动物所在物种进化历史分歧时间估算方法研究中取得进展
物种分歧时间估算一直是生命之树(Tree of Life)进化历史研究中具挑战性的热点工作。分析过程通常涉及:核苷酸序列数据的系统发育分析;在重建的系统发育树的基础上,基于化石信息校准内部节点时点区间。在现有的绝大多数利用基因或基因组数据开展的工作中,来自化石或生物地质事件的外在时间校准信息多由研究者直接赋予某具体的进化树内部节点,存在一定的主观性。同时,校准信息的具体时间统计分布往往不容易确定,但又对分析结果具有重要影响。另一种方法是贝叶斯整合定年,对现生类群的分子数据和现生化石类群形态学数据联合分析。该思路诱人的部分原因来源于化石的生灭过程,该过程为系统发育树拓扑和节点时间先验提供了谱系多样化的模型。旨在克服校准信息等诸多弊端的tip-dating方法,则将化石样品和现生物种同时作为进化树枝端信息进行分析。 自Ronquist Fredrik等2012年正式提出以来,贝叶斯整合推断分歧时间方法得到了学界的高度关注,已经......阅读全文
动物所揭示野生动物及其肠道菌群的生理适应机制
表型可塑性是生物应对复杂多变环境的一种适应,决定物种的适合度和分布范围。野生动物在自然环境中会面临周期性的环境温度波动。随着全球气候变暖,野生动物在夏季也会面临热浪的胁迫,以及极端气候条件的影响。面对周期性的低温或高温暴露,野生动物及其共生微生物如何适应这种变化的环境?低温或高温经历是否会提高动
动物所合作研究揭示哺乳动物早期胚胎命运决定的新机理
中国科学院动物研究所的合作团队结合数学建模以及哺乳动物早期胚胎单细胞转录组测序数据分析,对哺乳动物早期胚胎第一次谱系分化的起源问题提出了新的解释,研究工作发表于Development。 传统观点认为,哺乳动物早期胚胎的第一次细胞命运决定起始于桑葚胚阶段(16细胞期),此阶段的卵裂球首次在位置上
昆明动物所等通过动物DNA鉴定发现中国金丝猴新种群
金丝猴属于灵长目疣猴亚科,包括滇金丝猴、川金丝猴、黔金丝猴和越南金丝猴,其中前三个种类都分布在我国境内。2010年初,野生动植物保护国际(FFI)在缅甸克钦邦东北部发现一个新的金丝猴物种。但由于采集的是动物尸体,不能肯定该新物种是否依然存在。2012年3月,怒江州林业系统工作人员再次在怒江州境内
昆明动物所等完成云南两栖、爬行动物物种编目工作
物种名录是进行生物多样性研究、保护、利用以及管理的重要基础资料。近年来分类学研究方法、技术手段不断提高,特别是整合分类学的发展促进了生物分类体系不断得以完善;此外,新物种不断被发现并描述,已知物种的分布和生态数据不断更新。由于分类的变动,物种的分布范围、种群数量等也随之变化,直接影响了物种的受威胁等
昆明动物所等家养动物线粒体DNA基因组学研究取得进展
近年来,家养动物线粒体DNA(mtDNA)基因组学得到了迅速发展,积累了大量的mtDNA序列数据。与此同时,一些问题随之浮现出来。除了数据质量存在缺陷(Shi, et al. 2014. Mol Ecol)之外,mtDNA世系划分标准不一,世系命名混乱的问题也已开始干扰家养动物mtDNA的研究工
昆明动物所揭示两栖动物防御高原紫外辐射的分子机制
太阳光谱中的紫外线不仅使人体皮肤晒伤老化,产生炎症、黑色素和色斑,更严重的还会诱发癌变,危害人类健康。目前动物适应高海拔环境的策略和生理生化机理研究主要集中于低氧低温适应,对动物如何抵御高原强紫外线辐射的认识非常有限。 中国科学院昆明动物研究所动物模型与人类疾病机理重点实验室生物毒素与人类疾病
动物所端粒延长技术近日获得美国ZL授权
中国科学院动物研究所端粒与衰老研究组的一项发明在获得中国发明ZL后,近日正式获得美国国际ZL授权(ZL号 9505815),ZL发明人为谭铮、赵勇、王峰、郝玉华。人的衰老伴随着端粒的缩短和细胞分裂能力的减退,端粒长度的维持是维护细胞分裂能力的必要条件,因而端粒被比喻为“生命的时钟”。三位美国科学
昆明动物所揭示肺癌侵袭转移新机制
肺癌是一种常见的恶性肿瘤。随着吸烟和环境因素影响的增加,肺癌发病率和病死率均迅速上升。肺癌已成为我国恶性肿瘤首位死亡原因。肿瘤细胞分子水平的改变,如染色体、基因改变,已被认为是恶性肿瘤发生的最主要机理。寻找新的肺癌相关基因——癌基因和抑癌基因——对深入研究肺癌发生、发展的病理机制,发现新的诊断标
昆明动物所揭示海豚水生适应的分子基础
随着基因组数据的迅速增加,通过比较基因组学及生物信息学的方法探讨物种适应性进化的遗传基础是目前分子进化的研究热点。 中科院昆明动物研究所张亚平院士课题组针对已公布的海豚基因组,通过与其他近缘物种的基因组进行比较,系统地鉴定出海豚中经历正选择的基因及位点,为理解海豚等鲸目动物的
中科院昆明动物所摸清云南鱼类“家底”
记者8月15日从中科院昆明动物研究所获悉,该所副研究员陈小勇在《动物学研究》杂志 2013年第4期上发表了云南鱼类名录,种数达620种。该研究进一步印证了云南是中国淡水鱼类多样性最丰富的地区,并刷新了《云南鱼类志》的纪录,为全面摸清云南鱼类的“家底”、厘清相互关系奠定了基础。 陈小勇介
动物所合作揭示胚胎植入失败的新机理
胚胎植入的成功与否是妊娠建立的关键门槛。植入前相关激素紊乱是导致胚胎植入失败的一个常见因素,过去的观点主要认为这是由于破坏了子宫内膜的接受性造成的。然而除子宫内膜接受性因素之外,胚胎在植入前需要借助子宫收缩及宫腔内液体环境运输到准确的植入位置,并在定位后实现宫腔液体的快速重吸收,以促进胚胎与子宫
昆明动物所构建秀丽线虫脂代谢途径网络
动物模型对研究脂代谢调控和代谢性疾病是必不可少的。模式生物秀丽线虫(Caenorhabditis elegans)是第一个全基因组被测序的真核生物(1998年)。在过去的10多年中,由于其生活周期短、低成本、易培养和操作等优点,秀丽线虫成为一个研究脂代谢调控、肥胖和肥胖相关代谢性疾
昆明动物所揭示rRNA加工机器的进化机制
核糖体是蛋白质合成的分子机器。核糖体RNA的加工成熟及其与核糖体蛋白的结合是核糖体亚基装配的基本过程。真核生物的该过程是在核仁中进行的。在酵母上已有报道核糖体小亚基rRNA(SSU rRNA)的加工成熟,是由一个被称为SSU Processome(小亚基rRNA加工体)的核酸蛋白复合体所
动物所揭示生物入侵风险的全球格局
随着贸易的日益全球化,外来物种入侵对生物多样性以及生态系统功能的威胁持续增加。了解外来物种在全球的入侵热点,即多个外来种适宜的生境,以及这些入侵热点与全球生物多样性热点的重叠程度,对采取优先保护措施以减轻外来物种对生物多样性的危害至关重要。 中国科学院动物研究所李义明研究组选择影响外来种分布的
昆明动物所研发新的生物气味探测装置
在人类社会的多种场合中都有气味探测的需求,尤其现代社会中反恐、缉毒问题日益突出,而啮齿类动物在研发生物气味探测系统方面有独特的优势。中国科学院昆明动物研究所认知障碍病理实验室研究员马原野组的何静等开发设计了的一套新的生物气味探测装置,在该装置中5只受训合格的小鼠同时探测指定目标气味,正确率可达9
动物所揭示小胶质细胞发育的调控机制
小胶质细胞是脑中固有的免疫细胞,是脑中重要的免疫防线,保护大脑免受病毒细菌的入侵和破坏。小胶质细胞也在大脑的损伤、炎症和神经退行性疾病方面扮演着重要角色。小胶质细胞除了在成年生理病理条件下发挥作用外,还在脑发育的整个阶段都发挥着重要作用。小胶质细胞的这些重要作用与其在胚胎大脑皮层中特定的时空分布
AI加持动物行为识别,成都生物所亮“新招”
小鼠行为分类系统。 中科院成都生物所供图 小鼠、大鼠、猴子等模式动物的行为识别,在医学研究和药物开发中都具有重要意义。通过普通视频技术研究动物对特定刺激的反应,容易受到实验场所的光照条件和拍摄角度的影响。 为解决这一问题,近日,中国科学院成都生物研究所动物行为与仿生项目的科研人员基于受抑全反
中科院动物所《PNAS》发表研究新成果
来自中科院动物研究所的研究人员在斑马鱼中证实Foxn1通过mcm2维持胸腺上皮细胞,支持了T细胞发育。相关论文“Foxn1 maintains thymic epithelial cells to support T-cell development via mcm2 in zebraf
昆明动物所瞳孔检测诊断疾病研究获突破
眼睛是心灵的窗户。中科院昆明动物所认知障碍病理实验室马原野研究员介绍说,早在唐朝,中国的珠宝商就发现,购物者对珠宝的喜爱程度越强,瞳孔就变得越大。珠宝商往往根据购物者瞳孔大小来喊价。在现代,瞳孔大小的变化特征一直是眼科和神经科检查的重要手段,国内外研究发现,瞳孔的动态变化与某些神经精神病关系密切
康乐任中科院动物研究所所长
中国科学院人事教育局日前发出通知,宣布任命康乐为动物研究所所长(任期5年);李志毅为动物研究所副所长(任期服从年龄);魏辅文、周琪、乔格侠为动物研究所副所长(任期5年);免去孟安明的动物研究所所长职务;免去段恩奎的动物研究所副所长职务;免去张德兴的动物研究所副所长职务(保留副局级待遇)。
昆明动物所等揭示澳洲野犬群体起源机制
澳洲野犬(Canis lupus dingo)英文名dingo,分类学上属于犬属,灰狼种,澳洲野犬亚种,是澳大利亚特有的一种野生动物。它也是一种非常有趣的动物,首先,它生活在与外界孤立的澳大利亚,却不是澳洲的原生物种,由于澳洲的特殊地理位置,澳洲野犬只会是人类迁移澳洲携带过去的,因此研究澳洲野犬
昆明动物所金鱼起源研究取得新进展
金鱼是一种珍贵而独特的观赏鱼类,由于其颜色五彩缤纷,体形婀娜优美,深受人们的喜爱。以观赏为目的的长期人工选择,使得金鱼的外部形态(眼、背鳍、尾鳍、体型、鳞片等)同其野生鲫鱼相比存在着显著的变异,这在动植物的变异中是相当罕见的,也引起了研究者的关注。 中国科学院昆明动物研究所分子进化与进化基
昆明动物所揭示非洲家犬复杂的源流历史
近日,《遗传学和基因组学杂志》(Journal of Genetics and Genomics)发表了中国科学院昆明动物研究所张亚平课题组题为A Cryptic Mitochondrial DNA Link between North European and West African Dog
动物所揭示肠道组织稳态调控的重要机制
成体组织的稳态是由成体干细胞及其子代分化细胞来维持的。最好的例子就是成体的胃肠道组织:由于胃肠道组织不断受到食物摩擦、病原菌侵染等外部因素的干扰,造成胃肠道上皮细胞的不断丢失,这些丢失的细胞必需被及时补充以维持胃肠道上皮组织的稳态。成体干细胞的维持和分化必须受到严格的调控。干细胞的过早分化会导致
俄罗斯科学院外宾访问动物所
5月21日,俄罗斯科学院西伯利亚分院贝加尔自然管理研究所Khandazhapova Lubov Mikhailovna 研究员等一行6人到动物所访问。动物所孙江华研究员代表研究所接待了Khandazhapova Lubov Mikhailovna 研究员等一行,动物生态与保护生物学
昆明动物所Nature子刊水稻研究新成果
来自中科院昆明动物研究所、云南省农业科学院等机构的研究人员,在新研究中发现了一个重要的旱稻(upland rice)优良品种标签单核苷酸多态性等位基因(elite variety tag single-nucleotide polymorphism alleles ,ETASs)。相关论
动物所研究揭秘血雉奇特的孵卵行为
鸟类胚胎发育理想的温度范围在36-38℃间,26℃被认为是生理零温度,在26-36℃之间虽不会对胚胎造成损伤,但会减缓胚胎发育的速度。 环境温度对鸟类的孵卵行为有着非常重要的影响,在极地及高海拔山地等寒冷环境中,环境温度远远低于胚胎发育的适宜温度。在这种情况下,孵卵亲鸟往往采取多
“国际学生论坛”外籍青年学生参观微生物所和动物所
9月28日上午,参加2010年“国际学生论坛”的外籍青年学生等二十余人来到中科院微生物研究所参观学习。 学生们听取了微生物所的历史沿革、研究现状、取得的研究成果等基本情况介绍。随后,他们参观了微生物资源前期开发国家重点实验室和工业微生物与生物技术研究室,听取了概况介绍,包括现有课题组,导师情况
昆明动物所人类早期逆境猕猴模型研究取得进展
无论是在啮齿类还是在非人灵长类动物身上,母婴分离常常被用来模拟人类在童年时期经受的不幸打击(早期逆境)。母婴分离能够导致个体应激系统功能紊乱和异常的行为。对于人类,这种负面影响在个体成年之后仍然明显存在,但是对于啮齿类,同样的负性影响在一定条件下能够部分甚至全部被逆转。 为了
昆明动物所关于母婴分离后果研究受到国际关注
近日,英国广播公司新闻(BBC news)详细报道了中国科学院昆明动物研究所胡新天、马原野课题组关于母婴分离后果的研究(http://www.bbc.co.uk/news/science-environment-14562120)。 母婴分离的后果研究对现代社会十分重要。单亲