以斑马鱼胚胎为模型研究胚胎发育早期的自我保护机制

当生物体遇到药物或化学污染物入侵时,它会应激性地提高自身转化及外排能力,从而尽快将外源物降解或排出体外,从而实现自我保护,这一作用也被称作生物体的外源物抵御作用。由于该作用决定了药物或污染物在体内的停留时间,从而影响了药物药效或化学污染物毒性的发生,因而受到药物学及环境毒理学研究的广泛关注。 通常,生物体的外源物抵御作用由多个蛋白体系共同完成。其中,ABC转运蛋白(ATP Binding Cassette Transporters)的作用得到了越来越多的重视。该蛋白是一个包含200多种蛋白的超家族,在一系列真核和原核生物中均有表达,且广泛分布于肿瘤、肝脏、肾脏以及血脑屏障等器官组织中,是肿瘤细胞多药耐药、细菌耐药、血脑屏障、胎盘屏障药物抵御以及水生动物污染物毒性抵御的主要原因。特别的,针对癌症病人的化疗处理失败的主要原因即在于ABC转运蛋白家族中的ABCBs(包括Pgp与Bsep等)、ABCCs(如Mrps)及ABCGs(......阅读全文

-Nat-Commun:斑马鱼可用于癫痫药物筛选

  化学药物Clemizole在“Dravet综合症”的一个斑马鱼模型中能有效防止癫痫类发作。在Nature Communications上发表的这一发现确认了一个新方法,后者有可能被用来识别癫痫病的另类疗法。   “Dravet综合症”是一种从婴儿时期开始的严重癫痫,以严重的、自发的和复发的

斑马鱼基因敲除是怎么做的

  一、基因敲除的设计方案   1.1 基因的基本信息   确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。   1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析   1.3分析蛋白质的保守结构功能域   通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。   1.4

除了小鼠,斑马鱼也被盯上了-|-PNAS

  植有人类肿瘤细胞(红色)的斑马鱼胚胎,这一模型有望帮助医生快速筛选癌症患者最佳的治疗方案(图片来源:Rita Fior团队)  最新一期《PNAS》在线发表了一篇题为“Single-cell functional and chemosensitive profiling of combinato

斑马鱼基因敲除是怎么做的?

一、基因敲除的设计方案1.1 基因的基本信息确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR,分析其效率及脱靶的情况一般使用C

敲降斑马鱼基因的方法学比较

  一、基因敲降的前期准备工作相同   1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。   1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎(通常为48 hpf前的胚胎),提取总RNA,然后进行体外转录(RT)。   1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物,以1.2获得的cDNA为模板,

斑马鱼基因敲除是怎么做的

  一、基因敲除的设计方案   1.1 基因的基本信息   确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。   1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析   1.3分析蛋白质的保守结构功能域   通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。   1.4

斑马鱼嗅觉作用主要是左鼻子

斑马鱼嗅觉作用主要是左鼻子   如同人有“左撇子”一样,鱼也有类似“左撇子”的鼻子。   日前,日本名古屋市立大学与国立遗传学研究所的一项新研究发现,斑马鱼发挥嗅觉作用的主要是左鼻子。相关研究论文在线刊登在了近期出版的《自然—神经科学》(Nature Neuroscience)杂志上。  

寄生虫感染或破坏斑马鱼实验

  研究人员表示,一种感染实验室斑马鱼的常见寄生虫可能令多年的行为实验结果产生混淆。不过,批评者认为,这个案例仍有待证实。  和小鼠一样,斑马鱼被用在全球的实验室中,以研究从药物疗效到诸如精神分裂症和自闭症等遗传性疾病和障碍的所有事情。由于斑马鱼和人类都具有高度社会性,因此研究人员认为,和啮齿类动物

敲降斑马鱼基因的方法学比较

  一、基因敲降的前期准备工作相同   1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。   1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎(通常为48 hpf前的胚胎),提取总RNA,然后进行体外转录(RT)。   1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物,以1.2获得的cDNA为模板,

Dev-Cell:转基因斑马鱼的彩色皮肤

  美国杜克大学的研究人员,利用基因工程改造的方法,造成单个的皮肤细胞可以产生70种不同颜色的荧光。该研究发表在最近的《Developmental Cell》上。  该团队并非是为了好玩才做成这样五彩斑斓的斑马鱼,实际上,他们希望通过颜色标记来研究斑马鱼皮肤的愈合。利用颜色来标记细胞,可以让斑马鱼皮

敲降斑马鱼基因的方法学比较

一、基因敲降的前期准备工作相同1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎(通常为48 hpf前的胚胎),提取总RNA,然后进行体外转录(RT)。1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物,以1.2获得的cDNA为模板,进行PCR扩增,确认目标基因

Nature:系统解析斑马鱼参考基因组

  斑马鱼(Zebrafish)是研究发育生物学的新兴模式动物。斑马鱼由于具有饲育容易、胚胎透明、体外受精、突变种多、遗传学工具成熟等诸多优点,近年来已成为研究脊椎动物发育与人类遗传疾病的新兴模式动物。   近日,英国桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)

两篇Cell文章发现精子的作用远不止DNA遗传

  一般认为胚胎早期发育过程中,精子仅仅提供DNA遗传信息,其它方面主要由卵细胞决定,然而最新一期(5月10日)Cell杂志上接连公布了两项研究成果,指出精子的表观遗传学信息也会影响子代胚胎发育,这颠覆了传统上认为早期胚胎发育主要是由卵子决定的观念,也对于发育生物学和癌症生物学具有重要的意义。  

研究揭示RNA甲基化调控斑马鱼母源mRNA稳定性机制

  斑马鱼母源-合子转换 (maternal-to-zygotic transition, MZT)过程伴随着母源RNA和蛋白质的降解以及合子基因组的激活(maternal-to-zygotic transition, ZGA)。已有研究表明多种关键因素通过母源和合子途径促进母源mRNA降解,其中包

科研人员利用斑马鱼探究增塑剂DBP的水生态毒理

西北农林科技大学动物科技学院水域生态团队基于前期黄河流域(陕西段)中增塑剂污染情况的调研工作基础,使用斑马鱼探究了典型增塑剂—邻苯二甲酸二丁酯(Dibutyl Phthalate,DBP)的水生态毒理,从mtDNA-cGAS-STING信号通路角度为增塑剂的水生态毒理研究提供了新的视角,近日该研究成

水生所在鱼类诱导型原始生殖细胞理论和技术方面获进展

  原始生殖细胞(primordial germ cell,PGC)是精子和卵子在胚胎期的祖先细胞(progenitor cell),是遗传物质代际传递的细胞载体。因此,PGC是开展基因编辑和转基因等遗传操作的理想靶细胞。将遗传操作后的PGC移植入内源PGC剔除的受体胚,利用受体高效产生遗传操作的供

双酚A及其替代品双酚S同样“有毒”

  双酚A,称为BPA,在世界各地大量生产用于消费性产品,包括家用塑料制品。制造塑料容器剩余的双酚A都大概渗入到所盛的液体中,然后进入人体。为回应消费者对于安全性的担忧,许多厂家用一种称为双酚S(BPS)的化学物质来代替双酚A,通常被标记为“不含双酚A”,并被认为是安全的。  2015年1月12日在

深受科学家的热爱斑马鱼基因编辑技术介绍

  斑马鱼又叫蓝条鱼,因为其体表有暗蓝色和银色的类似于斑马一样的条纹而命名。斑马鱼属于鲤科鱼类,同属鲤科的还有我们十分熟悉的鲤鱼、鲫鱼等。斑马鱼的体型较小,成鱼体长约4-6厘米,而且成鱼常年产卵且产卵量大,可达300-1000粒,还是体外受精并发育,因此十分适合进行实验室的大规模养殖与筛选。

深受科学家的热爱斑马鱼基因编辑技术介绍

  斑马鱼又叫蓝条鱼,因为其体表有暗蓝色和银色的类似于斑马一样的条纹而命名。斑马鱼属于鲤科鱼类,同属鲤科的还有我们十分熟悉的鲤鱼、鲫鱼等。斑马鱼的体型较小,成鱼体长约4-6厘米,而且成鱼常年产卵且产卵量大,可达300-1000粒,还是体外受精并发育,因此十分适合进行实验室的大规模养殖与筛选。

水生所构建出能标示肝脏全程发育的转基因鱼

  脊椎动物的器官形成是一个复杂而又难以看到的发育过程。然而,依赖于转基因技术发展起来的细胞命运追踪和组织特异呈像就像黑暗中的灯光,可以照亮器官发生难以观察到的细节。就肝脏器官发育研究来说,本世纪以来虽已获得过几个标示肝脏发育的转基因斑马鱼品系,但迄今还没有报道过能标示肝脏全程发生特别是前期发育的转

新技术追踪单个细胞如何产生完整身体

生物学最大的谜题之一是单个受精卵如何产生众多组合在一起形成身体的细胞类型、组织和器官。如今,由单细胞测序技术和计算工具构成的组合体正在为这一过程提供迄今最详细的画面。在3篇日前在线发表于《科学》杂志的论文中,研究人员报告称拍下了正在发育的斑马鱼或青蛙胚胎中大多数细胞基因活性的多个快照。随后,他

基因组所最新成果揭示精子对遗传使命的新贡献

  20世纪生命科学的快速发展证实了遗传的物质载体是DNA,DNA序列可以稳定地从父母遗传到子代中去,从而使物种得以延续。但如果仅仅只是DNA序列的遗传,难以解释为什么一个受精卵细胞可以发育成一个包含多种不同细胞、组织和器官的复杂生命个体。   最近20年的研究发现,表观遗传信息通过有序地开启和关

科研人员利用斑马鱼探究增塑剂DBP的水生态毒理

西北农林科技大学动物科技学院水域生态团队基于前期黄河流域(陕西段)中增塑剂污染情况的调研工作基础,使用斑马鱼探究了典型增塑剂—邻苯二甲酸二丁酯(Dibutyl Phthalate,DBP)的水生态毒理,从mtDNA-cGAS-STING信号通路角度为增塑剂的水生态毒理研究提供了新的视角,近日该研究成

孕期补“酸”已成为共识,上海海洋大学团队发声:需谨慎

叶酸是B族维生素的一种,孕期补充叶酸已成为共识。那么,叶酸是不是补充得越多越好?近日,上海海洋大学水产与生命学院副教授祖尧团队研究发现,其答案是否定的。通过斑马鱼研究,作者发现叶酸摄入不足或过量补充均可能导致胚胎心脏发育异常。它首次阐明了叶酸对早期心脏发育的作用机制,为叶酸的合理补充的剂量提供了科学

中科院华南植物园通过斑马鱼快速检测水源毒性

  近期,记者从中科院华南植物园获悉,由该园研究员陈峰完成的“斑马鱼测试水质及其毒性的用途和方法”获得国家发明ZL授权。  据介绍,对日益恶化的水源污染问题,自来水厂所采取的方式是加入大量超过标准的氯(漂白粉)来消毒杀菌。加氯虽然能够杀死水中的各种病菌,但它一旦与水中的有机物结合,会产生大量如三氯甲

Development:一种能阻止性别反转的关键基因

  生物通报道:来自中科院遗传与发育生物学的研究人员发表了题为“Translation repression by maternal RNA binding protein zar1 is essential for early oogenesis in zebrafish”的文章,发现斑马鱼zar

水生所揭示急性白血病基因MLL对斑马鱼血细胞发生的作用

  急性白血病基因MLL编码一个组蛋白甲基化转移酶,能通过表观遗传机制调控Hox等基因的表达。它与70多种基因发生重排是导致急性淋巴细胞白血病(ALL)和急性骨髓性白血病(AML)发生的主要原因。由于小鼠mll基因敲除导致早期胚胎死亡,因此对于它在早期胚胎发育中的作用及其分子机制仍很不

研究发现一些3D打印物品有毒

  研究发现一些3D打印物品有毒  可致斑马鱼胚胎存活率大幅下降  美国加州大学河滨分校的研究人员发现,一些商业3D打印机制造的物品对某些鱼类胚胎来说具有致命毒性。随着3D打印设备逐渐向家庭普及,这一研究结果提出了如何处理3D打印的部件和废料等问题。  加州大学河滨分校官网4日发布的新闻公报称,伯恩

平生医疗Micro-CT小动物成像在斑马鱼基因突变个体观察...

平生医疗Micro CT小动物成像在斑马鱼基因突变个体观察的应用前言 斑马鱼与哺乳动物基因组和蛋白调控机制有高度同源性,而且个体小、生殖周期短、繁殖能力强、易于饲养、体外受精、胚胎透明且发育迅速等诸多方面的优点,被广泛应用于药物筛选、毒性检测和发育研究等科学领域。由于硬骨鱼和人类在骨骼发育过程中的基

Science:震撼视频!哈佛科学家揭示“胚胎发育”最详细过程

一个受精卵究竟是如何产生构成完整身体的多种细胞类型、组织和器官的?这是生物学领域最大的谜题之一。如今,结合单细胞测序技术和新型计算工具,来自哈佛大学、Broad研究所等机构的科学家们提供了关于这一过程最详细的图片。4月26日,Science杂志用3篇论文报道了这一突破性成果。为了追踪数千个细胞及其后