单细胞测序告诉你体内受精和体外受精的差异

中国多家机构的一个研究团队利用单细胞测序技术,对植入子宫的人类胚胎进行了更多的研究。在这项发表于Nature的论文中,该小组描述了从植入前、植入中和植入后对数千个人类胚胎细胞进行测序的过程,以及他们从中学到的新知识。精子使卵子受精后不久,卵子就会附着在子宫内膜上。这使得胚胎能够从母体获得氧气和营养。在这项新的研究中,研究人员从细胞的角度观察了在人类繁殖的这一关键时期发生了什么。图片来源:Nature为了进一步了解植入过程中发生了什么,研究人员让65个人类卵子受精,并让它们在体外培养系统中生长。这使得他们能够在植入前、植入中和植入后研究成千上万的细胞。研究人员在植入前(受精后6天)对大约2000个胚胎细胞进行了一种名为scTrio-seq的单细胞测序,从而开始了他们的研究。接下来,他们在植入后对另外9000个细胞进行了类似的测序。然后他们对3200个不同原始谱系的细胞进行了比较。研究人员报告说,他们发现一些原始细胞在植入后会比其他......阅读全文

动物所合作揭示胚胎植入失败的新机理

  胚胎植入的成功与否是妊娠建立的关键门槛。植入前相关激素紊乱是导致胚胎植入失败的一个常见因素,过去的观点主要认为这是由于破坏了子宫内膜的接受性造成的。然而除子宫内膜接受性因素之外,胚胎在植入前需要借助子宫收缩及宫腔内液体环境运输到准确的植入位置,并在定位后实现宫腔液体的快速重吸收,以促进胚胎与子宫

安诺开年力作:单细胞转录组测序登陆Nature子刊

  X染色体失活(XCI)是指雌性哺乳类细胞中,两条X染色体的其中之一失去活性的现象,过程中X染色体会被包装成异染色质,进而因功能受抑制而沉默化。Xist RNA是能引发X染色体沉默的长片段ncRNA,尽管Xist对XCI是必要的,但其对胚胎植入前的印记XCI的精确作用尚存争议。近日,安诺优达与法国

谢晓亮团队利用遗传诊断新技术提高试管婴儿成功率

  今年2月底在美国佛罗里达召开的生物技术领域最有影响力的“全球基因组生物学与技术进展”(AGBT)大会上,美国科学院院士、北京大学长江讲座及千人计划教授、北京大学生物动态光学成像中心(BIOPIC)主任谢晓亮代表北大BIOPIC-北医三院生殖医学研究团队报告了一项最新的单细胞基因组扩增技术成果,首

如何让单细胞测序变得简单?

单细胞生物学研究一直是当今的热门话题,而且最前沿的领域就是单细胞RNA测序了(scRNA-seq)。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序,并给出平均差异,但并没有两个细胞是完全一样的,而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变,甚至这种技术还能够阐明完整

Fluidigm推出单细胞TCR测序产品

  解析细胞表型是免疫学中一个共同的单细胞分析目标。然而,T细胞受体V(D)J基因区域的随机重排带来了T细胞群体的复杂变化。这形成了庞大的T细胞部队,以便识别特定的外源蛋白,引发有效的免疫反应。  为了在单细胞水平实现深度的T细胞分析,Fluidigm近日在C1™系统上推出了一个全新的免疫学应用 –

!单细胞测序的”CPU-2.0”时代

  对单个人类细胞的基因组进行准确的变异检测和大范围单倍体型分析一直以来都是测序领域的巅峰挑战。单细胞测序使我们能在更高的分辨率下研究生命的机制。一方面,在像癌症这样的组织样本中存在大量具有不同基因组类型的单个细胞,因此需要分析单细胞水平基因组而不是大量细胞的平均值;另一方面,对于非常珍贵的细胞样品

漫谈单细胞测序及其临床应用

一、概述随着现代生物学的发展,细胞群体的研究已不再能满足科研需求。单细胞测序解决了用组织样本测序或样本少时无法解决的细胞异质性难题,为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向。单细胞测序正在成为科研热点。二、单细胞测序倍受青睐的原因人们最初以为一个细胞类群是均质的(即各细胞都是

Nature-Genetics:单细胞全基因组DNA甲基化组新发现

  北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心,北大生命科学学院与第三医院等处的研究人员发表了题为“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章,利用单细胞DNA甲基化组高通量测序方法,首次在单细胞分辨

单细胞分离对单细胞测序领域有着很大的帮助

 单细胞分离可以采用特制的毛细管在载玻片的琼脂涂层上选取单孢子并切割下来,然后移到合适的培养基进行培养,分离法对操作技术有比较高的要求,多限于高度专业化的科学研究中采用。  它不仅仅可以用于分离单细胞,还可以用于nl级别试剂的分配和磁珠的分选,对于单细胞测序领域有着很大的帮助。快速高效接种单个活细胞

Namocell单细胞分离仪在单细胞测序领域的应用

9月26至27日2019年细胞产业大会暨2019第四届(上海)细胞与肿瘤医疗高峰论坛在上海新南雅酒店举行。本届会议,邀请了全国30位专家学者、人物演讲、40家企业参展,400余人报名参会,逾500人参加了会议,就细胞储存、细胞治疗、细胞培养、细胞工程、细胞银行、细胞能量与代谢、细胞免疫学、细胞生理学

基因测序技术首次实现胚胎筛选

  来自牛津大学的科学家们利用新的基因测序技术对胚胎进行分析,从而选择试管受精的胚胎。之前,新的基因测序技术从来没用被用于胚胎的筛选。   这项分析技术称为“下一代测序技术”,一种强大的方用来解读所有的基因。通过测试每个样品产生大量的DNA数据,同时揭示遗传性疾病,染色体的异常及线粒体的突变。下一

北京大学Nature子刊单细胞RNA测序新成果

  来自北京大学第三医院、教育部辅助生殖重点实验室的研究人员,采用先进的单细胞RNA测序技术绘制出了人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组全景图,这一重要的研究成果发表在8月11日的《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。   

北大乔杰、汤富酬、黄岩谊发表环状RNA新成果

  早在几十年前,生物学家们就发现了环状RNA。与线性RNA相比,环状RNA受到的关注比较少,一直被认为是剪切过程中发生的错误。随着二代测序的发展,近几年人们意识到环状RNA其实是非常普遍的。这些分子广泛存在于多种生物的细胞中(从古生菌、酵母、小鼠到人类),能够通过不同途径影响基因表达,很可能在细胞

Illumina推出孕前筛查新产品

Illumina公司近日宣布推出VeriSeq™ PGS,该产品是为胚胎植入前的遗传学筛查(PGS)而开发的新一代测序方案,有望提高试管婴儿的成功率,预计将在6月份开始发售  Illumina公司近日宣布推出VeriSeq™ PGS,一个为胚胎植入前的遗传学筛查(PGS)而开发的新一代测序(NGS)

国际首次发现植入前胚胎组蛋白修饰建立过程

  由同济大学附属第一妇婴保健院首席科学家高绍荣研究团队的相关科学新发现于2016年9月15日凌晨,在国际著名学术期刊《Nature》在线发表。该研究团队采用最新研究技术,从全基因组水平上揭示了哺乳动物植入前胚胎发育过程中的组蛋白H3K4me3和HK27me3修饰建立过程,并发现宽的(broad)H

胚胎植入前基因检测不仅无创还更精准!

  由于当今社会不孕不育的现象越来越普遍,人们对辅助生殖的需求也越来越大。胚胎染色体数目异常在体外受精中较常发生,会引起植入失败或胎儿异常,是导致人类辅助生殖失败的一个重要原因。胚胎植入前进行染色体数目异常(非整倍体)筛查(PGT-A)可有效提高体外辅助生殖成功率,已被广泛应用于临床实践中。但由于该

胚胎植入前染色体筛查的新技术

 如今,一系列分子遗传学技术被开发出,能够对单个或少量细胞中的24条染色体进行分析,如比较基因组杂交芯片(aCGH)、单核苷酸多态性芯片(SNP)和定量PCR反应(qPCR)。新一代测序(NGS)技术则有望带来更多的突变数据。    安捷伦的SurePrint G3 human CGH 8 × 

胚胎植入前染色体筛查的新技术

  尽管体外受精(IVF)已经彻底改变了不孕不育的治疗,但这个过程本身不够高效,成功率很低。染色体非整倍体,是造成体外受精失败的主要原因,因为大多数非整倍体胚胎无法植入,或在孕早期流产。因此,提高成功率的关键,是选择染色体数目正常的胚胎。为此,人们开始采用胚胎植入前染色体筛查(PGS)。  他们最早

单细胞分离仪在单细胞测序领域有着很大的帮助

   单细胞分离仪可以实现从微孔芯片转移单细胞到细胞收集管中。单细胞转移分离系统集单细胞成像,单细胞隔离,单细胞选择功能于一体,自动聚焦成像。    转移单细胞到微管,PCR微孔板或其它反应微管中,在隔离单细胞后,它可以对选定收集的细胞进行扫描并成像,采用倒置荧光显微镜,配备自动扫描显微镜载物台,自

迄今最完整胚胎发育单细胞图谱发布

科技日报北京8月4日电 (实习记者张佳欣)科学家以果蝇为模型生物,构建了迄今为止最完整、最详细的动物胚胎发育单细胞图谱。这一发表在最新一期《科学》杂志上的成果,利用了来自100多万个各个发育阶段的胚胎细胞数据,代表了多个层面的重大进步,有助于科学家探索突变如何导致不同的发育缺陷,以及了解人类基

Nature-methods发布单细胞测序新技术

  来自瑞典Ludwig癌症研究所及Karolinska研究所的研究人员,在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)杂志上报告了一项获得重大改良的新技术,可以利用它来分析单细胞中的基因表达——这一性能与从基础研究到未来癌症诊断的一切事物均存在关联。   资深作者Ri

《自然—方法学》年度方法:单细胞测序

  2014年1月《自然—方法学》(Nature Methods)上发表年度特别报道,将“单细胞测序”(Singled out for sequencing)的应用列为2013年度最重要的方法学进展。   近几年来,基于单细胞测序技术的科学研究取得了突飞猛进的发展,其成果有望为一些重

Science:单细胞分析?并行测序技术可以

  近日,一项发表于国际杂志Science上的研究论文中,来自美国的研究者描述了一种新型的大规模并行技术,通过利用新一代测序技术来在单细胞水平上实现对基因表达的监测;研究者表示,单细胞分析对于理解人类造血系统的必要性及重要性不断凸显,如果没有这种分析的话,来自少许细胞的大量表达改变就和来自许多细胞的

《细胞》:单细胞测序助力基因重组图谱

  来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了来自一个成人男子91个

Nature新技术:CRISPR+单细胞测序=?

CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因组编辑技术是生物研究和新型靶向药物研发的有力工具。比如利用CRISPR筛选基因(pooled CRISPR screens),可以通过CRISPR gRNAs靶向成百上千个不同的基因,同时编辑许多细胞,然后实验筛选编辑细胞,gRNA可以帮助确定哪些基因对于生物

单细胞测序技术应用于发育生物学研究登顶三大学术杂志

  2019年即将结束,在这一年中,单细胞测序的火热充分展示了该技术在科学研究领域的重要。发育生物学作为生命基本过程研究的基础学科,单细胞测序技术是该领域研究突飞猛进的助推器。在这300多个日夜里,科学研究成果殿堂《Cell》、《Nature》、《Science》上有哪些发育生物学的成果跟单细胞技术

科学家建立植入前胚胎遗传学诊断新方法

  北京大学谢晓亮、乔杰、汤富酬团队在国际上首次建立了一种全新的植入前胚胎遗传学诊断方法MARSALA(高通量测序同时检测突变位点、染色体异常以及连锁分析),可以在早期胚胎阶段对各种单基因遗传疾病和染色体疾病同时进行精确诊断,以避免严重遗传病患儿的出生。相关成果日前发表于美国《国家科学院院刊》。  

单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

单细胞测序这样的高通量技术的优势

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin