激活真菌中潜在的“沉默”基因簇获得新颖结构化合物
天然产物是新药开发的重要来源之一,近年来从真菌中发现的新颖天然产物越来越困难,其主要原因是由于传统的提取分离方法导致的重复发现已知化合物,因此,亟需开发出一种新的方法或策略来挖掘新结构天然产物。 近年来基因组测序技术的迅速发展及分子遗传学操作技术的成熟为发掘新的真菌天然产物创造了条件。通过对真菌基因组进行生物信息学分析发现,超过90%次级代谢生物合成的基因簇在常规培养条件下是“沉默”的,表明基因组中隐藏着大量的结构新颖的化合物宝藏。因此,基于海量的真菌基因组数据,如何挖掘发现真菌中新的活性天然产物便成为近年来国内外研究的重点和热点。 中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室尹文兵研究组致力于从基因(组)出发挖掘、激活真菌中潜在的“沉默”基因簇,获得了传统手段难以发现的新颖结构化合物。 前期研究发现,真菌次级代谢产物的产生与特定环境因素密切相关,受到复杂的基因调控,发生在多个水平。其中负责真菌次级代谢调控的蛋白,统称为......阅读全文
RNA沉默的作用
植物可利用 PTGS 和 TGS 来抵抗病毒侵染, 病毒侵染植物后会产生大量病毒来源的小 RNA (virus-derived small interfering RNAs, vsiRNA), 介导对病毒 RNA 的降解或抑制病毒基因的转录; 而在与植物长期共进化过程中, 病毒编码一个或多个RNA沉
单子叶植物特有的调控水稻免疫和细胞死亡的分子机制
近日,中国农业科学院植物保护研究所作物有害生物功能基因组研究创新团队在《科学通报》(Science Bulletin)上发表了题为“A monocot-specific hydroxycinnamoylputrescine gene cluster contributes to immunity
开发“猫捕”技术助力开发抗癌活性药物
近日,华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室的副研究员谭高翼与合作者在放线菌大型基因簇捕捉和沉默基因簇激活,发掘新颖活性天然产物研究中取得新进展,相关研究近日发表于《核酸研究》。 放线菌是合成天然产物药物的主力,被广泛用于抗肿瘤药物、免疫抑制剂和杀虫剂等多种药物的发酵和规模化工业制造。然而,放
Nature:研究发现调控血管形成的关键因子
血管生成是在原有血管网基础上,通过内皮细胞芽出而形成新生血管的复杂过程,这一复杂构成涉及几个分子信号通路。 近日,RIKEN BioResource中心Yoichi Gondo与一队来自加拿大的研究人员合作,发现了一种新的调节血管生成的分子,并确定其调控机制。 研究小组发现Gum
造血正向调控的细胞因子有哪些?
造血正向调控的细胞因子:①干细胞因子(SCF)。②Flt3配体(FL),即fam样酪氨酸激酶受体3(FLT)配体。③集落刺激因子(CSF),是细胞因子中的一大类,有四种主要的类型:粒-单细胞集落刺激因子(CSF-GM)、粒细胞集落刺激因子(CSF-G)、单核细胞集落刺激因子(CSF-M)、巨核细胞集
造血正向调控的细胞因子有哪些
造血正向调控的细胞因子:①干细胞因子(SCF)。②Flt3配体(FL),即fam样酪氨酸激酶受体3(FLT)配体。③集落刺激因子(CSF),是细胞因子中的一大类,有四种主要的类型:粒-单细胞集落刺激因子(CSF-GM)、粒细胞集落刺激因子(CSF-G)、单核细胞集落刺激因子(CSF-M)、巨核细
通过什么机制可以调控细胞因子水平?
通过什么机制可以调控细胞因子水平?一般来说,对细胞因子的抑制可以通过蛋白酶降解、细胞因子调节以及通过受体下游的信号转导来实现。目前,已经发现有两种机制可以调控细胞因子活性:一是受体拮抗剂(I型抑制蛋白),它与细胞因子同源,可以与受体分子结合,而不引发生物活性。第二种是可溶性受体分子(II型抑制蛋白)
上海交大Blood揭示干细胞调控因子
来自上海交通大学医学院、德克萨斯大学西南医学中心等机构的研究人员证实,组装抑制蛋白1(Profilin 1)是骨髓中小鼠造血干细胞维持及新陈代谢的必要条件。 造血干细胞(Hematopoietic Stem Cells,HSCs)是一类具有自我更新、分化和保持静止功能的多能干细胞。
研究发现调控苹果果实成熟的关键因子
近日,《园艺学报(英文版)》(Horticultural Plant Journal)发表了中国农业科学院郑州果树研究所苹果育种团队的研究论文。 该研究团队发现,调控苹果果实成熟期的遗传基础是启动子4-bp indel。果实成熟期是决定苹果品质和市场供应的关键农艺性状。目前,不同成熟期苹果品种的遗传
新发现:植物生物钟调控因子
为了适应地球自转引起的环境周期性变化,地球上几乎所有的真核生物都进化出了内源计时器——生物钟,它可以维持细胞内近24小时的基因表达节律性以适应环境中光温因子的昼夜动态变化。生物钟参与调控植物体内几乎所有的生长发育和代谢过程,如光周期依赖的开花时间、发育、叶片衰老,以及植物对生物与非生物胁迫的响应
《Cell》子刊:调控免疫应答的全新因子!
美国拉霍亚过敏和免疫学研究所(LJI)的研究人员Klaus Ley博士领导的一个研究小组报告说,他们发现辅助性T细胞可以利用膜突起移动到发炎的组织,同时保持膜稳定性,并提供脉管系统的牵引力。研究小组表示,高分辨率显微镜和分子分析的结果显示,未成熟的T细胞缺乏膜突起,而成熟的T细胞能够开启基因表达
Cell揭示干细胞命运的新调控因子
通过研究胚胎干细胞调节DNA包装的机制发现了一个心脏形成的新调控因子。科学家们说发现这种发现遗传调控因子的方法或许有能力提供关于身体内所有组织如肝、脑、血液等等形成的深入了解。 干细胞有潜力成为所有的细胞类型。一旦做出选择,这种细胞和其他的干细胞坚持一样的命运划分形成器官组织。 一个
Nature:T细胞功能调控的关键转录因子
T细胞是适应性免疫系统的主要组成部分, 它们在病菌感染中被功能活化, 参与宿主防御, 但是遇到自身抗原或者在慢性感染和肿瘤微环境中, 它们会发生命运改变, 进入功能失能命运, 但是调控T细胞功能失能的分子机制会不清楚。 来自清华大学医学院,陆军军医大学全军临床病理学研究所的研究人员发表了题为“
Nature发现癌基因MYC的主调控因子
根据来自明尼苏达大学共济会癌症中心的一项新研究中,一个导致了20%的癌症的关键致癌基因MYC,其盔甲上或许有一个弱点。MYC与非编码RNA PVT1之间的伙伴关系,有可能是了解MYC推动癌细胞机制的关键。这项研究发表在最新一期的《自然》(Nature)杂志上。 论文的主要作者、明尼苏达大学医学
“唤醒”沉默的基因-新方法揭秘微生物“生命暗物质”
微生物具有合成多种天然产物的能力。但在微生物合成天然产物时,大量合成基因仍处于“沉默”状态。它们的产物被称为微生物“生命暗物质”。如何有效激活并挖掘这些“生命暗物质”?近日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所(以下简称深圳先进院合成所)研究员罗小舟,与美国加州大学伯克利分校教授杰·基斯林及
中国医学科学院最新文章解析HOX基因表达模式
“核心刊物”迎来了新期刊:科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英
我国学者揭示棒曲霉素生物合成及转运路径分子网络
由真菌产生的聚酮类次生代谢产物——棒曲霉素(Patulin)是造成果实及其加工产品污染的重要真菌毒素,对人和动物都具有毒性,给消费者的身体健康带来巨大威胁。因此,解析真菌中棒曲霉素生物合成的分子基础,并阐明其合成途径及调控机制,对创制果实采后棒曲霉素防控技术至关重要。 中国科学院植物研究所田世
关于基因簇的基本信息介绍
基因簇少则可以是由重复产生的两个相邻相关基因所组成,多则可以是几百个相同基因串联排列而成。它们属于同一个祖先的基因扩增产物,也有一些基因家族的成员在染色体上排列并不紧密,中间还含有一些无关序列,但总体是分布在染色体上相对集中的区域。 基因簇中也常常包括一些没有生物功能的假基因。 一组
大脑和心脏起搏器的关键调控因子
目前,生物学家发现,T型钙通道的一个胞外域turret区,可改变心脏和脑细胞的电化学信号。了解这些区域如何发挥作用,将有助于研究人员最终开发出治疗癫痫、心血管疾病和癌症的一类新药。 这项研究来自于滑铁卢大学,发表在2014年4月25日的《Journal of Biological Chem
研究发现水稻调控细胞死亡及逆境胁迫因子
近日,中国农业大学教授彭友良、赵文生团队在《植物生物技术杂志》在线发表研究论文。该研究鉴定并分析了一个水稻自然叶枯突变体nbl3,揭示了一个PPR蛋白OsNBL3是调控水稻细胞死亡及生物和非生物胁迫的重要因子。 Pentatricopeptide repeat(PPR)蛋白是一类由核基因编码且多
研究揭示蛋白β羟基丁酰化修饰关键调控因子
近日,中国科学院上海药物研究所研究员黄河课题组与美国芝加哥大学教授赵英明团队合作,通过全面分析哺乳动物细胞中的Kbhb底物,系统揭示了新型蛋白动态修饰β-羟基丁酰化(Kbhb)的关键调控因子。相关研究成果于2月25日在线发表在Science Advance上。 细胞代谢为生命过程提供能量,同时
新研究发现植物特有囊泡运输调控因子
12月28日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表华南师范大学生命科学学院高彩吉团队和张盛春团队合作的最新成果。他们研究发现了植物特有囊泡运输调控因子BLISTER(BLI),并揭示其调控Retromer核心复合体组装和内体定位,进而调控内体介导的细胞膜和液泡蛋白分选的分子机制。 在植物细
科学家发现调控T细胞死亡关键因子
中国科学院上海营养与健康研究所研究员姚依昆和美国国立卫生研究院研究员Michael J. Lenardo合作,筛选并鉴定出凋亡相关因子(FAS)介导的T细胞死亡过程中的关键调控蛋白AMBRA1,揭示了AMBRA1在翻译水平控制T细胞受体(TCR)信号传导、T细胞周期和T细胞死亡的新机制,为未来研究T
Autophagy:神经细胞自噬的重要调控因子
华中科技大学,香港浸会大学等处的研究人员发表了题为“Phosphoproteome-based kinase activity profiling reveals the critical role of MAP2K2 and PLK1 in neuronal autophagy”的文章,利用从
转化生长因子β信号通路调控方式介绍
TGF-β信号通路参与许多细胞过程,因此受到频繁的调控。TGF-β信号通路有多种正反馈和负反馈调节机制,如配体和R-SMAD的激动剂,诱饵受体,R-SMAD和受体被泛素化等。配体激动剂/拮抗剂脊索蛋白和头蛋白都是骨形成蛋白(BMP)的拮抗剂。它们与BMP结合,阻碍其与受体的结合。有研究显示,脊索蛋白
肺癌细胞中异常剪接的关键调控因子
Pre-mRNA可变剪接是一种增加基因组多样性和调控基因表达的重要机制。在肿瘤的发生发展过程中,许多剪接事件发生异常变化。然而,我们并不清楚这些异常剪接事件是如何产生的,异常剪接产物对肿瘤细胞的生物学功能产生什么影响。肺癌是最常见的恶性肿瘤之一,在全球范围是癌症相关致死的头号杀手。由于缺乏有效的
启动子与转录因子/基因表达调控蛋白
目的基因的表达调控生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗,不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达,表达产生的一些特殊蛋白(如转录因子、调控蛋白)反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点,涉及到生命活动的各个过程,也是各类
转录因子MdERF2调控苹果表皮蜡质合成
近日,山东理工大学农业工程与食品科学学院教授李富军团队完成的研究在《农业科学学报(英文)》 (Journal of Integrative Agriculture,JIA)正式发表。该研究发现了转录因子MdERF2调控苹果表皮蜡质合成的分子机制。表皮蜡质是影响果蔬品质形成与保持的重要因子。植物激素乙
关于核因子κB的调控的基因的介绍
NF-κB在调节细胞反应中是相当重要的,因为它属于“快速作用”的初级转录因子,不需要新的蛋白质合成就能被激活(有该特性的其他成员包括c-Jun,STAT和核激素受体)。NF-κB是对有害细胞刺激的第一反应者。已知的NF-κB通路激活因子有很多,包括:TNF-α、IL-1β、IL-2、IL-6、I
微生物所在芳香化合物代谢的调控机制方面取得新进展
芳香化合物广泛存在于自然界,其代谢循环是地球化学元素循环的重要组成部分;同时,作为现代工业的重要原材料,芳香化合物在使用过程中大量排放到环境中,给生态系统带来了巨大压力。微生物经过适应和进化,形成了多种丰富的芳香化合物代谢途径,这些代谢途径的调控机制,是环境微生物学关注的研究热点。 谷氨酸