核酸序列分析

【实验目的】1、 掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤;2、 掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析;3、 熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析(内含子/外显子分析);4、 了解基因的电子表达谱分析。【实验原理】针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和功能位点的位置,以及标记已知的序列模式等过程。在此过程中,确认一段DNA序列是一个基因需要有多个证据的支持。一般而言,在重复片段频繁出现的区域里,基因编码区和调控区不太可能出现;如果某段DNA片段的假想产物与某个已知的蛋白质或其它基因的产物具有较高序列相似性的话,那么这个DNA片段就非常可能属于外显子片段;在一段DNA序列上出现统计上的规律性,即所谓的"密码子偏好性",也是说明这段DNA是蛋白质编码区的有力证据;其它的证据包括与"模板"序列的模式相匹配、简......阅读全文

DNA序列分析技术2

3)电泳电极缓冲液 1 倍TBE(pH 值8.0)预电泳 30 分钟至1 小时恒温方式 测序胶板上夹盖铝恒温板电泳温度 50℃左右电泳条件 恒功率 90~110W电泳时间 2.5 小时至5 小时4)干胶制备和压片电泳结束后取下胶板,用工具撬开玻璃板,使胶留在其中一块板上。将裁剪好的新华3 号滤纸在胶

无心畸胎序列征病例分析

 女,30岁,孕2产0,妊娠14周初次来我院检查。患者既往体健,无特殊病史,无药物过敏史,家族无遗传疾病史及双胎史,孕期无特殊接触史,既往月经规律,1年前曾因早孕胚胎停止发育人工流产1次。 此次超声显示:宫腔内可见2个胎儿回声,位于1个羊膜囊内。正常胎儿:双顶径28mm,股骨长15mm,胎心搏动规律

功能基因cDNA序列的分析

(一) cDNA序列的测定一.原理DNA 序列测定技术,目前主要是根据Sanger 等提出的酶法和Maxam和Gilber 提出的化学降解法,这两种方法的原理大致相同。这里主要介绍Sanger 的酶法——双脱氧链终止法。双脱氧链终止法是Sanger 等人于1977 年建立起来的。它是利用了2'

核苷酸序列的分析方法

根据核苷酸序列频率分布的特点和离散傅立叶变换所固有的“栅栏效应”,提出采用调频Z变换的分析方法,定义了相应的表达式,同时构造了短时调频Z变换用于识别基因区域中的外显子部分和内含子部分。与已有的基因区域识别算法相比,该方法不需要依赖于训练样本序列。测试结果表明了该方法的有效性。

核苷酸序列的分析方法

根据核苷酸序列频率分布的特点和离散傅立叶变换所固有的“栅栏效应”,提出采用调频Z变换的分析方法,定义了相应的表达式,同时构造了短时调频Z变换用于识别基因区域中的外显子部分和内含子部分。与已有的基因区域识别算法相比,该方法不需要依赖于训练样本序列。测试结果表明了该方法的有效性。

T载体克隆的DNA序列分析

实验目的: 了解常规DNA序列分析技术(Sanger双脱氧法)的原理及操作步骤。 实验原理: 在分子生物学研究中,DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger等(1977)发明的双脱氧链末端终止法和Maxam和Gilbert(1977)发明的化学

核酸蛋白分析仪

  核酸蛋白分析仪是一种用于基础医学、临床医学领域的分析仪器,于2010年12月31日启用。  技术指标  1.波长范围:190-840nm; 2.波长精度:1nm; 3.分辨率:

核酸分析技术有哪些

总的来说包括了核酸的分离、提纯,核酸的扩增,检测,定性与定量分析等。下面以DNA为例说一下相关的概念。1、DNA的分离提纯就那些试剂,那些步骤,网上一大堆视频的,自己去找吧。2、扩增一般指的是PCR,需提供引物(引物具有特异性,比如说乙肝病毒基因的引物只能扩增乙肝病毒基因)、酶、底物等,三个流程一个

序列分析仪的原理和用途

中文名称序列分析仪英文名称sequencer;sequenator定  义测定有序线性聚合物(如DNA、寡肽等)基本组成单位残基(核苷酸、氨基酸)排列顺序的仪器设备。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

实时定量焦磷酸序列分析仪

  实时定量焦磷酸序列分析仪是一种用于生物学、基础医学、临床医学领域的分析仪器,于2016年11月3日启用。  技术指标  1.样品通量:1-96个样本;2.灵活性:每次实验中,不同样本可进行不同的检测反应;3.无试剂及耗材浪费;4.检测器:CCD;5.检测速度:最快10分钟内完成96个样本的突变序

毗邻序列分析的方法特点和作用

中文名称毗邻序列分析英文名称nearest neighbor sequence analysis定  义分析核酸链中某核苷酸与其他核苷酸相邻频率的技术。即用5′-α-32P标记的某核苷三磷酸为底物参入核酸链,然后用特定的酶降解此核酸链生成3′核苷酸,则原来在某核苷酸5′侧的32P就转到相邻核苷酸的3

核苷酸序列的分析方法介绍

  核苷酸序列,就是指DNA或RNA中碱基的排列顺序。这意味着DNA中A,T,G,C的排列顺序,或者mRNA中A,U,G,C的排列顺序,也包括rRNA,tRNA中碱基的排列顺序。  根据核苷酸序列频率分布的特点和离散傅立叶变换所固有的“栅栏效应”,提出采用调频Z变换的分析方法,定义了相应的表达式,同

蛋白质序列分析和结构预测

【实验目的】1、掌握蛋白质序列检索的操作方法;2、熟悉蛋白质基本性质分析;3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测,了解基于motif、 结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测;4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素 (adiponectin)

蛋白质序列分析和结构预测

【实验目的】   1、掌握蛋白质序列检索的操作方法;  2、熟悉蛋白质基本性质分析;  3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测,了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测;  4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】   1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素(ad

蛋白质序列分析和结构预测实验

实验步骤 1.  人脂联素蛋白质序列的检索(1)调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez);(2)在Search后的选择栏中选择protein;(3)在输入栏输入homo sapiens adiponectin;

一例羊膜破裂序列征病例分析

患儿,男,9月龄。因“发现左侧上唇裂开9月余”就诊。为第4胎,第3产,孕39周,剖宫产。出生时体重2.5 kg。其母否认孕期致畸因素接触史,孕期未行产前检查,分娩时胎盘状态不明。无家族史,患儿两个姐姐均身体健康无畸形。体格检查:神志清楚,全身浅表淋巴结未见肿大。心音正常,心律齐,各瓣膜区未闻及杂音,

蛋白质序列分析和结构预测实验

实验步骤1.  人脂联素蛋白质序列的检索(1)调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez);(2)在Search后的选择栏中选择protein;(3)在输入栏输入homo sapiens adiponectin;(

蛋白质序列分析和结构预测实验

蛋白质序列分析和结构预测实验             实验步骤 1.  人脂联素蛋白质序列的检索(1)调用Internet浏览器并在其

测序技术及DNA序列测定结果分析

实验概要 在分子生物学研究中,DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger等(1977)发明的双脱氧链末端终止法和Maxam和   Gilbert(1977)发明的化学降解法。这二种方法在原理上差异很大,但都是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的

DNA序列分析电泳仪技术参数

电泳仪电源按电压分为高压1500~5000V、中压500~1500V、低压500V以下三种;按电流分为大电流500mA~2000mA、中电流100~500mA、小电流100mA以下三种;按功率分为大功率200~400W、中功率60~200W、小功率60W以下三种。基本参数外形尺寸(L×W×D):47

前导序列

中文名前导序列外文名leader sequence前导序列是结构基因中编码区之前的一段序列,这部分序列能被转录,但不被翻译,在mRNA是从5′端起至结构基因第一编码子开始点(通常 AUG)为止,在蛋白质合成过程中不被翻译。

核酸定量分析方法

核酸定量分析 DNA 或 RNA(以260nm处的吸光值为基础) 1. 制备用蒸馏水稀释过的DNA 或 RNA 样品溶液 ( 典型稀释比为 1:100 或 5:500μl) 2. 使用紫外光源,在260 nm 处测定吸光值,也可以在280 nm 和230 nm 测定吸光值 (260/280 的光吸收

orf1ab基因为何成为新型冠状病毒核酸检测的靶序列?

为什么当前nCov的核酸检测试剂盒以ORF1ab、S和N作为目标基因?为什么单用ORF1b做进化就能推测nCov来源于蝙蝠?为什么用如此短的时间就能比较分析那么多种coronaviruses基因组从而否定重组阴谋论?我睡前思考着这些问题,索性搜搜文献看。精神食粮让我意识到自己是个无知的人类。   我

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