上海生科院《GenomeRes》生物信息学新成果
十月十三日,国际基因组研究权威刊物《Genome Research》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所(中国科学院—马普学会计算生物学伙伴研究所)的一项最新研究,题为“A probabilistic method for testing and estimating selection differences between populations”。该研究介绍了一种新的群体遗传学数据分析方法,这种概率统计方法可用于检测和估算群体间的选择差异。延伸阅读:序列分析/生物信息学的十个手机应用程序。 本文第一作者兼通讯作者是中科院—马普学会计算生物学伙伴研究所的何云刚研究员,他主要从事人类群体遗传学和计算基因组学研究,并着重于基因组多态性的群体遗传学, 计算基因组学和疾病研究中的计算生物学问题。部分相关工作发表在PNAS、Cell Research等杂志。中科院院士、教育部长江学者讲座教授、国家“千人计划”金......阅读全文
遗传差异让小鼠变身“施瓦辛格”
PLoS ONE:此研究有助于探索人类肌肉萎缩症的治疗 利用特定的遗传差异,科学家创造了小鼠中的“施瓦辛格”,它的肌肉质量超过普通小鼠四倍。该研究成果有助于探索人类肌肉萎缩症、艾滋病以及癌症引起的肌肉损失。相关论文发表在近期的PLoS ONE上。 进行该项研究的是美国约翰·霍普金斯大学医学院的Se
物种的定向选择和自然选择的差异
定向选择就是指生存环境的方向性选择(自然选择)或品种的人工定向选择。自然选择在一定程度上是随机的,但也绝非漫无方向,它与生存环境、生态功能以及生物的体制等均息息相关。
遗传多样性的差异显示PCR介绍
可以用来研究同一个体不同生长时段和不同组织(或分化结构)或者不同个体之间基因表达差异.原理是:根据中心法则,每一个阅读框要表达必须先转录成mRNA.那么在不同细胞内只要存在基因差异表达现象,肯定就会存在不同的mRNA.我们可以提取细胞的mRNA,然后将其反转录为cDNA,并以此来作为PCR模板.
Nature子刊:决定生死的遗传学差异
我们每天都会吞入大量的微生物,但因为肠道有着成熟的免疫系统,我们并不会因此病倒。不过,肠道的防御能力是因人而异的。科学家们一直在探索一个问题,遗传学组成究竟是如何影响肠道免疫力的。 健康肠道具有各种各样的细菌,有些细菌帮助我们消化和处理食物,有些细菌则会引发感染。为此,肠道发展出了广泛的防御体
南北方6大遗传差异首次被揭示
图片来源于网络 南方人免疫力更强,后代身高或可通过基因测算? 10月10日,华大在深圳国家基因库正式对外发布一项迄今为止最大规模的中国人基因组学大数据研究成果。这是由中国科学家主导,历时两年,对14余万中国人的无创产前基因检测数据进行深入研究后,首次揭秘中国人群基因遗传特征的科研成果,也是由华
研究揭示中外猪种产肉性状差异遗传机制
中国农业科学院深圳农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队研究揭示了中国地方猪和西方瘦肉型猪在产肉性状及骨骼肌生长发育中的差异分子调控机制,为猪的分子设计育种提供了重要理论依据。相关研究成果发表在《公共科学图书馆:遗传学(PLoS Genetics)》上。生猪是我国农业支柱产业之一。我国养猪历史
遗传病的基因诊断选择
一、直接诊断和间接诊断 基因诊断可分为两类:一类是直接检查致病基因本身的异常。它通常使用基因本身或紧邻的DNA序列作为探针,或通过PCR扩增产物,以探查基因无突变、缺失等异常及其性质,这称为直接基因诊断,它适用已知基因异常的疾病;另一类是基因间接诊断。当致病基因虽然已知但其异常尚属未知时,或致
科学家发现欧亚人群复杂疾病遗传基因差异
记者4月11日从中科院昆明动物研究所获悉,日前,该所科学家通过国际合作,在复杂精神疾病——双向情感障碍的遗传学分析上取得成果,鉴定了个欧洲人群中新的双向情感障碍易感基因。此外,该研究也揭示了在复杂病症的遗传方面,不同种族人群的进化差异是导致易感基因差异的重要原因之一。 复杂疾病,也被称为多
对光选择吸收性质的差异检查药物杂质探析
药物中所含有的杂质可分为无机杂质如氯化物、硫酸盐、硫化物、氰化物和重金属等;有机杂质比如有机药物中引入的原料、中间体、副产物、分解物、异构体和残留溶剂等。按杂质的来源可为一般杂质和特殊杂质。一般杂质是指在自然界中分布较广泛,在多种药物的生产或贮藏过程中容易引入的杂质,如酸、碱、水分、氯化物、硫酸
Science:表观遗传学调控颠覆性别差异老观点
英国生物信息学研究所EMBL-EBI和德国Max Planck免疫表观遗传学研究所MPI的研究人员发现了细胞同时调节多种不同基因活性的方式。这一研究成果发表在Science杂志上,揭示了性别差异背后的重要机制,颠覆了此前的普遍观点。 该研究分析了果蝇调控一系列重要基因的机制。雌性果蝇拥
研究揭示我国不同尾型绵羊品种群体的遗传差异
近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所科研人员检测我国不同尾型的地方绵羊品种,发现不同群体特有和共有的ROH基因组区段,为保护和开发利用我国地方绵羊品种、深度挖掘功能基因提供了参考。相关成果发表在《畜牧与生物技术杂志(Journal of Animal Science and Biotechno
关于遗传多态性的遗传机制—杂合体的选择优势
在杂合体具有选择优势的情况下遗传多态性得以保持。人类的镰形细胞贫血基因HbS和野生型基因HbA是共显性的。正常纯合体HbA/HbA不患贫血症,可是对于疟疾的抵抗力较弱;镰形细胞纯合体(HbS/HbS)对于疟疾有较强的抵抗力,可是患贫血症,常在幼年死亡。杂合体HbA/HbS既不是贫血症患者,又对于
干细胞基因选择影响人群环境适应遗传
紫外辐射与气温是随纬度变化而变化的环境因子。在人类遗传上,是否存在同时导致对这两种环境因子变化适应的基因,一直是学界探寻的课题。我国多机构研究人员合作的一项最新成果,在进化遗传学国际期刊《分子生物学与进化》上回答了这一疑问。 据中国科学院昆明动物研究所宿兵研究员介绍,现代人在20至30万年
人工遗传回路模拟细胞如何选择“命运”
科技日报北京1月25日电 (记者张梦然)据最新一期《科学》杂志报道,美国加州理工学院研究人员开发出一种人工遗传回路,可展示细胞是如何选择其“命运”的。我们每个人开始时都是一个细胞,然后增殖成数万亿个细胞构成人体。尽管每个细胞都具有完全相同的遗传信息,但每个细胞也都发挥着特殊的功能:神经元控制着我们的
分子遗传学词汇选择性转录
中文名称:选择性转录英文名称:alternative transcription定 义:同一基因在不同组织中转录时,由于起始位点不同而生成不同的mRNA,即在某种组织中只产生某种转录物。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
表观遗传学揭示恶性儿童白血病患者的差异
《自然—通讯》近日发表的两项独立研究鉴定出了幼年型粒—单核细胞白血病的三种新亚组(JMML),它们可以预测病人结局,包括最有可能发生疾病自行消退的病人。图片来源于网络 幼年型粒—单核细胞白血病(JMML)是一种恶性儿童癌症,治疗手段有限。目前的JMML临床和遗传标记没有解释与该疾病相关的不同临
破解性别认同障碍:一组操纵男女大脑差异的遗传密码
哥伦比亚大学的研究人员在线虫性成熟过程中发现了一条全新的遗传途径,该途径可能对人类有同样作用。 研究人员确定了一组基因可以诱导雄性和雌性线虫采取不同路线进行大脑发育,并触发青春期的开始。在哥伦比亚大学领导下,这项研究为神经发育过程中的性别差异的直接遗传效应,提供了新的证据,并为了解男性和女性的
常规油料的烟点值差异以及测量方法的最佳选择
油脂的烟点是油脂质量指标之一,烟点高的油脂热稳定性在一定时期内较好,油炸食品及烹饪操作环境卫生条件较好,食品风味好,但是相对应的也有一定的不利之处,高烟点必将受加工过程高温的影响,将会降低消化吸收率和营养价值,而且使油中的天然抗氧化剂大大减少,储存安全性降低,含油食品货架期缩短。烟点的测定使用最
分子遗传学词汇非选择性标记
微生物遗传学上:观察者在一次试验中没有使用的,观察对象具体的(遗传)标记。
抑郁症居然也“男女有别”,科学家发现遗传基础差异
这项发表在 Biological Psychiatry 期刊上的研究,对死后抑郁症患者的大脑进行了分析。分析的结果暗示着,若对男性和女性患者开展不同诊疗方案,抑郁症的治疗将会更加有效。 这项研究是如何开展的呢?匹兹堡大学和多伦多成瘾与心理健康中心的研究人员分析了50名重度抑郁症患者死后脑组织中
如何追求健康的长寿?遗传基因仅能解释16%的寿命差异
美国哥伦比亚大学计算生物学家厄利希等人在《科学》杂志上发表论文,报告了他们通过对跨越11个世代涉及1300万人的家谱分析得出的惊人结论:遗传基因仅能解释16%的寿命差异,其余由环境因素决定,甚至外因比内因的作用更有决定性。那些拥有“长寿”基因的人,平均能延长5年寿命,但吸烟等不良生活习惯却能让他
荧光定量PCR(qPCR)内参的选择对基因表达差异分析结果的...
荧光定量PCR(qPCR)内参的选择对基因表达差异分析结果的影响与应用实时荧光定量PCR技术是在常规PCR基础上加入荧光标记探针或相应的荧光染料来实现其定量功能的。由于其精准度好、灵敏度高,在分子生物学研究和医学研究等方面得到了广泛的应用,尤其是在基因表达差异分析方面。基因表达差异分析一般是比较不同
昆明动物所等人群大脑结构差异遗传基础研究取得新进展
抑郁症是困扰人类的重大精神疾病之一,早期的双生子研究和领养研究证实,抑郁症是由遗传因素与外界环境共同作用的一种疾病。近年来,随着研究手段的不断成熟以及样本量的逐渐增大,越来越多的抑郁症易感基因被报道出来,然而绝大多数易感基因在中枢神经系统中的作用仍不甚清楚。 SLC6A15基因是
昆明动物所揭示人群进化历史差异对复杂病遗传分析的影响
目前,复杂疾病(如双向情感障碍、抑郁症等)的遗传学分析已在世界范围人群中广泛开展。然而,即使是大样本量和高密度SNP的分析,在不同样本尤其是遗传背景差异很大的人群中往往不能重复出疾病易感基因的相关性。人群生活的环境因素,如气候、饮食和生活方式等可能是造成这种差异的原因,但更重要的原因可能是由于易
两篇Cell分析17万人血细胞遗传差异与疾病关系
11月18日在Cell上,2篇 BLUEPRINT 和 IHEC consortia项目支持的里程碑式研究文章显示血细胞与三大免疫细胞的特性和数量如何变化以至于影响一个人出现复杂疾病如心脏病,类风湿性关节炎、哮喘、腹腔疾病和1型糖尿病这些自身免疫性疾病的风险。 连同其它发表在别的高影响力期刊的
遗传发育所发现两个WRKY转录因子差异调控小麦耐逆性
WRKY类转录因子调控植物生长发育的多个方面,其基因表达也受到多种非生物胁迫的影响。但这类转录因子在植物尤其是农作物耐受非生物胁迫方面的作用研究较少。 中科院遗传与发育生物学研究所陈受宜、张劲松和张正斌3个实验室合作分析了小麦中WRKY转录因子基因家族的成员,鉴定了胁迫应答基因,并研究了相
分子遗传学词汇选择性转录起始
中文名称:选择性转录起始英文名称:alternative transcription initiation定 义:不同的启动子对RNA聚合酶有不同的亲和力,可在不同的启动子上有选择地启动基因转录。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
RNA编辑:肿瘤和遗传疾病治疗的新选择
2018年,美国FDA和欧洲EMA批准了来自RNA药物制造两大巨头Ionis Pharmaceuticals公司的反义寡核苷酸疗法药物Tegesedi(Inotersen)和Alnylam Pharmaceuticals公司的siRNA疗法药物Onpattro(Patisiran),用于治疗遗传
差异表达
· What's Differential Display (GenHunter)Introduction to differential display technique· Differential Display (Chun-Ming Liu)The f
苦荞驯化过程中大多数差异代谢物受到选择
近日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用团队系统描述了荞麦在驯化过程中的代谢组变异图谱,揭示了苦荞重要代谢物定向变化的遗传机制,为苦荞药用特性和抗病性的遗传改良提供了理论依据。相关研究成果在线发表于《植物生物技术》(Plant Biotechnology Jo