凝胶迁移滞后实验基本原理

凝胶迁移滞后实验(electrophoretic mobility shift assays,EMSA)是近年发展起来的研究核酸与蛋白质相互作用简单、快速、敏感的方法。目前已经成为转录因子研究的经典方法。其基本原理是蛋白质可以与末端标记的核酸探针结合,电泳时这种复合物比无蛋白结合的探针在凝胶中泳动的速度慢,即表现为相对滞后(如下图所示)。该方法可用于检测DNA结合蛋白、RNA结合蛋白,并可通过加入特异性的抗体(supershift)来检测特定的蛋白质,并可进行未知蛋白的鉴定。简单说明以下EMSA技术的优缺点,基本原理和实验方法。Electrophoretic mobility shift assay (EMSA)IntroductionAdvantage:can separate different types of complexes, such as monomer and dimer => better than f......阅读全文

凝胶迁移滞后实验基本原理

凝胶迁移滞后实验(electrophoretic mobility shift assays,EMSA)是近年发展起来的研究核酸与蛋白质相互作用简单、快速、敏感的方法。目前已经成为转录因子研究的经典方法。其基本原理是蛋白质可以与末端标记的核酸探针结合,电泳时这种复合物比无蛋白结合的探针在凝胶中泳动的

凝胶迁移实验(EMSA)——凝胶迁移

凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)可以:(1)研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用;(2)可用于DNA定性和定量分析;(3)用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。实验方法原理一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初

凝胶迁移实验(EMSA)

实验方法原理 凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA-electrophoretic mobility shift assay)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列

凝胶迁移实验(EMSA)

            实验方法原理 一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32P同位素标记的D

凝胶迁移实验(EMSA)实验方法

凝胶迁移实验有称凝胶阻滞实验或电泳迁移率实验(EMSA,electrophoretic mobility shift assay),是一种用于蛋白与核算相互作用的技术。最初是用于转录因子与启动子相互作用的验证性实验,也可应用与蛋白-DNA、蛋白-RNA互作研究。 一、实验原理 EMSA主要基于蛋白

凝胶迁移实验(EMSA)之一

实验操作方法1.探针的标记:(1) 如下设置探针标记的反应体系:待标记探针 (1.75pmol/微升)                        2微升T4 Polynucleotide Kinase Buffer (10X)             1微升Nuclease-Free Water

凝胶迁移或电泳迁移率实验

凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)可以:(1)研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用;(2)可用于DNA定性和定量分析;(3)用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。凝胶迁移或电泳迁移率实验凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA-electrophoretic mobili

凝胶迁移实验(EMSA)之三:实验步骤

实验材料:DNA样品试剂、试剂盒:    [γ-32P]ATP、T4多聚核苷酸激酶、Nuclease-Free Water、T4多聚核苷酸激酶缓冲液、醋酸铵、TE、无水乙醇、TBE buffer、重蒸水、甲叉双、丙烯酰胺、丙烯酰胺、甘油、过硫酸铵、TEMED(四甲基乙二胺)、EMSA Gel

凝胶迁移率变动分析实验

在本实验中, 我们用 DNA 亲和层析所用的同一互补寡核苷酸 (具体序列见实验 3 的引言的末尾) 来进行 AP-1 的凝胶迁移率变动分析。本实验来源于蛋白质纯化与鉴定实验指南,作者:朱厚础。试剂、试剂盒丙烯酰胺双丙烯酰胺过硫酸铵TEMED(NNN'N'四甲基乙二胺)甘油 (50%;

凝胶迁移率变动分析实验

试剂、试剂盒 丙烯酰胺双丙烯酰胺过硫酸铵TEMED(NNN'N' 四甲基乙二胺)甘油 (50%;v v)竞争 DNA迁移率变动分析探针TBE凝胶迁移率变动分析缓冲液 TE实验步骤 材料丙烯酰胺双丙烯酰胺过硫酸铵(10%;w/v)TEMED(N,N,N',N', 四甲基

凝胶迁移率变动分析实验

凝胶迁移率变动分析实验             试剂、试剂盒 丙烯酰胺 双丙烯酰胺 过硫酸铵

凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)

凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。 其基本原理是蛋白质可以与末端标记的核酸探针

凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA-)

实验概要凝胶迁移或电泳迁移率实验是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。通常将纯化的蛋白或细胞粗提液和标记的DNA探针一同保温,在非变性的聚丙烯凝胶电泳上,分离复合物和非结合的探针。DNA-复合物比非结合的探针移动得慢。标记的探针依研究的结合蛋白的不同,

凝胶迁移实验系列二实验操作方法

1.探针的标记:(1) 如下设置探针标记的反应体系:待标记探针 (1.75pmol/微升)                        2微升T4 Polynucleotide Kinase Buffer (10X)       1微升Nuclease-Free Water            

什么是凝胶迁移或电泳迁移率实验?

凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32P同位素标记的DNA或RNA探针一同保温,在非变性

凝胶迁移实验系统提供了什么试剂?

 Promega公司提供一种凝胶迁移实验系统检测DNA结合蛋白,系统可作为这类实验的一种阳性对照。系统包括目的寡核苷酸,对照DNA结合蛋白,结合缓冲液,用于寡核苷酸探针末端标记所需的试剂。Core 系统包括含重组AP2蛋白(AP2抽提液)的大肠杆菌抽提液和AP2的同源寡核苷酸。AP2抽提液是

EMSA凝胶迁移-(Electrophoretic-mobility-shift-assay)实验

实验原理凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32P同位素标记的DNA或RNA探针一同保温,

凝胶迁移实验(EMSA)之二:实验方法原理

凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA-electrophoretic mobility shift assay)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。通

EMSA凝胶迁移(一)

实验原理凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术zui初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32P同位素标记的DNA或RNA探针一同保

EMSA凝胶迁移(二)

实验步骤生物素标记探针:1. 按如下顺序加入反应物,温和混匀,切勿涡漩    超纯水                                   25μl5×TdT Reaction Buffer           10μl探针(1μM)                          

凝胶迁移(Gel-Shift)实验操作方法2

探针冷竞争反应:Nuclease-Free Water 4微升EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5X) 2微升细胞核蛋白或纯化的转录因子 2微升未标记的探针 1微升标记好的探针 1微升总体积 10微升突变探针的冷竞争反应:Nuclease-Free Water 4微升EMSA/Gel-Shif

凝胶迁移(Gel-Shift)实验操作方法1

1.探针的标记:(1) 如下设置探针标记的反应体系:待标记探针 (1.75pmol/微升) 2微升T4 Polynucleotide Kinase Buffer (10X) 1微升Nuclease-Free Water 5微升[γ-32P]ATP(3,000Ci/mmol at 10mCi/ml)

凝胶迁移实验中需要用到什么试剂?

凝胶迁移实验需要的结合蛋白,可来源于纯化或部分纯化的蛋白,或粗的核和胞质抽提液。还必须制备同位素标记的DNA或RNA。一般,DNA核苷酸探针用32P和T4多核苷酸激酶来作末端标记,同位素标记的RNA用噬菌体RNA聚合酶和同位素标记的核苷酸在体外合成。Promega公司的Riboprobe/sup系统

成功进行凝胶迁移实验需要优化哪些因素?

凝胶迁移实验在理论上很简单也很快速,但要成功地进行凝胶迁移实验,需要优化一些参数,这主要受结合蛋白的来源和探针结合位点特点的影响。以下是需要优化的因素:抽提液的制备(核酸酶和磷酸酶污染会使探针降解),结合蛋白的浓度,探针的浓度,非特异性探针的浓度,缓冲液的配方和pH,聚丙烯凝胶电泳的特点和电泳条件,

凝胶迁移率变动分析

中文名称凝胶迁移率变动分析英文名称gel mobility shift assay定  义利用凝胶进行的电泳迁移率变动分析。不同大小的分子在凝胶中电泳移动的速度不同,当某种分子与另一种分子特异性结合后,它在非变性凝胶电泳带中的位置就发生了变化,由此可以分析不同分子间的相互作用。如待检测DNA样品与核

凝胶迁移实验(gel-shift)基本知识问题与回答3

TFIIB与预启动复合物结合后,致使RNA聚合酶II和TFIIF结合到转录启始区。故TFIIB在预启动复合物的形成中有重要作用。当用纯化的 TFIID作凝胶迁移实验时,poly dI-dC不用加入结合反应中。结合缓冲液含10%甘油,20mM Tris(pH8.0), 10mM MgCl2,

凝胶迁移实验(gel-shift)基本知识问题与回答1

(1)什么是凝胶迁移或电泳迁移率实验?凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。通常将纯化的蛋白和细胞粗提液和32P同位素标记

凝胶迁移实验(gel-shift)基本知识问题与回答2

1.AP1(激活蛋白1):是一个转录调节因子,它结合的同源序列为5'-TGAGTCA-3'。当基因的启动子区域存在AP1的结合位点时,这些基因可以被诱导,比如用佛波酯可诱导蛋白激酶C(2,7)。在细胞中,AP1形成c-Jun或Jun相关蛋白的同聚双体,或者形成c-Jun或Jun相关蛋

EMSA凝胶迁移-(Electrophoretic-mobility-shift-assay)

实验概要凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。实验原理凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前

凝胶迁移率变动分析的特点

中文名称凝胶迁移率变动分析英文名称gel mobility shift assay定  义利用凝胶进行的电泳迁移率变动分析。不同大小的分子在凝胶中电泳移动的速度不同,当某种分子与另一种分子特异性结合后,它在非变性凝胶电泳带中的位置就发生了变化,由此可以分析不同分子间的相互作用。如待检测DNA样品与核