方案6用水溶性金属复合体监控蛋白质蛋白质相互作用

实验材料待测蛋白质样品试剂、试剂盒过硫酸铵4 X 凝胶上样缓冲液甲醇PdCl25 X 反应缓冲液TMPyP三氟乙酸Tris-二吡啶钌仪器、耗材加热器光交联反应器SepPak C18 容器分光光度计注射器滤膜实验步骤一、用 Pd(Ⅱ)金属化 TMPyP1.将 1mg (1.2umol) 的 TMPyP 溶于 1.4 ml 水中,然后加入 0.34 mg(1.9umol) 的 PdCl2, 加热至 95°C 反应 2 h。实验提示:在金属化过程中,4 个 Q 带峰值 518nm、554nm、584nm 和 639nm,会变为 525nm 和 558nm 的两个峰,因此可以用可见分光光度计来监控金属化过程。2.冷却样品,并用孔径为 45um 的注射过滤器过滤,加入 TFA 至终浓度为 1%。3.将溶液注入用 1%TFA 平衡好的 SepPakC18 容器中,用 5 ml1% 的 TFA 冲洗容器。4.用 0.5 ml 的甲醇,将 TM......阅读全文

方案6-用水溶性金属复合体监控蛋白质蛋白质相互作用

实验材料待测蛋白质样品试剂、试剂盒过硫酸铵4 X 凝胶上样缓冲液甲醇PdCl25 X 反应缓冲液TMPyP三氟乙酸Tris-二吡啶钌仪器、耗材加热器光交联反应器SepPak C18 容器分光光度计注射器滤膜实验步骤一、用 Pd(Ⅱ)金属化 TMPyP1.将 1mg (1.2umol) 的 TMPyP

方案9-用-GFP-嵌合体监控蛋白质蛋白质相互作用实验

实验材料纯化的目标蛋白纯化的 S65T GFP 嵌合体试剂、试剂盒非变性聚丙稀醜胺凝胶Tris-HCl 缓冲液仪器、耗材荧光成像系统垂直胶板电泳系统实验步骤方法 1 荧光凝胶阻滞分析法方法 2 荧光极性分析法展开

蛋白质复合体性质的研究

方案1 用 FLAG抗原表位标记蛋白质进行蛋白质免疫共沉淀 方案2 细胞裂解液中相互作用蛋白的亲和纯化 方案3 多蛋白质复合体的非变性琼脂糖凝胶电泳实验 方案4 BN-PAGE 蛋白质分析法 方案5 采用交联法和质谱法对蛋白质复合体进行拓扑

蛋白质与水的相互作用:蛋白质的水溶性

  蛋白质与水之间的作用力主要是蛋白质中的肽键(偶极-偶极相互作用或氢键),或氨基酸的侧链(解离的、极性甚至非极性基团)同水分子之间发生了相互作用。  影响蛋白质水溶性的应素很多:  (1)pH>pI 时,蛋白质带负电荷,pH=pI 时,蛋白质不带电荷,pH 时,蛋白质带正电荷。溶液的pH 低于或高

蛋白质是脂溶性还是水溶性

细胞膜上的蛋白大多数都有脂溶性部分和水溶性部分,不过准确的称呼是疏水性部分和亲水性部分。疏水性部分是指一段或几段跨膜区,位于细胞膜内。亲水性部分是位于膜两侧的部分。

如何分离DNA蛋白质复合体与RNA蛋白质复合体的混合物

可以借助一些多组分抽提试剂,比如TRIzol可以将RNA/DNA/蛋白质分开。经TRIzol处理后,RNA位于上层水相中,DNA处于中间层,蛋白质则在下层。可分别取出水相用异丙醇沉淀回收RNA;用乙醇沉淀中间层回收DNA;用异丙醇沉淀有机相回收蛋白质。

方案14-蛋白质阵列:用“三明治法”研究复合体溶液

实验材料捕获抗体检测鸡尾酒混合液试剂、试剂盒裂解缓冲液磷酸盐缓冲液含40%甘油的PBS含 0.01g ml BSA的PBS含 500 mmol L 甘氨酸含0.1% Tween的PBS含 1% BSA的PBST仪器、耗材偶联有蛋白 G 或蛋白 A 珠子的亲和层析柱设备BSA-NHS玻片离心机荧光片扫

蛋白质相互作用

Interaction Trap/Trap Two-Hybrid System·         Yeast Two-Hybrid System (Finley Lab)This is one of the most comprehensive and detailed guide to yeast

关于可溶性蛋白质的简介

  可溶性蛋白质是重要的渗透调节物质和营养物质,他们的增加和积累能提高细胞的保水能力,对细胞的生命物质及生物膜起到保护作用,因此经常用作筛选抗性的指标之一。  可溶性蛋白质可以以小分子状态溶于水或其他溶剂的蛋白。通常在植物生理、微生物、食品加工等实验中作为重要指标。如可溶性蛋白质是植物抗旱性的重要指

方案5-交联法和质谱法对蛋白质复合体进行拓扑学分析

实验材料纯化的蛋白质复合体试剂、试剂盒缓冲液交联试剂二甲基亚砜(DMSO)4 X SDS 上样缓冲液终止溶液仪器、耗材Bio-Spin 柱可鉴定蛋白质的质谱仪可根据蛋白质序列计算肽链的软件包超滤装置实验步骤一、交联反应条件的优化不同方法得到的同种蛋白质复合体的质量与纯度不同,因此建议进行各种实验来摸

方案3-多蛋白质复合体的非变性琼脂糖凝胶电泳实验

实验材料含有目标蛋白的细胞提取物试剂、试剂盒琼脂糖凝胶脱色液凝胶染色液甘油2 X 上样缓冲液SDS-聚丙烯酰胺凝胶仪器、耗材玻璃纸锥形瓶凝胶电泳装置微量离心过滤装置小型离心机微波炉Ultrafree-DA 装置实验步骤一、非变性凝胶的制备在非变性凝胶缓冲液中,制备水平的 0.8% 琼脂糖凝胶,规格约

方案12-通过阵列检测来研究蛋白质小分子相互作用

实验材料用于标记的小牛血清白蛋目标小分子载有蛋白质阵列的玻片试剂、试剂盒单功能活性染料Cy-3或Cy-5磷酸盐缓冲溶液含有 500mmol L甘氨酸的 PBS二琥珀酰亚胺戊二酸(DSG)NN’-二琥珀酰亚胺碳酸盐硫代琥珀酰亚胺酯含 0.01g ml小牛血清白蛋白(BSA)的 PBST仪器、耗材荧光玻

方案8-用-FRET-法分析体内蛋白质的相互作用实验

实验材料a-GFP 抗体编码 CFP 和 YFP 的 DNA酵母细胞株系试剂、试剂盒分子生物学试剂合成的完全液体培养基酵母操作试剂编码目标内源蛋白的 DNA 片段仪器、耗材滤光镜装置图像分析软件显微镜设备分子生物学和酵母操作用的标准设备实验步骤一、实验设计因为体内 FRET 实验的复杂性,要获得有效

脑脊液蛋白质该如何做好质量监控?

(1)假阳性:因穿刺出血,血液蛋白质混入脑脊液;试管和滴管等器材不洁;试剂苯酚不纯等可致假阳性。(2)假阴性:室温低于10℃或苯酚饱和度减低等可导致。(3)阳性对照:人工配制含球蛋白的溶液,可在正常脑脊液或配制与正常脑脊液基本成分相似的基础液中加不同量的球蛋白。

高尔基复合体的蛋白质糖基化

  N-连接的糖链合成起始于内质网,完成于高尔基体。在内质网形成的糖蛋白具有相似的糖链,由Cis面进入高尔基体后,在各膜囊之间的转运过程中,发生了一系列有序的加工和修饰,原来糖链中的大部分甘露糖被切除,但又被多种糖基转移酶依次加上了不同类型的糖分子,形成了结构各异的寡糖链。糖蛋白的空间结构决定了它可

用-GST-融合蛋白检测蛋白质蛋白质相互作用实验

实验材料 结合到谷胱甘肽-球脂糖的 GST 融合蛋白试剂、试剂盒 碱性缓冲液 封闭缓冲液 相互作用缓冲液PK 缓冲液还原型谷胱甘肽于 Tris-Cl中洗涤缓冲液 1 洗涤缓冲液 2蛋白酶蛋白激酶 A[y-32P]ATP仪器、耗材 与待筛选蛋白结合的膜或滤膜Sephadex G-50 转柱实验步骤 材

用-GST-融合蛋白检测蛋白质蛋白质相互作用实验

            实验材料 结合到谷胱甘肽-球脂糖的 GST 融合蛋白 试剂、试剂盒 碱性缓冲液 封闭缓冲液 相

用-GST-融合蛋白检测蛋白质蛋白质相互作用实验

GST 融合蛋白作为在细菌中表达的重组蛋白,从它们被介绍以来,已用于成千上万个研究项目中(Smith and johnson 1988)。它们常常被用于制备抗体,这些抗体可用于研究蛋白质-蛋白质相互作用以及分析生化反应。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W

JCIM:计算提升蛋白质蛋白质相互作用的预测精度

  蛋白质-蛋白质相互作用和识别在生物学过程中有着非常重要的作用。尽管结构生物学已经取得了较大的进展,但直接采用实验方法确定蛋白质-蛋白质复合物结构仍然非常困难。分子对接技术是预测蛋白质-蛋白质复合物结构的有效方法。蛋白质-小分子之间的相互作用一般蛋白质受体有结合口袋,相互作用区域比较明确,而蛋白质

方案6-利用多维蛋白质鉴定技术分析复杂蛋质混合物

实验材料可溶性蛋白组分试剂、试剂盒乙腈(5%) 0.5%乙酸NH4HCO3(1mol L)CaCl2色谱溶剂二硫苏糖醇(DTT )内切蛋白酶Lys-C碘乙酰胺(IAA)修饰的胰酶尿素仪器、耗材C18固相抽提移液头纯金导线高效液相色谱仪Nano-LC 离子源PEEK 微型四通串联质谱仪水浴锅实验步骤#

细胞膜上的蛋白质也有脂溶性和水溶性部分吗

膜蛋白分为外在蛋白,内在蛋白,脂锚定蛋白;维系三者与膜关系的主要都是疏水键;简单来讲,一般在膜双分子层中间的都是脂溶性,暴露在胞质内外表面的都是水溶性。细胞膜上的蛋白大多数都有脂溶性部分和水溶性部分,不过准确的称呼是疏水性部分和亲水性部分。疏水性部分是指一段或几段跨膜区,位于细胞膜内。亲水性部分是位

超级计算机帮助“组装”大型蛋白质复合体

  红细胞中的血红蛋白分子通过以全有或全无的方式改变其形状来传输氧气。血红蛋白中相同蛋白质的四个拷贝像花瓣一样打开和关闭,在结构上相互耦合以相互作用。使用超级计算机,科学家们能够设计自组装的蛋白质,以组合和类似生命的分子,如血红蛋白。科学家表示,他们的方法可以应用于有用的技术,如药物靶向,人工能量收

方案11-标记蛋白并通过阵列检测探究蛋白质间相互作用

实验材料用于荧光标记的目标蛋白制成蛋白质阵列的玻片试剂、试剂盒单功能活性染料Cy-3或Cy-5磷酸盐缓冲溶液含有 500mmol L甘氨酸的 PBSPBST标记缓冲液仪器、耗材亲和层析设备离心机透析设备荧光片扫描仪保湿器孵育箱特定规格的层析设备玻片转子实验步骤一、蛋白标记1.将染料溶人 250ul

蛋白质与水的相互作用

  水和蛋白质是构成一切生命的基础材料。对人体来说,我们需要有二十种氨基酸才能保证细胞的正常工作。其中,有八种氨基酸是人体无法自行合成,必须由食物中摄取,称作“必需氨基酸”,又称作完全蛋白。资料表明:这八种中如果缺少任何一种,其他则毫无用处。另外十二种是人体可以自行合成的,称作“非必需氨基酸”。人体

蛋白质与水的相互作用

蛋白质与水之间的作用力主要是蛋白质中的肽键(偶极-偶极相互作用或氢键),或氨基酸的侧链(解离的、极性甚至非极性基团)同水分子之间发生了相互作用。影响蛋白质水溶性的应素很多:(1)pH>pI 时,蛋白质带负电荷,pH=pI 时,蛋白质不带电荷,pH 时,蛋白质带正电荷。溶液的pH 低于或高于蛋白质的p

不溶性蛋白质怎么测圆二色谱

1、首先取浓度大于0.5mg/ml,体积大于400ul的不溶性蛋白质。2、其次倒在一个容器中,然后倒入氢氧化钠。3、最后静置十分钟,即可测出圆二色谱。

蛋白质蛋白质相互作用理论预测和药物设计新法获进展

  11月29日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院上海药物研究所蒋华良课题组和美国莱斯大学(Rice University)José N. Onuchic 课题组合作的论文Elucidating the druggable interface of protein-protei

蛋白质组实验全套流程方案1

 蛋白质组实验流程双向电泳的样品的制备样品制备原则样品制备是双向电泳中最关键的一步,将直接影响2-DE结果好坏。目前并没有一个通用的样品制备方法,尽管处理方法多种多样,但都遵循几个基本的原则:1)尽可能的提高样品蛋白的溶解度,抽提最大量的总蛋白,减少蛋白质的损失;2)减少对蛋白质的人为修饰;3)破坏

蛋白质组实验全套流程方案2

聚丙烯酰胺凝胶的配制表1 配制Tris-甘氨酸SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶电泳分离胶所用溶液溶液成分不同体积(ml)凝胶液中各成分所需体积(ml)5101520253040506%   水2.65.37.910.613.215.921.226.5   30%丙烯酰胺溶液123456810   1.

蛋白质间相互作用研究方法1

LY: 宋体; mso-ascii-font-family: 'Times New Roman'; mso-hansi-font-family: 'Times New Roman'">融合蛋白进行Far Western印迹来检测蛋白质-蛋白质相互作用  放射标记蛋白探