拟南芥基因组加倍导致的三维染色质结构及基因表达调控
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物分子遗传国家重点实验室方玉达研究组题为The effects of Arabidopsis genome duplication on the chromatin organization and transcriptional regulation 的研究论文。该论文利用染色质构象捕获等技术解析了拟南芥基因组加倍所导致的基因三维空间变化及对基因转录调控的影响。 植物多倍化是自然界中非常普遍的现象，是推进植物进化、适应环境的主要方式之一。多倍体的形成增加了基因表达调控的复杂程度，目前很多研究证明基因组的三维结构对基因组的转录调控起到很重要的作用。为了解析多倍化过程中三维基因组结构变化及多倍体基因组表达调控的影响，方玉达研究组利用染色体构象捕获技术（Hi-C）绘制了拟南芥同源四倍体的......阅读全文
研究揭示拟南芥基因组加倍导致的三维染色质结构
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物分子遗传国家重点实验室方玉达研究组题为The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
拟南芥基因组加倍导致的三维染色质结构及基因表达调控
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物分子遗传国家重点实验室方玉达研究组题为The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
拟南芥基因组DNA的提取
实验概要本实验介绍了用CTAB法提取拟南芥基因组DNA。主要试剂CTAB提取液(2%CTAB，50mMEDTA，50mM Tris-HCl，PH 8.0，0.84M NaCI，0.05%巯基乙醇)，氯仿，无水酒精，70%的酒精主要设备1.5 mL离心管，65℃水浴锅，高速离心机，研钵实验材料拟南芥叶
染色质的结构要点
1、每个核小体单位包括 200 bp左右的DNA超螺旋和一个组蛋白八聚体以及一个分子的组蛋白H1。2、组蛋白八聚体构成核小体的盘状核心颗粒，相对分子质量100 000，由4个异二聚体组成，包括两个H2A-H2B和两个H3-H4。3、146 bp的DNA分子超螺旋盘旋组蛋白八聚体1.75圈。组蛋白H1
染色质DNA基因组的介绍
凡是具有细胞形态的生物其遗传物质都是DNA,只有少数病毒的遗传物质是RNA。在真核细胞中,每条未复制的染色体包含一条纵向贯穿的DNA分子。狭义而言,某一生物的细胞中储存于单倍染色体组中的总遗传信息,组成该生物的基因组。真核生物基因组DNA的含量比原核生物高得多。 突变分析结果表明,并非所有基因
异染色质和常染色质的结构差异
染色质可以分为两种类群，异染色质和常染色质。最开始，这两种形式是通过其在染色之后的颜色深浅区分的，常染色质一般着色较浅，而异染色质着色很深，表明其紧密聚集。异染色质通常集中在细胞核的边缘区域。然而，不同于这种早期的二分法，最近的研究表明在动物和植物体内都拥有不止这两种染色体结构，可能会有四到五种，区
重要作物染色质三维构象新特征成功解析
山东农业大学李平华课题组和香港中文大学钟思林课题组的合作研究团队，日前在重要作物大基因组染色质研究领域获得重大突破。近日，国际学术期刊《分子植物》发表了该项研究成果论文。 该团队利用最新的高通量染色体构象捕获技术，通过对玉米、番茄、高粱、水稻和小米等主要作物的染色质空间结构进行研究，成功揭示了
Nature－Plants文章：精准高通量检测Rloop分布的新方法
来自清华大学生科院，清华-北大生命科学联合中心的研究人员发表了题为“The R-loop is a common chromatin feature of the Arabidopsis genome”的文章，首次报道了精准、高效、高通量检测R-loop的方法，并利用此方法首次揭示模式植物拟南芥
常染色质的结构特点
常染色质的结构类似于未折叠的一串珠子中间被一根细绳穿过，这其中的珠子代表核小体结构。每个核小体由八个蛋白质单体组成，这些蛋白质叫做组蛋白，每个组蛋白单体周围有147个碱基对长度的双链DNA环绕；在常染色质中，DNA在组蛋白上的包裹是较为松散的，从而其上的原始DNA序列是暴露在外可被读取的。每一个处于
常染色质的结构简介
常染色质的结构类似于未折叠的一串珠子中间被一根细绳穿过，这其中的珠子代表核小体结构。每个核小体由八个蛋白质单体组成，这些蛋白质叫做组蛋白，每个组蛋白单体周围有147个碱基对长度的双链DNA环绕；在常染色质中，DNA在组蛋白上的包裹是较为松散的，从而其上的原始DNA序列是暴露在外可被读取的。每一个
常染色质的结构介绍
常染色质的结构类似于未折叠的一串珠子中间被一根细绳穿过，这其中的珠子代表核小体结构。每个核小体由八个蛋白质单体组成，这些蛋白质叫做组蛋白，每个组蛋白单体周围有147个碱基对长度的双链DNA环绕；在常染色质中，DNA在组蛋白上的包裹是较为松散的，从而其上的原始DNA序列是暴露在外可被读取的。每一个处于
三维染色质结构与基因组功能及进化的关系获揭示
辣椒是世界上种植最广泛的蔬菜之一，也是重要的调味料作物。近日，华南农业大学园艺学院辣椒课题组研究揭示了辣椒三维染色质结构与基因组功能及进化的关系。相关研究发表于Nature Communications。 我国辣椒生产和消费量居全球之首，种植面积超过3000万亩，产量4000多万吨，年逾700
研究发现去甲基化酶REF6是基因组中靶向的重要因素
核小体是真核生物染色质的基本单位，由DNA缠绕组蛋白八聚体构成。组蛋白翻译后共价修饰是表观遗传调控的重要方式之一，通过影响染色质的状态而调控基因表达等过程。组蛋白H3第27位赖氨酸的三甲基化修饰(H3K27me3)通过维持基因的沉默状态，在动植物细胞命运决定以及生长发育中发挥重要的调控作用。基因
Polycomb组蛋白与染色质相互作用的关键机制
2021年6月，Genome Research杂志在线发表了法国巴黎萨克雷大学植物科学研究所Moussa Benhamed教授为通讯作者题为“Polycomb-dependent differential chromatin compartmentalization determines gen
染色质修饰如何调控基因表达？－中国学者提出新见解
中科院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物逆境生物学研究中心的研究人员最新发表两篇Nature Genetics文章，利用生化、分子、遗传、组学及结构生物学等研究方法，分别揭示了植物特有染色质凝缩蛋白EMF1与含BAH结构域的SHL和EBS形成BAH-EMF1复合体而介导植物基因沉默
生命科学：染色质修饰沉默植物基因表达领域获重要突破
在国家自然科学基金(项目编号：31721001)等资助下，中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心何跃辉课题组在染色质修饰沉默植物基因表达领域获重要突破，发现了植物特有的染色质凝缩蛋白EMF1与含BAH结构域的蛋白形成BAH-EMF1蛋白复合体，以介导高等植物基因沉默的分子机制。研究成
染色质的基本结构单位介绍
20世纪70年代以前，人们关于染色质结构的传统看法认为，染色质是组蛋白包裹在DNA外面形成的纤维状结构。直到1974年Kornberg等人根据染色质的酶切和电镜观察，发现核小体是染色质组装的基本结构单位，提出染色质结构的“串珠”模型，从而更新了人们关于染色质结构的传统观念
染色质的结构组成及功能
染色质是指间期细胞核内由DNA、组蛋白、非组蛋白及少量RNA 组成的线性复合结构，是间期细胞遗传物质存在的形式。染色体是指细胞在有丝分裂或减数分裂过程中，由染色质聚缩而成的棒状结构。实际上，两者化学组成没差异，而包装程度即构型不同，是遗传物质在细胞周期不同阶段的不同表现形式。在真核细胞的细胞周期中，
关于染色质的结构要点介绍
1、每个核小体单位包括 200 bp左右的DNA超螺旋和一个组蛋白八聚体以及一个分子的组蛋白H1。 2、组蛋白八聚体构成核小体的盘状核心颗粒,相对分子质量100 000,由4个异二聚体组成,包括两个H2A-H2B和两个H3-H4。 3、146 bp的DNA分子超螺旋盘旋组蛋白八聚体1.75圈
常染色质的结构和特点
常染色质是染色质（由DNA、RNA和蛋白质组成）的一种松散聚集的形式，这种聚集方式在基因中大量存在，并且相应的片段通常处于活跃的转录当中（但并非必要，即常染色质部分不一定都是高表达的序列）。常染色质构成了细胞核基因组中表达最活跃的一部分。人类基因组中92%为常染色质。
染色质的结构成分介绍
通过分离胸腺、肝或其他组织细胞的核，用去垢剂处理后再离心收集染色质进行生化分析，确定染色质的主要成分是DNA和组蛋白，还有非组蛋白及少量RNA。大鼠肝细胞染色质常被当作染色质成分分析模型，其中组蛋白与DNA含量之比近于1:1，非组蛋白与DNA之比是0.6:1，RNA与DNA之比为0.1:1。DNA与
简述结构异染色质的特征
在间期核中,结构异染色质聚集形成多个染色中心(chromocenter)。在哺乳类细胞中,这些染色中心随细胞类型和发育阶段不同而变化。结构异染色质有如下特征: ①在中期染色体上多定位于着丝粒区、端粒、次缢痕及染色体臂的某些节段。 ②由相对简单、高度重复的DNA序列构成,如卫星DNA。 ③具
拟南芥转化
实验概要本实验以拟南芥为试材介绍了转化及筛选的过程。主要试剂1. 渗透培养基:(1L)1/2xMurashige-Skoog5%蔗糖0. 5克MES用KOH调至pH5. 7再加:10微升lmg/ml的6-BA母液200微升Silwet L-77Top agar0. 1%琼脂PNS或水溶液2. 筛选培
北京基因组所单细胞中识别染色质类染色质拓扑的算法
基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中，这一高级结构即三维基因组学，对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获（3C），尤其是高通量技术（Hi-C，ChIA-PET）的发展推动了三维基因组的研究，发现了包括染色质拓扑相关结构域（TAD），染色质环等一系列层次化的结构特征。近
研究揭示染色质修饰调控植物基因表达新机制
8月6日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物逆境生物学研究中心植物分子遗传国家重点实验室何跃辉研究组（与刘仁义研究组合作）和杜嘉木研究组（与美国威斯康辛大学钟雪花研究组合作）在《自然-遗传学》背靠背分别发表题为Polycomb-mediated gene silencin
拟南芥叶绿体基因组DNA双链断裂修复的全新分子机制
2021年6月16日，清华大学生命学院/清华-北大生命科学联合中心孙前文实验室在Nucleic Acids Research杂志在线发表题为“RNase H1C与单链DNA结合蛋白WHY1/3和重组酶RecA1在拟南芥叶绿体中协作完成DNA损伤修复 (RNaseH1C collaborates
[科学]：研究人员破译植物开花时间秘密
植物为什么会在不同季节开花?研究人员在新一期《科学》杂志上报告说，其秘密在于一种核糖核酸(RNA)起到了调控作用。 英国约翰·英尼斯中心的研究人员发现的这种核糖核酸名为COOLAIR，是一种反义长链非编码核糖核酸。长链非编码核糖核酸曾被认为没有功用，现在研究人员发现它能发挥很多重要的功能，
关于染色质的结构单位的介绍
20世纪70年代以前,人们关于染色质结构的传统看法认为,染色质是组蛋白包裹在DNA外面形成的纤维状结构。直到1974年Kornberg等人根据染色质的酶切和电镜观察,发现核小体是染色质组装的基本结构单位,提出染色质结构的“串珠”模型,从而更新了人们关于染色质结构的传统观念。
染色质结构对转录调控的影响
真核细胞中染色质分为两部分，一部分为固缩状态，如间期细胞着丝粒区、端粒、次溢痕，染色体臂的某些节段部分的重复序列和巴氏小体均不能表达，通常把该部分称为异染色质。与异染色质相反的是活化的常染色质。真核基因的活跃转录是在常染色质进行的。转录发生之前，常染色质往往在特定区域被解旋或松弛，形成自由DNA，这
什么是结构性异染色质？
又称结构性异染色质，是异染色质的主要类型。是各类细胞的整个发育过程中都处于凝集状态的染色质。 此类染色质多位于染色体的着丝粒区，端粒区，次缢痕，以及Y染色体长臂远端2/3区段，含有高度重复的DNA序列，没有转录活性。