Cell:单细胞测序绘制骨髓基质细胞全景图谱

最新发布在Cell上的一项研究表明,单细胞测序可以绘制骨髓基质细胞的完整类群,并为白血病研究提供新的视角。这一新研究由美国哈佛大学的David T. Scadden教授和马萨诸塞州综合医院Broad研究所的Aviv Regev团队合作而成。他们创新地使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术对急性髓(细胞)性白血病(AML)小鼠的骨髓基质细胞进行研究。 新研究视角:骨髓基质 AML是一种高度致命的白血病类型,常常发生在骨髓细胞成长周期发生中断时血液中未成熟细胞过度繁殖的情形下。一般情况下,被诊断为AML的成年人5年生存率最多只有30%。 本次研究中便针对这一“绝对致命”的血癌类型进行研究。通过AML小鼠模型研究发现,在病程发展过程中,骨髓基质细胞改变了骨髓微环境,导致骨髓干细胞和血液发育干细胞因子的生长被阻断。 因此,探索骨髓基质细胞映射骨髓微环境或许成为白血病研究提供了新的视角。尽管基质细胞充斥在几乎所有器官中......阅读全文

Cell:单细胞测序绘制骨髓基质细胞全景图谱

  最新发布在Cell上的一项研究表明,单细胞测序可以绘制骨髓基质细胞的完整类群,并为白血病研究提供新的视角。这一新研究由美国哈佛大学的David T. Scadden教授和马萨诸塞州综合医院Broad研究所的Aviv Regev团队合作而成。他们创新地使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术

Cell:利用单细胞测序描绘骨髓间质完整的细胞类群

  2019年5月23日,哈佛大学的研究人员在Cell上发表了题为“A Cellular Taxonomy of the Bone Marrow Stroma in Homeostasis and Leukemia”的文章。研究者们从单细胞角度系统地对骨髓间质细胞进行了详细的分类学研究,揭示了急性髓

Cell:科学家利用单细胞测序描绘骨髓间质完整细胞类群

  哈佛大学的研究人员在Cell上发表了题为“A Cellular Taxonomy of the Bone Marrow Stroma in Homeostasis and Leukemia”的文章。研究者们从单细胞角度系统地对骨髓间质细胞进行了详细的分类学研究,揭示了急性髓系白血病对间质细胞群体

单细胞测序技术(single-cell-sequencing)-综述(一)

单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向。在这一领域中,最前沿的则是单细胞测序技术。传统测序方法一次处理成千上万个细胞,得到的变异水平也是成千上万个细胞的平均后水平。但是,就如同世界上没有完全相同的两片树叶一样,没有两个细胞是完全相同的。所以,单细胞测序对于研究单个细胞就显得至关重要。单细胞测序可以

单细胞测序技术(single-cell-sequencing)-综述(二)

DroNC-seq10月,Broad研究所张锋教授团队在Nature Methods上发表题为“Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq with DroNc-Seq (doi: 10.1038/nmeth.4407)” 的文章,提出了一个新的测

《Cell-Stem-Cell》巧用单细胞测序解析生发过程的调控机制

单细胞转录组测序是这两年来非常流行的高通量组学研究工具,然而,是不是所有的研究都适合用该方法?是不是所有的问题都可以通过该方法来解释?这是一个值得探讨的问题。从现有的研究报道来说,单细胞转录组学研究很好地解决了细胞图谱,发育过程等重要的生物学问题。但是在相对比较传统的研究方向,是否也能利用单细胞转录

Cell:单细胞测序深度解析三阴乳腺癌

  美国MD安德森癌症中心联合瑞典卡罗林斯卡学院的研究人员利用单细胞测序对三阴乳腺癌展开分析,表明耐药性是来源于现有的带有基因突变的克隆。这些结果于周四发表在《Cell》杂志上,将对这种癌症的诊断、预后和治疗具有临床意义。  三阴乳腺癌是指雌激素受体、孕激素受体和原癌基因Her-2均为阴性的乳腺癌。

Cell-Stem-Cell巧用单细胞测序解析生发过程深层次调控机制

  单细胞转录组测序是这两年来非常流行的高通量组学研究工具,然而,是不是所有的研究都适合用该方法?是不是所有的问题都可以通过该方法来解释?这是一个值得探讨的问题。从现有的研究报道来说,单细胞转录组学研究很好地解决了细胞图谱,发育过程等重要的生物学问题。但是在相对比较传统的研究方向,是否也能利用单细胞

Cell-Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

Cell-Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

单细胞测序需要准备什么再去测序

DNA测序的测序原理: DNA测序是指分析特定DNA片段的碱基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。

Nature:单细胞测序(下)

  随着技术的飞速发展,成本大大降低,使得基因组测序成为常规技术。然而,大多数的人类基因组、癌症或其他仍然是通过从多个细胞中抽提DNA来进行测序,它所忽略的细胞间的差异对于控制基因表达、细胞行为和药物反应却有可能是至关重要的。   该研究小组也观测了其他类型的乳腺癌。将肿瘤作为一个整体测序,研究小

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。

单细胞测序方法汇总

单细胞生物学研究一直是当今的热门话题,而且-前沿的领域就是单细胞RNA测序了(scRNA-seq)。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序,并给出平均差异,但并没有两个细胞是完全一样的,而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变,甚至这种技术还能够阐明完整

Nature:单细胞测序(上)

  Nicholas Navin所需要的就只是一个细胞――问题是如何得到它。这是在2010年,冷泉港实验室的博士后研究员正在探究驱动乳腺癌的遗传改变。此前的大部分癌症基因组研究都是碾碎少量的肿瘤组织,一并将这些DNA进行测序,生成的是一张癌症基因组的一致图像。但Navin想要解析来自单个细胞的序

Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序

2018年11月,Namocell与CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞,并且将其进行单细胞测序,为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序(scRNA-s

单细胞测序和转录组测序的区别

单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。

单细胞测序和转录组测序的区别

单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。

单细胞测序和转录组测序的区别

单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。

单细胞测序和转录组测序的区别

单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。

Cell:机械敏感性基质影响

  细胞能感知周围细胞微环境,并对此做出反应,这些微环境十分重要,会影响细胞的形态、蛋白质水平和定位、基因表达,乃至核完整性。组织微韧性(micro-stiffness)在很大程度上受到细胞外基质的影响,但有机体内基质变化很大,因此也许可以作为分析和组织许多细胞类型和分子进程的一个有用参数,比如用于

骨髓基质肌样细胞的纯化方法介绍

在血液细胞和骨髓细胞静置培养时,常有许多肌样细胞和骨髓基质细胞贴壁生长,但也有许多淋巴细胞、单核细胞、粒细胞粘附其上,种类混杂,鉴于粘附细胞贴壁不牢固,也可用酶消化法使粘附细胞脱壁分离,以达到骨髓基质细胞或血液中肌样细胞与淋巴细胞分开和纯化的目的。其方法如下:①待基质或肌样细胞基本形成单层时,倒去旧

靶向深度测序和单细胞基因测序的区别

1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序

靶向深度测序和单细胞基因测序的区别

1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序

西安交大李磊Cell-Res用单细胞外显子组测序研究肾细胞癌

  生物通报道:肾细胞癌(RCC)占成人恶性肿瘤的3%,和肾肿瘤的90%~95%。转移性疾病通常会对放疗和化疗产生耐药性。免疫治疗表现出15%至20%的有限反应率。肿瘤干细胞(CSCs)是肾癌发生、发展以及耐药性的关键参与因子。以前的研究已经表明,RCC是一种遗传学明显不同的成人癌症,具有相对较低的

Fluidigm推出单细胞TCR测序产品

  解析细胞表型是免疫学中一个共同的单细胞分析目标。然而,T细胞受体V(D)J基因区域的随机重排带来了T细胞群体的复杂变化。这形成了庞大的T细胞部队,以便识别特定的外源蛋白,引发有效的免疫反应。  为了在单细胞水平实现深度的T细胞分析,Fluidigm近日在C1™系统上推出了一个全新的免疫学应用 –

!单细胞测序的”CPU-2.0”时代

  对单个人类细胞的基因组进行准确的变异检测和大范围单倍体型分析一直以来都是测序领域的巅峰挑战。单细胞测序使我们能在更高的分辨率下研究生命的机制。一方面,在像癌症这样的组织样本中存在大量具有不同基因组类型的单个细胞,因此需要分析单细胞水平基因组而不是大量细胞的平均值;另一方面,对于非常珍贵的细胞样品