CellStemCell巧用单细胞测序解析生发过程深层次调控机制
单细胞转录组测序是这两年来非常流行的高通量组学研究工具，然而，是不是所有的研究都适合用该方法？是不是所有的问题都可以通过该方法来解释？这是一个值得探讨的问题。从现有的研究报道来说，单细胞转录组学研究很好地解决了细胞图谱，发育过程等重要的生物学问题。但是在相对比较传统的研究方向，是否也能利用单细胞转录组测序方法来使研究更加深入和出色？ 本期小编通过对近期发表在《Cell Stem Cell》上的文献的重点内容解析，来领略下生发机制研究中，单细胞转录组学的巧妙运用，如何为解释内在的生发关键时期的调控通路提供了直接证据。 研究背景 哺乳动物毛发生命周期是由毛囊（HF）经历了由生长期（anagen）,退化期（catagen）和休止期（telogen）为代表的三个重要精细调控阶段。来自毛囊干细胞（HFSCs）的角质细胞接受到如Wnt或者Shh等通路的激活信号后，会在生长期促进细胞增殖；在休止期接受到如BMPs等抑制信......阅读全文
Cell－Stem－Cell巧用单细胞测序解析生发过程深层次调控机制
单细胞转录组测序是这两年来非常流行的高通量组学研究工具，然而，是不是所有的研究都适合用该方法？是不是所有的问题都可以通过该方法来解释？这是一个值得探讨的问题。从现有的研究报道来说，单细胞转录组学研究很好地解决了细胞图谱，发育过程等重要的生物学问题。但是在相对比较传统的研究方向，是否也能利用单细胞
巧用单细胞测序解析生发过程的深层次调控机制（二）
图2 单细胞测序结果tSNE细胞分类结果为进行更加精细的分类，研究人员对由巨噬细胞marker表达的细胞进行了重新分类，共产生7个新的分类亚群。这些巨噬细胞簇显示出相对均一的CD68表达，但相对于经典炎症和抗炎标记物是异质的。其中，Cluster 3主要表达抗炎症marker Mrc2(CD20
巧用单细胞测序解析生发过程的深层次调控机制（一）
单细胞转录组测序是这两年来非常流行的高通量组学研究工具，然而，是不是所有的研究都适合用该方法？是不是所有的问题都可以通过该方法来解释？这是一个值得探讨的问题。从现有的研究报道来说，单细胞转录组学研究很好地解决了细胞图谱，发育过程等重要的生物学问题。但是在相对比较传统的研究方向，是否也能利用单细胞转录
Cell－Stem－Cell综述：干细胞免疫调控
免疫系统是我们机体对抗入侵病原体的第一道防线，也是组织发展，内环境稳态和伤口修复不可或缺的一部分。近年来，科学家们已越来越认识到免疫系统中的细胞和体液成分也有助于损坏组织的再生，比如四肢、骨骼肌肉、心脏和中枢神经系统中出现的损伤，因此在这一方面进行了大量的研究。 7月Cell Stem Ce
Cell－Stem－Cell
|泛素连接酶HECTD1通过协调核糖体大小亚基的组装来调控造血干细胞的再生能力 造血干细胞（Hematopoietic stem cell， HSC）具有自我更新和分化的功能。在正常生理状态下，HSC处于休眠状态，其蛋白合成速度受到严格地调控并维持在较低水平。当机体受到损伤时，HSC 能够迅速
Cell－Stem－Cell：揭示细胞炎症记忆机制
当组织经历炎症时，它的细胞会记得。在炎症的高峰期，细胞将蛋白质固定在其遗传物质上，并将它们在最后斗争中所处的位置记下来。下次接触时，炎症记忆就会启动。这些细胞利用以前的经验来更有效地做出反应，即使是对它们以前从未遇到过的威胁也是如此。如果皮肤以前接触过刺激物，如毒素或病原体，它就会更快地愈合伤口
Cell－Stem－Cell:－帕金森发病机制新见解
在帕金森等神经退行性疾病中，特定的神经元的死亡会导致患者出现运动问题和其他症状。长期以来，科学家们致力于发现这些神经元死亡的原因。 最近，来自洛克菲勒大学的研究人员发现，帕金森氏病中受影响的神经元实际上会处于“关闭”而非“完全死亡”的状态。研究小组发现，这些不死的神经元释放出的化学物质也会使他
Cell解析蛋白质翻译调控机制
一个细胞的内部运作涉及到不计其数的单个分子，它们参与到重复循环的相互作用之中来维持生命。蛋白质形成就是这种生命活动的基础。 宾夕法尼亚大学的Joshua B. Plotkin教授说，由于蛋白质是细胞功能的基础构件，科学家们一直以来对于细胞生成蛋白质的机制都极其地感兴趣。 “蛋白质
《Cell－Stem－Cell》发现食管癌新机制
化生（Metaplasia ）被定义为一种完全分化的细胞类型被另一种细胞类型取代。有几个典型的化生例子，其中最常见的是巴氏食管。巴氏食管的特点是慢性胃酸反流时食管下部的角化细胞被柱状细胞取代。这个化生被认为是癌前病变，增加了大约50倍的风险食管腺癌。然而，参与食道化生发展的机制仍部分未知。 在
Cell：单细胞测序深度解析三阴乳腺癌
美国MD安德森癌症中心联合瑞典卡罗林斯卡学院的研究人员利用单细胞测序对三阴乳腺癌展开分析，表明耐药性是来源于现有的带有基因突变的克隆。这些结果于周四发表在《Cell》杂志上，将对这种癌症的诊断、预后和治疗具有临床意义。 三阴乳腺癌是指雌激素受体、孕激素受体和原癌基因Her-2均为阴性的乳腺癌。
Cell－Stem－Cell－|－连续取得进展！
下丘脑含有惊人的异质性神经元，可调节内分泌，自主神经和行为功能。然而，其分子发育轨迹和神经元多样性的起源仍不清楚。2021年4月21日，中国科学院遗传与发育生物学研究所吴青峰团队在Cell Stem 在线发表题为“Cascade diversification directs generati
中科院Cell－Res解析Hippo信号调控机制
来自中科院上海生命科学研究院的研究人员发现了转录因子Scalloped(Sd)的一个新型结合蛋白，证实它通过对抗Scalloped-Yorkie活性调控了Hippo信号，这一研究发现发表在9月3日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 上海生命科学研究院的张雷(Lei Z
杰出女科学家再发Cell解析调控机制
来自美国麻省大学医学院，英国牛津大学等处的研究人员发现DEAD-box家族蛋白中两个成员：UAP56和Vasa在piRNA生成和功能行使过程中扮演了重要角色，并指出了一种新型核周转录沉默机制。相关成果公布在Cell杂志上。 文章的通讯作者分别是麻省大学医学院生物信息学和整合生物学部的翁志萍
Cell－Stem－Cell：揭示造血干细胞休眠新机制
溶酶体是所有细胞中的有膜细胞器。溶酶体曾经被认为只是干细胞的“垃圾桶”，回收废弃物，调节细胞再生，并在所有细胞类型中发挥同样的功能。 在一项新的研究中，来自加拿大玛嘉烈公主癌症中心和多伦多大学的研究人员对休眠的造血干细胞如何被激活有了更广泛的了解，这可能为开发针对一些癌症的治疗方法铺平道路。他
stem－cell－culture－protocol
实验概要stem cell culture protocol主要试剂cell culture supplies and reagentssEnvironment: cell culture requires a sterile environment, so it needs a separat
Cell－Stem－Cell揭示新癌症干细胞
日前，Lawson健康研究所的研究人员在结肠中鉴定到了与癌症生长有关的新干细胞群体。这项研究发表在Cell Stem Cell杂志上，将给结肠癌研究和治疗带来显著改变。 结肠癌（colon cancer）是一种常见的消化系统恶性肿瘤，发病率占胃肠道恶性肿瘤的第三位。随着饮食习惯的改变和人口老龄
Cell－stem－cell：纯化人类细胞新技术
多能干细胞研究之所以流行是因为在生物医学研究中，多能干细胞能够分化为任意细胞类型。但一些代表性的分化方法会导致异质性细胞群体的出现，这时候就需要将目的细胞进行纯化分离。 目前对这类细胞进行分离主要根据细胞表面的特征性受体不同，利用抗体进行分离筛选。但在一些情况下，这种分离方法的纯化水平很低，并
Cell－Stem－Cell发表重编程重要成果
再生医学旨在通过细胞移植替换人体内受损的细胞、组织和器官，是一个发展迅速的新兴领域。胚胎干细胞（ESC）能够形成胎儿体内所有类型的细胞、组织和器官，被视为细胞治疗的宝贵资源。然而ESC在实际应用中遭遇了两大瓶颈，免疫排斥和伦理问题。 细胞重编程可以绕过人类胚胎干细胞的伦理争议，近年来受到了广泛
Cell－Stem－Cell：皮肤是突变的战场？
正常皮肤含有混杂的突变细胞，但很少有最终形成癌症的，科学家现在发现了原因。剑桥大学桑格研究所和MRC癌症研究所的研究员通过基因工程小鼠，发现皮肤组织中的突变细胞会相互竞争，只有适者才能生存。 9月27日发表在Cell Stem Cell杂志上的研究结果显示，人类正常皮肤对癌症的抵抗力比之前想象
Cell－Stem－Cell：叩开干细胞的家门
人类造血干细胞（HSC）可以通过造血过程生成成熟的血细胞，包括免疫系统的细胞。多年以来，科学家们一直在尝试解析调控造血干细胞功能和分化的具体机制。但这项工作并不简单，因为HSC只存在于骨髓的特殊区域（niche），体外培养很难重现这样的环境。 要对人类造血干细胞进行深入分析，就需要一个能够移植
Cell揭示节律活动调控机制
宾夕法尼亚大学Perelman医学院神经科学教授Amita Sehgal博士，在《细胞》(Cell)杂志上的一篇论文中描述了控制果蝇日常节律性作息行为的一个大脑回路。新研究还发现，人类大脑蛋白CRF的果蝇版本是这一回路中的一个重要协调分子。 果蝇中的CRF叫做DH44为休息/活动周期循
Cell揭示重要发育调控机制
鲁汶大学VIB研究所的Bassem Hassan研究小组发现了从前未知的一种机制，这一机制在物种间高度保守，通过精确地时间控制对大脑发育至关重要的一个蛋白质家族：proneural蛋白的活性调控了神经发生。这一机制——一种简单的可逆的化学修饰对于生成充足数量的神经元、它们的分化及中枢神经系统的发
Cell解析细胞垃圾清除机制
包括阿尔茨海默氏症、亨廷顿氏病和衰老在内的几种人类神经退行性疾病，都与细胞中异常及聚集蛋白质的累积有关联。细胞通过将它们清扫到称作为溶酶体（lysosome）的细胞垃圾回收站中，来清除这类细胞“垃圾”。 现在，来自马克斯普朗克生物化学研究所的科学家们发现了一个新的辅助蛋白家族，证实这些蛋白质能
单细胞测序技术(single－cell－sequencing)－综述（一）
单细胞生物学最近几年是非常热门的研究方向。在这一领域中，最前沿的则是单细胞测序技术。传统测序方法一次处理成千上万个细胞，得到的变异水平也是成千上万个细胞的平均后水平。但是，就如同世界上没有完全相同的两片树叶一样，没有两个细胞是完全相同的。所以，单细胞测序对于研究单个细胞就显得至关重要。单细胞测序可以
单细胞测序技术(single－cell－sequencing)－综述（二）
DroNC-seq10月，Broad研究所张锋教授团队在Nature Methods上发表题为“Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq with DroNc-Seq (doi: 10.1038/nmeth.4407)” 的文章，提出了一个新的测
Stem－Cell－Rep：神经管发育缺陷机制探秘
4月20日，Cell子刊《Stem Cell Reports》在线发表了同济大学生命科学与技术学院康九红课题组和同济大学医学院章小清课题组合作的题为“Dysregulation of the SIRT1/OCT6 axis contributes to environmental stress-
《Cell》重磅！全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制
2月7日，加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序，结合后续的功能机制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制！该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci
Cell》重磅！全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制！
2月7日，加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序，结合后续的功能机制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制！该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci
Cell揭示免疫调控新机制
免疫系统时常保持着警惕，以保护机体抵御来自外部的威胁——其中包括我们吃喝下的东西。当消化食物通过肠道时会呈现出一种小心的平衡状态。免疫细胞必须保持警觉以防御沙门氏菌一类的有害病原体，同时也必须适当控制它们的活性，因为过度反应可导致过分的炎症和永久性的组织损伤。 由洛克菲勒大学粘液免疫学实验室主
Cell揭示miRNA调控新机制
来自波士顿大学儿童医院及哈佛医学院的研究人员发现，微处理器上游的一个生物合成步骤控制了miR-17∼92表达。这一重要的研究发现发布在8月6日的《细胞》（Cell）杂志上。 MicroRNAs (miRNAs)是一个调控RNA大家族，其主要通过与靶mRNA 3′端非翻译区(3′ UTR)互补配