新型DNA测序算法让“重复片段”不再神秘
美国华盛顿大学的一个研究小组称，他们使用了一种被称为“mrFAST”的新型DNA测序算法，可对基因的重复片段进行精确统计并对其作用作出初步判断。相关研究发表在8月30日出版的《自然·遗传学》杂志上。 据了解，截至2003年底，绝大部分的人类基因组已获得测定。但基因组中仍有许多的区域未获得测序。这其中的首要原因是在每条染色体的中心区域(称为着丝粒)含有大量重复DNA序列。这些重复片段中常常含有不少未知功能的基因，不同个体间重复片段的拷贝数不同。不少科学家认为诸如红斑狼疮、精神发育迟滞、精神分裂症、色盲、牛皮癣，以及和年龄相关的眼部黄斑变性等疾病都与此相关。因此，对重复片段数量、含量以及位置的检测统计就显得尤为重要。 负责该项研究的美国华盛顿大学基因组科学学院的肯·阿尔康称，这种算法采用了新型DNA测序技术，可在重复片段中精确检测出具有特殊功能的基因。与其同校的论文的另外一位作者杰弗里·基德说，由于难度太大，目前大多......阅读全文
新型DNA测序算法让“重复片段”不再神秘
美国华盛顿大学的一个研究小组称，他们使用了一种被称为“mrFAST”的新型DNA测序算法，可对基因的重复片段进行精确统计并对其作用作出初步判断。相关研究发表在8月30日出版的《自然·遗传学》杂志上。 据了解，截至2003年底，绝大部分的人类基因组已获得测定。但基因组中仍有许多的区域未获得测
大片段DNA测序(>50KB)
大片段DNA的测序: 通过鸟枪法 (Shot Gun Sequencing) 测序 鸟枪法测序的操作方法1. 用限制酶切下目的片段的大片段Insert DNA, 并用Agarose凝胶电泳进行回收。2. 对回收的大片段DNA用物理方法 (如超声波等) 进行切断处理，然后用T4 DNA Polymer
长片段DNA如何设计测序引物
如果是测序引物的话，因为目前的测序技术一端只能到800bp左右，所以一对引物差不多能测1.5kb左右的片段，超出这个范围测出来的也不太可信了。所以如果你的目的片段在这个范围内，设计1对引物就行了，如果超出这个范围，比如说有6k左右，那就要设计四对引物，设计方法跟常规的一样，只是把握这个间隔就好了。1
Nat－Biotechnol：基因组中的“黑物质——DNA重复片段”
基因组的大部分区域由重复片段组成。这些“ DNA重复序列”在错误位置的扩增可能会产生严重后果。然而，DNA重复序列的扩增非常难以分析。柏林马克斯·普朗克分子遗传学研究所的研究人员最近开发的一种方法可以详细查看这些以前无法进入的基因组区域。它结合了纳米孔测序，干细胞和CRISPR-Cas技术。该方
DNA片段的制备方法
常用以下方法获得DNA片段：①用限制性核酸内切酶将高分子量DNA切成一定大小的DNA片段；②用物理方法(如超声波)取得DNA随机片段；③在已知蛋白质的氨基酸顺序情况下，用人工方法合成对应的基因片段；④从mRNA反转录产生cDNA。
DNA片段的连接技术
一、目的与原理DNA酶切片段的联接是两DNA片段相邻的5‘磷酸和3’羟基间可有连接酶催化形成磷酸二酯键，这个连接反应在体外一般都有大肠杆菌DNA连接酶和T4DNA连接酶催化，但是分子生物学试验中主要采用T4DNA连接酶，因该酶在正常条件下，即能完成连接反应。本实验拟通过T4DNA连接酶对酶切片断的连
DNA片段的回收实验
实验方法原理 本方法特别适合于PCR片段的回收，具有纯度高、操作简洁等特点，经此方法回收的片段可有效的用于重组载体构建。通过15分钟的纯化过程，PCR产物即能被有效地从含引物二聚体、非特异性扩增引物片断等混合物中分离出来，成为高度无盐的、不含其他大分子成分的纯化片断。在较宽的分子量范围内有较高的回收
DNA片段回收与纯化
质粒、噬菌体等经酶切，电泳；PCR产物经电泳后，常常需要对一些DNA电泳片段进行回收和纯化，用于亚克隆、探针标记等。DNA回收和纯化常用方法有压碎法、低融点琼脂糖法、冻融法等，也有现成的试剂盒供应。一、冻融法1. 紫外灯下仔细切下含待回收DNA的胶条，将切下的胶条（小于0.6g）捣碎，置于
DNA片段的回收实验
树脂回收法 微量柱法 液氮冻融法 常规方法 实验方法原理 本方法特别适合于PCR片段的回收，具有纯度高、操作简洁等特点，经此方法
DNA测序
自动测序法 双脱氧链末端终止法 非同位素银染 鸟枪法 Maxam-Gilbert化学修饰法 实验方法
DNA测序
实验方法原理 ABI PRISM 310型基因分析仪(即DNA测序仪)，采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法)，因此通过单引物PCR测序反应，生成的PCR产物则是相差1个碱基的3'末端为4种不同荧光染料的单链DN
DNA测序
DNA测序（主要内容如下）· Sequencing Gel Preparation· Preparation of Templates · DNA Sequencing by the Dideoxy Method· DNA Sequen
SageHLS靶向捕获大片段DNA在测序解析神经精神疾病CNVs结...
SageHLS靶向捕获大片段DNA在测序解析神经精神疾病CNVs结构研究的应用在2020年的美国AGBT（基因组生物学与技术进展）大会上，由斯坦福大学实验室的Alexander Urban和Hanlee Ji主导的一项国际合作项目中，研究人员使用SageHLS超大片段核酸回收系统在结构复杂的人类染色
高通量测序技术核酸片段分选
近年来，高通量测序技术已经日渐成为基因组学研究项目的标准。从样品制备到文库制备及最终测序，大多步骤都要求精确高效化、易于自动化操作，并且许多高通量测序应用都要求核酸片段在特定范围内紧密分布，因此精准快速的进行片段选择步骤更具挑战性。在进行核酸片段分选的过程中，传统的琼脂糖凝胶回收法不适于安全、高通量
细胞化学词汇重复DNA
中文名称：重复DNA英文名称：repetitive DNA定 义：真核生物染色体基因组中含有不同拷贝数的核苷酸序列。这些序列一般不编码多肽，在基因组内可成簇排布，也可散布于基因组。按序列的重复程度和特点可分为低度重复DNA、中度重复DNA和高度重复DNA。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科）
高度重复DNA的定义
中文名称高度重复DNA英文名称highly repetitive DNA;hyperreiterated DNA定 义真核生物基因组中存在的拷贝数可达数千以上的短核苷酸重复序列，不负责编码蛋白质或RNA，它们在基因组中发挥着各种不同的功能。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级
重复[DNA]序列的概念
中文名称重复[DNA]序列英文名称repetitive [DNA] sequence定 义DNA分子中重复出现的核苷酸序列。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
低度重复DNA的结构
中文名称低度重复DNA英文名称lowly repetitive DNA定 义在单倍体基因组中含1至10个拷贝的重复DNA。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
中度重复DNA的定义
中文名称中度重复DNA英文名称middle repetitive DNA;moderately repetitive DNA定 义在真核细胞中存在的，以含有大量拷贝的不同核苷酸序列为特征的重复DNA的一种，其重复度为10个至几千个，通常占整个单倍体基因组的1%～30%。如核糖体核糖核酸(rRNA)
DNA片段探针的应用实验
甲酰胺法 水溶液中杂交 实验材料 DNA 试剂、试剂盒
DNA片段的亚克隆实验
实验材料 DNA试剂、试剂盒 CIPdNTPDNA聚合酶T4聚合酶DTTATP仪器、耗材 水浴锅电泳仪培养箱实验步骤 1. 在20 μl 反应体积内用合适的酶完全消化DNA。75℃加热15 min，灭活酶。如若无需进一步的酶促处理，接歩骤6。2. 如果5’磷酸需要去除，加入2 μl 10×CIP
微量柱法纯化DNA片段
实验概要目的DNA片段的回收技术是重组DNA中的关键技术，回收是指从电泳介质中纯化出目的片断。目前待回收的片断主要有酶切片断和各种PCR片断；回收的介质主要有琼脂糖和PAGE；回收的方法主要有树脂回收、微量柱回收、玻璃奶回收、液氮冻冻融回收及透析袋大量回收等，下面分别介绍树脂、微量柱及液氮冻冻融回收
冻融法回收DNA片段
实验方法原理 冻融法是指采用反复冷冻与融化时由于细胞中形成了冰晶及剩余液体中盐浓度的增高可以使细胞破裂。这种方法简单方便，但要注意那些对温度变化敏感的蛋白质不宜采用此法。 实验材料
PCR扩增分离目的DNA片段
一、目的了解多聚合酶链反应DNA 扩增技术的基本原理和实验应用，掌握PCR反应基本技术。二、原理PCR（Polymerase Chain Reaction）即聚合酶链式反应是1986 年由Kallis Mullis 发现。这项技术已广泛地应用于分子生物学各个领域，它不仅可用于基因分离克隆和核酸序列分
冻融法回收DNA片段
冻融法回收DNA片段可用于：（1）获取纯化的DNA片段；（2）回收PCR产物。实验方法原理冻融法是指采用反复冷冻与融化时由于细胞中形成了冰晶及剩余液体中盐浓度的增高可以使细胞破裂。这种方法简单方便，但要注意那些对温度变化敏感的蛋白质不宜采用此法。 实验材料DNA胶条试剂、试剂盒Tris-HCl饱和酚
DNA片段探针的应用实验
实验材料 DNA试剂、试剂盒 杂交液洗膜液仪器、耗材 注射器超声仪水浴锅实验步骤 1. 用5~20 ml 杂交液Ⅰ依次浸泡10~20张硝酸纤维素滤膜。滤膜装入杂交袋中，加入足够的杂交液，密封后42℃预杂交1 h。 2. 往带螺盖的试管中，加入放射性探针和2 mg 超声波处理的鲱鱼精DNA，煮沸1
DNA小片段的纯化回收
DNA 电泳小于100bp的片断通常在电泳时就比较难观察分辨，需要用分辨率很高的琼脂糖或者丙烯酰胺凝胶。比如Cambrex的NuSieve 3:1或者GTG，或者是大名鼎鼎的MetaPhor琼脂糖。所以实际上对于小片断，可以分为两种情况：一个是真的要回收电泳中特别小的片断，这种情况我们前面有提到，比
DNA片段的亚克隆实验
基本方案 凝胶块中DNA连接 实验材料 DNA 试剂、试剂盒
DNA测序PCR测序反应
1. 取0.2 ml的PCR管，用记号笔编号，将管插在颗粒冰中，按下表加试剂： 所加试剂 测定模板管 标准对照管 BigDye Mix 1 μl 1 μl 待测的质粒DNA 1 μl － pGEM-3Zf (+) 双链DNA － 1 μl 待测DNA的正向引物 1 μl － M13(
DNA测序的测序技术
高通量测序技术（High-throughput sequencing）又称“下一代”测序技术（Next-generation sequencing technology），以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等，主要有以