昆明动物所发布中国恒河猴基因组并解析猿类结构变异
恒河猴（Macaca mulatta）是生物科学研究和新药研发广泛应用的非人灵长类实验动物。构建一个高质量的恒河猴基因组是开展相关研究的重要基础。当前国际上广泛使用的是印度恒河猴的参考基因组，但这个主要基于二代测序的恒河猴参考基因组组装质量较差，序列碎片化和缺失严重，极大地限制了它的应用，特别是无法用于对基因组结构变异（Structural Variant，SV）的解析。 中国科学院昆明动物研究所宿兵课题组运用三代长读长测序技术（PacBio），并结合多种基因组辅助组装技术（Bionano光学图谱技术、Hi-C互作图谱技术、以及Iso-Seq测序技术）组装了一个高质量的中国恒河猴参考基因组——rheMacS。相比于目前的印度恒河猴参考基因组，rheMacS的基因组质量提高了75倍，并填补了2万多个之前参考基因组存在的缺口（gaps）。另外，研究人员共采集了10种中国恒河猴的组织进行Iso-Seq和RNA-Seq测序，产生了......阅读全文
昆明动物所发布中国恒河猴基因组并解析猿类结构变异
恒河猴（Macaca mulatta）是生物科学研究和新药研发广泛应用的非人灵长类实验动物。构建一个高质量的恒河猴基因组是开展相关研究的重要基础。当前国际上广泛使用的是印度恒河猴的参考基因组，但这个主要基于二代测序的恒河猴参考基因组组装质量较差，序列碎片化和缺失严重，极大地限制了它的应用，特别是
NSR：人脑关键基因，转移给猴子变聪明猴？
人类智慧的出现是进化过程的一个重大节点，是人类数百万年前开始冲刺的结果，因此我们开始直立行走、使用工具、创造文明。但人类的近亲——灵长类还停留在树上。 基因编辑 为了探寻其中的差异，中科院昆明动物所和国内外多个研究团队（昆明理工大学、昆明医学院第一附属医院以及美国北卡罗来纳大学等）合作，首次
昆明动物所等通过动物DNA鉴定发现中国金丝猴新种群
金丝猴属于灵长目疣猴亚科，包括滇金丝猴、川金丝猴、黔金丝猴和越南金丝猴，其中前三个种类都分布在我国境内。2010年初，野生动植物保护国际（FFI）在缅甸克钦邦东北部发现一个新的金丝猴物种。但由于采集的是动物尸体，不能肯定该新物种是否依然存在。2012年3月，怒江州林业系统工作人员再次在怒江州境内
昆明动物所等破译山羊和绵羊基因组
在“973”项目的支持下，中国科学院昆明动物研究所研究员王文领导的团队继2013年解析山羊基因组揭示羊绒生长的基因基础之后，近日再次携手华大基因研究院、澳大利亚联邦科学与工业研究组织等国内外机构“破译”了绵羊基因组。至此，所有重要家畜动物的基因组密码全部告破。 山羊和绵羊是反刍动物的典型代表动
昆明动物所等揭示金丝猴属物种高海拔适应遗传机制
金丝猴属(Rhinopithecus)属于灵长目，猴科，疣猴亚科，包括5个近缘物种：滇金丝猴（R.bieti）、怒江金丝猴(R.strykeri )、川金丝猴(R. roxellana)、黔金丝猴(R. brelichia)和越南金丝猴(R. avunculus)。所有物种均被列为红色物种名录濒
昆明动物所等家养动物线粒体DNA基因组学研究取得进展
近年来，家养动物线粒体DNA（mtDNA）基因组学得到了迅速发展，积累了大量的mtDNA序列数据。与此同时，一些问题随之浮现出来。除了数据质量存在缺陷（Shi, et al. 2014. Mol Ecol）之外，mtDNA世系划分标准不一，世系命名混乱的问题也已开始干扰家养动物mtDNA的研究工
昆明动物所等在蝴蝶基因组研究中取得进展
蝴蝶因其在自然界中多姿多彩的变异，自达尔文时期以来就是进化研究的好材料。然而，长期以来其高杂合的基因组难以解析，对其也缺乏有效的遗传操作技术体系，极大地限制了蝴蝶在进化学研究的深入广泛应用。 为了使蝴蝶成为研究宏观形态进化遗传基础的新模式生物，中国科学院昆明动物研究所的基因起源课题组与深圳华大
昆明动物所等提出黑白仰鼻猴冬季家域选择的光照假说
沐浴在阳光中的黑白仰鼻猴 冬季来临时，一些恒温动物从高纬度地区迁徙到低纬度地区，一些从高海拔地带垂直迁徙到低海拔地带，还有一些选择了冬眠等。然而，世界上分布区海拔最高的非人灵长类动物——黑白仰鼻猴（滇金丝猴），却选择在多年家域的中高海拔段地带越冬。 针对黑白仰鼻猴的这一“反常”行
首个新冠疫苗动物实验数据出炉－恒河猴模型中安全有效
国内已有2家机构的新冠病毒灭活疫苗进入I期临床试验阶段，它们的有效性和安全性如何？ 4月20日，由中国医学科学院秦川团队领衔的团队，在预印本论文平台bioRxiv上传研究文章。这是目前为止公开报道的第一个新冠病毒（SARS-CoV-2）疫苗动物实验结果。 该疫苗可在小鼠、大鼠和非人类灵长类动
昆明动物所举办GLP培训
4月13日上午，中科院昆明动物研究所举办GLP培训会，研究所生物产业化中心及实验动物中心相关工作人员参加了培训。 生物产业化中心副主任杨启成博士就GLP的理念、管理准则及目标等进行了深入浅出的讲解。对在GLP运行中可能出现的问题、数据可追溯的重要性作了详细解释。同时，生物产业
昆明动物所等发布最新版树鼩基因组注释
树鼩是一种与实验大鼠差不多大小的小型哺乳动物，是灵长类的近亲。由于其繁殖周期短（约6周），饲养成本低，单胎产仔数较高（每胎2-5只）等特点，在某些方面有望替代非人灵长类用于生物医学研究和应用。目前，树鼩已被用于多种感染性疾病模型创建，是研究视觉系统与功能的很好的动物。中国科学院昆明动物研究所研究
关于血型的进化的内容介绍
猿类红细胞有ABO抗原,血清中有相应的抗体,唾液中有A、B、H物质。狒狒和大多数猴类的红细胞没有ABO抗原，但唾液中有A、B、H物质。猿、狒狒和猴的唾液中有 Lewis物质。这些事实说明在进化过程中唾液中的ABO抗原出现在先，红细胞上的ABO抗原出现在后。 猿类红细胞有MN血型。豚鼠抗恒河猴红
云南元谋发现迄今已知最早的长臂猿化石
中国西南（云南元谋）新发现的小型猿类化石提供了已知最早长臂猿的证据。长臂猿科现存20种，主要生活在中南半岛的亚洲热带、亚热带地区，包括我国华南和东南亚。在我国境内现存仅4-6种。然而，此类化石稀少，多数发现于华南和东南亚不老于200万年前的洞穴地点中。云南元谋新发现的被命名为元谋小猿（Yuanm
昆明动物所研究团队在蝴蝶基因组大小进化方面获进展
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。 中国科学院昆明动物研究所科研团队在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其
昆明动物所阐明多能干细胞基因组稳态维持新机理
多能干细胞（Pluripotent stem cells，PSCs）因在体外具无限增殖和分化为不同类型细胞的潜能，在再生医学领域中颇具应用前景，也成为目前临床上最具潜能的成药细胞。PSCs制备过程中的标准化、规模化及细胞质量稳定性是走向临床应用的先决条件，但人PSCs在体外扩增培养过程中，易出现遗传
昆明动物所揭示家养动物高原适应遗传机制
青藏高原低氧低压、寒冷、强紫外线等极端环境塑造了其独特的生物多样性资源。家养动物高原适应性状遗传机制的解析，不仅能够研究环境与遗传发育的相互作用机制，也有助于青藏高原动物遗传资源的保护和长远开发利用，为高原家畜育种、提高家畜的生产性能和品种改良提供重要信息和理论指导，进一步促进青藏高原地区生态文
昆明动物所人类早期逆境猕猴模型研究取得进展
无论是在啮齿类还是在非人灵长类动物身上，母婴分离常常被用来模拟人类在童年时期经受的不幸打击（早期逆境）。母婴分离能够导致个体应激系统功能紊乱和异常的行为。对于人类，这种负面影响在个体成年之后仍然明显存在，但是对于啮齿类，同样的负性影响在一定条件下能够部分甚至全部被逆转。 为了
云南元谋发现最早的长臂猿化石
中国西南（云南元谋）新发现的小型猿类化石提供了已知最早长臂猿的证据。现今，长臂猿科现存20种，主要生活在中南半岛的亚洲热带、亚热带地区，包括我国华南和东南亚。在我国境内现存仅4-6种。然而，此类化石非常稀少，多数是发现于华南和东南亚不老于200万年前的洞穴地点中。云南元谋新发现的被命名为元谋小猿（Y
灵长类动物结构变异的机制
2013年度基因组生物学大会(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美国纽约冷泉港实验室召开。这是基因组学领域最大的会议之一，吸引了多个著名研究所的大牛参加。会议主题包括高通量基因组学和遗传学、复杂性状的遗传学、功能和癌症基因组学、计算基因组学、进化基因组学以
昆明动物所等在灵长目疣猴亚科分子系统学研究中取得进展
灵长目疣猴亚科（Colobinae）物种是经历快速辐射进化和近期物种形成事件的典型类群，围绕其所包含的各属之间的系统发育关系一直是国内外研究的热点。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、云南大学于黎研究员和博士研究生王晓萍结合模式生物基因组信息，系统筛选得到44个新的单拷贝核基因内含子片段
昆明动物所揭示新的肿瘤靶标
肿瘤目前是世界人口死亡的第一原因。中国每年因肿瘤死亡的人数超过200万。除了传统的放化疗等方法外，靶向治疗是肿瘤临床的研究热点及发展趋势。该治疗方法是通过药物选择性抑制肿瘤细胞特异的分子靶标的功能，来抑制肿瘤生长，而不杀伤或较少损伤正常细胞。相比传统放化疗方法，靶向治疗具有耐受性好、毒副作用轻微
昆明动物所完成“一三五”国际评估工作
11月18日至20日，秋意浓浓，阳光暖人。 中国科学院组织国际专家对中科院昆明动物研究所进行了“一三五”现场诊断评估。评估专家组由来自英国、加拿大、法国、澳大利亚、美国的9位专家组成，王小凡教授任专家组组长。 中国科学院发展规划局副局长张凤代表中科院向远道而来的专家致辞；中国科学院副院长张亚
北京基因组所杨运桂研究员到昆明动物所进行学术交流
1月14日上午，应中国科学院、云南省动物模型和人类疾病机理重点实验室陈策实研究员邀请，中国科学院北京基因组研究所杨运桂研究员到昆明动物研究所进行学术交流，并作了题为N6-methyl-adenosine (m6A) in RNA: An Old Modification with A Nov
昆明动物所马普小组为新基因起源绘制全基因组蓝图
新基因的不断出现是生物进化的重要基础。昆明动物所马普青年科学家小组在王文研究员的领导下与国际一些研究小组合作，已陆续报道了包括 “sphinx”、“猴王”、“Hun”、BSC4等等一系列新近产生的新基因。这些研究成果表明新基因的起源是一个重要的生物学现象。但在全基因组水平，具体有哪些重要的新基因起源
昆明动物研究所通过实验动物饲料生产认证
11月29日，昆明市科学技术局为昆明动物研究所颁发实验动物饲料生产许可证，许可生产的七种饲料包括：实验猴繁殖、维持饲料，树鼩繁殖、维持饲料，大小鼠繁殖、维持饲料，实验兔维持饲料。 根据实验动物饲料生产许可证的认证程序，首先七种饲料要通过实验动物饲料检测部门的抽样检测，且各项营
昆明动物所转基因动物研究取得新成果
由中国科学院昆明动物研究所季维智研究员领导的研究小组关于非人灵长类转基因动物的研究论文Transgenic rhesus monkeys produced by gene transfer into early-cleavage–stage embryos using a simi
昆明动物所等揭示动物适应性进化的第二套基因组学机制
动物适应青藏高原极端环境的过程中，逐渐形成了耐低氧、耐高寒、耐粗饲料等复杂性状的适应性。以往针对高原适应遗传机制的研究大多数局限在动物自身遗传物质的变异，很少了解与动物宿主共进化的第二套基因组（即肠道微生物组）的重要贡献，特别是能量代谢方面。 中国科学院昆明动物研究所研究员施鹏领导的团队和中国
昆明动物所郑永唐组等发现平顶猴对HIV1易感的分子机制
宿主病毒限制因子APOBEC3、TRIM5α、TRIMCyp、Tetherin、SAMHAD1及Mx2等可直接作用于HIV-1等逆转录病毒，从而限制病毒在宿主细胞中的复制。对宿主限制因子的研究有助于阐明HIV-1复制的分子免疫机制，构建合适艾滋病的动物模型，探究艾滋病药物新靶点和治疗新策略。中国
昆明动物所创建HIV1感染北平顶猴艾滋病动物模型
近日，中国科学院昆明动物研究所郑永唐课题组用HIV-1病毒标准株HIV-1NL4.3感染北平顶猴，首次创建了HIV-1感染北平顶猴艾滋病模型，该研究成果发表在Science Bulletin上。HIV-1在北平顶猴体内呈低水平持续性复制和形成潜伏感染 长期以来，缺乏直接感染HIV的合适动物模型
拿下灵长类基因组“矿藏”挖掘主导权
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502057.shtm6月2日凌晨，《科学》以研究专刊形式在线发表8篇论文、《科学进展》在线发表2篇论文，集中报道了我国科学家发起并主导的灵长类基因组计划取得的阶段性突破。该计划由中国科学院昆明动物研究所（