研究揭示贝叶斯全证据定年对物种采样偏差具有稳健性
随着基因组数据的涌现以及形态学数据的积累，综合利用分子序列和形态性状进行整合的数据分析逐渐成为演化生物学尤其是系统学研究的热点。与单独依赖化石信息或分子数据相比，整合多方面的数据能够得到更可靠的统计推断结果，对探讨诸多演化生物学问题具有基础重要性。由于模型的复杂性，合理运用整合分析并在模型和方法上有所突破是当前领域的难点。 近期备受关注的问题是个别数据在进行贝叶斯全证据定年分析时，估算的分化时间过于古老，其结果和化石证据不吻合。这一现象称为深根吸引（deep root attraction）。针对膜翅目昆虫和胎盘哺乳动物两组数据，已有研究表明使用物种多样化采样策略（diversified sampling，图1）的化石生灭模型（fossilized birth-death model）能够在较大程度上解决深根吸引问题。然而，多样化采样的假设仅考虑较为极端的情况。现实情况中物种的采样模式可能难以建模。这便引出一个问题，即是否......阅读全文
研究揭示贝叶斯全证据定年对物种采样偏差具有稳健性
随着基因组数据的涌现以及形态学数据的积累，综合利用分子序列和形态性状进行整合的数据分析逐渐成为演化生物学尤其是系统学研究的热点。与单独依赖化石信息或分子数据相比，整合多方面的数据能够得到更可靠的统计推断结果，对探讨诸多演化生物学问题具有基础重要性。由于模型的复杂性，合理运用整合分析并在模型和方法
npj:－层状材料设计—主动学习与贝叶斯优化
由过渡金属二硫属化合物单层垂直堆叠而成的异质结在光电和热电器件领域拥有巨大的应用潜力。发现用于特定领域的最优层状材料，需要先估算关键的材料特性，例如电子能带结构和热输运系数。然而，通过严格从头算方法搜索整个材料结构空间来筛选材料特性大大超过了目前计算资源的限制。此外，材料特性函数对其结构的依赖性
英国科学家利用贝叶斯原理诠释细胞信号网络
繁复的细胞信号网络的解析一直是困扰生物学界的一个难题，众多的传导路径往往使研究人员无从入手，给具体实验研究带来极大困扰。而英国格拉斯哥大学研究人员最近证实，通过贝叶斯统计模型，不仅能对细胞信号通路模型进行评级，遴选出最优的传导路径，还可对细胞信号网络模型进行全新的诠释。这一代表了细胞
数学院等在贝叶斯模型选择渐进行为研究中取得进展
近日，中国科学院数学与系统科学研究院和英国伦敦大学科研人员合作的关于贝叶斯模型选择的渐进行为的研究成果，在线发表在PNAS上。研究表明，贝叶斯模型选择的病态渐进行为是使用贝叶斯方法进行物种进化树估计得到不合理结果的可能原因。 模型选择与假设检验是统计学中比较棘手的问题。经典统计与贝叶斯统计的处
分子物种定界可使用贝叶斯模型选择方法和参数估计方法
物种定界是分类学最基本的问题，基于贝叶斯模型选择方法的BPP软件是最为广泛使用的分子物种定界软件。一些对贝叶斯物种定界的模拟研究认为BPP软件检测到的是群体分化而非物种分化，并且当分析多基因数据时，该软件倾向于过度定界，即过度划分物种。 近日，中国科学院数学与系统科学研究院科研人员在分子物种定
“隐世”百年的贝叶芒毛苣苔现身
墨脱县位于西藏自治区东南部的南迦巴瓦峰南麓，地形复杂，交通不便，是中国最后一个通公路的县。西南季风沿雅鲁藏布江河谷将来自印度洋的暖湿气流源源不断的向北输送，在此遇到巨大的地形屏障阻挡形成比其他同纬度地区更为丰富的降水，使得该地区成为青藏高原南缘山地最温暖、湿润的地区。独特的地形气候条件使得墨脱地区在
欧洲山毛榉枝条光合过程中碳同位素测量的贝叶斯模拟...
欧洲山毛榉枝条光合过程中碳同位素测量的贝叶斯模拟方法LYDIA GENTSCH, ALBIN HAMMERLE, PATRICK STURM, JÉRÔME OGÉE, LISA WINGATE, & ROLF SIEGWOLF et al. (2014). Carbon isotope dis
全叶延胡索的介绍
全叶延胡索(原变种) 产 黑龙江省、吉林省、辽宁省，生于海拔700-1000米的灌木林下或林缘。俄罗斯远东的符拉迪沃斯托克（ 海参崴）和朝鲜有分布。
利用贝叶斯方法推断中生代鸟类分化时间和特征演化速率
近日，《英国皇家学会开放科学》（Royal Society Open Science）在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所张驰和王敏的研究工作。该研究利用贝叶斯末端定年法（Bayesian tip dating）推断了中生代主要鸟类支系的系统发育关系、分化时间及特征的演化速率，并包含这些
全叶延胡索的形态特征
多年生草本，高8-14（-20）厘米。块茎球形，直径约1-1.5厘米，有时瓣裂，内质近白色，微苦。茎细长，基部以上具1鳞片，枝条发自鳞片腋内。叶二回三出，小叶披针形至倒卵形，全缘，有时分裂，长6-25（-40）毫米，宽5-16（-20）毫米，常具浅白色的条纹或斑点，光滑或边缘具粗糙的小乳突。总状
全叶延胡索的形态特征
多年生草本，高8-14（-20）厘米。块茎球形，直径约1-1.5厘米，有时瓣裂，内质近白色，微苦。茎细长，基部以上具1鳞片，枝条发自鳞片腋内。叶二回三出，小叶披针形至倒卵形，全缘，有时分裂，长6-25（-40）毫米，宽5-16（-20）毫米，常具浅白色的条纹或斑点，光滑或边缘具粗糙的小乳突。总状
全叶延胡索的产地生境
产黑龙江、吉林、辽宁，生于海拔700-1000米的灌木林下或林缘。俄罗斯远东的符拉迪沃斯托克（海参崴）和朝鲜有分布。
古鸟类叶食性的起源有了新证据
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505801.shtm被子植物决定了现代地球陆地生态系统主要景观构成，维持着包括人类在内大量多门类生物类群的生存需求。长久以来，科学家认为鸟类可能在被子植物起源和早期多样性方面扮演着协同演化的重要角色。然而
一种基于贝叶斯频率估计算法的窄带有源噪声控制系统
窄带有源噪声控制是一种通过发出与初始噪声幅度相同、相位相反的声波从而有效降低低频窄带噪声的控制手段。窄带有源噪声控制算法需要预先获得初始噪声的频率信息，包括频率个数及各个频率值。 传统的基于自适应陷波器（adaptive notch filter，ANF）的频率估计方法需要人为设置频率个数，且
顾勇团队揭示多模态感觉信息整合与决策的神经机制－
生物体处在一个复杂多变的环境中，不同感觉信息输入的可靠性往往随着时间发生改变。例如，当我们在高速公路上突然驶入一团迷雾时，由于路面视觉信息输入的可靠性迅速降低，大脑需要立即调整策略，更多地依赖仪表读数、前庭觉、触觉和听觉等其它信息来判断车辆的行驶速度和方向，从而随时做出“是否需要刹车”和“是否需
多模态感觉信息整合与决策的神经机制研究获进展
10月10日，《神经元》期刊在线发表了题为《利用线性不变概率性群体编码实现基于复杂多模态感觉信息的最优决策》的研究论文，该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、中科院灵长类神经生物学重点实验室、上海脑科学与类脑研究中心空间感知研究组与瑞士日内瓦大学认知计算神经科学研究组
Neuron：多模态感觉信息整合与决策的神经机制
2019年10月10日，中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心、中科院灵长类神经生物学重点实验室、上海脑科学与类脑研究中心空间感知研究组顾勇研究员团队与瑞士日内瓦大学认知计算神经科学Alexandre Pouget研究组合作在Neuron杂志上发表了题为“Neural Correlates of
全叶延胡索的形态特征及产地生境
形态特征 多年生草本，高8-14（-20）厘米。块茎球形，直径约1-1.5厘米，有时瓣裂，内质近白色，微苦。茎细长，基部以上具1鳞片，枝条发自鳞片腋内。叶二回三出，小叶披针形至倒卵形，全缘，有时分裂，长6-25（-40）毫米，宽5-16（-20）毫米，常具浅白色的条纹或斑点，光滑或边缘具粗糙的
希格斯粒子赋予其他基本粒子质量有了证据
大型强子对撞机ATLAS探测器实验数据 世界最强大的粒子加速器——大型强子对撞机（LHC），其超环面仪器（ATLAS）实验日前报告了可用来测试希格斯粒子机制的第一个证据，正是这一机制，让希格斯粒子可以赋予其他基本粒子以质量。这一机制的出现，比希格斯粒子的产生本身更为罕见。此发现到目前为止与标准模型
动物所在物种进化历史分歧时间估算方法研究中取得进展
物种分歧时间估算一直是生命之树（Tree of Life）进化历史研究中具挑战性的热点工作。分析过程通常涉及：核苷酸序列数据的系统发育分析；在重建的系统发育树的基础上，基于化石信息校准内部节点时点区间。在现有的绝大多数利用基因或基因组数据开展的工作中，来自化石或生物地质事件的外在时间校准信息多由
赵新全小组提供青藏高原返青期提前观测证据
日前，记者从中科院西北高原生物所获悉，该所赵新全课题组研究人员利用1990年到2006年间青藏高原东部5个观测站点、11种优势植物的野外物候观测数据，分别在种、科和植被类型不同层次进行了分析，首次从不同水平提供了青藏高原植物返青期提前的实际观测证据，发现高寒草甸和高寒草原具有不同的返青期变化趋势
活细胞超分辨率显微技术研究获进展
2016年12月31日，中国科学院生物物理研究所徐平勇课题组、中国科学院计算技术研究所张法课题组以及美国科学院院士HHMI研究员Jennifer Lippincott-Schwartz合作在《细胞研究》（Cell Research）在线发表了题为Live-cell single molecule
古脊椎所等在角形类系统发育研究中取得进展
犀牛和貘在外形上差别较大，但两者均属于奇蹄目，形态和分子生物学的证据表明两者构成姐妹群，由共同的祖先演化而来，统称为角形类（Ceratomorpha）。虽然现生的犀仅包括四属五种，貘仅有一属四种，但是在新生代（6500万年前至今）的较长时期内，角形类是非常繁盛、多样的类群。约5000万年前的早
藏北羌塘中部中央隆起带再次发现古特提斯洋证据
西藏羌塘盆地是青藏高原北部重要的含有多种资源潜力的盆地，近年来成为油气、矿产资源勘查的重要地区。而羌塘盆地的构造演化是学术界关注和争论的焦点。争论的关键科学问题是羌塘盆地中部的中央隆起带（高压变质带）是原位形成的，抑或是由北侧的金沙江带向南俯冲形成的；另一科学问题则是判断羌塘盆地中部中央隆起带是代表
超高分辨成像技术实现纳米尺度的活细胞核内动态观测
近日，在国家自然科学基金国家重大科研仪器研制项目（31327901）、面上项目（31271423、21573013）等资助下，北京大学研究人员首次应用新型超分辨成像技术实现了活细胞单 个转录工厂(RNA Pol II cluster)的动态过程观测和定量分析，研究成果以“Study of RNA
低能宇宙相变参数空间研究取得进展
宇宙温度从远大于1012开尔文的高温冷却到如今接近绝对零度，经历了138亿年的历史。早期宇宙是混沌的夸克-胶子等离子体，经历了基于粒子物理模型的数次标志性相变后，当前宇宙相对稳定的结构得以形成。在相变发生过程中，真空泡泡不断产生，膨胀、碰撞、融合，最终物理参数稳定在有效势能的真空附近。原则上，相
斯伦贝谢公司毛伟建博士访问测地所
5月10日，斯伦贝谢西方地球物理油气勘探公司英国伦敦研发中心首席研究员毛伟建博士应邀访问中科院测量与地球物理研究所，并作题为“地震成像概述”的学术报告。测地所所长孙和平、许厚泽院士、副所长王勇、副书记冯灿以及有关科研人员和研究生参加了报告会。 在报告中，毛伟建博士简要介绍地震成像在地球物理勘探
2018年拉斯克奖揭晓
9月11日，2018年拉斯克奖获奖者新鲜出炉。拉斯克奖是生物医学领域最重要的奖项之一，包括基础医学研究、临床医学研究及特殊成就这三个奖项。今年的基础医学研究奖授予发现并解开组蛋白与基因调控关系的C. David Allis 和 Michael Grunstein；临床医学研究奖得主是发明了当下医
福斯2011年培训课程通知
尊敬的各位FOSS用户： FOSS计划在2011年度提供的培训课程如下：课程主题起始时间结束时间地点第一期近红外分析仪培训班2011年4月4日4月7日北京第一期乳品分析仪器培训班2011年5月16日5月19日北京第二期近红外分析仪培训班2011年7月18日7月21日北京第二期乳品
2009年拉斯克奖公布
英国科学家約翰·格登和日本科学家山中伸弥获基础医学奖 美国Lasker基金会9月15日宣布了2009年拉斯克奖(Albert Lasker Award)的获奖者，今年共有5位科学奖获奖。 2009年拉斯克基础医学奖授予英国剑桥大学的John Gurdon和日本京都大学的Shinya