生物信息学教程
Sequence - Evolution - FunctionComputational Approaches in Comparative GenomicsbyEugene V. KooninNational Center for Biotechnology Information, Bethesda, MD, USAMichael Y. GalperinNational Center for Biotechnology Information, Bethesda, MD, USASequence - Evolution - Function is an introduction to the computational approaches that play a critical role in the emerging new branch of biology known as functional genomics.......阅读全文
特征选择在生物信息学中的应用
随着生物信息学的发展,许多模式识别技术无法满足处理大量不相关特征的需求,因此特征选择技术(FS techniques)在生物信息学中的应用就变得越来越重要了。在过去的几年里,应用特征选择技术已经从仅仅作为一个说明性的例子发展到了建立模型所需要的先决条件了。特征选择技术最重要的目的有3点:(1)避免过
生物芯片技术用于生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
生物芯片技术用于生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
成都生物所开发新型生物信息学软件
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472859.shtm 近年来,随着测序技术的快速发展,动物(尤其是非模式动物)全基因组数据(WGS)获取变得简单、便宜,这使得数据库中全基因组数据量呈指数态势增长。全基因组测序数据往往同时包含
生物芯片技术应用与生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
德国生物信息学家发现新冠病毒新弱点
近日,德国的生物信息学家通过计算机模型识别出人体中一种对新冠病毒繁殖至关重要的酶,如果抑制这种酶,病毒就会停止繁殖而不影响宿主细胞。该研究有助于找到对抗新冠病毒感染的新方法。 除了疫苗,寻找有效的治疗新冠病毒感染的药物也是战胜疫情的重要手段之一。现在,来自德国感染研究中心和蒂宾根大学的德尔格
第五届全国生物信息学大会召开
第五届全国生物信息学与系统生物学学术大会日前在哈尔滨召开,来自海内外的600余位生物信息学专家、学者出席会议。与会专家以“高通量时代的生物信息学与系统生物学”为主题,分别就利用基因组信息学分类细菌的新方法、细菌基因组组织形式、系统生物学在医学发展中的应用和研究策略以及基因组非编码
北京大学PLOS生物信息学新成果
近日,北京大学分子医学研究所李川昀课题组与何爱彬研究员合作,在国际著名遗传学杂志《PLOS Genetics》发表一项重要研究成果,题为“Emergence, Retention and Selection: A Trilogy of Origination for Functional De
生物信息学应用:序列分析,电子克隆等初探
生物信息学可指利用信息技术管理和分析生物学数据。这就意味着生物信息学所涉及的范围相当广泛,从人工智能、机器人一直到基因组(genome)分析。就基因组分析这一角度来看,生物信息学主要是指核酸和蛋白质序列数据的计算机处理和分析。近年来,蛋白质结构数据的快速增长,使蛋白质三维结构的处理分析也归入到生物信
上海生科院《Genome-Res》生物信息学新成果
十月十三日,国际基因组研究权威刊物《Genome Research》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所(中国科学院—马普学会计算生物学伙伴研究所)的一项最新研究,题为“A probabilistic method for testing and estimating sele
免水凯氏定氮仪维护保养教程
凯氏定氮仪的分析原理-凯氏定氮法测定试样时,需经过消解、蒸馏、滴定3个过程样品的消解就是将含氮的有机化合物与硫酸和催化剂一同加热消化,使有机氮分解,分解的氨与硫酸结合生成硫酸按样品经过消解后将试样中有机氮转化为无机氮,再将消解后的样品加入到定氮仪蒸馏器中进行碱解蒸馏。 免水
抢救必备教程:关键时刻你会输血吗?
输血作为临床上常用的替代性治疗手段,起到了补充血容量、改善循环、增强免疫力和凝血功能等诸多神奇作用。但输血过多会使机体出现各种酸碱平衡紊乱,甚至多器官脏器功能衰竭,输血不足又不能起到预期的治疗效果。 那么如何输血才能把血用到「刀刃」上呢? 血制品的种类:种类丰富的血制品,临床上常用的主
有机沉淀法总蛋白提取实用小教程
从植物叶片提取的植物总蛋白不但是家养类动物生长发育的重要营养物质,而且是具有潜力的新一代营养保健食品,因而掌握植物叶蛋白的提取方法至关重要,让我们一起了解这整个实验原理和过程吧。 一、实验目的 熟悉植物叶蛋白的几种提取原理和方法,了解其意义及其应用价值。 二
免疫共沉淀(CoIP)详细步骤教程(一)
一、原理:免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。其原理是:当细胞在非变性条件下被裂解时,完整细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间的相互作用被保留了下来。如果用
Elveflow微流控器官培养套装的使用教程
微流控器官培养或类器官培养/模拟在当前的科学研究中处于风口浪尖上,尤其是多个类器官的模拟更是受到了很多研究人员的热捧。在这些类器官的模拟实验中,通常需要连续进行数天或数周的实验,在这种情形下,一个稳定、快捷、高效的微流控器官培养套装可以解决大部分实验中出现的问题。本文简要介绍用于微流控器官培养实验方
免疫共沉淀(CoIP)详细步骤教程(二)
注意:在准备做磷酸(酯)酶实验的时候,不加磷酸酯酶抑制剂工作液配制:配制100ml的modified RIPA buffe:1. 称取790mg 的Tris-Base,加到75ml 去离子水中,加入900mg的NaCl,搅拌,直到全部溶解,用HCl调节PH值到7.42. 加10 ml 10%的NP-
抢救必备教程:关键时刻你会输血吗?
输血作为临床上常用的替代性治疗手段,起到了补充血容量、改善循环、增强免疫力和凝血功能等诸多神奇作用。但输血过多会使机体出现各种酸碱平衡紊乱,甚至多器官脏器功能衰竭,输血不足又不能起到预期的治疗效果。那么如何输血才能把血用到刀刃上呢?血制品的种类种类丰富的血制品,临床上常用的主要包括血细胞、血浆和血浆
生物信息学技术分离蛋白质组的介绍
生物信息学在生命科学研究中起着越来越重要的作用。利用生物信息学对蛋白质组的各种数据进行处理和分析,也是蛋白质组研究的重要内容。生物信息学是蛋白质组学研究中不可缺少的一部分。生物信息学的发展,已不仅是单纯的对基因组、蛋白质组数据的分析,而且可以对已知的或新的基因产物进行全面分析。在蛋白质组数据库中
生物信息学技术:基因芯片实验原理与方法
本实验的目的是学会cDNA芯片的使用方法。了解各种基因芯片的基本原理和优缺点。基因芯片这一技术方法在1991年的Science杂志上被提出,其高通量、并行检测的特点适应了分析人类基因组计划所提供的海量的基因序列信息的需要,可以说,人类基因组计划是基因芯片技术发展的原因,而对深人研究基因突变和基因表达
生物信息学数据库和软件的搜索实验
实验方法原理熟练掌握上网搜索生物信息学数据库和软件的方法及技能。实验材料电脑实验步骤一、搜索生物信息学数据库或者软件数据库是生物信息学的主要内容,各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。核酸序列数据库有GenBank, EMBL, DDB等,蛋白质序列数据库有SWISS-PROT, PIR,OWL,
新款大肠杆菌定性测试仪的使用教程
主要点: 1.比传统检测饮用水、污染水、地表水、水处理及再生水的MF或MTF方法更加便捷,数据更可靠; 2.不需要复杂、昂贵的实验室器材和业人员即可现场测试,而且简单方便,操作方法更容易掌握; 3.现场测试减少了由于运输及保持时间引起的误差,这样可确保准确采样; 4.使水资源和健康家可以行
网页结构的简介和Xpath语法的入门教程
相信很多小伙伴已经听说过Xpath,之前小编也写过一篇关于Xpath的文章,感兴趣的小伙伴可以戳这篇文章如何利用Xpath抓取京东网商品信息以及Python网络爬虫四大选择器(正则表达式、BS4、Xpath、CSS)总结。今天小编继续给大家介绍一些Xpath知识点,希望对大家的学习有帮助。1
全面总结光纤光谱仪的使用方法教程
全面总结光纤光谱仪的使用方法教程 光纤光谱仪的作用 红外光谱仪可用于研究分子的结构和化学键,也可以作为表征和鉴别化学物种的方法。红外光谱具有高度特征性,可以采用与标准化合物的红外光谱对比的方法来做分析鉴定。利用化学键的特征波数来鉴别化合物的类型,并可用于定量测定。可用于不同种类高分子材料的鉴别研
关于酸度计(PH计)使用与维护教程
实验室常规测定PH值最常用、最经济的测试方法是采用PH试纸,而PH试纸所提供的仅仅为PH值的范围值,对于需要精确知道PH值无能无为。酸度计是可以提供精确PH值的测试仪器。由于酸度计的价格高且属于敏感耗材,正确掌握酸度计的使用以及维护教程显得尤为必要。酸度计,又称为PH计,是测量溶液中氢离子的活度仪器
2D电泳实验教程之第二向电泳
1.配制10%的丙烯酰胺凝胶两块。配80ml凝胶溶液,每块凝胶40ml,将溶液分别注入玻璃板夹层中,上部留1cm的空间,用MilliQ水、乙醇或水饱和正丁醇封面,保持胶面平整。聚合30分钟。一般凝胶与上方液体分层后,表明凝胶已基本聚合。2.待凝胶凝固后,倒去分离胶表面的MilliQ水、乙醇或水饱和正
专家介绍柱温箱的故障与维修使用教程
对于流动相温度的控制目前没有很好的方法,即使是整个室内使用空调也难于使流动相的温度保持一致,因此,目前大多采用柱温箱控制柱温的方法,使用柱温箱能耗低,控温精度高,是液相色谱仪必备的辅助设备。 柱温箱故障与维修 高效液相色谱仪的温控系统是由温控器及柱温箱组成,通过设定温度,温控系
PEA植物效率分析仪数据处理方法教程
前言及原理:Kautsky和Hirsh(1931)最先认识到光合原初反应和叶绿素荧光存在着密切关系。他们第一次报告了经过暗适应的植物绿色材料照光后,叶绿素荧光先迅速上升到一个最大值,然后逐渐下降,最后达到一个稳定值。此后,随着研究的深入,人们逐步认识到荧光诱导动力学曲线中蕴藏着丰富的信息。图1 用脉
专家介绍柱温箱的故障与维修使用教程
对于流动相温度的控制目前没有很好的方法,即使是整个室内使用空调也难于使流动相的温度保持一致,因此,目前大多采用柱温箱控制柱温的方法,使用柱温箱能耗低,控温精度高,是液相色谱仪必备的辅助设备。 柱温箱故障与维修 液相色谱仪的温控系统是由温控器及柱温箱组成,通过设定温度,温控系统可以避免
水分测定仪的寿命不会缩短的方法教程
水分检测仪能够检测各类有机及无机固体、液体、气体等样品中含水率的的仪器,一定要避开以下几点才能使水分测定仪的使用寿命不会缩短。一是避开放光直射处;二是避开湿度大电源波动大的环境三是避开腐蚀性气体的环境这是水分测定仪在安装时候的根本。其他事项:当然还需要注意的是水分仪在当次用完了之后放在干燥处,待下次
变送器的零点调整及测量范围设置教程
变送器是横河电机产品,在我国各行业都有不同型号的EJA变送器在使用。变送器说明书和相关技术资料,整理了EJA变送器的零点调整及测量范围设置教程,方便新手使用。1、EJA智能变送器的零点调整①利用EJA变送器外调零螺钉调零利用EJA变送器上的外调零螺钉调零,将输出准确调整至4mADC或可用电流表准确读