RTPCR引物的选择

随机引物 适用于长的或具有发卡结构的RNA。适用于rRNA、mRNA、tRNA 等所有RNA的反转录反应。主要用于单一模板的RT-PCR反应。 &nb......阅读全文

RTPCR引物的选择

随机引物 适用于长的或具有发卡结构的RNA。适用于rRNA、mRNA、tRNA 等所有RNA的反转录反应。主要用于单一模板的RT-PCR反应。 Oligo dT 适用于具有PolyA尾巴的RNA。(原核生物的RNA、真核生物的 Oligo dT rRNA和tRNA不具有PolyA尾巴。)由

RTPCR引物的选择

随机引物             适用于长的或具有发卡结构的RNA。适用于rRNA、mRNA、tRNA 等所有RNA的反转录反应。主要用于单一模板的RT-PCR反应。                                                   Oligo dT        

RTPCR引物的选择

 对靶序列中潜在的引物位点进行分析, 这些位点应该不会形成同源多聚体结构,也没有明显的形成二级结构的趋势,不会自身互补,与基因组中的其他序列无显著的同源性。    (1)依据寡核苷酸引物与其靶序列形成杂合分子的熔解度的计算中提供的公式计算各引物的熔解温度。    (2)选择一对匹配完好的正向和反向引

RTPCR技术简介和RTPCR引物的选择

RT-PCR简介RT-PCR是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cD

影响RTPCR的因素和反转录引物的选择

科研党们整天都在为提取RNA而烦恼,费尽九牛二虎之力,终于!RNA质量完美!可是。。。qPCR/PCR结果依然不好,咋整?!在做qPCR/PCR实验之前,必不可少的一步就是反转录。别小看它哦,它在整个实验流程中发挥着重要作用!反转录(Reverse transcription )是以RNA为模板合成

影响RTPCR的因素和反转录引物的选择

在做qPCR/PCR实验之前,必不可少的一步就是反转录。别小看它哦,它在整个实验流程中发挥着重要作用!反转录(Reverse transcription )是以RNA为模板合成DNA的过程,即RNA指导下的DNA合成。反转录PCR(Reverse Transcription-Polymerase C

RTPCR引物设计原则和方法

在NCBI上搜索到该基因,找到该基因的mRNA,在CDS选项中,找到编码区所在位置,在下面的origin中,Copy该编码序列作为软件查询序列的候选对象。打开Primer Premier5,点击File-New-DNA sequence,出现输入序列窗口,Copy目的序列在输入框内(选择As),此窗

RTPCR引物设计原则和方法

在NCBI上搜索到该基因,找到该基因的mRNA,在CDS选项中,找到编码区所在位置,在下面的origin中,Copy该编码序列作为软件查询序列的候选对象。打开Primer Premier5,点击File-New-DNA sequence, 出现输入序列窗口,Copy目的序列在输入框内(选择As),此

RTPCR的引物设计的基本原则

 1.上下游引物要保守:    为了能够扩增出所需要的保守片段,必须对保守的100-200片段进行pcr扩增。所以引物的选取也要非常的保守,最好不要有不同的碱基,若不得不有时,也必须保证引物的3’端至少有4个碱基是完全保守才可。    在设计保守引物时,要在发表序列上分别找保守一致的区域,即在发表序

概述合成cDNA引物的选择

  1、随机六聚体引物:当特定mRNA由于含有使反转录酶终止的序列而难于拷贝其全长序列时,可采用随机六聚体引物这一不特异的引物来拷贝全长mRNA。用此种方法时,体系中所有RNA分子全部充当了cDNA第一链模板,PCR引物在扩增过程中赋予所需要的特异性。通常用此引物合成的cDNA中96%来源于rRNA

相对-RTPCR:-引物与竞争子比例的决定实验

            试剂、试剂盒 双蒸水 RT-PCR 缓冲液 TaqDNA 聚合酶 cDNA dNTP 混合物 基因特异的正向引物

相对-RTPCR:-引物与竞争子比例的决定实验

这个方案的目的是要选择一个 18SrRNA 引物和竞争子之间的恰当比例,可以模仿目的转录本的表达量。对于大多数转录本来说,一般比例为 3:7。对于模板比较稀少的,采用2:8 或 1:9 可能更恰当。准备的 PCR 反应混合物应比 5 个反应多 10%。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:

相对-RTPCR:-引物与竞争子比例的决定实验

试剂、试剂盒 双蒸水RT-PCR 缓冲液TaqDNA 聚合酶cDNAdNTP 混合物基因特异的正向引物基因特异的反向引物dCTP仪器、耗材 PCR 仪 PCR 管Quantum RNA Universal 18S standards实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水1

关于逆转录PCR引物的选择

  对靶序列中潜在的引物位点进行分析, 这些位点应该不会形成同源多聚体结构,也没有明显的形成二级结构的趋势,不会自身互补,与基因组中的其他序列无显著的同源性。  (1)依据寡核苷酸引物与其靶序列形成杂合分子的熔解度的计算中提供的公式计算各引物的熔解温度。  (2)选择一对匹配完好的正向和反向引物。两

寡聚核苷酸引物的选择

1.简介    寡聚核苷酸引物的选择,通常是整个扩增反应成功的关键。所选的引物序列将决定PCR产物的大小、位置、以及扩增区域的Tm值这个和扩增物产量有关的重要物理参数。好的引物设计可以避免背景和非特异产物的产生,甚至在RNA-PCR中也能识别cDNA或基因组模板。引物设计也极大的影响扩增产量:若使用

RTPCR-的-探针-和-引物-是什么-它们的作用是什么

引物是用来扩增片段用的,而探针,探针上面有荧光基团,完整时检测不到荧光,与两引物之间的目的基因结合,PCR扩增过程中,探针被切断,可以检测到荧光.扩增得到的目的基因越多,那么探针被切断的也越多,检测到的荧光也越多,所以常用来做定量PCR.

引物纯化方式有哪些,如何选择?

◆ 脱盐    寡核苷酸合成后,为了纯化寡核苷酸成为天然的DNA结构,首先必须去除保护基团。通过浓氨水处理,合成的寡核苷酸从固相载体上分离,2-氰乙氧基――磷酸二脂键的保护基团,以及碱基的保护基团基(苯甲酰基和异丁基)被去除,从而形成了天然的DNA结构。然而,必要的去保护步骤完成后,寡核苷酸混合

RTPCR内参基因选择:除了βactin还能用什么?

Q1: 要做real-time pcr,而该种的β-actin未确定,我知道一般用持家基因作内参,但似乎其他基因各有缺点,有的作者用他们做内参时被SCI杂志要求用两个内参以证实,我想知道的是除了β-actin,哪个基因是SCI公认的内参基因(不用作两个内参了)?A1: 28S和18S rRNA甘油醛

RTPCR技术的进行过程及方法

RT-PCR可以用一步法或两步法的形式进行。在两步法RT-PCR中,每一步都在最佳条件下进行。cDNA的合成首先在反转录RT-PCR可以用一步法或两步法的形式进行。在两步法RT-PCR中,每一步都在最佳条件下进行。cDNA的合成首先在反转录缓冲液中进行,然后取出1/10的反应产物进行PCR。在一步法

做real-time-pcr,逆转录引物怎么选择

显然是选random primer更好,其实说明书是有写的啦,原因是RT-PCR逆转录是要得到一个所有的RNA的cDNA库,然后再P出你要的“几个基因”,所以不是每个基因的mRNA都是有polyA的,很多都是没有的,microRNA,piRNA,很多都没有哦,所以如果你用oligo dT引物,就自然

如何对-cDNA、gDNA进行选择性引物设计?

设计策略PS:该方法适用于检测或部分 DNA 片段克隆,不适合全长基因克隆反转录 PCR 的主要问题是基因组 DNA (gDNA) 污染的存在,这将导致产生假阳性信号,特异性降低或对特定 RNA 的过高估计。为了消除 RT-PCR 中 gDNA 的干扰,可将引物设计为与两个外显子的接合部退火,该点为

如何对-cDNA、gDNA进行选择性引物设计?

设计策略 PS:该方法适用于检测或部分 DNA 片段克隆,不适合全长基因克隆 反转录 PCR 的主要问题是基因组 DNA (gDNA) 污染的存在,这将导致产生假阳性信号,特异性降低或对特定 RNA 的过高估计。为了消除 RT-PCR 中 gDNA 的干扰,可将引物设计为与两个外显子的接合

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。2、G十C含量:应在40%一60%之间,PCR扩增中的复性温度一般较Tm值低等于引物的Tm值减去5—10度。引物长度小于20时,

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物溶解引物保存

1. 如何测定引物的OD值?用紫外分光光度计在260nm波长测定溶液的吸光度来定量,请注意紫外分光光度计的使用,测定时溶液的吸光度最好稀释到0.2~0.8之间(吸光度太高或太低会有较大的误差)。DNA干粉用一定体积的水充分振荡溶解以后,取部分溶液稀释到1 ml 并在1 ml 标准比色皿中测定其吸光度

引物溶解引物保存

1.  如何测定引物的OD值? 用紫外分光光度计在260nm波长测定溶液的吸光度来定量,请注意紫外分光光度计的使用,测定时溶液的吸光度最好稀释到0.2~0.8之间(吸光度太高或太低会有较大的误差)。DNA干粉用一定体积的水充分振荡溶解以后,取部分溶液稀释到1 ml 并在1 ml 标准比色皿中测定其

PCR的基础原理

PCR的基础原理*章 PCR和RT-PCR基础PCR基础聚合酶链式反应(PCR)过程利用模板变性,引物退火和引物延长的多个循环来扩增DNA序列。这是一个指数增长的过程,因为上一轮的扩增产物又作为下一轮扩增的模板,使其成为检测核酸的一种非常灵敏的技术。一般,经过20-30个循环得到的扩增产物就足够在溴

RTPCR一步法与两步法有什么不同

两步法RT-PCR比较 常见,在使用一个样品检测多个mRNA时比较有用。然而一步法RT-PCR具有其他优点。一步法RT-PCR在处理大量样品时易于操作,有助于减少残余污 染,因为在cDNA合成和扩增之间不需要打开管盖。一步法可以得到更高的灵敏度,最低可以达到0.1pg总RNA,这是因为整个cDNA样