微生物所建立无痕迭代DNA组装新方法
DNA组装与DNA合成技术并称为合成生物学的两大基础使能技术。在合成生物学和生物工程领域中，“设计-构建-验证-学习（Design-Build-Test-Learn，DBTL）”的循环工程，精细的遗传元件无缝拼接以及重复DNA序列（如CRISPR和TALEN结合序列）串联分别需要迭代、无痕和序列重复的DNA组装技术。目前酶切连接的组装方法被广泛地应用于迭代组装，其中BioBrick组装法则是最早发展起来的DNA标准化组装技术，已成为国际基因工程机器大赛iGEM的组装标准。然而，BioBrick及其类似的组装方法在DNA连接处形成6–21 bp的疤痕序列，影响DNA完整性和mRNA正确折叠，且不适用于序列严格依赖的遗传元件的精确组装。 中国科学院微生物研究所病原室温廷益研究组建立了基于IIP和IIS型限制性内切酶（RE）的DNA组装方法，命名为PS-Brick。与在两端加入RE识别序列的现有DNA组装技术不同，本方法仅在PS......阅读全文
微生物所建立无痕迭代DNA组装新方法
DNA组装与DNA合成技术并称为合成生物学的两大基础使能技术。在合成生物学和生物工程领域中，“设计-构建-验证-学习（Design-Build-Test-Learn，DBTL）”的循环工程，精细的遗传元件无缝拼接以及重复DNA序列（如CRISPR和TALEN结合序列）串联分别需要迭代、无痕和序列
DNA纳米物体的组装加快
据一项新的研究披露，在合适的情况下，科学家们能够比过去更为有效地诱导DNA折叠成为复杂的、纳米尺度的物体。这些发现应该会使诸如纳米级电子器件或药物输送系统等的DNA纳米技术在实际应用上更为有用。在过去的研究中，科学家们通过折叠由短DNA“书钉”捆绑的某单股DNA“支架” 而制作出了一系列令人
“折纸DNA”设计控制病毒组装
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504958.shtm 衣壳涂层在不同厚度和形状的结构上的适用性。图片来源：《自然·纳米技术》科技日报北京7月17日电 （记者张梦然）据发表在最新一期《自然·纳米技术》上的一项研究，澳大利亚格里菲斯
DNA导向自组装带来新奇纳米“绳梯”
据物理学家组织网近日报道，美国能源部布鲁克海文国家实验室科学家开发出一种DNA“连接器”，能像绳索一样把纳米棒规则地连接一起，形成一种“绳梯”似的带状结构。研究人员指出，这种组装是由DNA“绳索”间的共同作用而实现，有望带来一种新型纳米纤维，并赋予其人们想要的各种属性。相关论文发表在美国化学协会
DNA“手”组装先进纳米粒子材料
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516364.shtm
单链Oligo合成与DNA组装技术－（一）
合成生物学作为迅速发展的交叉学科，已在生物医药、新材料、诊断、能源和数据储存等领域展现越来越广泛的应用潜力。合成基因组学作为合成生物学的重要研究方向，着重于新生命体系的从头设计与合成，其以Oligo（寡核苷酸链）合成、拼装和转移等核心技术为支撑。新生命体系的从头设计与合成不仅需要合成组成基因组的小片
单链Oligo合成与DNA组装技术－（二）
2.2 Golden Gate组装Golden Gate组装技术是基于非同源重组的代表性技术，其利用Ⅱ型限制性酶 BsaⅠ在识别位点外部切割的特性，设计特异的突出序列同时组装多个片段，且酶切和酶连可以同时进行，原理如图3所示。首先，扩增目的片段，在两端加上BsaⅠ识别序列，同时在识别序列内侧
化学所超分子手性组装研究获进展
作为三维物体的基本属性之一，手性广泛存在于自然界中，大到宇宙中的银河系、小到微观的分子、粒子体系。对于手性的研究不仅有助于我们加深对地球生命甚至是宇宙起源的认识，而且在生命科学、制药以及材料科学等领域也有着非常重要的现实作用。在手性研究中，除了分子层次的手性以外，分子以上层次尤其是纳米尺度上的手
我学者提出DNA纳米自组装新方法
科技日报合肥5月22日电 记者从合肥工业大学获悉，该校化学与化工学院李育林研究员课题组提出了一种全新的调控方法，使DNA纳米自组装不再依赖特殊结构设计即可实现动态控制，进一步拓宽了DNA纳米材料的应用前景。相关成果日前发表于国际著名学术期刊《德国应用化学》，并被评选为热点论文。 由于其精巧
自组装DNA纳米结构“侵染”细胞过程获揭示
中科院上海应用物理研究所樊春海课题组和黄庆课题组，应用一系列先进的细胞显微成像技术，并结合生物化学手段，清晰展示了一类自组装DNA四面体结构在活细胞中的摄取与转运过程，为其在药物载运和治疗方面的应用奠定了良好基础。相关成果日前以封面论文形式发表于《德国应用化学》杂志。 DNA不仅是生命的密码，
新研究显示原始DNA可能通过自发组装形成
这张图片显示的是一滴凝聚的纳米DNA（nano-DNA），其中的小颗粒是处于液晶相的纳米DNA，图片左侧呈现的是偏振光下的情景。这些液晶颗粒扮演“微型反应堆”的角色，短DNA在这里连接成为多聚物长链，这一过程无需生物学机制的帮助。 一项由美国科罗拉多大学博尔德分校和意大利米兰大学完成的新研究发现，
DNA支架能自组装成单电子器件
据美国电气和电子工程师协会《光谱》杂志官网近日报道，芬兰科研人员研究发现，DNA（脱氧核糖核酸）支架无需低温环境，就能够自组装成固定模型，并将纳米颗粒融合到功能性结构中，集成单电子器件。相关成果发表在近期《纳米通讯》杂志上。 DNA支架技术是纳米生物学的重要组成部分。DNA分子除具有基因的
单分子测序改善微生物基因组组装
美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员近日在《Genome Biology》上发表文章，介绍了SMRT技术在微生物基因组组装上的应用。他们认为，单分子测序数据能降低测序费用，并带来更多完整的基因组，改善微生物基因组数据库的质量。 随着测序费用的不断下降，测序项目的数量也在不断上升。G
新算法将更好组装DNA序列－检测特殊遗传突变
刊登在国际杂志Bioinformatics上的一项研究论文中，来自杨百翰大学(Brigham Young University)的研究人员开发了一种新方法来进行人类基因组的装配，而且这或许可以帮助鉴别引发常见遗传障碍的新型突变。 这种新方法依赖于一种新算法，其可以非常敏感地检测DNA序列的特异
DNA—纳米粒子自组装胶体可带来智能材料
据物理学家组织网近日报道，瑞士联邦理工学院(EPFL)和英国剑桥大学科学家合作开发出一种技术，用DNA链给纳米粒子涂上一层涂层，能控制并引导两种不同胶体的自动组装。这种胶体粒子可用于制造新奇的自组装材料，如智能递药补丁、随光变色的新奇涂料等。相关论文发表在《自然·通讯》杂志上。 胶体是一种
我国学者提出DNA纳米自组装新方法
记者从合肥工业大学获悉，该校化学与化工学院李育林研究员课题组提出了一种全新的调控方法，使DNA纳米自组装不再依赖特殊结构设计即可实现动态控制，进一步拓宽了DNA纳米材料的应用前景。相关成果日前发表于国际著名学术期刊《德国应用化学》，并被评选为热点论文。 由于其精巧的纳米结构以及超强的组装能力，
细菌微生物检测真空抽滤系统使用组装指南
L400-S1微生物检测真空抽滤系统是适合用于进行细菌、微生物限度检测的一款辅助工具，可以通过滤膜法将微生物和细菌截留在滤膜上，以便进行下一步的培养和计数。下面介绍该设备的具体操作和使用方法：将黑色的防溢逆止阀插入真空抽吸集液接收瓶内的接口，逆止阀可以防止废液瓶满忘记倾倒时大量液体涌出吸入泵内的情况
新研究揭示微生物群落组装机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511972.shtm中山大学中山医学院教授丁涛团队研究揭示了人类口腔生物被膜（OBM）菌群过程中的纵向时序群体感应网络，并通过实验验证了细菌群体感应网络在预测和操纵菌群装配过程中的有效性。近日，相关成果
细菌微生物检测真空抽滤系统使用组装指南
L400-S1微生物检测真空抽滤系统是适合用于进行细菌、微生物限度检测的一款辅助工具，可以通过滤膜法将微生物和细菌截留在滤膜上，以便进行下一步的培养和计数。下面介绍该设备的具体操作和使用方法：1.将黑色的防溢逆止阀插入真空抽吸集液接收瓶内的接口，逆止阀可以防止废液瓶满忘记倾倒时大量液体涌出吸入
化学所寡肽分子可控组装研究获新进展
分子组装是自然界生命体形成的主要方式。近年来，人们开发了系列寡肽分子作为组装基元，构筑了多种功能纳米结构体系，并将其应用于基因转染、组织工程及肿瘤治疗。其中，作为阿兹海默症的β-淀粉样多肽纤维的主要识别序列，二苯丙氨酸（由两个苯丙氨酸分子缩合得到的芳香性线性二肽）由于结构简单、组装性能优异引起广
文献解读|分层组装的DNA线框纳米结构，可用于...（一）
文献解读|分层组装的DNA线框纳米结构，可用于癌症高效成像和靶向治疗疏水小分子化疗药物的系统分布和非靶向细胞毒性导致副作用和疗效降低，阻碍了其在癌症治疗中的广泛应用。由于包括有机聚合物、无机纳米颗粒、脂质体等药物载体的快速发展，许多靶向给药策略已经建立起来，以克服这些缺点。然而，这些合成材料的生物相
DNA蛋白质多级可控组装研究中取得进展
生物大分子在自然进化中发展出一套独特的“自下而上”自组装方式进行各种复合结构的可控装配，为多功能生物纳米材料的加工制备提供了绝佳范例。其中，核酸-蛋白质纳米复合体系的可控构筑，不仅将实现生物学上两种基本组装模式的有效结合，以提供愈加复杂的生物结构模板，还有助于体内生物大分子相互作用的深入理解，对
新研究用DNA分子组装类生命“软机器人”
美国和中国科研人员近期合作设计出一种以DNA（脱氧核糖核酸）为材料构成的类生命“软机器人”，可通过自身新陈代谢为驱动实现自主运动，未来有望用于开发生物芯片等。 发表在新一期美国《科学·机器人学》杂志上的研究显示，在这一系统中，DNA分子被合成组装为一种层级结构，在可提供能量的液体中按指令、自动
文献解读|分层组装的DNA线框纳米结构，可用于...（三）
5.体内靶向癌症治疗图像表征完成后，作者在HCT116荷瘤异种移植小鼠中进行了抗肿瘤实验，未发现溶血现象。经5次静脉给药（接种肿瘤后第18天），CA4-Oct、CA4-FS、CA4组的肿瘤生长抑制率分别达到86%、65%、46%（图5a）。但一旦停止给药，CA4-Oct的抑瘤率仍维持在85%左右，而
研究发现DNA支架能自组装成单电子器件
据美国电气和电子工程师协会《光谱》杂志官网近日报道，芬兰科研人员研究发现，DNA（脱氧核糖核酸）支架无需低温环境，就能够自组装成固定模型，并将纳米颗粒融合到功能性结构中，集成单电子器件。相关成果发表在近期《纳米通讯》杂志上。 DNA支架技术是纳米生物学的重要组成部分。DNA分子除具有基因的
文献解读：分层组装的DNA线框纳米结构，可用于...（一）
文献解读：分层组装的DNA线框纳米结构，可用于癌症高效成像和靶向治疗疏水小分子化疗药物的系统分布和非靶向细胞毒性导致副作用和疗效降低，阻碍了其在癌症治疗中的广泛应用。由于包括有机聚合物、无机纳米颗粒、脂质体等药物载体的快速发展，许多靶向给药策略已经建立起来，以克服这些缺点。然而，这些合成材料的生物相
文献解读|分层组装的DNA线框纳米结构，可用于...（二）
这种DNA八面体的可寻址性和可预见性允许地装载不同数量的单链CA4-FS。作为概念验证，作者构建了半负载CA4-八面体（hCA4-Oct）和全负载CA4-Oct，并测定了负载效率（图1c）。为了进一步验证hCA4-Oct和CA4-Oct的可编程组装，作者接下来分别用Cy3标记的Oct-12H、Cy3
我国科学家在DNA自组装技术方面取得突破
仿生纳米孔道结构的设计与构建是生物分析、合成化学和限域催化领域的热点。经典的蛋白质纳米孔道结构精确，然而其可控性和稳定性较差；通过电子束刻蚀固态纳米孔道成本高、重复性差、通量低。自组装DNA纳米结构合成纳米孔道具有可编程设计、成本低廉、通量高等优点，但DNA孔道结构的刚性和稳定性成为阻碍其广泛应
文献解读：分层组装的DNA线框纳米结构，可用于...（二）
3.靶向性细胞毒性和稳定性在鉴定了CA4-Oct的细胞内化和穿透能力后，作者测定了其对目标癌细胞的细胞毒性。为了研究适配体介导的靶向给药的影响，作者选择了8h的短期孵育和40h的额外孵育，将抗癌功能从非特异性细胞吸附和核溶解中分离出来。作者发现，对照组Sgc8c、Lib、CA4-Lib、DNA八面体
科学家发现人类肠道微生物所产基因毒素对DNA的破坏机制
近日，美国哈佛大学和明尼苏达大学的研究人员针对肠道细菌毒素破坏双链dNA的机制，在Science杂志上发表了题为“The human gut bacterial genotoxin colibactin alkylates DNA”的文章。他们利用化学合成、小鼠实验和基于非靶向质谱测定的组学分析