聚合酶链反应一单链构象多态性分析(PCRSSCP)

聚合酶链反应-单链构象多态性分析(Single Strand Conformation Polymorphism Analysis of Polymerase Chain Reaction Products, PCR-SSCP)是近年来发展起来的一种基因分析方法。 PCR-SSCP分析的基本程序为:首先PCR扩增特定靶序列,然后将扩增产物变性为单链,进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳。在不含变性剂的中性聚丙烯酰胺凝胶中电泳时,DNA单链的迁移率除与DNA链的长短有关外,更主要的是取决于DNA单链所形成的构象。在非变性条件下,DNA单链可自身折叠形成具有一定空间结构的构象。这种构象由DNA单链碱基决定,其稳定性靠分子内局部顺序的相互作用(主要为氢键)来维持。相同长度的DNA单链其顺序不同,甚至单个碱基不同,所形成的构象不同,电泳迁移率也不同。PCR产物变性后,单链产物经中性聚丙烯酰胺凝胶电......阅读全文

关于聚合酶链反应的概述

  PCR技术是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。 它具有特异、敏感、产率高、 快速、 简便、重复性好、易自动化等突出优点。  PCR技术最早由美国Cetus公司人类遗传研究室Kary Mullis及同事于1985年发现并研制成功的;最早的应用报道是Saiki等1985年将PCR技术应用于β-

核酸扩增—普通聚合酶链反应

  把DNA分子变性后解链,两条单链DNA分别经复性与两条引物互补结合,在4种dNTP存在和合适的条件下,由DNA聚合酶催化引物由5'到3'扩增延长,每经过变性、复性、延伸一个循环,模板DNA增加1倍,新合成的DNA链又可作为下一个循环的模板,经过30-50个循环,可使原DNA量增加

荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验(一)

实验步骤 ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂(Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物,操作时应穿实验服,戴手套,存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯(DEPC) 处理的水。6.无DNA试剂盒(Ambion)。贮存于一 20°C

遗传性神经性肌萎缩的并发症及实验室检查

  并发症  CMT3型可出现弓形足和脊柱侧弯等骨骼畸形。CMT4型视觉受累表现为视力减退、夜盲、视网膜色素变性、视野缩小、瞳孔异常和白内障。多数患者有心肌损害,可因心脏损害引起急性心衰而导致猝死。还可有神经性耳聋、嗅觉丧失、小脑性共济失调、骨骼畸形、皮肤角化或鱼鳞癣。婴儿型还可有抽搐和肌张力低下。

聚合酶链反应的常规应用介绍

用于治疗感染性疾病,肿瘤及遗传病。感染性疾病PCR在医学检验学中最有价值的应用领域就是对感染性疾病的诊断。理论上,只要样本有一个病原体存在,PCR就可以检测到。一般实验室也能检出10~100基因拷贝,而目前病原体抗原检测方法一般需要105-7个病原体才可检测到。PCR对病原体的检测解决了免疫学检测的

聚合酶链反应的用途和特性

PCR反应扩增出了高的拷贝数,下一步检测就成了关键。荧光素(溴化乙锭,EB)染色凝胶电泳是最常用的检测手段。电泳法检测特异性是不太高的,因此引物两聚体等非特异性的杂交体很容易引起误判。但因为其简捷易行,成为了主流检测方法。近年来以荧光探针为代表的检测方法,有逐渐取代电泳法的趋势。

关于聚合酶链反应模板的介绍

  单、双链DNA或RNA都可以作为PCR的样品。若起始材料是RNA,须先通过逆转录得到第一条cDNA。虽然PCR可以仅用极微量的样品,甚至是来自单一细胞的DNA,但为了保证反应的特异性,还应用ng级的克隆DNA,μg水平的单拷贝染色体DNA或104拷贝的待扩增片段作为起始材料,模板可以是粗品,但不

聚合酶链反应的模板的制备

PCR的模板可以是DNA,也可以是RNA。模板的取材主要依据PCR的扩增对象,可以是病原体标本如病毒、细菌、真菌等。也可以是病理生理标本如细胞、血液、羊水细胞等。法医学标本有血斑、精斑、毛发等。标本处理的基本要求是除去杂质,并部分纯化标本中的核酸。多数样品需要经过SDS和蛋白酶K处理。难以破碎的细菌

聚合酶链反应的循环参数介绍

预变性模板DNA完全变性与PCR酶的完全激活对PCR能否成功至关重要,建议加热时间参考试剂说明书,一般未修饰的Taq酶激活时间为两分钟。 [5] 变性步骤循环中一般95℃,30秒足以使各种靶DNA序列完全变性,可能的情况下可缩短该步骤时间。变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不彻底,易造成扩增失败

聚合酶链反应的引物设计原则

PCR反应中有两条引物,即5′端引物和3′引物。设计引物时以一条DNA单链为基准(常以信息链为基准),5′端引物与位于待扩增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物与位于待扩增片段3′端的一小段DNA序列互补。(1)引物设计的基本原则引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。引物碱基:G+

定量聚合酶链反应的应用特点

中文名称定量聚合酶链反应英文名称quantitative PCR;qPCR定  义将某种已知含量的DNA模板作为内标准进行PCR反应,对待测模板进行定量分析的方法。更灵敏的定量PCR是采用实时PCR方法。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生物学技术(二级学科)

P53基因缺失怎么回事

  基因突变的研已成为当今生命科学研究的热点之一,检测方法也随之迅速发展。人类细胞癌基因的突变类型已如上所述,对于基因突变的检测,1985以前,利用Southern印迹法,可以筛选出基因的缺失、插入和移码重组等突变形式。对于用该法法不能检测的突变,只能应用复杂费时的DNA序列测定分析法。多聚酶链反应

关于基因扩增技术—聚合酶链反应的扩增产物分析

  基因扩增技术—聚合酶链反应扩增DNA片段只是一个重要手段。扩增片段的检测和分析才是目的,根据研究对象和目的的不同而采用不同的分析法。琼脂糖凝胶电泳可帮助判断扩增产物的大小,有助于扩增产物的鉴定,点杂交除可鉴定扩增产物外,还有助于产物的分型;Southern杂交分析可从非特异扩增产物中鉴定出特异产

简述微流控芯片检测基因突变

基因突变主要是指高等动物、低等动物受到各种因素的作用下,基因出现改变,包括单个碱基、多个碱基的改变,使用微流控芯片可以检测基因突变,例如秀丽隐杆线虫cwn-1突变、循环系统肿瘤细胞基因突变。一般而言,所有疾病相关基因逐渐被克隆基因突变包括单链构象多态性、限制性片段长度多态性所取代,其中,单链构象多态

分子诊断在心血管病中的应用

个体化医疗模式,主要是基于分子(基因)诊断和循证医学而提出的,涵盖了分子诊断学、分子病理学和药物基因组学等领域。将分子诊断技术应用于心血管疾病的筛查、诊断、治疗和预后评价,有着非常广泛的前景。(一)筛查对心血管病的筛查,其主要目的就是检出有助于预告疾病风险、提高心血管疾病防治水平的基因,提早采取相应

聚合酶链[式]反应

中文名称聚合酶链[式]反应英文名称polymerase chain reaction;PCR定  义通过DNA互补双链解链、退火和聚合延伸的多次循环来扩增DNA特定序列的方法。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生物学技术(二级学科)

半制备规模单链RNA纯化(一)

Sean M. McCarthy and Martin GilarWaters Corporation, Milford, MA, U.S.引言寡核苷酸合成是非常高效和高产率的过程。在固相载体上进行寡核苷酸反应的典型产率为每耦合阶98~99.5%。在典型的多阶寡核苷酸合成中,杂质聚集在一起,即使是一

基因多态性的检测方法概述

多态性(polymorphism)是指处于随机婚配的群体中,同一基因位点可存在2种以上的基因型。在人群中,个体间基因的核苷酸序列存在着差异性称为基因(DNA)的多态性(gene polymorphism)。这种多态性可以分为两类,即DNA位点多态性(site polymorphism)和长度多态性

基因多态性的检测方法

多态性(polymorphism)是指处于随机婚配的群体中,同一基因位点可存在2种以上的基因型。在人群中,个体间基因的核苷酸序列存在着差异性称为基因(DNA)的多态性(gene polymorphism)。这种多态性可以分为两类,即DNA位点多态性(site polymorphism)和长度多态性

反转录聚合酶链反应的影响因素

(一)组织或细胞样本不是每种组织或细胞都表达所有的基因,即某些基因的mRNA不存在于某些组织或细胞中。因此,确定所选用的材料中是否含有需扩增的目标mRNA模板是实验成败的关键。(二)引物合成cDNA第一条链时,引物可用随机6聚核苷酸,或下游引物,或poly(dT),其中以6聚核苷酸的随机引物效果最好

聚合酶链反应技术的检查过程

  1材料:标本采自经胃镜检查确诊的胃、十二指肠溃疡、各类胃炎及溃疡合并胃炎病例,在距幽门口5cm内钳取胃粘膜2份(每例检查前2周停用抗HP药物),分别作PCR及病理切片检查,检测HP。  2研究方法:PCR技术:采用厦门长城生物工程有限公司生产的HPDNAPCR诊断试剂盒,DNA抽提采用水煮沸法,

HCV-cDNA/聚合酶链反应的相关介绍

  (HCV cDNA/Polymerase Chain Reaction,RTPCR)测定肝和血清中HCV RNA。  本法是将HCV RNA逆转录为HCV DNA,选用高度保守的5′非编码区引物扩增放大后作电泳观察结果。本法较灵敏。由于肝和血清中HCV RNA出现较抗-HCV为早,一些HCV感染

逆转录聚合酶链反应所需试剂

1.RMA提取试剂2.第一链cDNA合成试剂盒3.dNTPmix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2mM4.Taq DNA聚合酶

聚合酶链反应的扩增平坡概述

  扩增反应并不是可以无穷地进行下去的,经过一定的循环周期后需扩增的片段不再按指数增多而逐渐进入平坡;进入平坡的循环次数,取决于起始时存在的模板拷贝数以及合成的DNA总量。所谓平坡就是批PCR循环的后期,合成产物达0.3~1pmol时,由于产物的堆积,使原来以指数增加的速率变成平坦的曲线。造成PCR

聚合酶链反应的常见问题介绍

PCR产物的电泳检测时间一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚至消失。假阴性不出现扩增条带。PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及溴乙锭的使用, ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板

基因诊断的聚合酶链反应方法介绍

  21世纪,基因分析和基因工程技术有了革命性的突破,这主要归功于聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)的发展和应用。应用PCR技术可以使特定的基因或DNA片段在短短的2-3小时内体外扩增数十万至百万倍。扩增的片段可以直接通过电泳观察,也可用于进一步的分析。这样,

反转录聚合酶链反应的操作步骤

1、从RNA(或mRNA)反转录合成cDNA第一链:2、于95℃加热5~10min,灭活反转录酶,使RNA—cDNA杂交体变性,然后迅速冰浴冷却:3、PCR扩增:方法基本同PCR。cDNA第一链合成方法:20ul反应液中含10xPCR扩增缓冲液,2ul;四种dNTP(10 mmol/L)2ul;RN

聚合酶链反应的污染监测方式

1、阳性对照:在建立PCR反应实验室及一般的检验单位都应设有PCR阳性对照,它是PCR反应是否成功、产物条带位置及大小是否合乎理论要求的一个重要的参考标志。阳性对照要选择扩增度中等、重复性好,经各种鉴定是该产物的标本,如以重组质粒为阳性对照,其含量宜低不宜高(100个拷贝以下)。但阳性对照尤其是重组

聚合酶链反应技术的注意事项

  不适宜人群:1)凝血功能差者。(2)胃血管瘤(质软)  检查前禁忌:1.检查前一天避免吸烟,以免检查时因咳嗽影响插管。  2.要有成人亲友陪伴,术前取下假牙。  3.检查前一天晚饭后不应再吃东西,检查当天早晨不应再喝水。  检查时禁忌:1.告知医生您的既往病史及药物过敏史。  2.嘱病人在操作中

聚合酶链反应技术的临床意义

  异常结果:测定Hp有关毒力因子基因的mRNA(信使核糖核酸)的存在。  需要检查人群:消化性溃疡,慢性胃炎患者。