Northern杂交试验指导手册(2)-RNA质量检测
二、RNA质量检测提取的RNA需要对其质量和数量进行检测。实验室常用的方法有紫外吸收值检测和电泳检测两种。方法一、紫外吸收检测试剂:TE ( 10mmol/L Tris, 1mmol/LEDTA)。dH2O试验程序1.预热紫外分光光度计10~20min.。2.取两个1ml的狭缝石英杯,一个装入1mlTE溶液作为空白校正液,用来校正分光度计零点及调整透光度至100。3.取4μl RNA待测样品加入另一比色杯中,加dH2O至1ml,用无菌石蜡膜堵住杯口,倒转混匀。4.将两个比色杯置于分光光度计中,调入射光波长,用空白溶液分别调整T至100、OD至0,然后测定样品在260nm、280nm、230nm的OD值。RNA浓度和纯度分析浓度计算:对于单链RNA,OD260=1.0时,RNA浓度为40μg/ml,按照上述稀释方式,即OD260=0.1时,其RNA浓度为1μg/ml。纯度分析:纯净的RNA样品其OD260/OD280的比值应介于1......阅读全文
OsAGAP的Northern杂交
实验概要本实验参照Sambrook等(1989)的方法进行转膜,杂交。实验步骤1. RNA样品的电泳转膜将适量的琼脂糖溶于水,微波炉加热使之完全溶解,并冷却至60℃;将甲醛溶液、琼脂糖水溶液、5X甲醛凝胶电泳缓冲液按1:3.5:1.1比例混合,灌制凝胶。将不同材料的上样量调成一致,均为35ug,与样
southern杂交与northern杂交的区别
研究的对象不同。southern主要的对象是DNA,northern研究的对象是RNA。Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上。
分子杂交技术Northern杂交的简介
Northern杂交与Southern杂交很相似。主要区别是被检测对象为RNA,其电泳在变性条件下进行,以去除RNA中的二级结构,保证RNA完全按分子大小分离。变性电泳主要有3种:乙二醛变性电泳、甲醛变性电泳和羟甲基汞变性电泳。电泳后的琼脂糖凝胶用与Southern转移相同的方法将RNA转移到硝
southern杂交与northern杂交的区别
研究的对象不同。southern主要的对象是DNA,northern研究的对象是RNA。Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上。
RNA印迹(Northern-Blot)
【实验原理】将RNA变性及电泳分离后,转移到固相支持物上,用于与DNA探针杂交以鉴定其中特定 RNA分子的大小与含量。基本原理与Southern印迹相同,但RNA变性方法与DNA不同,不能用碱变性,因为碱会导致RNA的水解。Northern印迹主要用于组织细胞靶基因表达水平的研究以及对同一组织细胞的
组织印迹的Northern杂交
组织印迹的Northern杂交1)硝酸纤维素膜或尼龙膜上的组织印迹1.在塑料板上放置两层Whatman 1号滤纸,在滤纸上方放上一张普通纸,然后铺上一层尼龙膜。2.用双面刀片从植物组织如大豆的茎上切取一块切片(厚度约为1mm)。如果组织表面是湿的,则在Kimwipes纸上轻轻吸干或先用蒸馏水洗涤几秒
Northern杂交步骤和过程
Northern杂交与Southern杂交很相似。主要区别是被检测对象为RNA,其电泳在变性条件下进行,以去除RNA中的二级结构,保证RNA完全按分子大小分离。变性电泳主要有3种:乙二醛变性电泳、甲醛变性电泳和羟甲基汞变性电泳。电泳后的琼脂糖凝胶用与Southern转移相同的方法将RNA转移到硝酸纤
Northern杂交分析操作步骤
【操作】1.RNA的提取见前。2.变性胶的制备:取琼脂糖0.2g,加入 DEPC H2O 12.4ml,加热熔化,冷却至 60℃时加入5×甲醛凝胶电泳缓冲溶液4.0 、37%甲醛3.6ml、混匀、制胶。待胶凝固后,置于1×甲醛凝胶电泳缓冲溶液中预电泳5min。3.样品制备 取总RNA4.5 ,加入5
分子杂交技术Northern杂交的操作步骤
(1)RNA经变性电泳完毕后,可立即将乙醛酰RNA转移至硝酸纤维素滤膜上。转移方法与转移DNA的方法相似。 (2)转移完毕后 ,以6×SSC溶液于室温浸泡此膜5分钟,以除去琼脂糖碎片。 (3)将该杂交膜夹于两张滤纸中间,用真空烤箱于80℃干燥0.5-2小时。 (4) 用下列两种溶液之一进行
Northern杂交操作步骤和DNA探针的制备与标记(2)
(4) 将1 ~ 2 μl RNA 上样缓冲液加到乙二醛化的RNA 样品中,然后马上把RNA样品加到凝胶加样孔中,留着两边最外面的两个孔不要加样。将RNA 相对分子质量标准参照物加到最外面的孔中。(5) 以5V/cm 的电压进行电泳,直到溴酚蓝迁移大约8 cm。(6) 将凝胶放在保鲜膜上,在紫外灯下
核酸蛋白转移电泳及杂交(Southern-Blot、Northern-Blot和...2
(10)倒去预杂交液,加入含探针的杂交液封口,42℃ 6h或过夜。 (11)取出转移膜,按以下条件洗膜 1×SSC,0.1%SDS室温2×15分钟 0.25SSC,0.1%SDS,42℃ 2×15分钟,气中干燥。 (12)将杂交后的膜曝光于X光片,暗盒中放射自显影2~
Northern杂交、Southern杂交和Western杂交有什么区别
区别:研究的对象不同。southern主要的对象是DNA,northern研究的对象是RNA,而western研究的对象为蛋白质。1、Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段
Northern杂交、Southern杂交和Western杂交有什么区别
区别:研究的对象不同。southern主要的对象是DNA,northern研究的对象是RNA,而western研究的对象为蛋白质。1、Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段
Northern杂交、Southern杂交和Western杂交有什么区别
区别:研究的对象不同。southern主要的对象是DNA,northern研究的对象是RNA,而western研究的对象为蛋白质。1、Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段
分子杂交技术Northern杂交的注意事项
(1)如果琼脂糖浓度高于1%,或凝胶厚度大于0.5cm,或待分析的RNA大于2.5kb,需用0.05mol/LNaOH浸泡凝胶20分钟,部分水解RNA并提高转移效率。浸泡后用经DEPC处理的水淋洗凝胶,并用20×SSC浸泡凝胶45分钟。然后再转移到滤膜上。 (2)在步骤(3)的操作中,如果滤膜
Northern的杂交有哪些过程
Northern杂交的总体过程与Southern杂交相似,只不过在印迹(Blotting)过程中转移的是RNA而不是DNA,这种将RNA样品从凝胶转移滤膜的方法,其设计者为之起了一个与Southern:blotting对应的名称Northern:blotting。其分子杂交过程与Southern分子
Northern的杂交有哪些过程
Northern杂交的总体过程与Southern杂交相似,只不过在印迹(Blotting)过程中转移的是RNA而不是DNA,这种将RNA样品从凝胶转移滤膜的方法,其设计者为之起了一个与Southern:blotting对应的名称Northern:blotting。其分子杂交过程与Southern分子
Northern的杂交有哪些过程
Northern杂交的总体过程与Southern杂交相似,只不过在印迹(Blotting)过程中转移的是RNA而不是DNA,这种将RNA样品从凝胶转移滤膜的方法,其设计者为之起了一个与Southern:blotting对应的名称Northern:blotting。其分子杂交过程与Southern分子
Northern的杂交有哪些过程
Northern杂交的总体过程与Southern杂交相似,只不过在印迹(Blotting)过程中转移的是RNA而不是DNA,这种将RNA样品从凝胶转移滤膜的方法,其设计者为之起了一个与Southern:blotting对应的名称Northern:blotting。其分子杂交过程与Southern分子
Northern-protocol(RULES-FOR-RNA-WORK)
1. Wear gloves at all time including filling pipet tip in racks, filling jars with Eppendorf tubes, and weighing chemicals to prepare solution
指导RNA
中文名称指导RNA英文名称guide RNA;gRNA定 义一种小分子RNA,约含60~80个核苷酸,在RNA编辑中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或删除的信息。由小环DNA及大环DNA编码的指导RNA均带有编辑区的序列信息,可介导编辑过程。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调
Northern杂交技术的方法和步骤
Northern杂交与Southern杂交很相似。主要区别是被检测对象为RNA,其电泳在变性条件下进行,以去除RNA中的二级结构,保证RNA完全按分子大小分离。变性电泳主要有3种:乙二醛变性电泳、甲醛变性电泳和羟甲基汞变性电泳。电泳后的琼脂糖凝胶用与Southern转移相同的方法将RNA转移到硝酸纤
RNA酶保护试验((RNase-Protection-Assay,RPA)简介
RNA酶保护试验((RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。1。原理:双链RNA(杂交的)能够抵抗RNA酶的降解。2。应用:检测RNA表达3。与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优点:1.
RNA酶保护实验(RNase-Protection-Assay,RPA)简介
简介:RNA酶保护试验(RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。1. 原理:双链RNA(杂交的)能够抵抗RNA酶的降解。2. 应用:检测RNA表达3. 与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优
RNA酶保护实验(RNase-Protection-Assay,RPA)简介
简介: RNA酶保护试验(RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。 1. 原理:双链RNA(杂交的)能够抵抗RNA酶的降解。 2. 应用:检测RNA表达 3. 与Northern杂交和RT-PCR比较
Northern杂交法对mRNA的检测、分析及定量的方法
方法:Northern杂交目标RNA的类型:mRNA同时定量的目标RNA的数量:通常为一个,最多几个。用途:主要用于估测不同组织、细胞中目标mRNA的分子质量,可用于mRNA的粗略定量。缺点:需要大量RNA;只可同时检测一个或最多几个mRNA;与PCR方法相比,灵敏度差、耗时。
RNA酶保护试验((RNase-Protection-Assay,RPA)的优缺点
RNA酶保护试验((RNase Protection Assay,RPA)是通过液相杂交的方式,用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优点:1. 检测灵敏度比Northern杂交高。由于Northern杂交步骤中转膜和洗膜都将造
RNA质量检测与鉴定
方法一、检测RNA溶液的吸光度280、320、230、260nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白等有机物的值。一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R)。1.82.0时,我们认为RNA中蛋白或者时其他有机物的污染是可以容忍的,不过要注意,当你用Tris作为缓冲
RNA点线杂交
RNA点线杂交(Dot and Slot blotting)· RNA dot blot and slot blot (Beverly Faulkner-Jones)This methods allows the rapid analysis of numerous small sa
RNA点杂交
1) 纯化的RNA的点杂交和狭线杂交安装印迹装置1.切一张合适大小的带正电荷尼龙膜。用铅笔标上表示方向的记号。用水把膜简单弄湿,在20×SSC中室温泡1 h。2.在膜浸泡期间,先用0.1 mol/L NaOH小心清洗印迹装置,再用无菌水洗干净。3.把两片厚滤纸用20×SSC浸湿,再放到真空器顶部。4