cDNA合成技术

实验材料 RNA 试剂、试剂盒 α32PdNTP mRNA 甲基氢氧化汞 β-巯基乙醇 RNase抑制剂 引物01igo dT Tris-HCl MgCl2 KCl 逆转录酶 EDTA 酚-氯仿 乙醇 琼脂糖 Hepes DTT DNA聚合酶 核酸酶S1 ......阅读全文

cDNA克隆的定义

中文名称cDNA克隆英文名称cDNA cloning定  义从基因的转录产物(如mRNA)开始,逆转录合成互补DNA(cDNA),然后重组入载体,经过复制,筛选得到单一种cDNA分子的技术。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

cDNA合成技术1

Promega公司的RibocloneR M-MLV(H- ) cDNA合成系统采用M-MLV反转录酶的RNase H缺失突变株取代AMV反转录酶,使合成的cDNA更长。该系统的第一链合成使用M-MLV反转录酶,cDNA第二链合成采用置换合成法,采用 RNaseH和DNA聚合酶Ⅰ进行置换合成

cDNA合成技术3

2. 电泳分析(1) 用50mM NaCl, 1mM EDTA制备1.4%的碱性琼脂糖电泳, 并置碱性电泳缓冲液中30分钟。(2) 取样品液, 用TE调整体积, 使第一链和第二链产率测定液的体积相同,加入等体积的2×样品缓冲液(20mmol/L NaOH, 20%甘油,0.025%溴粉兰)。(3)

cDNA的筛选1

(一)λgt11 cDNA文库铺平板宿主细菌制备1.用一个E.coli宿主菌株单菌落分别接种2×5ml LB培养基(Y1088用于噬菌斑杂交,Y1090用于免疫筛选),于37℃振荡培养过夜。2.将过夜培养物以3000×g离心5min。3.分别用2ml λ-dil(10 mmol/L tris-Cl,

cDNA能存放多久

不要反复冻融就没有太大影响,可以放在-70度长期保存。

cDNA合成技术2

3. 第一链产量测定第一链掺入率(%)= 掺入cpm/总cpm ×100%掺入dNTP(nmol)=2nmol dNTP/μl ×反应体积(μl)×(第一链掺入率)设330为每mol dNTP的平均分子量合成cDNA量(ng)=掺入dNTP (nmol)×330ng/nmolmRNA向cDNA转变率

cDNA浓度的测定

理论上讲,等质量是必要的。但是就反转录结果而言,里面的成分太多,测量浓度的误差比较大。我们实验室一般都是测量RNA的浓度,然后取等量RNA、过量oligodT做充分反转录,再取等量反转录体系做PCR。另外,我看你用条带定量?这样很不准确,因为你也不知道PCR多少循环后达到饱和。比方说,组间差8倍,差

cDNA-文库的构建

            实验材料 λ噬菌体臂 大肠杆菌菌株 用于λ噬菌体的包装抽提物 试剂、试剂盒 放线菌素 D

cDNA-文库的构建

此经典方案建立在 Gubler-Hoffman 法(Gulber-Hoffman 1983) 之上,分为六个阶段。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。实验材料λ噬菌体臂大肠杆菌菌株用于λ噬菌体的包装抽提物试剂、试剂盒放线菌素 D二硫苏糖醇EDTATris-ClMgCl2反转录酶

cDNA克隆的方法

cDNA克隆( cDNA cloing)与RNA互补的双链DNA片段,而且它能携在克隆载体中。通常用于克隆真核生物mRNA的DNA拷贝。由于cDNA持贝是一个成熟的信息分子拷贝,因此,无内含子顺序。如果在其克隆的藏体中连上一个适当的活动子序,它可在任何宿主体内得以迅速表达 。

cDNA克隆的概念

cDNA克隆( cDNA cloing)与RNA互补的双链DNA片段,而且它能携在克隆载体中。通常用于克隆真核生物mRNA的DNA拷贝。由于cDNA持贝是一个成熟的信息分子拷贝,因此,无内含子顺序。如果在其克隆的藏体中连上一个适当的活动子序,它可在任何宿主体内得以迅速表达

cDNA能存放多久

不要反复冻融就没有太大影响,可以放在-70度长期保存。

cDNA浓度的测定

理论上讲,等质量是必要的。但是就反转录结果而言,里面的成分太多,测量浓度的误差比较大。我们实验室一般都是测量RNA的浓度,然后取等量RNA、过量oligodT做充分反转录,再取等量反转录体系做PCR。另外,我看你用条带定量?这样很不准确,因为你也不知道PCR多少循环后达到饱和。比方说,组间差8倍,差

cDNA文库组标准流程五:cDNA双链和载体的连接

1.连接:根据载体和cDNA的电泳定量结果,每个样品设置3个比例的连接,即:insert/vector=1/3  incert/vector=1/1   insert/vector=3/1按以下体系依次加入:      ddH2O                      xulT4 ligase

锚定酶消化cDNA实验

            试剂、试剂盒 溶液与缓冲液 引物 仪器、耗材 试剂盒 MPC-E

Experimental-Protocol-for-cDNA-Library-Construction

Experimental Protocol for cDNA Library Construction Identify appropriate celltype over-expressing corresponding gene. Find out if transc

cDNA-文库的构建2

阶段 3:cDNA 的甲基化 材料 缓冲液和溶液 将贮存液稀释到合适浓度。 氯仿 10XEcoRⅠ 缓冲液 1XEcoRⅠ 甲基化酶缓冲液(选用) 如希望,可替代步骤 1 中的 Tris-HCl,NaCl 和 EDTA。 EDTA(0.5mol/L,pH8.0) 乙醇 MgCl2(

cDNA文库的构建3

接头-衔接子与cDNA的连接8.将下列试剂加入到已削成平末端的DNA中:10×T4噬菌体DNA聚合酶修复缓冲液 2μl800~1000 ng 的磷酸化接头或衔接子 2μlT4噬菌体DNA连接酶(105 Weiss单位/ml) 1μl10 mmol/L ATP 2μl混匀后,在16℃温育8~12h。9

锚定酶消化cDNA实验

试剂、试剂盒 溶液与缓冲液引物仪器、耗材 试剂盒MPC-EPCR仪Gene PulserII 型系统实验步骤 实验方案 A1.通过加入下列物质来消化双链 cDNA2.在 37°C 下消化 lh。3.65°C 孵育 20 min 热失活限制性酶。4.等体积 PCI 抽提后乙醇沉淀(实验方案 A, 第

cDNA文库的物化方法

  基因工程初始阶段所用的方法,已不用。利用核酸双螺旋之间存在着碱基G C,A T配对特性,分离目的基因。  例如:海胆rDNA分子内其G C含量可以达63%(其稳定性高,溶解温度高),通过热变性和S1酶解处理可得到提纯50倍的rDNA,最后经氯化铯平衡梯度离心,得到相对分子量为1.9X107Dal

cDNA文库的构建2

10. Sephadex G-50用含有10 mmol/L NaCl的TE(pH7.6)溶液进行平衡,然后通过离子柱层析将未掺入的dNTP和 cDNA分开。11. 加入0.1倍体积的3mol/L乙酸钠(pH5.2)和2倍体积的乙醇,沉淀柱层析洗脱下来的cDNA,将样品置于冰上至少15分钟,然后在微量

cDNA文库的构建1

分为六个阶段:阶段1:反转录酶催化合成cDNA第一链阶段2:cDNA第二链的合成阶段3:cDNA的甲基化阶段4:接头或衔接子的连接阶段5:Sepharose CL-4B凝胶过滤法分离cDNA阶段6:cDNA与λ噬菌体臂的连接 [阶段1:反转录酶催化合成cDNA第一链] 1.在置于冰上的无菌微

cDNA-扩增和影印实验

实验方法原理 实验材料 保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列试剂、试剂盒 LB 培养基超级肉汤培养基乙醇裂解液RNA 酶溶液缓冲液乙醇 乙酸溶液丁二酸酐1-甲基-2-吡咯烷酮硼酸钠仪器、耗材 离心机96 孔热循环仪水浴锅微量滴定板清洗仪实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具

cDNA-文库的构建3

阶段 5:SepharseCL-4B 凝胶过滤法分离 cDNA材料缓冲液和溶液乙醇乙酸钠(3 ml/L,pH5.2)TE(pH7.6)含 0.1mol/LNaCl 的 TE(pH7.6)Tris-HCl(1mol/L,pH8.0)凝胶琼脂糖凝胶(1%)见步骤 8。核酸和寡核苷酸cDNA阶段 4 中步

cDNA-扩增和影印实验

            实验方法原理 实验材料 保存于细菌中的克隆纯的、已测序确证的人 EST 序列 试剂、试剂盒

cDNA-文库的构建(三)

阶段 3:cDNA 的甲基化材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿10XEcoRⅠ 缓冲液1XEcoRⅠ 甲基化酶缓冲液(选用)如希望,可替代步骤 1 中的 Tris-HCl,NaCl 和 EDTA。EDTA(0.5mol/L,pH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)NaCl(5mol/L)

锚定酶消化cDNA实验

试剂、试剂盒溶液与缓冲液引物仪器、耗材试剂盒MPC-EPCR仪Gene PulserII 型系统实验步骤实验方案 A1.通过加入下列物质来消化双链 cDNA2.在 37°C 下消化 lh。3.65°C 孵育 20 min 热失活限制性酶。4.等体积 PCI 抽提后乙醇沉淀(实验方案 A, 第 2 步

cDNA-文库的构建(一)

实验材料 λ噬菌体臂大肠杆菌菌株用于λ噬菌体的包装抽提物试剂、试剂盒 放线菌素 D二硫苏糖醇EDTATris-ClMgCl2反转录酶RNase 抑制剂用于 cDNA 合成的寡核苷酸引物poly(A)+RNA[a-32P]dCTPEDTA乙醇(NH4)2SO4β-烟酰胺腺嘌呤二核苷酸T4

cDNA-文库的构建(四)

方法cDNA 末端的削平1.cDNA样品(来自步骤 11)于 68°C 加热5 min。这一步骤是使cDNA分子的单链突出端可能形成的双链结构发生变性。2. 将cDNA溶液冷却至37°C并加入下列试剂:5xT4噬菌体DNA聚合酶修复缓冲液                              

Universal-RiboClone®-cDNA-Synthesis-System

Universal RiboClone® cDNA Synthesis SystemThe Universal RiboClone® cDNA Synthesis System contains the reagents required for the synthesis of double-st