中科生信云平台发布全国多组学技术应用高端论坛召开

分析测试百科网讯 2019年8月8日,由上海中科新生命生物科技有限公司主办的“第一届全国多组学技术及应用高端论坛暨中科新生命生信培训班”在上海举行。本次论坛展示了蛋白质组和代谢组在多组学和生命大数据背景下的最新研究进展,促进行业内各研究领域的交流与合作,加强行业信息资源的共享与成果转化,邀请了各研究领域的专家、学者共研蛋白质组和代谢组的新技术和新思路,探讨大数据背景下的组学未来发展方向。同期,还将举办中科新生命十五周年用户答谢会及蛋白质组和代谢组生信培训班,吸引了近200位行业同仁参与。分析测试百科网作为本次活动的支持媒体,全程跟踪报道。第一届全国多组学技术及应用高端论坛现场中科院上海生命科学研究院副院长廖侃研究员致辞 中科新生命成立于2004年,前身是中科院上海生命科学研究院蛋白质组研究分析中心。目前中科新生命已建立科技服务(蛋白/修饰/代谢研究)、生物医药表征确证及精准医疗三大服务平台。中科院上海生命科学研究院副院长廖......阅读全文

Nature发布单细胞基因组学新技术

  胚胎是如何形成我们肺脏、肌肉、神经和其他组织中的细胞的?一种新的方法可以解码使得胚胎万能细胞能够增殖并转变为机体许多特化细胞类型的遗传指令。   一开始是一团相同的细胞,随着增殖不断地改变形状和功能,最终变为我们肺脏、肌肉、神经和机体所有其他特化组织中的细胞。胚胎拥有这种创造奇迹的能力。  

基因组学推动生命科学大步向前

  2010年下旬,河南安阳曹操墓真伪之辩正酣。而一则来自上海的重磅消息更是引发了多方关注。复旦大学现代人类学教育部重点实验室宣布,向全国征集曹姓男性DNA样本,拟用基因组科学的手段验证出土的头骨是否为曹操本人。   一下子,基因组科学成为热门,这一话题“落入寻常百姓家”。   事实上,伴随着2

Illumina传奇(二):基因组学领域的巨无霸

Illumina的圣地亚哥总部与硅谷的科技园有些相似。走廊上非常明亮,即使是雾天也不例外,空间宽敞可以供员工们工作、喝咖啡和自助用餐,不过食物并不是免费的,这在一定程度上证明了资源被有效利用。高层管理人员与其他人一起在隔间工作,没有专门的办公室。在deSouza担任CEO的第一周,他将行政楼层的隔间

基因组学做不了的事-蛋白质组学更精准打击癌症

近日,国际人类蛋白质组组织公布了2020年度权威奖励获奖名单,中国科学院院士、军事科学院军事医学研究院研究员贺福初荣获蛋白质组学杰出成就奖。 贺福初院士率先提出人类蛋白质组计划的科学目标与技术路线,倡导并领衔了人类第一个关于组织、器官的蛋白质组计划,揭示了人体首个器官(肝脏)蛋白质组。2014年

中科院大化所代谢组学深度覆盖分析技术获新进展

近日,中科院大连化物所高分辨分离分析及代谢组学许国旺研究员团队在代谢组学深度覆盖分析技术研究方面取得新进展,相关工作在Analytical Chemistry《分析化学》杂志上连续发表3篇研究论文。 代谢组学是研究表型的重要工具,但现有技术在代谢组数据采集质量和数据解析方面仍存在很大瓶颈,

中科院大化所代谢组学深度覆盖分析技术获新进展

近日,中科院大连化物所高分辨分离分析及代谢组学许国旺研究员团队在代谢组学深度覆盖分析技术研究方面取得新进展,相关工作在Analytical Chemistry《分析化学》杂志上连续发表3篇研究论文。 代谢组学是研究表型的重要工具,但现有技术在代谢组数据采集质量和数据解析方面仍存在很大瓶颈,

中药基础物质、代谢及代谢组学研究方案

  中药组成成分复杂、作用环节多样,中药药效物质基础以及临床疗效机理的阐明,已成为中医药现代化研究的重要内容。如何快速地从海量的质谱数据中获取有价值的信息,减轻繁重的数据处理工作量,成为广大中医药研究工作者的心声。  赛默飞的Compound Discoverer软件针对中药成分鉴定、体内代谢转化和

代谢组学-|-肿瘤治疗之靶向葡萄糖代谢

  能量代谢重编程是肿瘤的十大特征之一,其中葡萄糖代谢异常是肿瘤代谢最突出的特征。在氧气充足的情况下,肿瘤细胞依然倾向于进行糖酵解,将葡萄糖代谢为乳酸。肿瘤细胞有氧糖酵解能力是正常细胞的20 ~ 30倍,为肿瘤代谢提供 大量能量和中间产物。因此,靶向糖酵解等异常环节的代谢酶是抗肿瘤治疗的重点。一些研

【盘点】定量蛋白组学将在未来10年飞速发展

  人类基因组计划的成功实施,我们已初步掌握了自身的遗传信息。但阐明人类基因组整体功能的功能基因组学仍任重而道远。蛋白质作为生命活动的"执行者",自然成为生命科学研究的新"宠儿"。几乎在所有生命科学领域内,科学研究工作者都需要对细胞、组织或完整生物体的蛋白进行定性描述或定量检测。对一种细胞、组织或完

代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(二)

案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章,采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现,CrPV

代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(一)

在疫情逐步可控的情形下,一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学,脂质组学,以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示,新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样,

实质等同性(代谢组学)实验

实验材料SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒[ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤本章描述的方法最适合于分析小麦精白面,但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织,如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前,如其他任何田间试验或温室

实质等同性(代谢组学)实验

实验材料 SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒 [ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材 Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤 本章描述的方法最适合于分析小麦精白面,但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织,如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前,如其他任何田间试

合作成果丨靶向代谢组学

     本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。关于岛津      岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理     

实质等同性(代谢组学)实验

实验材料:SIMCA - P 多变量统计软件    试剂、试剂盒:[ 1H ] - NMR 抽提剂      仪器、耗材:Eppendorf 聚丙稀管                                                                  NMR 管    

代谢组学全流程解决方案

赛默飞基于其超高分辨的静电场轨道阱(Orbitrap)质谱平台结合其功能强大的软件平台,提供代谢组学全流程解决方案。该方案不仅覆盖从极性代谢物到非极性代谢物的全面检测、峰提取与定量、统计学分析与可视化作图、代谢产物的全面鉴定、代谢通路分析等全流程的要求,而且还整合了从非靶标生物标记物发现到靶标生物标

临床代谢组学研究常见问题

分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后,所收集到的常见问题,供大家学习和参考。Q:如何设置验证集和测试集?A:按我理解你想问的问题是:training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这几个数据集概念,通常

宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组

  来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。   由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。   宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术,并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增

整合基因组和组织学信息-基因组学公司联手开拓新前沿

  10x Genomics公司宣布收购位于瑞典斯德哥尔摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空间基因组学(spatial genomics)领域的领先公司。空间基因组学是一个新兴领域,它不但让研究人员可以获得单细胞内的基因组数据

蛋白基因组学助力挖掘结肠癌治疗新思路

  原文:   Proteogenomic Analysis of Human Colon Cancer Reveals New Therapeutic Opportunities   原文链接:   https://www.sciencedirect.com/science/article/

基因组学探究沙棘放线菌固氮生物学机制

   沙棘是胡颓子科沙棘属落叶性灌木,其根部与放线菌共生固氮,适应缺水少肥的华北及西北贫瘠地区,是防风固沙功臣;其果实富含维生素C及黄酮等活性物质,是健康饮品的原料供给者;具有重要的生态和经济价值。  近日,《新植物学家》(New Phytologist)在线发表了来自中科院植物分子科学卓越创新中心

英国成立功能基因组学实验室

  近日,英国科研与创新署(UKRI)宣布,医学研究理事会(MRC)、剑桥大学米尔纳治疗研究所(MTI)等联合成立功能基因组学实验室,作为英国卓越研究中心和国家资源中心,汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识,加速新药物和诊断方法的研究发现,巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。  该实验

谢晓亮:当单分子遇上基因组学

  当单分子遇上基因组学,它们会擦出什么样的火花?著名华人学者谢晓亮(Sunney Xie)博士围绕这个话题,在《美国医学会杂志》(JAMA)上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授,也任北京大学生物动态成像中心主任。  谢博士写道,单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于

基因组学结合传统育种获得优质主食作物

   “我喜欢这个。”Ismail Rabbi边说边将手掌放在木薯上,就像父母在夸赞自己心爱的孩子,他羞涩地笑了。“它们看上去没什么了不起的——并不高。”Rabbi说,“但它克服了我们设置的所有障碍。”  Rabbi是尼日利亚伊巴丹国际热带农业研究所(IITA)的遗传学家。他和同事正在开展一项改良木

美X大奖基因组学挑战赛流产

图片来源:美国国家人类基因组研究所   美国X大奖基金会宣布废止其备受瞩目的奖金为1000万美元的基因组学挑战赛。报名截止时,该比赛仅吸引了两组竞争者参加。不过发言人表示,取消竞赛的决定与参赛人数无关。   7年前,阿康基因组学X大奖高调设立。该奖项旨在通过提供1000万美元奖金,推动医学基因组

Illumina推出全球首个基因组学孵化器

  Illumina公司是生命科学工具和遗传变异及功能分析集成系统的领先的开发商、制造商和销售商。它不仅能为基因分型、拷贝数变异分析、甲基化研究、基因表达分析以及DNA、RNA、蛋白质的低复制率分析等提供创新的排序和基于阵列的解决方案,同时,它还为消费者的基因组学和诊断学研究进展提供工具和服务。Il

深度解读:个人基因组学的现状与发展

  什么是Personal Genomics?  Personal Genomics,一般翻译为“个人基因组学”。是基因组学的一个分支,主要关注个人基因组的测序和分析。  1990年开始发起的浩大的“人类基因测序计划”是从大量的个体中获取基因信息,综合之后建立一个具有“参考价值”的人类“平均”基因组

单分子遇上基因组学:会擦出什么火花

  当单分子遇上基因组学,它们会擦出什么样的火花?著名华人学者谢晓亮(Sunney Xie)博士围绕这个话题,在《美国医学会杂志》(JAMA)上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授,也任北京大学生物动态成像中心主任。  谢博士写道,单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于

英国成立功能基因组学实验室

  近日,英国科研与创新署(UKRI)宣布,医学研究理事会(MRC)、剑桥大学米尔纳治疗研究所(MTI)等联合成立功能基因组学实验室,作为英国卓越研究中心和国家资源中心,汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识,加速新药物和诊断方法的研究发现,巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。  该实验

基因组学常规流程中SPIA通路分析方法

基因组学常规流程中通过实验样本组与组之间的比较得到成千上百的差异基因,再通过通路分析,从生物学角度探究差异基因的功能。但是常规的ORA、FCS方法往往忽视了基因在通路中复杂的相互作用关系,所以给大家介绍一种考虑更周全的分析方法SPIA。 SPIA整合了差异倍数、基因集显著性和拓扑分析,为每条通路计算