微卫星不稳定型肿瘤细胞生存所必需的——Werner螺旋结构
微卫星是基因组中不到10个核苷酸的简单重复序列,微卫星不稳定性(MSI)是指由DNA 错配修复异常造成DNA在复制和重组过程中发生的碱基错误插入,缺失以及合并,从而导致微卫星序列发生改变的现象。许多肿瘤中都存在MSI现象。由于MSI与免疫检查点阻断反应之间存在着显著相关性,但仍有45-60%的MSI型肿瘤并不会对免疫检查点阻断反应产生应答,并且免疫阻断治疗方法存在着一定的毒性。合成致死(synthetic lethality,SL)是指一类两个遗传事件共同发生,导致有机体或者细胞死亡的遗传作用。MSI型肿瘤和DNA损伤修复缺陷之间是否也存在合成致死的关系? 美国科学家Adam J. Bass和Francisca Vazquez在Nature上合作发表了WRN helicase is a synthetic lethal target in microsatellite unstable cancers的研究成果,提出了Re......阅读全文
微卫星不稳定型肿瘤细胞生存所必需的——Werner螺旋结构
微卫星是基因组中不到10个核苷酸的简单重复序列,微卫星不稳定性(MSI)是指由DNA 错配修复异常造成DNA在复制和重组过程中发生的碱基错误插入,缺失以及合并,从而导致微卫星序列发生改变的现象。许多肿瘤中都存在MSI现象。由于MSI与免疫检查点阻断反应之间存在着显著相关性,但仍有45-60%的M
微卫星不稳定(MSI)检测将如何变革肿瘤个性化治疗?
从临床的肿瘤诊疗从放、化疗时代过渡到靶向、免疫治疗时代开始,按照生物标记物划分肿瘤类型,逐渐成为一种与传统的按原发器官分类并行的肿瘤区分方式。在越来越多的肿瘤新药适应症里,已经不会简单罗列*期*癌,而是出现了如EGFR基因突变的III期肺癌、HER2基因突变的III期乳腺癌等字样。 2017年,FD
微卫星标记的概念
微卫星标记(microsatellite),又被称为短串联重复序列(short tandem repeats,STRs)或简单重复序列(simple sequence repeats,SSR),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,由2~6个核苷酸的串联重复片段构成,由于重复单位的重复次数在个
微卫星DNA的特点
⑴种类多、分布广,并按孟德尔共显性方式在人群中世代相传。在基因组中平均50kb就有一个重复序列,突变率低(< 0.04%)。⑵在人群中高度多态,其多态信息含量容量超过70%。其多态性表现为正常人群的不同个体某一基因位点重复序列的重复次数可不一样,同一个体的两个同源染色体上重复次数也可以不一样,即微卫
微卫星DNA的特点
⑴种类多、分布广,并按孟德尔共显性方式在人群中世代相传。在基因组中平均50kb就有一个重复序列,突变率低(< 0.04%)。⑵在人群中高度多态,其多态信息含量容量超过70%。其多态性表现为正常人群的不同个体某一基因位点重复序列的重复次数可不一样,同一个体的两个同源染色体上重复次数也可以不一样,即微卫
微卫星标记的分类
Weber 将微卫星分为3 类:单纯(pure) SSR、复合(compound) SSR,和间隔(interrupted) SSR。所谓单纯SSR 是指由单一的重复单元所组成的序列,如(AT) n;复合SSR 则是由2 个或多个重复单元组成的序列,如(GT)n(AT)m;间隔SSR 在重复序列中有
微卫星DNA的特点
⑴种类多、分布广,并按孟德尔共显性方式在人群中世代相传。在基因组中平均50kb就有一个重复序列,突变率低(< 0.04%)。⑵在人群中高度多态,其多态信息含量容量超过70%。其多态性表现为正常人群的不同个体某一基因位点重复序列的重复次数可不一样,同一个体的两个同源染色体上重复次数也可以不一样,即微卫
微卫星DNA分析技术
微卫星DNA(MicrosatelliteDNA),又称为短小串联重复(Shorttandemrepeats,STR)或简单重复序列(Simplerepeatsequence,SRS或SSR),广泛存在于原核生物和真核生物基因组中,常见的有二、三、四核苷酸重复序列,约占真核生物基因组的5%,其基本构
序列标记微卫星的定义
中文名称序列标记微卫星英文名称sequence tagged microsatellite;SIMS定 义染色体上已定位的、核苷酸序列已知的微卫星重复序列。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
微卫星DNA的基本介绍
微卫星DNA,重复单位序列最短,只有1~6bp,串联成簇,长度50~100bp,又称为短串联重复序列(Short Tandem Repeat STR)。广泛分布于基因组中。 其中富含A-T碱基对,是在研究DNA多态性标记过程中发现的。1981年Miesfeld等首次发现微卫星DNA,其重复单位长
细胞化学词汇微卫星DNA
微卫星DNA,重复单位序列最短,只有1~6bp,串联成簇,长度50~100bp,又称为短串联重复序列(Short Tandem Repeat STR)。广泛分布于基因组中。 其中富含A-T碱基对,是在研究DNA多态性标记过程中发现的。1981年Miesfeld等首次发现微卫星DNA,其重复单位长度一
概述微卫星DNA的特点
⑴种类多、分布广,并按孟德尔共显性方式在人群中世代相传。在基因组中平均50kb就有一个重复序列,突变率低(< 0.04%)。 ⑵在人群中高度多态,其多态信息含量容量超过70%。其多态性表现为正常人群的不同个体某一基因位点重复序列的重复次数可不一样,同一个体的两个同源染色体上重复次数也可以不一样
微卫星标记法的特点
与其它标记技术相比,具有以下特点:首先,在每个微卫星DNA 两端的序列多是相对保守的单拷贝序列,尤其在亲缘关系相近的物种间是保守的,而且在一些紧密相关的物种中其重复单位和重复次数具有一定的相似性。其次,这些小的、串联排列的重复序列经常是通过核苷酸链的滑动错配或者其它未知的过程来改变它们的长度,从而导
微卫星DNA的分布情况
微卫星DNA又称短串联重复序列(shorttandemrepeat,STR)或简单重复序列(simplesequencerepeats,SSR),广泛随机地分布于真核生物基因组中,在DNA序列中平均每6kb就可能出现一个,约占人基因组的10%,其基本构成单位(核心序列)为1-6bp,呈串联重复排列而
微卫星技术(micro-satellite,-MS)
微卫星DNA又称短串联重复序列(short tandem repeats, STR) 、简单重复序列(simple sequence repeat, SSR),指DNA基因组中小于10个核苷酸的简单重复序列,广泛存在于真核基因组中,多数以2~6个碱基为核心单位、串联重复排列的序列。 1974年,S
微卫星标记的实验步骤
1. 客户收集标本(血液或组织等标本)并提取DNA。2. 设计引物序列并扩增,琼脂糖电泳检测结果。3. 合成荧光标记引物。4. 进行PCR扩增,产物通过测序仪器电泳检测, 获得扩增片段大小。5. 分析测序仪器读出的数据,给结果图谱。
微卫星多态性的概念
中文名称微卫星多态性英文名称microsatellite polymorphism定 义头尾衔接的短串联重复序列由于重复单元的重复数目不同而造成的DNA多态现象。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
关于微卫星标记的基本简介
微卫星DNA 是真核生物基因组重复序列中的主要组成部分,主要由串联重复单元组成,每单元长度在1-10bp 之间,1 个SSR 的总长度可达几十到几百个bp。每个微卫星DNA 都由核心序列和侧翼序列组成,其核心序列呈串联重复排列。侧翼DNA 序列位于核心序列的两端,为保守的特异单拷贝序列,能使微卫
微卫星标记的概念和应用
微卫星DNA 是真核生物基因组重复序列中的主要组成部分,主要由串联重复单元组成,每单元长度在1-10bp 之间,1 个SSR 的总长度可达几十到几百个bp。每个微卫星DNA 都由核心序列和侧翼序列组成,其核心序列呈串联重复排列。侧翼DNA 序列位于核心序列的两端,为保守的特异单拷贝序列,能使微卫星特
微卫星DNA分子标记及其应用
微卫星(Microsatellite,MS)又称短串联重复(Short Tandem Repeats,STR)或简单序列重复(Simple Sequnce Repeat,SSR),是指基因组中以少数几个核苷酸(多数为2-4个)为单位多次串联重复组成的长达几十个核苷酸的序列。其中最常见的是双核苷酸
NASA首次以微卫星发射纳卫星
美国国家航空航天局(NASA)于当地时间6日凌晨首次利用微卫星发射了一颗纳卫星,即其太阳帆飞行器“纳米帆-D”(NanoSail-D)。这标志着NASA不但发射成功了一颗拥有独立系统的卫星,且这颗卫星又成功进行了“二级展开”——发射出一颗更小的卫星。 除人们所知的常规卫星外
微卫星DNA的研究和分布情况
微卫星DNA,重复单位序列最短,只有1~6bp,串联成簇,长度50~100bp,又称为短串联重复序列(Short Tandem Repeat STR)。广泛分布于基因组中。 其中富含A-T碱基对,是在研究DNA多态性标记过程中发现的。1981年Miesfeld等首次发现微卫星DNA,其重复单位长度一
关于微卫星标记的相关特点介绍
SSR 操作简单,仅需微量组织,即可使DNA 降解,进行有效地分析鉴定。其标记带型简单,记录条带一致,客观明确,PCR 技术的利用,使微卫星标记技术实现操作自动化。 与其它标记技术相比,具有以下特点:首先,在每个微卫星DNA 两端的序列多是相对保守的单拷贝序列,尤其在亲缘关系相近的物种间是保守
微卫星DNA分子标记及其应用(二)
3. 微卫星分子标记技术的应用 微卫星DNA 作为遗传标记具有很大的优越性。近年来随着研究的不断深入,对微卫星标记的研究不仅具有重要的理论意义, 而且还具有较好的应用前景。3.1 微卫星多态性分析在自然界中,生物个体表现出来的各种遗传变异,在本质上就是DNA 的差异,因此通过研究DNA的变异来分
微卫星DNA分子标记及其应用(一)
微卫星(Microsatellite,MS)又称短串联重复(Short Tandem Repeats,STR)或简单序列重复(Simple Sequnce Repeat,SSR),是指基因组中以少数几个核苷酸(多数为2-4个)为单位多次串联重复组成的长达几十个核苷酸的序列。其中最常见的是双核
关于微卫星标记的基本信息介绍
微卫星标记(microsatellite),又被称为短串联重复序列(short tandem repeats,STRs)或简单重复序列(simple sequence repeats,SSR),是均匀分布于真核生物基因组中的简单重复序列,由2~6个核苷酸的串联重复片段构成,由于重复单位的重复次数
关于微卫星标记的实验的步骤介绍
1. 客户收集标本(血液或组织等标本)并提取DNA。 2. 设计引物序列并扩增,琼脂糖电泳检测结果。 3. 合成荧光标记引物。 4. 进行PCR扩增,产物通过测序仪器电泳检测, 获得扩增片段大小。 5. 分析测序仪器读出的数据,给结果图谱。
微卫星DNA的结构和分布特点
微卫星DNA,重复单位序列最短,只有1~6bp,串联成簇,长度50~100bp,又称为短串联重复序列(Short Tandem Repeat STR)。广泛分布于基因组中。 其中富含A-T碱基对,是在研究DNA多态性标记过程中发现的。1981年Miesfeld等首次发现微卫星DNA,其重复单位长度一
微卫星DNA多态性的概念和应用
中文名称微卫星DNA多态性英文名称microsatellite DNA polymorphism定 义真核生物不同个体基因组中微卫星DNA短序列串联重复拷贝数和核苷酸序列的差异。通常是设计引物用PCR去扩增微卫星DNA,所得产物再用限制性内切酶消化,电泳分析可以得到含不同长度DNA的图谱。用于遗传
什么是微卫星不稳定性(MSI)
MSI是微卫星不稳定性(microsatellite instability)的缩写,MSI是指与正常组织相比,在肿瘤中某一微卫星由于重复单位的插入或缺失而造成的微卫星长度的任何改变,出现新的微卫星等位基因现象。检测临床意义:1、诊断Lynch综合征:MSI是Lynch综合征的重要生物学标记,当MS