利用贝叶斯方法推断中生代鸟类分化时间和特征演化速率
近日，《英国皇家学会开放科学》（Royal Society Open Science）在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所张驰和王敏的研究工作。该研究利用贝叶斯末端定年法（Bayesian tip dating）推断了中生代主要鸟类支系的系统发育关系、分化时间及特征的演化速率，并包含这些参数的不确定性，为讨论原始鸟类身体不同部位的形态特征演化提供了新的信息。 在原始鸟类演化为现生鸟类的历史上，中生代的几大基干类群经历了恐龙向鸟类演化以及鸟类演化初期一些重要特征的变化，而且身体不同的骨骼部位的变化程度也有显著差别。传统的分析往往采用定性的描述或者通过多步计算来推演出特征演化速率的变化（如王敏和Graeme Lloyd 2016年的研究），而这种多步计算会在中间过程损失很多信息，并且没有考虑其中的不确定性。贝叶斯末端定年法能够综合利用化石形态和年代的信息进行整合的分析，不需要分步推断各个参数，并在计算中包含了树拓扑结构......阅读全文
利用贝叶斯方法推断中生代鸟类分化时间和特征演化速率
近日，《英国皇家学会开放科学》（Royal Society Open Science）在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所张驰和王敏的研究工作。该研究利用贝叶斯末端定年法（Bayesian tip dating）推断了中生代主要鸟类支系的系统发育关系、分化时间及特征的演化速率，并包含这些
古脊椎所等揭示中生代鸟类头骨演化特征
近日，eLife发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所王敏、托马斯、周忠和与合作者关于早期鸟类头骨演化的论文（Insight into the evolutionary assemblage of cranial kinesis from a Cretaceous bird）。该研究通过高精度
宏演化分析揭示翼龙的兴亡史
2023年2月13日出版的《当代生物学》（Current Biology）在线发表了中科院古脊椎所余逸伦，张驰研究员，徐星研究员关于翼龙多样性大尺度演化的成果。该研究详细的讨论了翼龙从起源至灭绝多样性的变化过程以及潜在的影响因素。研究结果显示，翼龙的演化历史大致可以分为两个阶段，即长达115个百万年
古脊椎所等揭示原始鸟类演化速率的不均一性
近年来，随着大量特征矩阵和谱系关系的获得，对生物大类群在长时间尺度上的演化模式进行量化分析成为了重要的研究方向。鸟类的起源与早期演化一直以来都是脊椎动物演化研究的重点。然而，原始鸟类各支系的演化模式，如形态特征的变化快慢、不同类群的演化模式异同等，由于长期缺乏量化分析，仍不清楚。 4月5日，最
科学家首次证实古鸟类叶食性的早期起源和演化
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505787.shtm近日，由中国科学院古脊椎动物与古人类研究所主导的热河生物群中古鸟类食性研究取得新进展，研究人员从1.2亿年前辽西热河生物群古鸟化石胃容物中发现了被子植物早期分支木兰类叶子的植硅体，首次
分子物种定界可使用贝叶斯模型选择方法和参数估计方法
物种定界是分类学最基本的问题，基于贝叶斯模型选择方法的BPP软件是最为广泛使用的分子物种定界软件。一些对贝叶斯物种定界的模拟研究认为BPP软件检测到的是群体分化而非物种分化，并且当分析多基因数据时，该软件倾向于过度定界，即过度划分物种。 近日，中国科学院数学与系统科学研究院科研人员在分子物种定
npj:－层状材料设计—主动学习与贝叶斯优化
由过渡金属二硫属化合物单层垂直堆叠而成的异质结在光电和热电器件领域拥有巨大的应用潜力。发现用于特定领域的最优层状材料，需要先估算关键的材料特性，例如电子能带结构和热输运系数。然而，通过严格从头算方法搜索整个材料结构空间来筛选材料特性大大超过了目前计算资源的限制。此外，材料特性函数对其结构的依赖性
多学科整合方法揭示鸟类重要特征演化机制
2月6日，国家基因库生物多样性基因组学团队、日本东北大学、东京大学等单位的科学家们共同揭开鸟类特有性状的形成及宏观演化之谜——特异性保守序列对鸟类特有性状的宏观演化起到重要作用。此项关于鸟类基因组特异性保守序列（avian-specific highly conserved elements,
从恐龙到鸟，为何演化变慢？
生命演化史上有一些重要的节点事件，比如颌的出现，鱼类登上陆地，爬行动物飞上蓝天等等。过去，科学家理所当然地认为，当这类具有“演化革新”意味的特征或者形态功能在某一类群中刚刚出现时，该类群的演化速率会变快，多样性也会增加。原因是，这些“革新”能够帮助生物快速进入新的生态位。中国科学院古脊椎动物与古人类
研究发现中生代鸟类生殖和个体发育
近期，《国家科学评论》（National Science Review）发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所王敏、邹晶梅、Alida Bailleu、李志恒的关于早期鸟类生殖和个体发育方面最新研究成果，报道了迄今发现的髓质骨保存最完好的中生代鸟类化石，证明了髓质骨在骨骼系统中广泛分布这一模式
古脊椎所等发现最早的恐龙蛋为革质蛋
恐龙生殖生物学特征的宏演化是备受关注但争议不断的领域。过去几十年来，一些保存状态良好的蛋窝与成体关联标本提高了古生物学家对这一领域的认知。然而，由于化石证据稀缺以及缺乏大尺度的定量分析，关于生殖特征宏演化模式的研究有限，尤其是白垩纪之前的演化历史。本研究报道了一种发现于贵州省的早侏罗世蜥脚形类恐
我国首次发现体内保存蛋壳的中生代鸟类化石
鸟类演化的成功与其独有的生殖孵育系统密不可分。3月21日，周忠和、邹晶梅、巴约勒团队在英国《自然-通讯》（Nature Communications）杂志在线报道了世界范围内首个腹腔内含有蛋壳的灭绝鸟类——反鸟类化石，为研究古鸟类的生殖繁育提供了新的信息，进而为探知早期鸟类的演化历程提供了新的证
英国科学家利用贝叶斯原理诠释细胞信号网络
繁复的细胞信号网络的解析一直是困扰生物学界的一个难题，众多的传导路径往往使研究人员无从入手，给具体实验研究带来极大困扰。而英国格拉斯哥大学研究人员最近证实，通过贝叶斯统计模型，不仅能对细胞信号通路模型进行评级，遴选出最优的传导路径，还可对细胞信号网络模型进行全新的诠释。这一代表了细胞
国际学者聚焦“中生代哺乳动物演化新证据”
2018年6月6日~8日，由北京自然博物馆、中国科学院古脊椎动物与古人类研究所主办，北京自然博物馆承办，北京市科学技术研究院、国家古生物化石专家委员会办公室、中国自然科学博物馆协会自然历史专业委员会支持的“中生代哺乳动物国际研讨会”在北京举行。 人类一直在探索自己究竟是从何而来的，而哺乳动
中国发现古老鸟类化石长有锋利牙齿
中国辽宁发现了一种长有古怪牙齿的鸟类的骨架化石 一具拥有奇特尖牙的鸟类化石在中国发现，这些特化的牙齿能够咬开坚硬的食物 北京时间1月10日消息，古生物学家近日在中国辽宁发现了一种长有古怪牙齿的鸟类的骨架化石，距今已有1.25亿年历史。化石保存的状况极好，能清楚看到残留的胃容物。研究
我国科学家探索鸟类头骨演化奥秘
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/12/490863.shtm本报北京12月8日电（记者齐芳）现生鸟类虽然没有“手”，但具有极其灵敏的喙，能够取代“手”完成大量精细的动作。研究认为，这是由于现生鸟类具有头骨可动性——其头部的部分骨骼能够发生相互
化石为鸟类羽毛分子演化提供直接证据
1月28日，由中国科学院南京地质古生物研究所副研究员泮燕红等完成的题为《羽毛分子演化的化石直接证据》的研究成果，在线刊登在《美国科学院院报》（PNAS）上，为探讨早期羽毛的演化提供了分子生物学证据。中科院古脊椎动物与古人类研究所周忠和院士、临沂大学郑晓廷教授、美国北卡罗来纳州立大学Mary S
我国中生代鸟类化石中首次发现肺部结构
2018年10月22日，《美国科学院院刊》（PNAS）发表了中国科院古脊椎动物与古人类研究所邹晶梅、周忠和等，临沂大学王孝理、郑晓廷等，约翰内斯堡大学John N. Maina，南京地质与古生物研究所泮燕红等组成的国际研究团队最新的研究成果，报道了在一件距今1.2亿年前的原始鸟类上保存的肺部
古脊椎所发现体内保存蛋壳的中生代鸟类化石
鸟类演化的成功与其独有的生殖孵育系统密不可分。3月21日，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所周忠和、邹晶梅、巴约勒团队在英国《自然-通讯》（Nature Communications）杂志在线报道了世界范围内首个腹腔内含有蛋壳的灭绝鸟类——反鸟类化石，为研究古鸟类的生殖繁育提供了新的信息，进而为
换牙还分奇偶数－这种中生代鸟类的牙齿间隔替换
对于包括人类在内的多数哺乳动物来说，一生中通常会生长和发育出乳齿与恒齿两套牙齿，这被称为双齿性。而与之不同的是，在大多数两栖类、爬行类动物中，普遍存在多次替换牙齿的现象。 在多姿多彩的自然界中，鸟类是种类最为繁盛的脊椎动物之一。身披羽毛、前肢为翼、骨骼中空而轻盈，它们凭借一身特殊的“装备”自由
古鸟类叶食性的起源有了新证据
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505801.shtm被子植物决定了现代地球陆地生态系统主要景观构成，维持着包括人类在内大量多门类生物类群的生存需求。长久以来，科学家认为鸟类可能在被子植物起源和早期多样性方面扮演着协同演化的重要角色。然而
周忠和任中科院古脊椎所所长
据中国科学院古脊椎动物与古人类研究所网站消息：8月23日，中科院古脊椎所完成所长换届，担任古脊椎所所长。 周忠和，出生于江苏省江都市。1986年获南京大学理学学士学位。1989年获中科院研究生院硕士学位。1999年获美国堪萨斯大学博士学位。现为中国科学院古脊椎动物与古人类研究
螽斯化石解读2亿年前的“交响乐”
中科院南京地质古生物研究所（以下简称南京古生物所）的研究人员揭示了中生代螽斯声学行为的演化，为昆虫和早期哺乳动物的声学共演化假说提供了证据，也为动物的声学演化机制和中生代的声学景观提供了新信息。相关研究成果12月13日在线发表于美国《国家科学院院刊》。 动物在求偶、交配、捕食和躲避天敌等行为中
中科院院士组Nature子刊文章
来自中科院古脊椎动物与古人类研究所，临沂大学等处的研究人员根据东北地区发现的新鸟类样品，获得了鸟类胸骨进化的新发现，指出反鸟亚纲鸟类胸骨形成方式上的不同，这强调了鸟类研究中对同源性和古生物骨骼特征进化理解的重要性。相关成果公布在Nature Communications杂志上。 这项研
探索原始生命奥妙，揭秘热河生物群隐藏的生命演化密码
周忠和，中国科学院院士，进化生物学及古鸟类学家，曾任中国科学院古脊椎动物与古人类研究所所长，长期从事中生代鸟类与热河生物群的研究，提出了热河生物群是若干生物进化摇篮的假说，找到了一系列支持鸟类恐龙起源学说和鸟类飞行树栖起源假说的新证据，发现并命名了若干中生代鸟类化石，通过深入研究早期鸟类的系统演
螽斯化石解读2亿年前的“交响乐”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/12/491048.shtm 侏罗纪螽斯的生态复原图。杨定华/绘 本报讯（记者沈春蕾）中科院南京地质古生物研究所（以下简称南京古生物所）的研究人员揭示了中生代螽斯声学行为的演化，为昆虫和早
数学院等在贝叶斯模型选择渐进行为研究中取得进展
近日，中国科学院数学与系统科学研究院和英国伦敦大学科研人员合作的关于贝叶斯模型选择的渐进行为的研究成果，在线发表在PNAS上。研究表明，贝叶斯模型选择的病态渐进行为是使用贝叶斯方法进行物种进化树估计得到不合理结果的可能原因。 模型选择与假设检验是统计学中比较棘手的问题。经典统计与贝叶斯统计的处
研究揭示贝叶斯全证据定年对物种采样偏差具有稳健性
随着基因组数据的涌现以及形态学数据的积累，综合利用分子序列和形态性状进行整合的数据分析逐渐成为演化生物学尤其是系统学研究的热点。与单独依赖化石信息或分子数据相比，整合多方面的数据能够得到更可靠的统计推断结果，对探讨诸多演化生物学问题具有基础重要性。由于模型的复杂性，合理运用整合分析并在模型和方法
科学家在我国中生代鸟类化石中发现髓质骨
12月5日，英国《自然-通讯》（Nature Communications）在线刊发了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所邹晶梅、周忠和团队与国外同行（包括美国自然历史博物馆教授Mark Norell 以及佛罗里达州立大学教授Gregory Erickson）合作的最新研究成果，首次报道了早白垩世
早白垩世鸟类化石显示鸟类牙齿退化模式的多样性
11月12日，英国《系统古生物学杂志》（Journal of Systematic Palaeontology）发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所王敏、邹晶梅、周爽、周忠和有关基干今鸟型类演化的工作，揭示了牙齿退化在原始鸟类中的多样性，甚至在姐妹群支系中呈现截然不同的模式。 今鸟型类（O