单细胞检测技术在肿瘤研究中的新挑战和新方向(一)
单细胞转录组研究是近期生命科学领域运用最火的组学检测技术之一,来自麻省总医院和哈佛医学院的研究人员在《Molecular Cell》(Suva and Tirosh 2019)上讨论了单细胞转录组测序技术在肿瘤研究中的经验与未来挑战。在此,我们对该review中的部分内容进行解读和分享。作者认为,在接下来的几年中,通过单细胞RNA-seq研究肿瘤的方法将进一步整合到癌症研究中,并将用于解决越来越多关于肿瘤生物学的问题。在这里,作者简要介绍一些可能解决的主要问题和scRNA-seq及其相关新兴技术在其中的作用。一. 区分遗传与非遗传机制:单细胞多组学分析遗传异质性是在肿瘤之间和肿瘤内产生多样性的重要原因。然而,越来越多的证据表明非遗传机制在其中的重要性。因此,在同一个细胞中映射细胞状态和遗传状态就是一个重要的挑战了。但是,现有大多数的scRNA-seq数据,基本忽略了细胞的遗传状态,或者只具有部分评估遗传状态的能力:(1)......阅读全文
单细胞凝胶电泳法检测单细胞DNA损伤
单细胞凝胶电泳(single-cell gel eiectrophoresis,SCGE)又称慧星试验(comet assay)是一项较新的电泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于检验DNA单链断裂以来,经过不断的改进,已成为一种快速、灵敏、简便的检测DNA损伤的方法,广泛地应用
单细胞凝胶电泳的检测原理
各种因素诱发细胞DNA 损伤后会影响DNA 的高级结构,使其超螺旅松散。这种细胞经过实验中细胞原位裂解、DNA 解链等过程后,电泳时,损伤的DNA从核中溢出,朝阳极方向泳动,产生一个尾状带,未损伤的DNA 部分保持球形,二者共同形成“慧星”。在一定范围内,“慧星”的长度(代表DNA迁移距离)和经荧光
Science:新型单细胞基因表达检测技术
发表在最新一期《科学》(Science)杂志上的一篇研究论文,证实了一种新型的大规模平行测序技术可借助于新一代测序(NGS)在单细胞水平上检测基因表达。 论文作者、来自Cellular Research, Inc公司的Christina Fan博士、Glenn Fu博士以及Stephen Fo
单细胞测序技术的检测下限是多少?
单细胞测序技术的检测下限会受到多种因素的影响,包括所采用的具体技术方法、样本质量、实验操作等。一般来说,单个细胞中的 DNA 含量非常少,例如人类单个细胞的 DNA 含量仅有 6pg(皮克),而基因组建库的下限通常为 1ng(纳克),这就需要在单细胞测序建库前对全基因组进行扩增。目前常用的基因组扩增
单细胞基因组突变检测新突破
爱因斯坦研究人员已经开发并验证了一种准确识别单细胞基因组中突变的方法。这种新方法可以帮助预测癌症是否将在看似健康的组织中发展,在今天的自然方法的在线版本中发表的论文中被描述。相应的作者是Lola和Saul Kramer分子遗传学主席Jan Vijg博士。 在科学家可以分析单个细胞的基因组之前,
单细胞分离用于单细胞基因扩增
单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。 单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测;获得单克隆细胞;用于单细胞基因扩增,
DNA单链断裂检测技术:单细胞凝胶电泳(SCGE)检测原理..
DNA单链断裂检测技术:单细胞凝胶电泳(SCGE)检测原理和操作步放回玻片托盘中待琼脂糖凝固。 (3)裂解: 移开盖玻片,将载玻片缓慢浸入新配制的冰凉的细胞裂解液中,置于4℃冷藏至少1h。细胞可在裂解液中至少保存4周,但时间太长可能会引起缓冲液沉淀。 碱性细胞裂解液配制(每1000ml)
澳科学家发明单细胞DNA法医检测技术
一位澳大利亚科学家日前宣布他对法医DNA检测技术做了改进,通过检测单一细胞就能识别出个体。 Scotsman Ian Findlay是澳大利亚昆士兰大学基因组研究所的一名研究人员,他表示这个新检测技术的准确度相当于当前DNA检测方法检查200到500个细胞所达到的准确度。 “我们
单细胞测序是一种高效的检测技术
单细胞测序技术又称“下一代“测序技术或深度测序技术,可以一次性对几十万至几百万条DNA分子进行序列测定,现已广泛应用在基因组测序、基因表达分析、非编码小分子RNA鉴定、转录因子靶基因筛选及DNA甲基化等相关的研究领域。 测序技术的突出优点是可以从细胞图谱的角度,探测细胞特异性以及细胞间的差异,探
单细胞分离用于单细胞基因扩增介绍
单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。 单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测;获得单克隆细胞;用于单细胞基因扩增,用
Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序
2018年11月,Namocell与CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞,并且将其进行单细胞测序,为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序(scRNA-s
单细胞分离对单细胞测序领域的作用
单细胞分离可以采用特制的毛细管在载玻片的琼脂涂层上选取单孢子并切割下来,然后移到合适的培养基进行培养,分离法对操作技术有比较高的要求,多限于高度专业化的科学研究中采用。 它不仅仅可以用于分离单细胞,还可以用于nl级别试剂的分配和磁珠的分选,对于单细胞测序领域有着很大的帮助。快速高效接种单个活细胞至
CloneSelect 单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法
CloneSelect™ Single-Cell Printer™ f.sight™ ( f.sight )被开发用于满足这些需求, 它可以柔和地接种单个细胞至微孔,同时记录整个细胞接种过程,提供单克隆性的图像证据以及优异的接种后细胞生长用于细胞株开发在这个研究中,我们开展了六组实验,用无血清培养基
单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法对比
随着监管机构对细胞株开发的要求愈加严格,研究人员被要求开展单细胞克隆并提供细胞株源于单个细胞的证据( 即单克隆性的证据 )。 有限稀释是一个普遍接受的建立单克隆性的方法,它基于统计概率因此只有很少一部分( 10-30% )的微孔能被接种单个细胞。流式细胞分选是另一种传统的克隆方法,它可以高效地接种单
Namocell单细胞分离仪应用介绍——藻类单细胞分离
Namocell单细胞分离仪最新应用:随着人们对环境研究的不断深入,研究人员逐渐将目光转向藻类的单细胞层面:有些需要对藻类进行单细胞级别的分析(如藻类单细胞测序等),也有需要对单细胞藻类进行培养。这样就面临一个棘手的问题,那就是如何获取藻类的单个细胞。通常实验室里的方式,是在显微镜下用毛细管吸取。这
IsoPlexis单细胞蛋白质组学检测服务即将启动啦!
重磅消息来袭 你想要的单细胞 蛋白质组学检测服务即将启动啦! 单细胞蛋白质检测技术 传统的细胞分析通常包含数千个或更多的细胞,提供了一个总体平均值,掩盖了重要的细胞异质性,尤其是一些发挥重要作用的稀有细胞群体的意义,比如免疫细胞、肿瘤细胞、干细胞等均展现出广泛的异质性。 当前,随着单细
细胞介导细胞毒作用检测法7:单细胞CMC试验
单细胞CMC试验1.用细胞培养液等量混合效应细胞和靶细胞,30℃水浴10分钟。室温中250×g离心5分钟,去上清液。同量靶细胞不加效应细胞同样处理作为对照。2.用少量细胞培养液轻轻悬浮细胞,吸管上下吹打5~6次。这一分散细胞的步骤关系到试验的准确性和重复性,应当设法保持技术的一致性。取少许细胞悬液,
Nature新技术:精确检测单细胞中单核苷酸突变
SingulOmics公司是一家最近成立的基因组研究和服务公司,其研究人员3月20日在Nature Methods上发表最新论文,指出该公司的新系统:用于单细胞 测序的AccuSomatic Amplification,能精确检测单个体细胞中的单核苷酸变异(single nucleotide
青岛能源所研制出活体单细胞淀粉含量检测方法
近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心助理研究员籍月彤、硕士研究生何曰辉等利用该中心研制的活体单细胞拉曼分选仪原型机,通过单细胞拉曼光谱的快速采集和分析,发明了一种快速、非侵入性、不需标记、以单个活体细胞为单位的淀粉定量检测方法,为富含淀粉的种质资源选育提供了一种崭新手段。 据
怎样用拉曼光谱检测单细胞水平的固态氮
氮是维持生命活动最重要的营养元素之一。氮气是氮元素的丰富来源,但由于性质惰性,不能为生物直接利用。氮的生物地球化学循环是将氮转化成生物可利用形式的关键过程。固氮微生物,包括固氮细菌和固氮古菌,可将惰性的氮气转化成生物可利用的氨态氮或硝态氮。据估计,生物可利用氮的半数由生物固氮过程提供。然而,由于
单细胞的作用
在人体组织中有着令人难以置信的细胞类型、状态和相互作用的多样性。为了更好地了解这些组织和存在的细胞类型,scRNA-seq 提供了在单个细胞水平上研究表达情况的可能。scRNA-seq 可以用来:探索组织中存在哪些细胞类型识别未知/稀有细胞类型或状态阐明分化过程中或跨时间或跨状态的基因表达变化鉴定特
什么是单细胞
单细胞生物 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物(Protozoa)和多细胞生物(Metazoa)。单细胞生物只由单个细胞组成,个体微小,用肉眼很难看的见,大多数单细胞生物生活在水域环境中,有些寄生在我们身上。单细胞生物靠分裂繁殖(酵母菌在适宜的环境下出芽繁殖)单细胞生物包括所有古细菌和真细菌和
单细胞分离技术
单细胞测序日趋火爆的原因很大程度上得益于单细胞分离技术的不断完善。这一讲,我们将跟大家一起回顾传统的单细胞分离技术,并重点介绍单细胞分离技术的新宠微孔芯片技术及微流控技术。图1为目前常见单细胞分离设备。图1:目前常见单细胞分离设备传统单细胞分离技术相信许多实验人员,都见过下面我们要介绍的传统的单细胞
单细胞是什么
单细胞既可以指单细胞生物,比如细菌等,也可以指从多细胞生命体分离的单个细胞,比如实验室培养的人体细胞等。此外,受精卵也是单细胞,属于可以发育成完整生命体的全能干细胞。
什么是单细胞?
单细胞生物 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物(Protozoa)和多细胞生物(Metazoa)。单细胞生物只由单个细胞组成,个体微小,用肉眼很难看的见,大多数单细胞生物生活在水域环境中,有些寄生在我们身上。单细胞生物靠分裂繁殖(酵母菌在适宜的环境下出芽繁殖)单细胞生物包括所有古细菌和真细菌和
单细胞是什么
单细胞既可以指单细胞生物,比如细菌等,也可以指从多细胞生命体分离的单个细胞,比如实验室培养的人体细胞等。此外,受精卵也是单细胞,属于可以发育成完整生命体的全能干细胞。
Namocell单细胞分离仪在单细胞测序领域的应用
9月26至27日2019年细胞产业大会暨2019第四届(上海)细胞与肿瘤医疗高峰论坛在上海新南雅酒店举行。本届会议,邀请了全国30位专家学者、人物演讲、40家企业参展,400余人报名参会,逾500人参加了会议,就细胞储存、细胞治疗、细胞培养、细胞工程、细胞银行、细胞能量与代谢、细胞免疫学、细胞生理学
单细胞分离对单细胞测序领域有着很大的帮助
单细胞分离可以采用特制的毛细管在载玻片的琼脂涂层上选取单孢子并切割下来,然后移到合适的培养基进行培养,分离法对操作技术有比较高的要求,多限于高度专业化的科学研究中采用。 它不仅仅可以用于分离单细胞,还可以用于nl级别试剂的分配和磁珠的分选,对于单细胞测序领域有着很大的帮助。快速高效接种单个活细胞
基于拉曼组的单细胞快检技术可同时定量检测
通过光合作用固定的二氧化碳与太阳能在生物体内有三种主要的存储形式:多糖、油脂和蛋白质,共同构成了生物碳存储与生物能源产业的物质基础。目前,对细胞中这三类高含能储碳分子的识别、表征和定量极为繁琐,通常难以在单个细胞精度测量,这限制了光合固碳细胞工厂的筛选与改造效率。中国科学院青岛生物能源与过程研究
翟继先团队开发植物单细胞核全长RNA检测技术-
近年来,高通量单细胞转录组测序已广泛应用于动物细胞研究,但只在少数植物物种和组织的研究中存在报道。其主要原因是因为植物细胞比动物多了一层细胞壁,使得植物单细胞RNA-seq必须先消化细胞壁并制备原生质体。而原生质体的制备对于许多组织都非常困难,且制备过程会影响细胞的转录状态而引入不必要的干扰。因