蛋白质相互作用

Interaction Trap/Trap Two-Hybrid System· Yeast Two-Hybrid System (Finley Lab)This is one of the most comprehensive and detailed guide to yeast two-hybrid system technique with introduction to its background. The following procedures are described: mating assay - small scale for tens of different bait or prey proteins, collecting bait (and prey) strains, large ......阅读全文

方案9-用-GFP-嵌合体监控蛋白质蛋白质相互作用实验

实验材料纯化的目标蛋白纯化的 S65T GFP 嵌合体试剂、试剂盒非变性聚丙稀醜胺凝胶Tris-HCl 缓冲液仪器、耗材荧光成像系统垂直胶板电泳系统实验步骤方法 1 荧光凝胶阻滞分析法方法 2 荧光极性分析法展开

大规模蛋白质相互作用研究方法进展(二)

这一经典的蛋白相互作用研究方法接近于体内环境,那些瞬时、不稳定的两两相互作用也可以被检测到,并且与内源蛋白的表达无关[6]。鉴于这些优点并结合简便高效的Gateway表达载体构建方法[7],在大规模的蛋白质-蛋白质相互作用研究中酵母双杂交系统得到了最为广泛的应用。Rain 等[8]用该法绘制了人类胃

大规模蛋白质相互作用研究方法进展(三)

           图1 TAP亲和层析纯化原理[14]  注:A:标签中的ProteinA 与固化的IgG 结合缓冲液淋洗去除不能结合的杂蛋白,TEV 酶切分离ProteinA   和靶蛋白;B:利用CBP(Calmodulin binding peptide)-Calmodulin   的相互

大规模蛋白质相互作用研究方法进展(一)

 来源:生命科学 关 薇, 王 建, 贺福初*(军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京 100850)  摘 要:随着2000 年酵母大规模蛋白质相互作用网络图谱的成功描绘,蛋白质相互作用特别是大规模蛋白质相互作用研究成为生命科学领域的又一个研究热点。酵母、果蝇、线虫以及人类蛋白的大规模相

Cell重磅:人类病毒蛋白质相互作用图谱面世

图片来源:《寄生虫》海报  近日,一部豆瓣评分9.2的韩国电影《寄生虫》广受大家的好评。故事也正如片名一样,讲述了一个贫困家庭“寄生”于富人家庭的故事。说到寄生,其实人体内的寄生事件更是数不胜数,最常见的便是病毒的感染。  病毒是一种比真菌和细菌小得多的感染性微生物,要想生存,它就必须找到合适的活体

蛋白质间相互作用研究方法:免疫共沉淀

相互作用在生理上的证实和探索l      通过免疫共沉淀确定结合蛋白1.用磷酸盐缓冲液洗30块10 cm培养板上的适宜细胞。刮去每块板上的细胞到1 ml冰冷的EBC裂解缓冲液中。2.将每毫升细胞悬液转移到微量离心管中,在微量离心机上4℃以最大速度离心15 min。3.收集上清(约30 ml)并加入3

大规模蛋白质相互作用研究方法进展(四)

表1 蛋白质相互作用分析相关数据库及网站  网站 资源类型 网址  DIP  蛋白质相互作用http: //dip.doe-mbi.uda.edu  INTERACT  蛋白质相互作用http: //bioinf.man.ac.uk/interactpr.htm  ProNet  蛋白质相互作用ht

简述P53与蛋白质的相互作用

  一些蛋白质能与P53蛋白作用,导致其正常生物学功能的丧失,DNA肿瘤病毒如 HPV16、18、SV40和腺病毒编码癌蛋白,引起宿主细胞的恶性病变,这些癌蛋白如 SV40T抗原、腺病毒ELa、ELb、HPVE6能与Rb,P53结合。Scheffner证实,HPVE6结合 P53后,启动细胞内蛋白酶

研究蛋白质与DNA相互作用的主要方法

一、引言在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。重组DNA技术的发展,人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要:a、鉴定分析参与基因表达调控的DNA元件

研究蛋白质之间相互作用的实验方法

白质与蛋白质之间相互作用构成了细胞生化反应网络的一个主要组成部分,蛋白-蛋白互作网络与转录调控网络对调控细胞及其信号有重要意义。把原来spaces空间上的一篇蛋白质与蛋白质间相互作用研究方法转来,算是实验技巧分类目录的首篇。一、酵母双杂交系统酵母双杂交系统是当前广泛用于蛋白质相互作用组学研究的一种重

研究蛋白质与DNA相互作用的主要方法

  一、引言   在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。   重组DNA技术的发展,人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要:   a、鉴定分析

方案6-用水溶性金属复合体监控蛋白质蛋白质相互作用

实验材料待测蛋白质样品试剂、试剂盒过硫酸铵4 X 凝胶上样缓冲液甲醇PdCl25 X 反应缓冲液TMPyP三氟乙酸Tris-二吡啶钌仪器、耗材加热器光交联反应器SepPak C18 容器分光光度计注射器滤膜实验步骤一、用 Pd(Ⅱ)金属化 TMPyP1.将 1mg (1.2umol) 的 TMPyP

克隆化基因体外合成蛋白质分析DNA蛋白质相互作用实验

体外合成的蛋白质对于测定一个克隆的基因是否编码一个特异的DNA结合蛋白, 以及分析DNA-蛋白质相互作用都是极为有用的。为了检测DNA的结合能力,可将标 记的蛋白质与特异的DNA片段共温育,用非变性丙烯酰胺凝胶电泳将蛋白质-DNA复 合物与游离的蛋白质分离开来。来源:《精编分子生物学实验指南》第五版

人工智能成功预测蛋白质的相互作用

  美国科学家主导的国际科研团队在最新一期《科学》杂志撰文指出,他们利用人工智能和进化分析,绘制出了真核生物的蛋白质之间相互作用的3D模型,首次确定了100多个可能的蛋白质复合物,并为700多个蛋白质复合物提供了结构模型,深入研究蛋白质相互作用有望催生新的药物。  研究负责人之一、美国西南大学人类发

蛋白质间相互作用研究方法2:免疫共沉淀

相互作用在生理上的证实和探索l  通过免疫共沉淀确定结合蛋白1.用磷酸盐缓冲液洗30块10 cm培养板上的适宜细胞。刮去每块板上的细胞到1 ml冰冷的EBC裂解缓冲液中。2.将每毫升细胞悬液转移到微量离心管中,在微量离心机上4℃以最大速度离心15 min。3.收集上清(约30 ml)并加入3

蛋白质相互作用识别和干预机制分析获进展

  近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员王方军团队在蛋白质复合物形成和干预机制分析新方法研究方面取得新进展。研究人员通过溶液状态蛋白质赖氨酸两步稳定同位素标记和定量蛋白质组学分析,实现对蛋白—蛋白识别关键位点区域的精确探测,并可评估小分子对蛋白质复合物的构象识别干预情况。相关研究结果发表于《化学

食品成分与蛋白质的化学反应相互作用

食品成分与蛋白质的化学反应相互作用1 乳化性质蛋白质在许多乳胶体食品体系中起着重要的作用,如牛奶、冰淇淋、肉馅等。蛋白质对水/油体系的稳定性差,而对油/水体系的稳定性好。影响蛋白质乳化的因素:(1)盐:0.5-1.0mol/L 的氯化钠有利于肉馅中蛋白质的乳化;(2)蛋白质的溶解性:蛋白质的溶解性越

DNA与蛋白质相互作用的研究方法有哪些

研究蛋白质与DNA相互作用的主要方法一、引言在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题.重组DNA技术的发展,人们已分离到了许多重要的基因.现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性.为此需要:a、

DNA与蛋白质相互作用的研究方法有哪些

在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。重组DNA技术的发展,人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要:a、鉴定分析参与基因表达调控的DNA元件;b、分

DNA与蛋白质相互作用的研究方法有哪些

研究蛋白质与DNA相互作用的主要方法一、引言在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。重组DNA技术的发展,人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要:a、

用克隆化基因在体外合成蛋白质分析DNA蛋白质相互作用

基本方案             实验方法原理 实验材料 含有所需结合位点的质粒DNA

蛋白质相互作用识别和干预机制分析新方法

  近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员王方军团队在蛋白质复合物形成和干预机制分析新方法研究方面取得进展,通过溶液状态蛋白质赖氨酸两步稳定同位素标记和定量蛋白质组学分析,实现对蛋白—蛋白识别关键位点区域的精确探测,并可评估小分子对蛋白质复合物的构象识别干预情况。  蛋白质的结构和相互作用决定了其

青岛能源所等在蛋白质相互作用研究中取得进展

  日前,中国科学院青岛生物能源与过程研究所代谢物组学团队研究员冯银刚和中科院生物物理研究所研究员柯莎(Sarah Perrett)研究组在翻译控制肿瘤蛋白(TCTP)参与蛋白质相互作用研究中取得新进展,揭示了TCTP与翻译延伸因子的相互作用可能代表了TCTP的一个基本生物学功能,相关成果于1月2

新方法能预测蛋白质与环境间的相互作用

  众所周知,蛋白质是生命的基石,在所有的生物过程中发挥着关键的作用。因此,了解它们如何与环境相互作用,对于开发有效的治疗方法和设计人工细胞的基础至关重要。图片来源:Laura Persat / 2019 EPFL  近日,由瑞士联邦理工学院(EPFL)生物工程研究所蛋白质设计与免疫工程实验室(LP

方案12-通过阵列检测来研究蛋白质小分子相互作用

实验材料用于标记的小牛血清白蛋目标小分子载有蛋白质阵列的玻片试剂、试剂盒单功能活性染料Cy-3或Cy-5磷酸盐缓冲溶液含有 500mmol L甘氨酸的 PBS二琥珀酰亚胺戊二酸(DSG)NN’-二琥珀酰亚胺碳酸盐硫代琥珀酰亚胺酯含 0.01g ml小牛血清白蛋白(BSA)的 PBST仪器、耗材荧光玻

聚集态蛋白质相互作用组的交联解析方法获揭示

近日,我所蛋白质折叠化学生物学创新特区研究组(02T5组)刘宇研究员团队、生物分子高效分离与表征研究组(1810组)张丽华研究员团队,以及西湖大学张鑫教授团队等合作,通过系统性调控绿色荧光蛋白发色团的骨架结构,实现分子的三重态化学活性,并用于活细胞内聚集态蛋白质的靶向交联,获得了聚集态蛋白质的相互作

新疆理化所提出预测蛋白质相互作用的计算方法

  蛋白质相互作用研究能够从分子水平上揭示蛋白质的功能,帮助揭示生长发育、新陈代谢、分化和凋亡等细胞活动的规律。在全基因组范围内识别蛋白质相互作用对是解释细胞调控机制的重要一步。随着蛋白质相互作用实验技术的发展,人们能够获得大量的蛋白质相互作用数据,甚至能够在全基因组范围内对蛋白质相互作用进行分析。

蛋白质的化学反应及与食品成分的相互作用

1 蛋白质与水的相互作用:蛋白质的水溶性 蛋白质与水之间的作用力主要是蛋白质中的肽键(偶极-偶极相互作用或氢键),或氨基酸的侧链(解离的、极性甚至非极性基团)同水分子之间发生了相互作用。 影响蛋白质水溶性的应素很多: (1)pH>pI 时,蛋白质带负电荷,pH=pI 时,蛋白质不带电荷,pH 时,蛋

青岛能源所在蛋白质五级相互作用研究中取得进展

  蛋白质的结构层次通常被分为一到四级。但是在细胞拥挤环境下,胞内其它大分子和目标蛋白质形成瞬态复合物,也被称为蛋白质“五级结构”,而导致五级结构形成的作用力被称为五级作用力(quinary interaction)。但是关于该作用力的研究难度大,相关报道很少。中国科学院青岛生物能源与过程研究所仿真

蛋白质的化学反应及与食品成分的相互作用

1 蛋白质与水的相互作用:蛋白质的水溶性蛋白质与水之间的作用力主要是蛋白质中的肽键(偶极-偶极相互作用或氢键),或氨基酸的侧链(解离的、极性甚至非极性基团)同水分子之间发生了相互作用。影响蛋白质水溶性的应素很多:(1)pH>pI 时,蛋白质带负电荷,pH=pI 时,蛋白质不带电荷,pH 时,蛋白质带