预测小分子抗癌活性有了新算法
记者从中科院昆明动物研究所获悉，该所李功华博士在研究员黄京飞的指导下，开发了一个新的基于分子药效团的小分子比对算法，并成功应用于预测小分子的抗癌活性。近日，该研究发表在顶级计算生物学杂志《生物信息学》上。 据李功华介绍，开发新的抗癌药物是科学界和医学界的热点和难点。直接采用实验的方法筛选抗癌药物具有花费大、时间长的特点。以小分子为例，现在已知的小分子化合物超过了1000万个，因此，直接采用实验的方法从这1000万个化合物中筛选药物小分子几乎是不可能的。因此，建立一个高效、可靠、准确的抗癌药物的计算生物学筛选系统对发掘新的抗癌药物具有重要意义。 为建立抗癌药物活性的计算生物学预测系统，李功华开发了一个新的基于分子药效团的小分子比对算法，通过交叉验证发现其预测的线下面积达到了0.878，显示该算法能很好地预测药物小分子的抗癌活性。 同时，李功华还开发了一个简便易用的预测抗癌药物活性的网页服务器，使该算法能被不同......阅读全文
预测小分子抗癌活性有了新算法
记者从中科院昆明动物研究所获悉，该所李功华博士在研究员黄京飞的指导下，开发了一个新的基于分子药效团的小分子比对算法，并成功应用于预测小分子的抗癌活性。近日，该研究发表在顶级计算生物学杂志《生物信息学》上。 据李功华介绍，开发新的抗癌药物是科学界和医学界的热点和难点。直接采用实验的方法筛选抗
Cancer－Cell:科学家发现新型抗癌小分子
约翰霍普金斯大学科学家在培养细胞体系中发现一种小分子具有破坏癌细胞分裂，防止癌细胞生长的功能。相关报道发表在近期的Cancer Cell杂志上。 该研究是由Marikki Laiho博士领导的研究团队完成的。科学家发现小分子BMH-21能够破坏RNA聚合酶POL I转录通路，阻断癌
分子生物学实验小技术
当找到可能的重组质粒且条带清晰时可直接切下含DNA 的凝胶条带，用胶回收DNA 的方法回收质粒并进行酶切鉴定，如果DNA 量太少则需重提质粒。 用QIAprep Miniprep Spin 小量提质粒注意以下事项可提高得率A．用含抗生素的培养基培养细菌会有较高的得率。B．收菌时用tips吸干净残余的
计算小RNA分子的单细胞测序新法
最近，卡罗林斯卡学院的研究人员开发出了一种单细胞程序，测量了单个胚胎干细胞中短的非编码RNA序列的绝对数量。这种新方法可以加深我们对于“基因是如何被调节、不同的细胞类型如何发展”的理解。相关研究结果发表在10月31日的《Nature Biotechnology》。当我们基因中的信息被使用时――例如构
分子生物学实验小技术（二）
1 、 各供应商送货时往往会提供冰袋，在室温下将化冻的大冰袋平整的一面整齐地插入1.5ml 或0.5ml 、0.2ml 的废弃离心管；或将几个化冻后的小冰袋填料塞入一个小泡沫盒中压实，再插入各种大小的试管，放在-20 摄氏度下冻24小时后取出，拔出插入的废管（可加点热水以助拔管）即可做成一个
小分子药物研发亟需颠覆性创新
【新闻事件】：今天LifeSciVc的Michael Gladstone撰文展望今年转化医学领域的主要事件。ECHO301将是今年最大的不成功则成仁试验，但他估计无论成败IDO领域的工作都只是开始，因为适应症、人群、剂量、药物选择性等细节不会因为一个试验结果全部弄清。活性极高、所以窗口狭小的细胞
小分子药物研发亟需颠覆性创新
【新闻事件】：今天LifeSciVc的Michael Gladstone撰文展望今年转化医学领域的主要事件。ECHO301将是今年最大的不成功则成仁试验，但他估计无论成败IDO领域的工作都只是开始，因为适应症、人群、剂量、药物选择性等细节不会因为一个试验结果全部弄清。活性极高、所以窗口狭小的细胞
小分子药物与miRNA关联图首次构建
哈尔滨医科大学科研人员基于基因芯片数据、利用生物信息学方法，首次构建了人类癌症中小分子化合物与miRNA(微小核糖核酸)的关联图。近日，相关成果《基于转录反应识别人类癌症中小分子和miRNA关联》由Nature子刊《科学报道》在线发表。 miRNA是一种单链的非编码RNA，参与多种与人类癌
小分子药物单克隆抗体制备
在单克隆抗体制备中，首先进行的就是抗原的设计与合成，这是制备单抗成功与否的关键。因为产生抗体的特异性与亲合性是与抗原密切相关的，合成的抗原如果可以将所需要的抗原决定簇充分暴露出来，那么机体更容易识别抗原决定簇，从而免疫的动物所产生的抗体自然会在特异性和亲合力上最大程度的与抗原决定簇拟合。所以，在制备
新的根除癌症干细胞小分子抗癌药被发现
托莱多大学的科学家们在对一种常用化疗药物的进行改进时发现了一类全新的抗癌药物，有望根除癌症干细胞。 尽管目前的研究在癌症预防和早期检测方面取得了重大进展，但是许多肿瘤仅在它们扩散到远处器官后才被发现，这为临床治疗带来巨大的难题。 事实上，对人类某些肿瘤分析已表明，扩散可能很早就已经发生。但是
利用人工智能和计算生物学方法－寻找到17个活性药物分子
近日，中国科学院深圳先进技术研究院医药所计算机辅助药物设计中心袁曙光课题组带领团队，利用人工智能和计算生物学的方法从158万个化合物中寻找到了17个嗅觉受体蛋白Olf73的活性药物分子。该工作为基于嗅觉受体蛋白的药物发现与设计提供了有力的理论基础和依据。该成果以Computational mod
核酸与小分子识别理论计算研究取得进展
中国科学院长春应用化学研究所电分析化学国家重点实验室研究员汪劲和副研究员晏致强，提出了核酸—小分子识别特异性的理论计算方法并开发了一套全新的核酸—小分子相互作用能量打分函数SPA-LN。该研究成果发表在Nucleic Acids Research上。 研究表明，核酸（nucleic acids
预测抗癌药物活性方面获进展
癌症是目前世界人口死亡的第一原因。全世界每年因癌症死亡的人口超过720万人。而在中国，每年因癌症死亡的人口也超过了 170万。因此，开发新的抗癌药物是科学界和医学界的热点和难点。但直接采用实验的方法筛选抗癌药物具有花费大、时间长的特点。以小分子为例，现在已知的小分子化合物超过了1000万个，
昆明动物所在预测抗癌药物活性方面获进展
癌症是目前世界人口死亡的第一原因。全世界每年因癌症死亡的人口超过720万人。而在中国，每年因癌症死亡的人口也超过了170万。因此，开发新的抗癌药物是科学界和医学界的热点和难点。但直接采用实验的方法筛选抗癌药物具有花费大、时间长的特点。以小分子为例，现在已知的小分子化合物超过了100
小分子褐藻糖胶对生长讯号传递机制的抗癌调节效用
小分子褐藻糖胶具备多种不同的生物与药学活性，例如抗癌／抗肿瘤、抗增生、抗发炎与免疫调节功能[1-3]，并且与小分子褐藻糖胶相关膳食补充品和营养医学食品近年愈来愈获重视。上海市科林临床生物信息学研究所长期投入各项小分子褐藻糖胶在辅助性疗法的转化医学应用，在2019年由上海市科林临床生物信息学研究所
小分子药物可预防致命性辐射病
大规模辐射接触，如切尔诺贝利和福岛第一核电站灾难之后的那类辐射接触，仍是一个全球性的公共卫生顾虑及军事威胁。在小鼠中从事研究的科研人员表示，一类新的研发用于治疗其它疾病的药物可能会在发生辐射事故时帮助挽救生命。这些药物被称作PHD抑制剂，它们似乎能保护机体免于辐射诱发的胃肠道综合征，这种疾病通常
新型小分子药物促进肝脏肠道皮肤修复再生
近期，厦门大学两个科研团队联合攻关，研制出一种能促进受损的肝脏、肠道及皮肤等器官修复与再生的重要小分子药物，并在小鼠实验中取得了优异的治疗效果。也许未来的某一天，人们只需通过服药，便可实现受损肝脏、肠道和皮肤的修复与再生。这被认为为再生医学领域带来了新的“曙光”。 8月18日，这项研究成果发表
OpenSPR助力JAK/Stat信号通路抗癌药物分子机制研究
宫颈癌是女性第二常见的恶性肿瘤，近年来其发病有年轻化的趋势。基于塔斯品碱及其衍生物的化学结构所设计合成的同分异构化合物TAD-1822-7-F2 (F2)和TAD-1822-7-F5 (F5)可以有效抑制HeLa细胞的增殖。西安交通大学的研究人员使用OpenSPR的表面等离子共振(SPR)技
超分子囊泡实现抗癌药物细胞内转运
超分子囊泡的形成以及pH调控的抗癌药物释放 在过去的二十年里，伴随着纳米技术的迅速发展，研究人员一直致力于开发能够显著提高药物的生物利用度的新型药物纳米载体或药物转运系统。这些药物纳米载体或药物转运系统需具备“智能性”，即不仅需要构筑规整有序的结构骨架实现高效地负载治疗药物，而且可以在人体内病
OpenSPR助力JAK/Stat信号通路抗癌药物分子机制研究
宫颈癌是女性第二常见的恶性肿瘤，近年来其发病有年轻化的趋势。基于塔斯品碱及其衍生物的化学结构所设计合成的同分异构化合物TAD-1822-7-F2 (F2)和TAD-1822-7-F5 (F5)可以有效抑制HeLa细胞的增殖。西安交通大学的研究人员使用OpenSPR的表面等离子共振(SPR)技
基因组所抗癌药物分子机制研究获进展
近日，中国科学院北京基因组研究所“百人计划”研究员雷红星及其研究组开展的“抗癌药物的分子机制研究”取得阶段性进展，其研究论文Early stage intercalation of doxorubicin to DNA fragments observed in mol
一些分子生物学实验小技术2
5．有关融合蛋白表达载体的克隆 在构建融含蛋白表达载体时除了要注意插入片段的方向、读码框架与载体保持一致外，注意以下问题可能会减少一些不必要的麻烦，当外源片的插入载体起始密码的后面，另一个基因的前面时，注意检查插入后基因的两端是否引入了新的终止密码，特别是用到Klenow mung bean
关于犬小孢子菌的分子生物学介绍
分子生物学在各医学领域中的广泛应用推动了人们对微观世界的认识，同时也为广大真菌学工作者提供了新的研究方法。不少真菌学家已开始在分子水平上研究犬小孢子菌的生物学和基因特征，以了解犬小孢子菌的分子生物学特征与致病机制的关系并为临床快速确诊提供实验室依据。就较新研究论述如下： Papini将从70只
一些分子生物学实验小技术汇编
1．保存菌种保存菌种或长时间放置的培养板应先划板活化菌种，挑取分隔良好的单 克隆接种于2-10 ml ＬＢ中（如菌种含质粒则应加抗生素）３７摄氏度快摇 ８小时，按0.1%-0.5% 比例转种，培养基的量不应超过锥瓶的0.25容量，以 保证足够的通气。用O.D.600 测菌密度时，读数值在0.1-0.
一些分子生物学实验小技术1
1．保存菌种保存菌种或长时间放置的培养板应先划板活化菌种，挑取分隔良好的单 克隆接种于2-10 ml ＬＢ中（如菌种含质粒则应加抗生素）３７摄氏度快摇 ８小时，按0.1%-0.5% 比例转种，培养基的量不应超过锥瓶的0.25容量，以 保证足够的通气。用O.D.600 测菌密度时，读数值在0.
全球销售额－Top－20－的小分子药物及药物设计思路
根据美国Arizona大学的Jon Njardarson课题组整理的小分子药物销售额数据（https://njardarson.lab.arizona.edu/content/top-pharmaceuticals-poster），笔者总结了2021年全球销售额top 20的小分子药物的分子结构、靶
小分子RNA
RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”，但越来越多的证据清楚的表明，RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰（RNA interference）的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识，更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具，
小分子疗法
小分子疗法 15日，PTC Therapeutics公布了一项针对DMD和贝克肌营养不良（BMD）患者的最新研究结果，显示从常规疗法转为Emflaza（deflazacort）治疗后6个月的平均随访期内，大部分患者显示病情改善。>>阅读更多 16日，罗氏（Roche）旗下基因泰克（Genet
“黑马”分子成抗癌药物新靶点－将变革癌症疗法
据物理学家组织网8月13日(北京时间)报道，澳大利亚的研究人员确定一种名为白细胞介素-11的分子，在癌细胞的生长扩散中发挥着重要作用，能够成为抗癌疗法的新靶点。此前研究中，该分子的作用一直被忽视，而今这匹“黑马”极有可能为包括肠癌和胃癌在内的多种癌症带来全新的治疗途径。相关论文在线发表在《癌细胞
辉瑞114亿美元拿下靶向小分子药物公司Array
辉瑞公司（纽约证券交易所股票代码：PFE）和Array BioPharma Inc.（纳斯达克股票代码：ARRY）在6月17日宣布，辉瑞将以每股48美元、总企业价值约为114亿美元的现金收购Array。在并购完成之后，双方将专注于靶向小分子药物的发现，开发以及商业化，用以治疗癌症和其它疾病。