基于N端信号的蛋白质亚细胞定位识别

摘要: 对未知蛋白的功能注释是蛋白质组学的主要目标. 一个关键的注释是蛋白质亚细胞定位的预测. 应用基于多样性增量的二次判别分析( Increment ofD iversity w ith Q uadrat ic D iscrim inant analysis, IDQD) 方法进行蛋白质亚细胞定位预测, 对4 个植物定位类型和3 个非植物定位类型, 52fo ld 交叉检验的总精度分别为87% 和91% , 所得结果与已有模型相比, 预测结果较好.点击这里进入下载页面:进入下载页面......阅读全文

怎么亚细胞定位分析

用报告基因技术呀 比如说最常用的绿色荧光蛋白GFP或者改造过的EGFP等。和目的基因构建成为融合蛋白,转入细胞中以后,用激光扫描共聚焦显微镜就可以观察到基因的亚细胞定位

关于亚细胞定位的基本介绍

  亚细胞定位是查找生物大分子在细胞内的具体存在的位置,如在核内、胞质内或者细胞膜上存在。常见的亚细胞定位方法有生物信息学预测法、免疫荧光法、GFP融合蛋白表达法。  不同的细胞器往往具有不同的理化环境,它根据蛋白质的结构及表面理化特征,选择性容纳蛋白。  蛋白质表面直接暴露于细胞器环境中,它由序列

如何做蛋白亚细胞定位实验?

生物功能的区域化是生命的一种基本现象,这种区域化是通过不同层次的系统组成,从器官到特异细胞,再到细胞内部的亚细胞结构,最后到大分子复合物。在细胞水平,蛋白在特定的时间和空间发挥作用,这种区域化的定位为蛋白发挥作用提供特定的化学环境以及所需的互作因子等。蛋白的错误定位容易导致细胞活动的紊乱。因此,了解

绿色荧光蛋白(GFP)标记亚细胞定位

一、原理利用绿色荧光蛋白(GFP)来示踪胞内蛋白的技术。利用GFP融合蛋白技术来进行活细胞定位研究是目前较为通行的一种方法,在光镜水平进行研究,不需要制样,没有非特异性标记的影响。并且GFP的分子量为27kD,经激光扫描共聚集显微镜激光照射后,可产生一种绿色荧光,从而对蛋白质进行精确定位。激光扫描共

亚细胞定位的GFP融合蛋白表达法

  GFP是绿色荧光蛋白,在扫描共聚焦显微镜的激光照射下会发出绿色荧光,从而可以精确地定位蛋白质的位置。绿色萤光蛋白(GFP)是一个由约238个氨基酸组成的蛋白质,从蓝光到紫外线都能使其激发,发出绿色荧光。通过基因工程技术,绿色萤光蛋白(GFP)基因能转进不同物种的基因组,在后代中持续表达,并且能根

亚细胞定位的免疫荧光法介绍

  1、直接法  将标记的特异性荧光抗体,直接加在抗原标本上,经一定的温度和时间的染色,用水洗去未参加反应的多余荧光抗体,室温下干燥后封片、镜检。  2、间接法  如检查未知抗原,先用已知未标记的特异抗体(第一抗体)与抗原标本进行反应,用水洗去未反应的抗体,再用标记的抗抗体(第二抗体)与抗原标本反应

Science:首次揭示蛋白组亚细胞结构定位地图

  对于人细胞中的蛋白是如何在细胞中定位的首次分析于5月11日在线发表在Science上,这项研究,揭示了在给定的一个细胞中,大部分的人类蛋白被发现存在一个以上的定位位置。  基于瑞典的Cell Atlas计划,研究人员检查了对应大部分蛋白编码基因的人类蛋白组的空间分布,空前地详细描述了蛋白在多个细

亚细胞定位用荧光显微镜能看到吗

目前进行亚细胞定位研究,提取拟南芥(Arabidopsis thaliana)(Arabidopsis thaliana)叶肉原生质体进行PEG转化。研究目标采用GFP/YFP融合蛋白,但是在LSM710观察时,叶绿体有很明显的背景,尽管有些细胞是明显看到了GFP荧光,远远强于叶绿体背景,但是拍的照

倒置相差荧光显微镜可以做亚细胞定位嘛

可以。根据查询中国知网可知,倒置相差荧光显微镜可以做亚细胞定位。倒置相差显微镜,是将相差显微镜和倒置显微镜相结合的产物,倒置相差显微镜既具有倒置显微镜的倒置观察方式,同时又具有与相差显微镜相一致的成像原理。

细胞共定位

实验试剂 高保真聚合酶(pfu ultra),限制性内切酶(XhoI、SpeI、BamHI、SpeI、SacI),金粉,无水乙醇,2.5MCaCl2 ,20ul 0.1M亚精胺实验设备 PCR扩增仪,PDS-1000/He型基因枪,激光共聚焦显微镜(Carl Zeiss LSM 510 )实验材料 

细胞共定位

实验概要本实验子在构建了中间载体pA7-CFP和pA7-YFP的基础上,构建了pA7- CFP- AtCOP1,pA7-AtCRY1-YFP,pA7- CFP-OsCOPl和pA7-OsCRY1b-YFP载体。利用基因枪将重组质粒轰击入洋葱内表皮。主要试剂高保真聚合酶(pfu ultra),限制性内

Science:首次全方位揭示人类蛋白组亚细胞定位图谱

导 语在亚细胞水平获得蛋白质空间分布的准确信息对于理解蛋白质功能、相互作用及细胞活动机制具有重要意义。2017年5月11日,Science 杂志在线发表了瑞典皇家理工学院题为 A subcellular map of the human proteome的最新研究成果论文。研究者整合转录组、免疫荧光

首次在蛋白激酶组水平上描绘他们的亚细胞定位信息

  浙江大学生命科学研究院赵斌实验室于2021年5月14日在eLife上在线发表了题为《A subcellular map of the human kinome》的论文,首次在蛋白激酶组水平上描绘了他们的亚细胞定位信息。  蛋白质磷酸化是一种重要的蛋白质翻译后修饰,它在包括代谢、增殖、分化、迁移等

细胞化学词汇RNA定位

中文名称:RNA定位英文名称:RNA localization定  义:RNA特异定位在细胞不同区域的过程。尤其是信使核糖核酸(mRNA)的定位对生长和发育是重要的。细胞质中RNA定位起始于细胞核,在核中被特异RNA结合蛋白识别,生成核糖核蛋白复合体,然后输出到细胞质。应用学科:生物化学与分子生物学

体细胞重组定位法介绍

原理相同于基因纯合化的定位方法。由于体细胞交换发生得较少,所以常用 X射线处理杂合体使之发生更多的体细胞交换。

胰岛细胞瘤的定位诊断

  目前, 胰岛素瘤诊断的主要挑战是定位。80%以上的胰岛素瘤直径< 2 cm, 一般不引起胰腺轮廓的改变,常规的形态学定位方法如B 超、CT 和核磁共振(MRI) 均难以发现。胰岛素瘤定位诊断检查一般分为形态学定位和功能定位两大类。形态学定位主要有: ( 1)腹部超声,总体诊断率不高,约35.1%

细胞色素C的定位检测

细胞色素C作为一种信号物质,在细胞凋亡中发挥着重要的作用。正常情况下,它存在于线粒体内膜和外膜之间的腔中,凋亡信号刺激使其从线粒体释放至细胞液,结合Apaf-1 (apoptoticprotease activating factor-1)后启动caspase级联反应:细胞色素C/Apaf-1复合物

胰岛细胞瘤的定位诊断

  目前, 胰岛素瘤诊断的主要挑战是定位。80%以上的胰岛素瘤直径< 2 cm, 一般不引起胰腺轮廓的改变,常规的形态学定位方法如B 超、CT 和核磁共振(MRI) 均难以发现。胰岛素瘤定位诊断检查一般分为形态学定位和功能定位两大类。形态学定位主要有:  (1)腹部超声,总体诊断率不高,约35.1%

丽江森林生态系统定位站:维护滇西北生物多样性

滇西北地区地质特殊、地形复杂、气候多样,是世界上生物多样性最丰富的地区之一,中科院昆明植物所丽江森林生态系统定位研究站位于滇西北的核心地区。 丽江森林生态系统定位研究站负责人、高级工程师许琨对《中国科学报》记者说:“当前台站的定位是进行野生植物资源的收集,建设相关资源圃;致力于野生植物资源

澳大利亚林火对生物多样性造成巨大影响

   2019年7月以来,高温天气和干旱导致澳大利亚多地林火肆虐。截至目前,林火灾害已致28人死亡,2600多栋民居被毁,过火面积超过1000万公顷。持续数月的森林大火对当地生态系统和野生动物更是造成了巨大影响。  被列入世界遗产名录的悉尼蓝山地区,占地103万公顷,这里有包括“活化石”植物瓦勒迈松

Nature子刊:细胞定位与癌症

  曼彻斯特大学的科学家揭示了细胞定位的机制,因为在癌症早期细胞的组织形式会遭到破坏,所以细胞定位机制的发现将有助于人们对抗癌症。这项研究发表在Nature Cell Biology杂志上。   正确的细胞组织形式对于维持器官正常功能和机体健康至关重要,这包括细胞在组织中的位置和朝向,因为细胞

关于胶质细胞瘤的定位诊断

  主要依靠病史和查体,如一侧肢体的局限性运动性癫痫发作,则说明病变在局限性抽搐对侧的皮层运动区;如以运动性失语(丧失语言的表达能力)为主,说明肿瘤在左侧半球额下回后部;如以感觉性失语(丧失理解语言的能力)为主,肿瘤可能在左侧半球的颞上回后部;如无癫痫发作,而是以进行性偏身瘫痪为主,则说明肿瘤在近内

细胞自噬的蛋白定位介绍

  在研究自噬相关蛋白时,需对其进行定位。由于自噬体与溶酶体、线粒体、内质网、高尔基体关系密切,为了区别,常用到一些示踪蛋白在荧光显微镜下来共定位:  Lamp-2:溶酶体膜蛋白,可用于监测自噬体与溶酶体融合。  LysoTrackerTM 探针:有红或蓝色可选,显示所有酸性液泡。  pDsRed2

细胞内定位的相关介绍

   in vivo的蛋白质研究常常专注于蛋白质在细胞中的合成和定位。虽然已经知道许多细胞内蛋白质是在细胞质中合成,而膜结合蛋白质或分泌性蛋白质是在内质网中合成,但蛋白质定位到特定细胞器或细胞结构的特异性是如何达到的,目前还不清楚。一些有助于获得特定蛋白质在细胞中定位的方法得到了发展,特别是用基因工

细胞亚株的概念

中文名称细胞亚株英文名称cell substrain定  义由原细胞株再次克隆形成的与原株性状有部分不同的细胞群。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞培养与细胞工程(二级学科)

亚细胞成分及组成

细胞是生物体的构造和生理的基本单位,却不能因此认为所有的生物细胞都相同,即使在同一个个体内,也有因为分化而产生各式各样外观与功能不同的细胞,即使相同种类的细胞,也可能正在执行的生理工作也有差异,但是基本上彼此都有共同的基本构造。细胞膜细胞膜为细胞与环境之间以及细胞器与细胞质之间的分界,能够调节物质的

LSCM细胞亚微结构

细胞亚微结构(细胞器探针)一般的光学显微镜由于分辨率有限,在观察细胞器结构时受到一定的限制,而共聚焦激光扫描显微镜可获得较一般普通光学显微镜分辨率高的细胞内线粒体、高尔基复合体、内质网、溶酶体等细胞器图像,同时还可动态观察活细胞状态下细胞器的形态学变化情况,此外还可通过光学切片即断层扫描技术进行三维

亚细胞的成分介绍

细胞是生物体的构造和生理的基本单位,却不能因此认为所有的生物细胞都相同,即使在同一个个体内,也有因为分化而产生各式各样外观与功能不同的细胞,即使相同种类的细胞,也可能正在执行的生理工作也有差异,但是基本上彼此都有共同的基本构造。细胞膜细胞膜为细胞与环境之间以及细胞器与细胞质之间的分界,能够调节物质的

我国科学家将肿瘤定位精度提高到亚毫米级

  中科院合肥物质科学研究院核能安全技术研究所研究团队,研发出多模式图像引导精准放射治疗软件系统,成功将肿瘤跟踪定位精度提高到亚毫米级。这项成果对于提高中国放疗装备的技术水平、打破国外产品垄断和降低治疗价格具有重要作用。  放射治疗是治疗恶性肿瘤的主要手段之一。在放疗过程中,肿瘤精准定位是关键环节之

成体干细胞的非定位性介绍

虽然胚胎干细胞能分化成各种细胞类型,但这种分化是“非定位性”的。当前尚不能控制胚胎干细胞在特定的部位分化成相应的细胞,当前的做法容易导致畸胎瘤。在应用胚胎干细胞治疗前,必须先进行初步的细胞诱导分化,以防止畸胎瘤的发生。应用胚胎干细胞时,也必须确认胚胎干细胞供者没有诸如(肌)营养失调症之类的遗传性疾病