研究发现去甲基化酶REF6是基因组中靶向的重要因素

核小体是真核生物染色质的基本单位,由DNA缠绕组蛋白八聚体构成。组蛋白翻译后共价修饰是表观遗传调控的重要方式之一,通过影响染色质的状态而调控基因表达等过程。组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3)通过维持基因的沉默状态,在动植物细胞命运决定以及生长发育中发挥重要的调控作用。基因组中特定位点的H3K27me3修饰水平由组蛋白甲基转移酶和去甲基化酶进行动态调控。中国科学院遗传与发育生物学研究所曹晓风研究组前期研究发现,拟南芥组蛋白H3K27me3去甲基化酶REF6/JMJ12能够通过其自身的锌指结构域特异性的识别拟南芥基因组中CTCTGYTY基序从而去除H3K27me3/me2甲基化修饰,调控基因的时空表达水平(Lu, et al. Nature Genetics, 2011; Cui, et al. Nature Genetics, 2016)。进一步研究发现,并非所有的CTCTGYTY基序都能够被REF6识......阅读全文

去白细胞输血的临床应用

  安全、及时、有效是临床输血的原则。随着科学技术的进步和人民生活水平的提高,人们更重视血液质量、输血疗效和输血安全。近代医学研究表明[1],血液中非治疗性成分,如白细胞,被视为是一种污染物,其在输血中的不良作用逐渐为临床所重视,如同种异体输注会产生白细胞抗体,而白细胞抗体会引起一系列副作用,如非溶

室内甲醛检测方法及去甲醛

根据《室内环境质量及检测标准》中的检测环境要求,目前常采用以下6种室内甲醛检测方法,分别是:1、测定工业废气和环境空气中甲醛的乙酰丙酮分光光度法,本法使用与树脂制造、涂料、人造纤维、塑料、橡胶、染料、制药、油漆、制革等行业的排放废气以及做医药消毒、防腐、熏蒸时产生的甲醛蒸汽测定。测量范围在0.5~8

科学家发现高等真核生物中DNA新修饰方式

  DNA甲基化作为重要表观遗传机制调控基因的表达,从而影响一系列的生物学过程,如细胞命运决定、发育和组织、器官的稳态维持。医学上,DNA甲基化失调与人类疾病密切相关,如肿瘤。DNA甲基化以多种修饰方式[5-methylcytosine (5mC), N6-methyladenine (6mA) 和

朱健康等揭示DNA甲基化对番茄果实成熟作用

  近日,中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组和郎曌博研究组利用CRISPR/Cas9技术获得了番茄sldml2的突变体植株,发现番茄sldml2调节的DNA去甲基化不仅可以激活成熟需要的基因,同时还可以抑制成熟不需要的基因,在调节番茄果实成熟的过程中发挥了重要作用。相关研究成果日前在线发表

著名学者朱健康Cell子刊表观遗传研究新文章

  来自中国科学院上海生命科学研究院和普渡大学的研究人员证实,甲基化CpG结合蛋白MBD7促进DNA主动去甲基化,限制了DNA高度甲基化以及转录水平的基因沉默。这一重要的研究发现发表在2月12日的《分子细胞》(Molecular cell)杂志上。  任职于中科院上海生命科学研究院和普渡大学的朱健康

DNA羟化酶Tet1可取代外源Oct4促进体细胞重编程

  2013年4月5日,北京生命科学研究所高绍荣博士实验室首次发现Tet1和5hmC在iPS细胞诱导过程中参与内源Oct4基因的去甲基化和激活,并且进一步证明Tet1可以取代外源Oct4实现安全高效的体细胞重编程。相关研究论文发表在近期出版的《Cell Stem Cell》杂志上。该文章被选为本

张启发院士发表权威期刊综述:杂交的遗传优势

  来自华中农业大学,亚利桑那大学的研究人员发表了题为“Heterosis in elite hybrid rice: speculation on the genetic and biochemical mechanisms”的综述性文章,提出了一种基因表达与蛋白质量控制的新假说,并指出未

哺乳类动物的DNA甲基化特点

哺乳类动物一生中DNA甲基化水平有着显著变化:在受精卵最初几次卵裂中,去甲基化酶清除DNA分子上几乎所有从亲代遗传下来的甲基化标记;在胚胎植入子宫时,一种新的甲基化遍布整个基因组,构建性甲基化酶使DNA重新建立一个新的甲基化模式,一旦细胞内新的甲基化模式建成,将通过维持甲基化酶以“甲基化维持”的形式

两篇Nature文章发表表观遗传重要研究成果

  表观遗传修饰是指在不改变DNA序列的情况下,发生的一种可影响基因表达的基因组变化。像DNA一样,当细胞分裂时某些表观遗传修饰可以被忠实地复制,使得子细胞中能够保留来自亲代的这一信息。这确保了沿着细胞谱系向下以一种稳定的方式维持基因表达。  近日发表在《自然》(Nature)杂志上的两篇新研究论文

上海生科院发现打破细胞重编程屏障的关键因素

  2月13日,国际期刊Cell Stem Cell 杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所徐国良课题组的研究论文。该研究发现DNA加氧酶TET和糖苷酶TDG共同介导DNA氧化去甲基化,在细胞命运转变中起必不可少的作用。   生物体的各种细胞具有精细的分工,每一类

组蛋白甲基化修饰研究再获突破

  日前,复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展,相关成果发布在《分子细胞》上,该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。  组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰,参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是

基因甲基化缺失是致癌重要成因

  人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不仅含有人体所有遗传信息,而且基因中的所谓甲基基团是人体组织的必要成分。德国耶拿人体老化研究所研究人员首次证实,DNA出错并甲基化缺失是导致癌症的一个重要成因。这项研究结果刊登在最新出版的《自然》杂志上。   人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不

棉花“甲基化基因图谱”首次绘成

  30日出版的《基因组生物学》杂志刊登了中美科学家合作的一项重要研究成果:他们首次绘制出棉花表观遗传基因的“甲基化基因图谱”,即野生棉和种植棉之间500多种表观遗传基因的差异,为生物技术公司通过表观修饰育种培育出高产优质棉花提供了重要线索。  几十年来,科学家们发现,许多动植物的表观特征,既可用基

基因甲基化缺失是致癌重要成因

  人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不仅含有人体所有遗传信息,而且基因中的所谓甲基基团是人体组织的必要成分。德国耶拿人体老化研究所研究人员首次证实,DNA出错并甲基化缺失是导致癌症的一个重要成因。这项研究结果刊登在最新出版的《自然》杂志上。  人体每个组织由特定属性的组织特异细胞构成。基因选择

PNAS发布人类胎盘甲基化组

  甲基化是控制基因表达的关键表观遗传学修饰。加州大学Davis分校和加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员对胎盘进行研究,揭示了人类胎盘的甲基化组,文章发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。他们发现,37%的胎盘基因组具有低甲基化区域(部分甲基化区域PMD),这与大多数人体组织不同,在大多数人体

精氨酸甲基化调控细胞凋亡研究

遗传与发育生物学研究所杨崇林实验室以秀丽线虫为模式,探索蛋白质精氨酸甲基化这一重要的蛋白质翻译后修饰方式在调控DNA损伤诱导的细胞凋亡方面的作用机制。 通过研究发现哺乳动物II型蛋白质精氨酸甲基转移酶PRMT5在线虫中的同源物,即线虫的PRMT-5,参与调控DNA损伤引起的细胞凋亡。在prmt-5基

最新DNA甲基化测序技术比较研究

  在不同疾病中,DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具体模式通常与诸如疾病亚型、疾病预后以及药物反应等临床信息具有一一对应的联系。在多种癌症的治疗过程中,DNA甲基化生物标志物可以帮助临床医生选择恰当的治疗方式。  对于拥有成千上万个样本的大量病人来说,全基因组映射与DNA甲基化分析是非常合

基因甲基化缺失是致癌重要成因

  人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不仅含有人体所有遗传信息,而且基因中的所谓甲基基团是人体组织的必要成分。德国耶拿人体老化研究所研究人员首次证实,DNA出错并甲基化缺失是导致癌症的一个重要成因。这项研究结果刊登在最新出版的《自然》杂志上。   人体每个细胞都含有完整的DNA基因,其不仅含有

DNA甲基化的基本原理

基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类,即维持DNA甲基化转移酶(Dnmtl或维持甲基化酶)和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能,真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类:Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与C

PNAS发布人类胎盘甲基化组

  甲基化是控制基因表达的关键表观遗传学修饰。加州大学Davis分校和加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员对胎盘进行研究,揭示了人类胎盘的甲基化组,文章发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。他们发现,37%的胎盘基因组具有低甲基化区域(部分甲基化区域PMD),这与大多数人体组织不同,在大多数人体

​ctDNA(羟)甲基化测序案例分享(一)

新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA(羟)甲基化测序cfDNA(Cell free DNA)是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段,是一种新型的分子标记物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指来源于肿瘤细胞的cfDNA,是液体活检主流方向。最新

十年探索,甲基化与癌症

  组蛋白是负责包装DNA的蛋白,DNA与组蛋白互作调节着许多基础细胞活动,例如干细胞分化或者血细胞变为白血病细胞等。上述相互作用由抑制子和激活子之间的拉锯战控制,这两种因子会通过对组蛋白进行化学修饰,告诉组蛋白包装更紧还是松开让基因表达。   在十一月十九日Genes & Developme

关于甲基化的基本信息介绍

  甲基化,是指从活性甲基化合物上将甲基催化转移到其他化合物的过程,可形成各种甲基化合物,或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内,甲基化是经酶催化的,这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸加工。

DNA甲基化的基本原理

DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作为甲基供体,通过共价键结合的

DNA甲基化反应的主要类型介绍

DNA甲基化反应分为2种类型。一种是2条链均未甲基化的DNA被甲基化,称为从头甲基化(denovo methylation);另一种是双链DNA的其中一条链已存在甲基化,另一条未甲基化的链被甲基化,这种类型称为保留甲基化(maintenance methylation)。

甲基化领域重要研究成果解读!

  本文中,小编整理了近年来科学家们在甲基化研究领域取得的重要研究成果,与大家一起学习!  【1】Science:重大进展!揭示DNA甲基化增强基因转录机制  doi:10.1126/science.aar7854  DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能够在不

甲基化特异性的PCR检测

用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到扩增片段,则说明该位点存在甲基化;反之,说明被检测的位点不存在甲基化。

一文了解RNA甲基化机制

  1. 什么是RNA甲基化修饰?  我们知道DNA的甲基化修饰是发生在胞嘧啶(C)上的,而最常见的RNA的甲基化修饰是m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)和尿苷化修饰(uridylation,U-tail)。  m6A修饰在70年代就发现了,是可以发生在mRNA、lncR

MSP(甲基化特异性PCR)介绍

甲基化特异性 PCR(Methylmion Specific PCR,MSP)及其改进方法是检测基因甲基化的经典方法.MSP法的原理是首先用亚硫酸氢钠修饰处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶都被转化为 尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶则不变。然后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物并进行聚合酶链反应(P

ctDNA(羟)甲基化测序案例分享(二)

案例解析案例1:ctDNA甲基化可作为肝癌诊断和进程的分子标志物原文:Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma期刊:Nature Materia