。l 制样设备:真空镀膜仪,超声清洗仪,切片机,磨片机,电解双喷仪,离子薄化仪,超薄切片机等。 ▽ 超细颗粒制备方法示意图来源:公开资料 ▽ 材料薄膜制备

样品制备方式

(1)无机材料溶剂清洗或长时间抽真空,以除去试样表面的污染物。如对陶瓷或金属样,用乙醇或丙酮擦洗,然后用蒸馏水洗掉溶剂,吹干或烘干。用氩离子刻蚀法除去表面污染物。擦磨、刮剥和研磨。表层与内表面的成分相同的固体样品,用SiC纸擦磨或用刀片刮剥;粉末样品采用研磨的办法使之裸露出新的表面层。真空加热法。对

土壤样品制备

  一、样品制备  (一)场地和器具  1、制样场地  (1)风干室  应设置专用土壤风干室,配备风干架;风干室应通风良好,整洁,无易挥发性化学物质,避免阳光直射土壤样品, 注意防酸或碱等污染,可在窗户加设防尘网。每层样品风干盘上方空间应不少于 30cm,风干盘之间间隔应不少于 10cm。风干室应配

QIAGEN透露测序仪的更多细节

  AGBT 2013,目前规模最大的测序技术会议,于2013年2月20日-23日在美国佛罗里达州马可岛举行。QIAGEN公司在这次会议上向客户介绍了其新一代测序(NGS)的流程,旨在将这一突破性的技术常规应用在生命科学研究之外的领域,如临床研究和诊断。   QIAGEN的CEO Peer M

NGS测序十年记:ABI奋起直追

  说起全自动测序仪,Applied Biosystems(ABI)那是绝对的领头羊,其3730旗舰测序仪在人类基因组计划中立下赫赫战功。然而,在新一代测序方面,454和Solexa抢了先机,率先推出了NGS仪器。ABI当然不会作壁上观,让客户的实验室里摆满对手的仪器。  于是,它在2006年斥资1

第二代测序技术(NGS)是什么

NGS又叫高通量测序,主要优势就是通量大,可以得到海量的数据。一代测序一次只能产生1K的数据。高通量最小的数据量单位也是G。

第二代测序技术(NGS)是什么

NGS又叫高通量测序,当传统的癌症治疗不起作用,或者医生不能确定患者的癌症起源(原发灶)时,NGS(二代测序)可以帮助确定肿瘤中的基因突变,这些突变可能与某些针对特定变异的药物相匹配。NGS主要优势是通量大,可以得到海量的数据,高通量最小的数据量单位是G,而一代测序一次只能产生1K的数据。NGS对晚

第二代测序技术(NGS)是什么

NGS又叫高通量测序,当传统的癌症治疗不起作用,或者医生不能确定患者的癌症起源(原发灶)时,NGS(二代测序)可以帮助确定肿瘤中的基因突变,这些突变可能与某些针对特定变异的药物相匹配。NGS主要优势是通量大,可以得到海量的数据,高通量最小的数据量单位是G,而一代测序一次只能产生1K的数据。NGS对晚

样品和标准样品的制备

1.固体样品野外采回的土壤样品和岩石样品,经自然风干、粉碎、研磨、过筛(100~200目),混合均匀,干燥保存;称样50mg到1g,用高纯铝箔包好(作好编号)。根据待测元素的种类及核反应特征,制备标准样品。一般使用光谱纯或分析纯的待测元素的金属或化合物,根据(估计)待测元素含量范围,称取一定量的化学

样品和标准样品的制备

1.固体样品野外采回的土壤样品和岩石样品,经自然风干、粉碎、研磨、过筛(100~200目),混合均匀,干燥保存;称样50mg到1g,用高纯铝箔包好(作好编号)。根据待测元素的种类及核反应特征,制备标准样品。一般使用光谱纯或分析纯的待测元素的金属或化合物,根据(估计)待测元素含量范围,称取一定量的化学