Benchmarker一种可靠的对GWAS数据进行挖掘的算法
全基因组关联研究(GWAS)针对大量人群寻找有助于常见的多基因特征(如身高或肥胖)的基因。这些综合性研究经常发现大量微小的遗传变异,这些变异在高龄,肥胖等人群中更常发生。但这种相关性并不一定意味着因果关系的存在。 虽然有许多计算算法可用于帮助提取GWAS结果,但很难知道选择哪一种。研究人员在《American Journal of Human Genetics》杂志上发表的文章称Benchmarker一种可靠的对GWAS数据进行挖掘的算法。(图片来源:Www.pixabay.com) “我们有不同的优先级算法,但我们实际上并不知道如何确定哪一个是最好的,”该文章主要作者Rebecca Fine说 “我们不想依赖先前的'黄金标准'或引入除原始GWAS数据之外的任何其他内容。” 借助“交叉验证”的机器学习概念,Benchmarker使调查人员能够将GWAS数据本身作为自己的控制。我们的想法是采用GWAS数据......阅读全文
遗传算法的主要应用领域介绍
函数优化函数优化是遗传算法的经典应用领域,也是遗传算法进行性能评价的常用算例,许多人构造出了各种各样复杂形式的测试函数:连续函数和离散函数、凸函数和凹函数、低维函数和高维函数、单峰函数和多峰函数等。对于一些非线性、多模型、多目标的函数优化问题,用其它优化方法较难求解,而遗传算法可以方便的得到较好的结
准确预测身高?这种机器学习算法能做到
美国密歇根州立大学的研究人员近日开发出一种先进的算法,能够根据个人基因组来预测他们的身高、骨密度,甚至是教育水平。这项成果于近日发表在《Genetics》杂志十月刊上。 这项研究的负责人、密歇根州立大学的Stephen Hsu博士表示这仅仅是开始。“尽管我们现在验证了这一工具的这三个结果,但我
预测小分子抗癌活性有了新算法
记者从中科院昆明动物研究所获悉,该所李功华博士在研究员黄京飞的指导下,开发了一个新的基于分子药效团的小分子比对算法,并成功应用于预测小分子的抗癌活性。近日,该研究发表在顶级计算生物学杂志《生物信息学》上。 据李功华介绍,开发新的抗癌药物是科学界和医学界的热点和难点。直接采用实验的方法筛选抗
新算法将物理问题转化为量子语言
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/515050.shtm科技日报讯 (记者刘霞)谷歌公司科学家设计出一种算法,可将复杂的物理问题转化为量子物理学的语言,这可能使量子计算机变得更有用。相关论文发表于最近的《物理评论X》杂志。 新成果
新算法可大幅提高图像边界识别效率
美国麻省理工学院的研究人员日前称,他们开发出了一种新的图像分割算法,可将传统分割算法的效率提高上万倍。该研究将有助于改善医疗成像系统的识别精度并实现对特定3D物体的连续跟踪识别。 当我们推开窗户向外张望时,马上就能看到汽车、人行道、行人或者远处高大的建筑。这在计算机领域中被称为视觉识别,对人类
“金融计算法”准确算出HIV病毒变化过程
金融数学(股票价格预测)和粒子的液体扩散可以生成更好的HIV疫苗?根据爱荷华大学的微生物学家希勒尔哈伊姆的说法,我们可以使用概念预测HIV表面蛋白质的进化,得到的信息可以用来设计更加优良的HIV疫苗。 人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)是全球艾滋病流行的原因,据世界卫生组织统计,自1970年末
新型DNA测序算法让“重复片段”不再神秘
美国华盛顿大学的一个研究小组称,他们使用了一种被称为“mrFAST”的新型DNA测序算法,可对基因的重复片段进行精确统计并对其作用作出初步判断。相关研究发表在8月30日出版的《自然·遗传学》杂志上。 据了解,截至2003年底,绝大部分的人类基因组已获得测定。但基因组中仍有许多的区域未获得测
热重分析仪的2类算法
热重分析仪主要由天平、炉子、程序控温系统、记录系统等几个部分构成。我们一般常用的测量的原理有两种,即变位法和零位法。所谓变位法,是根据天平梁倾斜度与质量变化成比例的关系,用差动变压器等检知倾斜度,并自动记录。零位法是采用差动变压器法、光学法测定天平梁的倾斜度,然后去调整安装在天平系统和磁场中线
打通算法,让机器人步伐更“社会”
近日,华东师范大学心理与认知科学学院和脑科学与教育创新研究院教授蒯曙光团队利用虚拟现实结合计算建模方法,巧妙地对人类社会行走行为进行了量化,并进一步设计出基于人类行为特性的算法,显著提升了机器人的拟人性以及人机交互体验,有效解决了机器人融入社会场景中的问题。 11月7日,这项横跨人文、科学
新算法可模拟人脑整体神经电路
下一代超级计算机利用新算法,可模拟人脑整体神经电路。图片来自网络 科技日报东京3月28日电 (记者陈超)日本理化学研究所日前宣布,他们的一个国际联合研究小组成功开发出模拟人脑整体神经电路的算法,可在下一代超级计算机上应用。新算法不仅节省内存,也能大幅提高现有超级计算机上的脑模拟速度。 神经
常见机器学习算法优缺点比较(二)
常见算法优缺点 1.朴素贝叶斯 朴素贝叶斯属于生成式模型(关于生成模型和判别式模型,主要还是在于是否是要求联合分布),非常简单,你只是做了一堆计数。如果注有条件独立性假设(一个比较严格的条件),朴素贝叶斯分类器的收敛速度将快于判别模型,如逻辑回归,所以你只需要较少的训练数据即可。即使
常见机器学习算法优缺点比较(一)
机器学习算法太多了,分类、回归、聚类、推荐、图像识别领域等等,要想找到一个合适算法真的不容易,所以在实际应用中,我们一般都是采用启发式学习方式来实验。通常最开始我们都会选择大家普遍认同的算法,诸如SVM,GBDT,Adaboost,现在深度学习很火热,神经网络也是一个不错的选择。假如你在
各大微波仿真软件介绍及算法和原理
1.引言微波系统的设计越来越复杂,对电路的指标要求越来越高,电路的功能越来越多,电路的尺寸要求越做越小,而设计周期却越来越短。传统的设计方法已经不能满足系统设计的需要,使用微波EDA软件工具进行微波元器件与微波系统的设计已经成为微波电路设计的必然趋势。随着单片集成电路技术的不断发展,GaAs、硅为基
常见机器学习算法优缺点比较(三)
优点:实现简单,计算简单; 缺点:不能拟合非线性数据. 4.最近领算法——KNN KNN即最近邻算法,其主要过程为: 计算训练样本和测试样本中每个样本点的距离(常见的距离度量有欧式距离,马氏距离等); 对上面所有的距离值进行排序; 选前k个最小距离的样本; 根据这k个样本的标签进行
深度学习算法-助力精准诊断结直肠肿瘤
根据发表在《Life Science Alliance》杂志上的新研究,一种新的深度学习算法可以快速,准确地分析来自结直肠肿瘤的几种基因组数据,以进行更准确的分类,从而有助于改善诊断和相关的治疗选择。 大肠肿瘤的发展方式各不相同,需要接受的药物类型也不同,生存率也大不相同。通常,基于对基因表达
常见机器学习算法优缺点比较(四)
缺点 · 当观测样本很多时,效率并不是很高; · 对非线性问题没有通用解决方案,有时候很难找到一个合适的核函数; · 对缺失数据敏感; · 对于核的选择也是有技巧的(libsvm中自带了四种核函数:线性核、多项式核、RBF以及sigmoid核): · 第一,如果样本数量小于特征
未来密钥安全- 后量子密码算法来保护
早在量子计算时代到来前,互联网就已经进入了后量子时代。许多人对未来量子计算机破解现代生活所依赖的密钥的能力感到担忧,因为这些密钥保护着从智能手机银行应用到在线支付的一切流程。 据《自然》报道,近日,美国国家标准与技术研究院(NIST)正式公布了其认可的能够抵抗量子计算机攻击的4项密码技术,即C
研究发现驯化选择水稻DNA寒害损伤修复机制及优异模块
农作物应对全球气候变化引起的异常温度需要具备优异耐受模块,品种设计需依赖细胞寒害感知防御“信号网络”“修复机制”的原理。 在前期研究中,中国科学院院士、中科院植物研究所研究员种康研究组在水稻寒害感知与防御“信号网络”中发现了包括感受器、激酶、叶绿体维生素E-K1代谢途径、转录因子和海藻糖代谢
数字地形分析并行算法设计方面取得进展
数字地形分析算法常具有数据-计算密集型特点,一方面算法步骤常涉及迭代、递归等高复杂度的计算,另一方面其应用经常需面对大区域、高分辨率的大规模栅格数字高程模型(DEM)数据。在这种情况下,传统以串行方式实现的数字地形分析算法以分钟、小时、乃至以天计的运行时间,显然难以满足用户的时间响应需求,因此迫
新计算机算法可辨别声音环境方向
假如把你蒙住眼睛放在一个陌生房间里,你打个响指听听动静,能否听出房间是什么形状格局?蝙蝠和海豚能用这种回声定位法在环境中辨别方向,有些盲人也能做到这一点。而据物理学家组织网6月18日报道,瑞士联邦理工学院视听通讯实验室(LCAV)科学家设计出一种计算机算法,通过分析来自4个麦克的声音,同样能完成
AI新算法测寿命-或能助人类更长寿
据英国每日邮报报道,一项新的研究表明,利用AI技术可以检测人的细胞年龄,并依此制定出个性化医疗方案,从而帮助人们实现长寿的愿望。 据悉,科学家开发的这种AI算法被称为“Aging.AI”,根据人们的血液样本可以计算出生理年龄,并验证某些生活方式的改变和药物是否能提高人们长寿和健康的几率。目
简介数字信号处理器的算法格式
DSP的算法有多种。绝大多数的DSP处理器使用定点算法,数字表示为整数或-1.0到+1.0之间的小数形式。有些处理器采用浮点算法,数据表示成尾数加指数的形式:尾数×2指数。 浮点算法是一种较复杂的常规算法,利用浮点数据可以实现大的数据动态范围。这个动态范围可以用最大和最小数的比值来表示。浮点D
机器学习算法助力新模型实现羊肉精准溯源
近日,中国农业科学院农产品加工研究所肉品科学与营养工程创新团队将非靶向代谢组学与机器学习方法相结合,成功构建了羊肉产地精准判别模型,为羊肉产地精准溯源提供了新方法。相关研究成果发表于《食品化学X》(Food Chemistry: X)。受肉羊品种和饲养环境影响,羊肉品质具有鲜明的地域特征,因此地理标
美开发出基于热映像的图像分割算法
美国普渡大学的研究人员开发出一种基于热映像的计算机图像分割算法,可使计算机迅速识别出物体的外形,即便其发生扭曲或轻度变形也不会受到影响。该技术将使机器视觉与人类视觉更加接近,可广泛应用于图像搜索、医疗影像以及无人机制造等多个领域。详细研究结果将分为两篇论文,在6月21日至23日举行的IEEE(美
科学家破解卫星电话加密算法
近日,德国波鸿鲁尔大学霍斯特-戈尔兹信息安全研究所(HGI)的研究人员成功破解了欧洲电信标准协会(ETSI)的卫星电话加密算法,证明使用卫星电话也存在被窃听的危险。 全球有很多地区无法保证移动电话的使用,因此,在非常偏远的地区、战乱地区、第三世界国家和海上,卫星电话成为及时沟通的好工具。卫
基于Nagle算法的嵌入式TCP协议(一)
随着嵌入式系统的发展,在嵌入式系统中实现网络连接已成为研究热点,广泛使用的廉价8/ 16 位嵌入式处理器的性能不足与网络协议的复杂构成了尖锐的矛盾。嵌入式Internet 技术的核心是在嵌入式系统中实现TCP/ IP 协议簇, TCP 协议的机制比较复杂,对8/ 16 位嵌入式处理器的存储能力和
新算法比较分析可搜索癌症基因突变
桑福德伯翰医学研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承担了前所未有的对一个新兴算法类别的比较分析,该算法通过聚焦内部基因结构,在癌症数据库中挖掘遗传信息(即亚基因像素算法),这与专注于基因视其为单个单元的经典方法形成
王欣明:提出原行星盘演变新算法
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499635.shtm太阳系缘起何处?地球等行星又是如何形成?如果要回答这些问题,我们的目光可能就要穿越浩瀚宇宙的变迁,追溯到太阳、行星及其他恒星、行星系统的初始状态,“星云假说”、原行星盘就会进入我们的视
AI新算法测寿命-或能助人类更长寿
据英国每日邮报报道,一项新的研究表明,利用AI技术可以检测人的细胞年龄,并依此制定出个性化医疗方案,从而帮助人们实现长寿的愿望。 据悉,科学家开发的这种AI算法被称为“Aging.AI”,根据人们的血液样本可以计算出生理年龄,并验证某些生活方式的改变和药物是否能提高人们长寿和健康的几率。目