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补平标签实验

试剂、试剂盒 溶液与缓冲液 BSA LoTE cDNA标签 实验步骤 实验方案 A 1.向两个含有释放的 cDNA 标签的试管中加入: 2.在 37°C 下孵育 30 min。 3.加入 150ul LoTE 扩容到 200ul。 4.如上所述,用等体积的 PCI 抽提,乙醇沉淀(实验方案 A,第 2 步)。 5.将沉淀溶解于 4ul 的 LoTE 中。 实验方案 B 1.向沉淀的 cDNA 标签中加入: 2.在 37℃ 下孵育 30 min。 3.加入 170ul 的 LoTE 扩容到 2004。 4......阅读全文

cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验

实验步骤 ##一、 cDNA 宏阵列的样品制备培养基: I : 2 (V7 V ) Gamborg B5 培 养 基(GibcoBRL, Rockville, MD), I : 1000(V /V ) Hyponex肥 料(Hypon

cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验(一)

除 cDNA 微阵列外,基于尼龙膜支持物的 cDNA 宏阵列方法是又一被广泛应用的大规模基因表达数据的收集方法。从新基因的发现到基因表达谱的分析, cDNA 宏阵列被应用于分子生物学研究领域的各个方面。尽 管 cDNA 宏阵列的点阵密度低于微阵列,但由于应用灵敏度较高的同位素标记的 cDNA 探针,

cDNA 文库的构建3

阶段 5:SepharseCL-4B 凝胶过滤法分离 cDNA材料缓冲液和溶液乙醇乙酸钠(3 ml/L,pH5.2)TE(pH7.6)含 0.1mol/LNaCl 的 TE(pH7.6)Tris-HCl(1mol/L,pH8.0)凝胶琼脂糖凝胶(1%)见步骤 8。核酸和寡核苷酸cDNA阶段 4 中步

实质等同性(转录组学)实验

实验材料:小麦  试剂、试剂盒:β-巯基乙醇                                   &nb

差减cDNA文库法

差减cDNA文库法[第一条链cDNA合成]1.合成第一条cDNA链时,所有试剂应按下列顺序依次加入:10×第一条链合成缓冲液              &nbs

逆转录PCR(RT-PCR)

实验四 逆转录PCR (RT-PCR )【实验目的】1.了解用逆转录PCR 法获取目的基因的原理。2.学习和掌握逆转录PCR 的技术和方法。【实验原理】聚合酶链式反应(PCR)过程利用模板变性,引物退火和引物延伸的多个循环来扩增DNA序列。因为上一轮的扩增产物

异显示技术(DD)实验

D D 由 Liang和 Pardee在 1992年首次提出。至今有大约1700篇 与 DD相关的文章发表,可见其影响巨大。许多与神经变性和凋亡相关的基因也通过DD 的方法得以鉴定。 .DD的原理基于对cDNA分子进行随机扩增和随后按大小进行的分离。

cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验(二)

11.用 mRNA 纯 化 试 剂 盒(Amersham Biosciences, Piscataway, NJ) 将 Poly.(A )+ RNA从总R N A 中分离出来(见注释5)。####(2) c D N A 文 库 的 构 建1.取1. 5 〜7. 5 μg poly (A )<

Differential cDNA Screening Procedures

Differential cDNA Screening ProceduresThe protocols listed refer to cDNA library construction and preliminary differential screening procedures. They

EST技术及其在基因全长cDNA克隆上的应用策略

第二军医大学细胞生物学教研室;上海200433 何志颖;姚玉成(综述);胡以平(审校)关键词:EST技术;“电子”基因克隆;生物信息学;基因摘要: 随着人类基因组计划的顺利进行,EST技术被广泛应用于基因识别、绘制基因表达图谱、寻找新基因等研究领域。利用人类基因组研究不断产生的数据,从ES

差异显示技术(DD)实验

            实验材料 无菌玻璃器皿 无菌 Eppendorf试 管 Eppendorf枪头 无菌 falcon离心管

cDNA 文库的构建(二)

7. 尽可能快地进行 cDNA 合成的下一步骤阶段 2:cDNA 第二链的合成材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿EDTA(0.5mol/LpH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)(NH4)2SO4(1mol/L)将 1.3 g 固体硫酸铵溶解于终体积为 10 ml 的水中,溶液经滤膜过滤

基因差异表达技术

真核生物中,从个体的生长、发育、衰老、死亡,到组织的得化、调亡以及细胞对各种生物、理化因子的应答,本质上都涉及基因的选择性表达。高等生物大约有30000个不同的基因,但在生物体内任意8细胞中只有10%的基因的以表达,而这些基因的表达按特定的时间和空间顺序有序地进行着,这种表达的方式即为基因的差异表达

RACE的原理、应用和优缺点(一)

一、RACE 的简介  目前,全长基因的获得是生物工程及分子生物学研究的一个重点。尽管已经有多种方法可以获得基因的全长序列,但在很多生物研究中,由于所研究的目的基因丰度较低,从而使得由低丰度mRNA通过转录获得全长cDNA很困难。近年来发展成熟的cDNA末端快速扩增(RACE)技术为从低丰度转录快速

常用的分子生物学基本技术1

DNA重组技术(或基因工程)是20世纪生物学的伟大成就,并已渗透到生命科学包括医学 各个领域,为肿瘤的实验研究和临床诊断及治疗提供了崭新的技术和有用的工具。本附录扼要介绍在分子肿瘤学领域中常用的分子生物学基本技术及其在肿瘤研究中的应用,着重介绍它们的原理和应用。至于具体的技术方法和操作步骤可参阅《分

分子生物学常用实验技术(六)

一、材料  提纯TMV 病毒液(10mg/ml)。二、设备  冷冻台式离心机,低温真空干燥仪,电泳仪,电泳槽。三、试剂  TE-饱和酚:氯仿(1:1),氯仿,3M NaAc(pH5.2),乙醇(100%和70%),TE 缓冲液,无RNA 酶的双菌水。四、操作步骤1、取一eppendorf 管加入提纯

常用的分子生物学基本技术

核酸分子杂交技术由于核酸分子杂交的高度特异性及检测方法的灵敏性,它已成为分子生物学中最常用的基本技术,被广泛应用于基因克隆的筛选,酶切图谱的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突变的检测等。其基本原理是具有一定同源性的原条核酸单链在一定的条件下(适宜的温室度及离子强度等)可按碱基互补原成双链。杂交的

定位候选克隆

当前,人类基因组研究的重心正在由“结构”向“功能”转移,一个以基因组功能研究为主要内容的所谓“后基因组时代”(post-genomics),也即功能基因组(functional genomics)时代,即将到来。如何获取基因的功能信息,即与人类重大疾病和重要生理功能相关的基因信息,就摆在了我们面前。

表达谱基因芯片实验

表达谱基因芯片可应用于:(1)疾病诊断;(2)新药开发;(3)环境保护。实验方法原理按照预定位置固定在固相载体上很小面积内的千万个核酸分子所组成的微点阵阵列。在一定条件下,载体上的核酸分子可以与来自样品的序列互补的核酸片段杂交。如果把样品中的核酸片段进行标记,在专用的芯片阅读仪上就可以检测到杂交信号

基因表达差异分析方法进展

  高等真核生物的基因组一般具有80 000~100 000个基因,而每一个细胞大约只表达其中的15%[1]。基因在不同细胞间及不同生长阶段的选择性表达决定了生命活动的多样性,如发育与分化、衰老与死亡、内环境稳定、细胞周期调控等。比较细胞间基因表达的差异为我们揭示生命活动的规律提供

cDNA文库构建的注意事项

构建全长cDNA文库分为噬菌体文库和质粒文库,二者大同小异。无论怎样,应当注意如下几个方面: 一、保证获得数量足够的高质量的起始RNA。构建cDNA文库要求的RNA量比做RACE和Northern blot的要多,在材料允许的情况下一般的试剂盒均推荐采用纯化总mRNA后进行反转录,这比直接

cDNA Libraries

cDNA LibrariesIsolation of corresponding genetic informationInstead of synthesizing a desired gene, can we used the amino acid information to directly

cDNA

·         cDNA Synthesis (Crawford Lab)mRNA can be converted into DNA (copy DNA, cDNA) by annealing

目的基因的获取-4

4、cDNA文库的大小 一个cDNA文库要包含99%的mRNA时所需要的克隆数目。 p: 文库包含了完整mRNA的概率(99%) 1/n: 某一种低丰度(不足14份拷贝)mRNA占细胞整个mRNA的比例 N:所需的重组载体数(克隆数) (三)基因组文库与c

比较分子生理基因组学 —cDNA阵列的异种杂交实验

实验步骤 一、材料 这里用到的所有化学试剂都为分子生物学等级,或者用它们最高纯度的等效物。所有的塑料和玻璃制品,包括瓶子和移液器吸头都要高压灭菌,在核酸实验操作过程中必须始终戴手套。 cDNA A T L A S阵列从Clo

比较分子生理基因组学 —cDNA阵列的异种杂交实验

近几年来, DNA 微阵列已经被公认是分子生物学研究的一种标准方法。特别是在生物医学研究方面,常用物种的微阵列一面世就得到广泛应用。但是对于非模式生物来说 ,微阵列的应用尚未得到充分开展,而这些物种往往表现出一些很有趣的生理表型。对大多数比较生物学的研究者来说,制备一个新物种的 D N A 阵列或微

提高RT-PCR特异性的方法总结

第一链cDNA合成的起始可以使用三种不同的方法,各种方法的相对特异性影响了所合成cDNA的量和种类。      随机引物法是三种方法中特异性最低的。引物在整个转录本的多个位点退火,产生短的,部分长度的cDNA。这种方法经常用于获取5'末端序列

cDNA 5’末端的快速扩增(5’-RACE)

在分子克隆中没有比分离缺乏相应的 mRNA 5' 末端的序列特征结构的 cDNA 克隆更易失败的了。通常存在于 cDNA 基因文库中的部分克隆,由于反转录酶未能沿全长 mRNA 模板延伸完全,合成的 cDNA 第一条链往往 5' 末端不完整。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂

基因组文库和cDNA文库的构建及筛选

刘芝华 中国医学科学院肿瘤研究所  分子肿瘤学国家重点实验室 概念: 基因组文库是含有某种生物体全部基因的随机片段的重组DNA克隆群体;cDNA文库是指含有所有重组cDNA的克隆群体。   基因组文库:来源于基因组DNA,反映基因

脊索瘤相关基因鉴定及筛查实验

脊索瘤相关基因鉴定及筛查实验,用于(1)脊索瘤分子机制(2)基因诊断(3)基因治疗。实验方法原理真核生物的mRNA 5’端有个帽子结构,3‘端有长约200 bp 的poly(A)尾巴。据此特点,可设计一种与其互补的序列oligo dT,为了把它锚定在poly(A)尾的起始端,将其设计成T12MN(M