Cell：单细胞测序绘制骨髓基质细胞全景图谱
最新发布在Cell上的一项研究表明，单细胞测序可以绘制骨髓基质细胞的完整类群，并为白血病研究提供新的视角。这一新研究由美国哈佛大学的David T. Scadden教授和马萨诸塞州综合医院Broad研究所的Aviv Regev团队合作而成。他们创新地使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术对急性髓（细胞）性白血病（AML）小鼠的骨髓基质细胞进行研究。 新研究视角：骨髓基质 AML是一种高度致命的白血病类型，常常发生在骨髓细胞成长周期发生中断时血液中未成熟细胞过度繁殖的情形下。一般情况下，被诊断为AML的成年人5年生存率最多只有30％。 本次研究中便针对这一“绝对致命”的血癌类型进行研究。通过AML小鼠模型研究发现，在病程发展过程中，骨髓基质细胞改变了骨髓微环境，导致骨髓干细胞和血液发育干细胞因子的生长被阻断。 因此，探索骨髓基质细胞映射骨髓微环境或许成为白血病研究提供了新的视角。尽管基质细胞充斥在几乎所有器官中......阅读全文
Cell：单细胞测序绘制骨髓基质细胞全景图谱
最新发布在Cell上的一项研究表明，单细胞测序可以绘制骨髓基质细胞的完整类群，并为白血病研究提供新的视角。这一新研究由美国哈佛大学的David T. Scadden教授和马萨诸塞州综合医院Broad研究所的Aviv Regev团队合作而成。他们创新地使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术
Cell：利用单细胞测序描绘骨髓间质完整的细胞类群
2019年5月23日，哈佛大学的研究人员在Cell上发表了题为“A Cellular Taxonomy of the Bone Marrow Stroma in Homeostasis and Leukemia”的文章。研究者们从单细胞角度系统地对骨髓间质细胞进行了详细的分类学研究，揭示了急性髓
Cell：科学家利用单细胞测序描绘骨髓间质完整细胞类群
哈佛大学的研究人员在Cell上发表了题为“A Cellular Taxonomy of the Bone Marrow Stroma in Homeostasis and Leukemia”的文章。研究者们从单细胞角度系统地对骨髓间质细胞进行了详细的分类学研究，揭示了急性髓系白血病对间质细胞群体
单细胞测序技术(single－cell－sequencing)－综述（一）
单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向。在这一领域中，最前沿的则是单细胞测序技术。传统测序方法一次处理成千上万个细胞，得到的变异水平也是成千上万个细胞的平均后水平。但是，就如同世界上没有完全相同的两片树叶一样，没有两个细胞是完全相同的。所以，单细胞测序对于研究单个细胞就显得至关重要。单细胞测序可以
单细胞测序技术(single－cell－sequencing)－综述（二）
DroNC-seq10月，Broad研究所张锋教授团队在Nature Methods上发表题为“Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq with DroNc-Seq (doi: 10.1038/nmeth.4407)” 的文章，提出了一个新的测
Cell：单细胞测序深度解析三阴乳腺癌
美国MD安德森癌症中心联合瑞典卡罗林斯卡学院的研究人员利用单细胞测序对三阴乳腺癌展开分析，表明耐药性是来源于现有的带有基因突变的克隆。这些结果于周四发表在《Cell》杂志上，将对这种癌症的诊断、预后和治疗具有临床意义。 三阴乳腺癌是指雌激素受体、孕激素受体和原癌基因Her-2均为阴性的乳腺癌。
Cell－Stem－Cell巧用单细胞测序解析生发过程深层次调控机制
单细胞转录组测序是这两年来非常流行的高通量组学研究工具，然而，是不是所有的研究都适合用该方法？是不是所有的问题都可以通过该方法来解释？这是一个值得探讨的问题。从现有的研究报道来说，单细胞转录组学研究很好地解决了细胞图谱，发育过程等重要的生物学问题。但是在相对比较传统的研究方向，是否也能利用单细胞
Cell－Res重点论文：单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
Cell－Res重点论文：单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
单细胞测序基准数据集－Immune－Cell－Atlas－有哪些应用场景？
单细胞测序基准数据集 Immune Cell Atlas 具有以下应用场景： 1. 新算法和分析工具的评估与验证：研究人员开发新的单细胞数据分析算法或工具时，可以使用该数据集来检验其性能和准确性，并与现有的方法进行比较。 2. 免疫细胞类型和状态的精准鉴定：帮助优化细胞类型和状态的分类算法，提高
单细胞测序需要准备什么再去测序
DNA测序的测序原理： DNA测序是指分析特定DNA片段的碱基序列，也就是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）与鸟嘌呤的（G）排列方式。快速的DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。
单细胞测序方法汇总
单细胞生物学研究一直是当今的热门话题，而且-前沿的领域就是单细胞RNA测序了（scRNA-seq）。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序，并给出平均差异，但并没有两个细胞是完全一样的，而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变，甚至这种技术还能够阐明完整
什么是单细胞测序？
单细胞测序是一种能够在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观遗传组等进行分析的技术。通过单细胞测序，可以：揭示细胞的异质性：了解即使是看似相同的细胞群体中，每个细胞在基因表达、染色质可及性等方面的独特特征。发现新的细胞类型和状态：识别出传统方法难以区分的稀有细胞类型以及细胞在不同生理或病理条件下的特殊
Nature：单细胞测序（上）
Nicholas Navin所需要的就只是一个细胞――问题是如何得到它。这是在2010年，冷泉港实验室的博士后研究员正在探究驱动乳腺癌的遗传改变。此前的大部分癌症基因组研究都是碾碎少量的肿瘤组织，一并将这些DNA进行测序，生成的是一张癌症基因组的一致图像。但Navin想要解析来自单个细胞的序
如何－解读－单细胞－测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位，研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
如何－解读－单细胞－测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位，研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
单细胞测序方法介绍
单细胞RNA测序（scRNA-seq）作为一种全基因组测序的方式，在单细胞层面广泛用于确定细胞类型和细胞变异的鉴定。Namocell单细胞分离仪可以通过细胞标记CD27以及一种细胞活性的染料，来分选出单个活的B细胞。通过分析分离后的单细胞基因表达情况，对比静息记忆B细胞，可以从单细胞层面研究基因表达
Nature：单细胞测序（下）
随着技术的飞速发展，成本大大降低，使得基因组测序成为常规技术。然而，大多数的人类基因组、癌症或其他仍然是通过从多个细胞中抽提DNA来进行测序，它所忽略的细胞间的差异对于控制基因表达、细胞行为和药物反应却有可能是至关重要的。 该研究小组也观测了其他类型的乳腺癌。将肿瘤作为一个整体测序，研究小
如何－解读－单细胞－测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位，研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
如何－解读－单细胞－测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。
Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序
2018年11月，Namocell与CZ-Biohub（Chan Zuckerburg Biohub）合作，在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞，并且将其进行单细胞测序，为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序（scRNA-s
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术的差异
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术主要在以下方面存在区别：空间信息获取普通单细胞测序技术：通常不提供细胞在原始组织中的空间位置信息。时空分辨单细胞测序技术：能够同时获取细胞的基因表达等信息以及它们在组织内的空间位置。细胞间相互作用分析普通单细胞测序技术：难以直接推断细胞间基于空间位置的相互作
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术的区别
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术主要有以下区别：空间信息获取传统单细胞测序：通常无法获取细胞在组织中的空间位置信息，只是对分离出的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序：能够在测定单细胞基因表达等信息的同时，明确细胞在原始组织中的具体空间位置。细胞互作研究传统单细胞测序：难以直观地揭示基于
单细胞测序技术在－Immune－Cell－Atlas－数据集中的作用是什么？
单细胞测序技术在 Immune Cell Atlas 数据集中起到了关键作用，包括以下几个方面： 1. 揭示细胞异质性：能够检测到单个免疫细胞之间基因表达的细微差异，从而发现不同的免疫细胞亚型和细胞状态，这对于全面了解免疫系统的复杂性至关重要。 2. 精准定义细胞类型：通过分析单个细胞的基因表达
单细胞测序基准数据集－Immune－Cell－Atlas－包含了多少种细胞类型？
Immune Cell Atlas 涵盖了非常广泛的免疫细胞类型，包括但不限于数十种常见和罕见的类型。具体的数量可能会随着研究的推进和新数据的纳入而有所变化。常见的免疫细胞类型如 T 细胞、B 细胞、NK 细胞、巨噬细胞、树突状细胞等都包含在内，并且对这些细胞的不同亚型和活化状态也有详细的表征。
Cell－Ranger－开源代码在分析单细胞测序数据时有哪些优点？
Cell Ranger 开源代码在分析单细胞测序数据时具有以下优点：针对性和兼容性好专为 10x Genomics 平台生成的数据设计，能很好地兼容和处理该平台产生的各种单细胞测序数据，确保数据处理的准确性和可靠性。高效的数据分析流程提供了从原始数据的预处理、基因定量到细胞聚类和差异表达分析的一站式
开源代码－Cell－Ranger－可以处理哪些类型的单细胞测序数据？
Cell Ranger 主要用于处理由 10x Genomics 平台生成的单细胞测序数据，包括以下几种常见类型：单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）数据单细胞免疫组库（scVDJ-seq）测序数据单细胞 ATAC 测序（scATAC-seq）数据（在较新的版本中支持）它为这些数据提供了从原始
单细胞测序基准数据集－Immune－Cell－Atlas－涵盖了哪些免疫细胞类型？
Immune Cell Atlas（免疫细胞图谱）涵盖了多种免疫细胞类型，包括但不限于以下常见类型： 1. T 细胞：如 CD4+ T 细胞（辅助性 T 细胞）、CD8+ T 细胞（细胞毒性 T 细胞）、调节性 T 细胞等。 2. B 细胞：包括初始 B 细胞、记忆 B 细胞、浆细胞等。 3. 自
Cell：机械敏感性基质影响
细胞能感知周围细胞微环境，并对此做出反应，这些微环境十分重要，会影响细胞的形态、蛋白质水平和定位、基因表达，乃至核完整性。组织微韧性（micro-stiffness）在很大程度上受到细胞外基质的影响，但有机体内基质变化很大，因此也许可以作为分析和组织许多细胞类型和分子进程的一个有用参数，比如用于
骨髓基质肌样细胞的纯化方法介绍
在血液细胞和骨髓细胞静置培养时，常有许多肌样细胞和骨髓基质细胞贴壁生长，但也有许多淋巴细胞、单核细胞、粒细胞粘附其上，种类混杂，鉴于粘附细胞贴壁不牢固，也可用酶消化法使粘附细胞脱壁分离，以达到骨髓基质细胞或血液中肌样细胞与淋巴细胞分开和纯化的目的。其方法如下：①待基质或肌样细胞基本形成单层时，倒去旧