用单细胞质谱流式技术“绘制”乳腺癌微生态系统图谱
乳腺癌是妇女最常见的恶性肿瘤之一,也是女性癌症死亡的主要原因【1】。目前临床工作中尚未实现乳腺癌完全意义上的精准治疗,很大程度是因为对肿瘤微生态系统的了解不够充分。肿瘤微生态系统是由癌细胞,浸润性免疫细胞,基质细胞和其他细胞类型以及非细胞组织成分所构成【2】。由于各种遗传或者非遗传的因素,癌细胞以及肿瘤相关细胞在细胞表型功能上差别很大。目前在临床具体诊疗过程中,通过肿瘤细胞表面是否表达ER(雌激素受体), PR(孕激素受体), HER2(人表皮生长因子受体2), 和Ki-67(细胞增殖的标志物)等将乳腺癌分为luminal A,luminal B,luminal B-HER2+,HER2+和三阴型乳腺癌等5类【3】。通过上述分型进行针对性的治疗,能够总体提升临床治疗的效果。然而,即便如此,同类型的乳腺癌患者对相同治疗方案的敏感性差异很大。因此,基于肿瘤微生态系统的差异,通过单细胞蛋白组学的方法对乳腺癌进行更加细致准确的分型有......阅读全文
用单细胞质谱流式技术“绘制”乳腺癌微生态系统图谱
乳腺癌是妇女最常见的恶性肿瘤之一,也是女性癌症死亡的主要原因【1】。目前临床工作中尚未实现乳腺癌完全意义上的精准治疗,很大程度是因为对肿瘤微生态系统的了解不够充分。肿瘤微生态系统是由癌细胞,浸润性免疫细胞,基质细胞和其他细胞类型以及非细胞组织成分所构成【2】。由于各种遗传或者非遗传的因素,癌细胞
基于单细胞测序绘制肿瘤微环境相关细胞代谢图谱
肿瘤作为一个异常复杂的“生态系统”,不同类型的肿瘤细胞与非肿瘤细胞共同构成了肿瘤微环境。肿瘤存在肿瘤间异质性和肿瘤内异质性,可以说肿瘤内每种细胞都存在于不同的微环境中,每种细胞都可能有不同的代谢状态。由于异质性,肿瘤细胞会通过改变自身代谢模式(即“代谢重编程”)来适应不同的微环境,以满足其对能量
质谱流式技术——蛋白水平的单细胞技术
摘要:在蛋白质水平,流式一直是最为常用的单细胞分析手段。但是由于串色等问题的困扰,流式通常只能进行6~10种蛋白的同时检测。质谱流式技术的出现给研究者带来了惊喜。利用分辨力超强的质谱技术以及独特的金属标记抗体,CyTOF2质谱流式细胞仪在检测通道数量和信号质量两方面都有了质的提升。单细胞技术在近年来
四川大学吕弋团队:单细胞无机质谱分析在肿瘤免疫治疗中的应用
肿瘤免疫治疗虽通过PD-1/PD-L1抑制剂、CAR-T等创新疗法取得突破,但受肿瘤微环境异质性影响,其总体响应率仍待提升。肿瘤微环境的复杂性体现在免疫细胞亚群的多样性(如T细胞、巨噬细胞、树突状细胞等)及其功能状态的动态变化,传统的流式细胞术受限于荧光通道数量(通常≤30个参数)和光谱重叠的干
质谱流式细胞技术汇总:单细胞,技术限制,分析方法等
生命科学中的技术往往会朝着两个方向发展,其一就是增加细胞特征分析数量,用以同时分析细胞的不同特点,其二就是增加分析的分辨率,从而提高观测精确水平。近几十年里,流式细胞技术的发展满足了这两个要求,精确分析单个细胞的多种特征,帮助科学家们了解复杂或多级细胞系统中的分子机理。近期研究人员将流式细胞技术与质
质谱流式细胞仪:蛋白水平的单细胞技术
【摘要】在蛋白质水平,流式一直是最为常用的单细胞分析手段。但是由于串色等问题的困扰,流式通常只能进行6~10种蛋白的同时检测。质谱流式技术的出现给研 究者带来了惊喜。利用分辨力超强的质谱技术以及独特的金属标记抗体,CyTOF2质谱流式细胞仪在检测通道数量和信号质量两方面都有了质的提升。
光谱流式与质谱流式之“争-”
质谱流式技术是近来年发明的一门新兴技术,它利用金属同位素标签替代荧光标签,并利用质谱对标签进行定量,通过结合质谱和流式细胞技术,可以同时对单细胞进行超多参数、无需补偿的测量,大大增强了评估复杂细胞系统和过程的能力,弥补了荧光流式的不足。其高通量、高灵敏度和高稳定性的特点尤其适合于免疫、肿瘤、血液、药
质谱流式技术在TIL研究中的应用
免疫细胞经常会出现在肿瘤组织中。它们也被称为肿瘤浸润性白细胞(Tumor Infiltrating Leukocyte)。这些细胞组成复杂、多变,在肿瘤发生过程中发挥着巨大的作用。目前已经成为了肿瘤免疫治疗领域研究的热点。由于免疫细胞的异质性,需要对其进行单细胞分析才能获得真实、全面的信息。单细胞测
到底是谁诱发了侵袭性-?质谱流式细胞术告诉您
每年全世界有170多万女性被诊断出患有乳腺癌,这种疾病在大约50万患者中死亡。在抗击乳腺癌的斗争中,各国研究人员正在研究针对这种疾病的新治疗方法,旨在更准确地靶向癌细胞并激活肿瘤相关的免疫系统。 乳腺癌是一种异质性疾病。肿瘤细胞和其微环境中的健康细胞的生长分化情况决定着疾病的进展和对治疗的反应
人类胸腺单细胞图谱助力肿瘤免疫治疗
胸腺是T细胞的分化、发育和成熟的场所,是组成免疫系统的重要器官。到目前为止,还不清楚在整个生命过程中,人体胸腺中的早期免疫前体细胞如何发育为T细胞。尽管已通过各种动物模型对胸腺进行了广泛的研究,但是还未有详细的人类胸腺细胞图谱得以报道。 由来自VIB炎症研究中心(VIB Center for
质谱流式应用于描绘手术后病人康复的指纹图谱(一)
手术以后多久康复?血液会提前告诉你一切每年有数以百万计的人接受各种大手术,但是没有人知道他们多久可以恢复。有些人几天会感觉明显好转,而对于其他人则可能需要一个月或更长的时间。对于具体某一个病人,医生也无法告诉他究竟属于那种类型。就在最近,斯坦福大学医学院的研究人员发现,在手术后的第一个24小时内,一
质谱流式应用于描绘手术后病人康复的指纹图谱(二)
愈合与阻碍“炎症最初的爆发阶段对愈合过程非常关键,”Angst表示,“你需要释放这条‘猛龙’,但是你需要能够驾驭它。太多的炎症会导致恢复的延迟。”免疫系统的组件必须不断动态的调整自己的功能,以便加速而不是阻碍伤口的愈合。几年前,Angst参加了Nolan的一个讲座,讲座中介绍了质谱流式技术。它可以在
CyTOF:质谱流式细胞技术
中文名:质谱流式细胞技术 外文名:Mass Cytometry 技 术:流式技术 区 别:标签系统的不同 技术优势:通道数量增加到上百个 基本概念: 质谱流式细胞技术(Mass Cytometry)是利用质谱原理对单细胞进行多参数检测的流式技术。它继承了传统流式细胞仪的高速分析的特点
哈佛大学尹鹏Nature-Biotechnology:高灵敏度单细胞质谱流式
利用质谱仪计数单细胞 质谱仪使用金属同位素标记的抗体标记感兴趣的靶点,这使得能够同时测量数百万个单细胞中的约50种蛋白质或蛋白质修饰,从而能够分析高度异质性样品中复杂的细胞行为。然而,目前的质谱分析灵敏度有限,通常需要将数百种金属标记抗体结合到每种细胞表位上,才能达到仪器的检测阈值。这阻碍了用
白玉副教授团队搭建多维度有机质谱流式细胞分析平台
近日,北京大学白玉副教授团队在常压质谱免疫分析平台工作的基础上,设计并拓展质谱探针,利用基于狄恩流的微流控芯片实现单细胞排列,结合纳升电喷雾-高分辨质谱(nanoESI-HRMS),搭建了多维度有机质谱流式细胞分析平台(图1)。该平台能够高通量地对单细胞水平的蛋白质和代谢物等多维度信息进行同时获
林金明:微流控单细胞样品预处理与在线质谱检测
分析测试百科网讯 2019年8月31日,在第四届全国样品制备学术报告会上,清华大学化学系教授林金明带来了题为《微流控单细胞样品预处理与在线质谱检测》的报告。清华大学化学系教授 林金明 林金明介绍了一种活体单细胞原位采样及其在线质谱检测技术,基于微流控芯片的单细胞采样与原位检测质谱接口装置。利用
质谱流式细胞技术推荐论文
研究人员将流式细胞技术与质谱分析技术结合在一起,发展出了质谱流式细胞技术(mass cytometry),这种融合技术能在单细胞水平上同时分析超过40种细胞参数,极大的增加了流式细胞分析评估复杂细胞系统和过程的能力。5月5日Cell杂志发表“Mass Cytometry: Single Cell
Science:构建肿瘤浸润T细胞的泛癌单细胞图谱
靶向肿瘤特异性T细胞的癌症免疫疗法已使许多癌症患者受益,但是针对不同类型的癌症的临床疗效差异很大。肿瘤浸润T细胞经常进入功能失调状态,这一现象被广泛称为T细胞衰竭(T cell exhaustion),而效应T细胞的抗肿瘤功能受多种因素调节,包括调节性T细胞(Treg细胞)的存在。T细胞的状态和
质谱流式和光谱流式的原理和优缺点介绍
流式细胞仪仍然是无与伦比的单细胞分析技术,分析数百万甚至更多细胞上的多个荧光参数的能力,使得流式能够帮助人类深入理解复杂的生物过程。然而,常规流式在发展过程中,渐渐表现出一些缺陷,主要表现为荧光染料的限制,即使方案经过精心设计,也无法避免光谱渗漏、自发荧光等问题,使用的荧光染料的数量越多,这些问
Nature:开启单细胞病理学新篇章-Hyperion助力临床肿瘤治疗
在临床上,对肿瘤的分类是癌症诊断、判断预后以及治疗方案选择的重要依据。目前这种分类主要是依据肿瘤组织学特征以及少量Marker的表型进行的。近年来,随着单细胞分析技术的发展,肿瘤患者个体间以及个体内普遍存的异质性被不断被揭示出来,这些复杂的单细胞表型及空间信息并未反映在组织学分类中。 近日,来
Cell:绘制人类单细胞染色质可及性图谱
在人类细胞中,总长约2米的基因组DNA通过与组蛋白缠绕形成核小体,并经过螺旋折叠等方式盘绕形成染色体进而团聚于直径10微米的细胞核中。在细胞内的DNA需要进行转录等活动的时候,DNA才会从组蛋白中释放出来,裸露出需要与转录因子结合的位点从而便于转录,染色质的这种特性叫做染色质可及性,暴露的区域被
地大未来城,聚英集荟——湖北省第四届色谱质谱学术会
4月2日第四届湖北省色谱质谱学术会议在中国地质大学未来城校区成功举办。本届会议由湖北省化学化工学会色谱质谱专业委员会主办,中国地质大学(武汉)生物地质与环境地质国家重点实验室承办。旨在为更好的探讨色谱质朴及相关技术领域的发展现状、趋势和前沿动向,促进相关交叉学科间的合作和拓展交流。大会现场盛况中国地
乳腺细胞发育中细胞状态特异性转录因子和细胞谱系关系
乳腺癌是全世界妇女中最常见的癌症,大约每年两百多万女性受其困扰。根据WHO 估计,在所有的女性癌症者中,约15%的死亡与乳腺癌相关。乳腺癌中某些类型至今仍然没有有效治疗方案。乳腺癌中癌细胞的可塑性和组织的异质性是治疗失败的一大原因。不论是乳腺发育过程中的正常乳腺细胞,还是乳腺癌发展过程中的癌细胞
高通量单细胞ChIPseq确定了乳腺癌染色质状态的异质性
近日,法国巴黎文理研究大学等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer”的文章,利用高通
单细胞测序揭示肺癌肿瘤免疫细胞亚型的细胞图谱
最近免疫疗法的出现标志着多种癌症的研究和护理发生了巨大变化,给世界各地的患者和家庭带来了新的希望。对于那些对治疗有反应的人来说,结果可能是激动人心的。激活病人的癌症免疫系统可以杀死或缩小肿瘤,在某些情况下,会导致完全缓解。 尽管取得了重大进展,但只有少数人从免疫治疗中获益,原因尚不清楚。 免
质谱流式揭示粒细胞发育及功能
在人的外周血中,中性粒细胞(Neutrophils)约占白细胞总数的50%~70%,是人体天然免疫的重要组成部分。另一方面,中性粒细胞在快速的更新之中,数据表明它们在外周血中的半衰期只19小时(Lahoz-Beneytez et al., 2016; Tak et al., 2013),因此
文献研究:质谱流式(CyTOF)的高端应用
质谱流式细胞术是指用稳定的重金属同位素(主要是镧系元素)代替荧光基团来标记抗体。然后将细胞引入CyTOF分析仪并雾化成液滴,液滴被汽化、雾化、电离,然后通过电势加速被带入质谱仪。最后,用TOF探测器对过滤后的离子云进行分析。图1.质谱流式工作原理尽管质谱流式细胞术通常被认为是一种基于荧光流式细胞术的
质谱流式揭示粒细胞发育及功能
在人的外周血中,中性粒细胞(Neutrophils)约占白细胞总数的50%~70%,是人体天然免疫的重要组成部分。另一方面,中性粒细胞在快速的更新之中,数据表明它们在外周血中的半衰期只19小时(Lahoz-Beneytez et al., 2016; Tak et al., 2013),因此中性粒细
清华大学张新荣近年来单细胞质谱分析领域工作进展概览
张新荣,清华大学教授,博士生导师。兼任中国分析测试协会副理事长,北京质谱学会理事长,英国皇家化学会会士,Analytical Chemistry(ACS)执行主编。张新荣教授课题组近年来致力于单细胞质谱分析研究,与同行学者和企业合作,研制了液滴微萃取-皮升电喷雾质谱单细胞分析仪、免标记质谱流式细
Cell:首次在单细胞水平描绘肝癌微环境中的免疫图谱
2017年6月16日,北京大学生命科学学院BIOPIC中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大-清华生命科学联合中心张泽民研究组,首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组,以及美国AMGEN公司的欧阳文军研究组在Cell杂志发表了题为“Landscape o