蒋华良院士团队开发可解释性深度神经网络分子表征模型

近日,上海科技大学免疫化学研究所特聘教授蒋华良院士团队在《Journal of Medicinal Chemistry》发表封面文章“Pushingthe Boundaries of Molecular Representation for Drug Discovery with the GraphAttention Mechanism”,介绍了一种基于注意力机制的图神经网络模型(Attentive FP)。该模型可以用于分子表征,在多个药物发现相关的数据集上的预测表现达到当前最优,并且该模型所学到的内容具有可解释性。 可解释性人工智能(Explainable AI)是AI的前沿研究方向之一,聚焦于用系统性和可解释的方式呈现人工智能所学习到的复杂逻辑,让人工智能的预测依据更好地被人类理解。人工智能药物设计研究的重点之一也是如何针对性地开发了更符合化学背景、更易于解读的模型。在Attentive FP中,研究人员使用图神经网......阅读全文

蒋华良院士团队开发可解释性深度神经网络分子表征模型

  近日,上海科技大学免疫化学研究所特聘教授蒋华良院士团队在《Journal of Medicinal Chemistry》发表封面文章“Pushingthe Boundaries of Molecular Representation for Drug Discovery with the Gra

蒋华良,李洪林等PNAS获研究新技术

  来自华东理工大学,大连理工大学,中科院上海药物研究所等处的研究人员发表了题为“Free energy landscape for the binding process of Huperzine A to acetylcholinesterase”的文章,研发出了配体-受体结合自由能全景

上海药物所蒋华良院士荣获“安捷伦思想领袖奖”

  分析测试百科网讯 2019年9月19日,安捷伦思想领袖奖颁奖典礼暨创新药物研发研讨会在中科院上海药物研究所隆重举行。迄今为止,全球范围内已有46位科研人员获得这个奖项。安捷伦将第47个“安捷伦思想领袖奖”颁发给中国科学院上海药物研究所蒋华良院士,以表彰蒋华良院士在原创药物研发以及糖类药物研究领域

蒋华良院士,人工智能结合DNA编码开发创新药

  阿尔脉生物牵手再鼎医药  2021年3月12日,再鼎医药与阿尔脉生物科技有限公司(以下简称”阿尔脉生物”)签订新药发现合作协议。根据协议,阿尔脉生物将利用其人工智能(AI)技术、大数据和其独特的Intelligence DNA编码化合物库(iDEL)平台,以及相关设计、合成和筛选技术,与再鼎医药

睡在实验室里的院士:拼命三郎蒋华良经历了什么

“做科研,就要耐得住寂寞,不要害怕坐冷板凳。我们在前面为年轻人铺路,摇旗呐喊,希望能有越来越多的人参与进来,为中国科研发展献计献力、奉献一生。”他是中科院院士,中国科学院上海药物研究所学术委员会主任;他也是国家杰出青年基金获得者,曾任科技部“973”计划首席科学家、科技部“863”计划“生物和医药技

蒋华良等离子通道结构功能研究与药物设计获进展

  GPCR和激酶等靶标存在较为明确的内源性配体结合口袋,其激动剂类药物一般是作用于该口袋,在一定程度上取代(模仿)内源性激动剂的功能。针对 GPCR和激酶开展的基于结构的药物设计已有很多成功案例。与这些受体和激酶不同,电压门控通道是被电压激活,没有明确的常规内源性配体结合口袋。确证激动剂的作用

蒋华良研究组合作发表最新PNAS文章:蛋白互作界面预测

来自中科院上海药物研究所,美国莱斯大学的研究人员报道了最新研究成果,在可药性蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)界面预测与识别计算方法发展方面取得重要进展。这一研究成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上,文章的通讯作者是上海药物研究所蒋华良研究员,以及莱斯大学José N. Onuchic博

讣告-|-著名药学家、中国科学院院士蒋华良先生逝世

讣告著名药学家、中国科学院院士、中国民主同盟盟员、中国科学院上海药物研究所原所长、研究员蒋华良先生因病医治无效,于2022年12月23日15点54分在上海逝世,终年57岁。蒋华良先生治学严谨、学识渊博、肩负重任、攻艰克难,把全部精力奉献于药物科学基础研究和新药发现,积极推动中国药物科学发展。他一生潜

上海药物所研究员蒋华良解读2013年诺贝尔奖

  为深入解读2013年诺贝尔奖的成就对当前自然学科发展的贡献,激发公众对科学的兴趣和关注,鼓励更多科研人员发挥探索和创新精神,上海市科协于12月5日至12月10日在上海科学会堂二楼卢浮宫举办了三场报告会,由相关领域的科研一线科学家分别解读2013年诺贝尔“物理学奖”、“生理学奖”和“化学

蒋华良、王明伟合作发表Nature子刊文章获突破性进展

  《自然-通讯》于7月31日在线发表了中国科学院上海药物研究所蒋华良课题组和王明伟课题组与美国南加州大学Raymond C. Stevens、Scripps研究所Patrick Griffin和Bridget Carraghe、荷兰阿姆斯特丹自由大学Chris de Graaf和上海科技大学iHu

蒋华良院士留给人间最后一份礼物:新冠口服药VV116诞生

  走过三年艰辛,一朝终获首肯——1月29日,经国家药监局应急审评审批,1类创新药民得维(VV116)附条件获批上市了!  这是一款上海自主研发的口服小分子新冠病毒感染治疗药物,由中科院上海药物所、上海君实生物等联合研发,上海旺实生物医药科技有限公司持有,由上海迪赛诺生物医药有限公司作受托生产。这意

多任务深度神经网络建立药物调控激酶谱的预测分析方法

  蛋白激酶(protein kinases)是细胞功能的关键调节分子,是生物体内最大且功能最多样的基因家族之一。因此,激酶是开发治疗癌症、炎症、糖尿病、心血管疾病和阿尔兹海默症等相关疾病药物的重要靶标。然而,由于激酶家族蛋白质(特别是催化域)结构的高度保守性,给高效选择性激酶抑制剂的开发带来了巨大

晶体材料科学家蒋民华院士逝世

1935年8月16日—2011年5月6日,享年76岁  著名晶体材料科学家、教育家,中国科学院院士,中国共产党的优秀党员,第九届全国政协委员,第十届、十一届全国人大代表,山东大学终身教授蒋民华因病医治无效,于2011年5月6日凌晨4时56分在济南逝世,享年76岁。   蒋民华院士遗

“知识分子的优秀代表”蒋筑英

作为中国科学院长春光机所原研究室代理主任,蒋筑英曾为新中国填补了光学设计评价领域的科学实践空白。今天,新时代的“蒋筑英们”拓展其研究成果给航天器“擦亮眼”,继承他刻苦钻研、任劳任怨的精神品格,为祖国的科研事业默默奉献着。 蒋筑英1962年从北京大学物理系毕业,随后考取了我国著名光

蒋民华院士获得亚洲晶体生长与晶体技术奖

5月22日至24日,第四届亚洲晶体生长与晶体技术会议(CGCT—4)在日本仙台召开。我国晶体生长与晶体材料分会理事长、山东大学晶体材料国家重点实验室蒋民华院士在会议上获得亚洲晶体生长与技术协会所颁发的最高奖励——晶体生长与晶体技术奖(CGCT Award)。 在CGCT—4开幕式上,日本晶体学会前主

人工智能将成药物研发关键工具

  “AI(人工智能)技术应用于药物研发已经引起研究院所和制药行业高度重视,AI开始赋能药物研发的靶标发现和确证、药物先导化合物的发现和优化、药物药代和毒性评价等各个阶段,将成为未来药物研发的关键核心技术之一。”7月12日,中国科学院院士、中国科学院上海药物研究所研究员蒋华良在2022《理解未来》科

华大智造蒋慧:做测序领域智能制造的领跑者

华大智造COO、深圳华大生命科学研究院执行副院长蒋慧博士  天书已谱好,我们是否就安全了?  人类基因组计划始于1990年,美国、英国、法国、德国、日本和我国科学家共同参与了这一预算达30亿美元的计划。截止到2003年,人类基因组计划的测序工作已经完成。至此,人类的基因这本“天书”也谱写完成。这一伟

华大智造蒋慧:做测序领域智能制造的领跑者

华大智造COO、深圳华大生命科学研究院执行副院长蒋慧博士 天书已谱好,我们是否就安全了? 人类基因组计划始于1990年,美国、英国、法国、德国、日本和我国科学家共同参与了这一预算达30亿美元的计划。截止到2003年,人类基因组计划的测序工作已经完成。至此,人类的基因这本“天书”也谱写完成。这一伟大的

羟乙基淀粉分子量及分子量分布表征

羟乙基淀粉(Hyroxyethyl Starch, HES)是一种非离子型淀粉改性产物。目前,被认为是最为良好的血浆代用品,在医学领域常作为失血性休克的治疗和血液的稀释剂等以维持血液胶体渗透压作用。因其独有的特性及功能,近年来,羟乙基淀粉再次成为人们关注的焦点。 HES的分子量及分子量的分布无疑

北大蒋争凡最新综述:接头分子研究进展

  科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英国的SA,日本的《科技文献

《中国科学报》药物设计新方法可预测药效

  3月5日,《中国科学报》记者撰文,介绍了我校课题组与美国Rice大学José N.Onuchic课题组合作,在药物设计理论计算新方法发展研究中获得重要成果的情况,全文转载如下:   本报讯(记者黄辛)近日,中科院上海药物研究所蒋华良课题组、华东理工大学李洪林课题组和美国Rice大学José

09候选院士最新PLoS-Biology文章

  摘要: 记者报道,09候选院士中科院上海生科院上海药物研究所蒋华良课题组和神经科学研究所徐天乐课题组在《PLoS Biology》上联合发表了关于离子通道门控机制研究的论文(PLoS Biology, 2009, 7: e1000151),Inherent Dynamics of the Aci

蒋庆华教授PNAS文章:rs763361变异-减少CD226表达

  CD226作为激活自然杀伤细胞的启动子,在多发性硬化症(Multiple Sclerosis,MS)个体中显著低表达,而人类遗传研究识别出CD226基因的rs763361变异能够增加多发硬化风险。但是,迄今仍不清楚rs763361是否能够调控CD226基因表达,进而影响自然杀伤细胞活性。  来自

大昌华嘉将召开最新颗粒表征技术研讨会

  尊敬的__________________________:   您好!   大昌华嘉商业(中国)有限公司将于2011年11月1日在清华大学化学馆301报告厅与清华大学化学系徐柏庆教授课题组联合举办“最新颗粒表征技术研讨会”和“β亚基介孔分子筛的合成,表征及催化学术讲座”。   此次会议分

瑞士华嘉颗粒表征研讨会北京站即将召开

  美国麦奇克有限公司(Microtrac Inc.)是世界上最著名的激光粒度研究和制造厂商,自2004年底进入中国市场以来,其极高的性价比,在材料科学,石油石化,冶金地质等领域享有很高的声望。   瑞士华嘉公司(SiberHegner China)是一家著名的国际贸易集团,总部位于瑞士的苏黎世。

上海药物所蛋白质折叠计算模拟研究取得进展

  在生物体系中,蛋白质通过折叠成特定的三维结构发挥功能。这种折叠过程可能受到不同因素的影响,如配体结合、聚合状态等。充分理解蛋白质折叠过程对于药物分子设计、蛋白质突变所导致致病机理的预测、深入了解细胞功能以及进化都至关重要。大规模计算机模拟有潜力从原子水平捕捉整个蛋白系统的动态过程,但是

上海药物所靶标发现技术取得突破

中科院上海药物所蒋华良研究员与大连理工大学力学系王希诚教授合作,针对寻找药物作用新靶标的需求,带领博士后李洪林和高振霆等,发展了以活性小分子为探针、搜寻潜在结合蛋白质的“反向分子对接”方法,相关结果发表在Nucl. Acids Res. (2006, 34, W219-224),并建立了相应的公共网

张江药物实验室:勇走新药研发长征路

  一个具有全球影响力的药物实验室,该是什么样?原创新药和引领技术,都拿得出手;既是原创新药研发高地,也是药物科学创新中心。前天签约成立的张江药物实验室,显然从一开始便下定决心要干大事儿!对于呼唤“药神”的老百姓而言,最重要的事莫过于“研发老百姓吃得起、疗效好、副作用小的原创新药”。记者获悉,张江药

精确表征分子筛的辨识、演化和酸性

  近日,大连化物所催化基础国家重点实验室固体核磁共振及前沿应用研究组(510组)侯广进研究员、陈魁智研究员团队与低碳催化与工程研究部催化基础与催化新反应探索研究组(DNL1201组)徐舒涛研究员合作,利用固体核磁共振(ssNMR)及红外技术,精确表征了分子筛中部分骨架配位铝物种的辨识、演化和酸性。

科技致富:一位科学家与一位茶农之间的故事

蒋华良(左)与胡应祥  蒋华良的简历上,写着中国科学院院士、民盟中央常委、中科院上海药物所所长、国家杰出青年基金获得者、国家“863”计划、“973”计划专家组成员、国家自然科学基金委重大研究计划专家组组长等一系列头衔,他在国际期刊上以通讯作者身份发表论文近200篇,授权ZL数十项,4项技术实现成果