MolCellProteomics：好的样品决定好的研究
有效的疾病诊断和治疗需要系统的基础研究，而这些研究通常依赖于生物学样本的质量。 因此，准确的结果依赖于生物样品的可靠性，这也将是科学界最关注的问题。 根据亚利桑那州立大学研究人员Chad Borges的说法，样品的可靠性往往是最容易被忽视的。“文献中发现了很多生物标志物（疾病的早期指标），但很少有能被后续的研究或实践证实。其中最大的原因在于我们对这些样品的来源以及完整度并不清楚。（图片来源：Www.pixabay.com） 随着时间的流逝，生物样品非常容易受到变化，例如从冷藏环境中取出时会出现降解。降解的样品可能会在研究中产生虚假结果。确保样品已得到妥善处理是认真研究的第一步，该研究必须满足可靠性和可重复性所必需的高标准。为了解决这些问题，Borges和他的同事设计了一种高度灵敏的测试，可用于建立血浆和血清的完整性。相关结果发表在《Molecular and Cellular Proteomics》杂志上。该测试依赖于精......阅读全文
大化所等在蛋白质磷酸化规模化分析研究中获新进展
近日，中科院大连化学物理研究所研究员邹汉法带领的研究团队（1809组）与华中科技大学教授薛宇和第二军医大学王红阳院士合作，在人类肝脏蛋白质磷酸化的规模化分离鉴定研究方面取得新进展，相关研究成果发表在蛋白质组学领域著名刊物上 (Mol. Cell. Proteomics，2012，
Cell－Stem－Cell
|泛素连接酶HECTD1通过协调核糖体大小亚基的组装来调控造血干细胞的再生能力 造血干细胞（Hematopoietic stem cell， HSC）具有自我更新和分化的功能。在正常生理状态下，HSC处于休眠状态，其蛋白合成速度受到严格地调控并维持在较低水平。当机体受到损伤时，HSC 能够迅速
1mol/L精胺（Spermine）配制方法
溶解3.48g精胺于足量的水中，使终体积为10ml。分装成小份贮存于-20℃。
1mol/LCaCl2的配制
用20ml0.01mol/L乙酸钠溶液（pH5.2）溶解3.09gDTT，过滤除菌后分装成1ml小份贮存于－20℃。
1mol/LMgCl2的配制
在800ml水中溶解203.3gMgCl2?6H2O，用水定容至1升，分装成小份并高压灭菌备用。
QTRAP代表文献回顾
生物分子发表的代表性文献 QTRAP：同时具有三重四极杆和线性离子阱性能的独一无二的LC/MS/MS系统 QTRAP系统最早在ASMS 2002上，作为第一台商用的线性离子阱发布，是世界上唯一的线性离子阱和三重四极杆的复合串联液质联用系统。QTRAP具有独一无二的能力，可以运行蛋白
《Nature》：新方法提高单细胞蛋白质组学质谱定量准确度
单细胞蛋白质组学在蛋白丰度检测、转录修饰和翻译后修饰方面填补了单细胞转录组学的空白。单细胞蛋白质组学质谱（SCoPE-MS）是近年来兴起的一种定量分析多功能单细胞蛋白质组的方法，这种方法采用同位素标记和载体蛋白质组学来分析单个细胞【1】。同位素标记具有相同质量的化学标签，其中包含了独特的质量条码
Journal－of－Proteomics：质谱分析尿液诊断早产儿呼吸道疾病
来自v . i Kulakov产科，妇科，围产期学研究中心和莫斯科物理技术研究所的专家设计了一种方法，就是使用尿蛋白质组来诊断新生儿的状况。在未来，这种尿蛋白质组诊断方法不仅能帮助专家检测疾病，并且能控制康复期的治疗反应不会引起疼痛。该研究结果已发表在《Journal of Proteomics
PROTEOMICS：OGalNAc糖基化修饰蛋白质的系统发现
近日，上海交通大学系统生物医学研究院张延课题组在国际知名蛋白质组学研究期刊PROTEOMICS上发表题为《Systematic identification of the protein substrates of UDP-GalNAc: polypeptide N-acetylgalactos
一小时－DDA－鉴定－DIA－定量－4000－个－Hela－蛋白（二）
500 ng Hela 细胞裂解液用相同的色谱柱，相同的色谱梯度，将 QE HF 切换至 DIA 扫描模式进行 3 次 DIA 数据采集。在一次扫描循环中，目标母离子质核比范围 400–1000，四极杆的隔离窗口为 12 Da，包含 50 次 MS/MS 扫描。每一张 MS/MS 谱图中
基于QOTqIT质谱系统的蛋白质组学快速鉴定（四）
A: 1 μg HeLa结果比较; B: 50 ng HeLa结果比较. 以每项最高值为100% 3 讨论 随着“一小时酵母蛋白质组”全覆盖的实现, 蛋白质组深度覆盖研究迎来新的时代[6]. 在复杂样本蛋白质组研究中, 传统方法需要进行二维分离、分级的方式简化样本、充分分离, 这样不仅操作费力,
a－pipeline－for－the－identification－of－intact－Nglycopeptides（七）
Complementary ion information provided by HCD- and CID-MS/MS. Both HCD- and CID-MS/MScould be used to optimize the glycopeptide identification. Rece
Cell－to－Cell－Adhesion－Signaling
Interactions between cells responsible for cell to cell adhesion also can communicate signals into the cellular interior, often involving interactions
Mol－Metabol：爷爷肥胖会影响孙子健康
目前有超过1400万澳大利亚人超重或肥胖，研究人员称父母肥胖对未来几代人都有影响。这是对肥胖研究的一项重要突破，父亲的新陈代谢变化健康会影响后代，这不仅会影响自己孩子的健康，也会影响孙子的健康。 研究人员发现雄性老鼠肥胖时交配生下的小鼠以及小鼠的后代患代谢性疾病的风险会增高。 Catheri
－Mol－Psychatr：基因治疗小头症取得进展
东京医科齿科大学日前发表公报称，其研究人员参与的一个国际团队在动物实验中弄清了先天性小头症的发生机制，并通过基因治疗，部分恢复了小头症实验鼠脑的尺寸和智力。 由于遗传原因，每3万至5万名婴儿中就有1人患小头症，患者脑的尺寸很小，并且伴随智力障碍。近年来，与小头症有关的致病基因相继被发现，PQB
EMBO－Mol－Med：防止脂肪肝的妙招
近日，慕尼黑亥姆霍兹中心的科学家们发现一项新内容，当人们饥饿时在人体分子水平上会发生什么。德国糖尿病研究中心（DZD）和德国癌症研究中心（DKFZ)的研究人员表明去除食物中产生的某些蛋白质可以调节肝脏的新陈代谢。研究结果发表在《EMBO Molecular Medicine》杂志上。 越来越多
10mol/L－乙酸铵的配制
把770g 乙酸铵溶解于800ml水中，加水定容至1L后过滤除菌。
0.5mol/LEDTA(pH8.0)的配制
在 800ml 水中加入 186.1g 二水乙二胺四乙酸二钠（EDTA-Na?H2O），在磁力搅拌器上剧烈搅拌，用NaOH调节溶液的pH值至8.0，然后定容至1升，分装后高压灭菌备用。
1mol/L亚精胺（Spermidine）配制方法
溶解2.55g亚精胺于足量的水中，使终体积为10ml。分装成小份贮存于-20℃。
杂质蛋白鉴定与定量的完美结合—Hi3分析方法
液质数据中，不但含有蛋白药序列表达是否正确的肽图信息，其它杂质蛋白同样可以被挖掘出来。然而，单纯的杂质蛋白鉴定却又是不够远远的，其确切的含量信息同样至关重要。沃特世PLGS软件可以在肽图液质数据中，进一步鉴定其中的杂质蛋白，并其相对含量信息进行分析。 一、“顺便”完成的杂质蛋白鉴定与相对定量使用相应
蛋白质组学发文章的四重境界（二）
译文：细胞+基因芯片+iTRAQ+WB+功能验证。遥想当初，很多老师意气风发砸钱做芯片，数据堆积如山，一脸懵逼。然而如今世风日下，基因芯片灌水发文章很难上5分，怎么将课题继续下去？其实芯片数据结合蛋白质组学可以玩出新花样，比如下面这篇：Cheng DD, Yu T, et al. MiR-542-5
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的－DIA－解析3
结果显示，从 DIA 数据中提取、定量到 6401 条可信的磷酸化肽，占谱图库磷酸化肽总数（6505 条）的 98.4%（图 5）。磷酸化肽的丰度和离子化效率普遍较低，本实验如此高的解析成功率表明，基于 Orbitrap 的 DIA 数据具有极高的谱图质量和出色的灵敏度。 图5. DIA可
Cell－Thawing/Cell－Freezing－Protocol
Freezing Cells:Cells should be growing well or known to be in log phaseCount, collect and pellet cells in a 15mL test tubeResuspend in freezing media
Cell－Thawing/Cell－Freezing－Protocol
Freezing Cells:Cells should be growing well or known to be in log phaseCount, collect and pellet cells in a 15mL test tubeResuspend in freezing media
中国科大长江特聘教授PNAS新文章
八月三日，中国科技大学博士生导师姚雪彪教授带领的研究小组，在《PNAS》发表一项研究成果，题为“Dynamic localization of Mps1 kinase to kinetochores is essential for accurate spindle microtubule at
MRM－Proteomics同Biodesix合作开发蛋白质组肺癌精准诊断法
蛋白质组学领头公司MRM Proteomics和分子诊断公司Biodesix于近期签署了一项合作协议。根据协议条款，MRM Proteomics将授予Biodesix使用其专有iMALDI技术的权利，以进一步推进其基于血液的肺癌诊断。在此之前，Biodesix的测试菜单包括GeneStrat®基因组
蛋白质组学研究－可投哪些期刊？
蛋白质作为功能的直接行使者，已经被科研工作这广泛应用于不同领域中，目前蛋白组学有很多优秀的科研成果，在各个领域及期刊上发表，其中也不乏CNS在内的顶级期刊。那我们的蛋白组学文章可以投哪些期刊呢？了解已发表文章的情况可以帮助我们很好的解决这个问题。这里，我们以“Proteomics”为关键词，
Mol－Psych：睡眠质量取决于你的基因？
2014年12月2日，国际顶尖精神病学杂志《分子精神病学》（Molecular Psychiatry）发表的一项新研究表明，你每晚睡多长时间在一定程度上可能取决于你的基因。 该研究共同作者、哈佛医学院睡眠研究者和医学副教授Daniel Gottlieb博士指出：“睡眠模式受遗传差异的影响。这项
Mol－Cancer－Ther：改变癌细胞代谢的抗癌新药
Manchester科学家们发现一种新的药物，能抑制肿瘤的生长，并且将其与放射疗法结合后其有效性得到改进，这表明其可以在临床中有效治疗肿瘤。 许多肿瘤都缺氧，并且肿瘤能量生成过程会发生变化，从有氧呼吸切换到糖酵解并生成乳酸作为副产物。 为了防止乳酸对肿瘤细胞造成毒性，这种乳酸必须被单羧酸转运
8mol/L乙酸钾（potassium－acetate）配制方法
8mol/L乙酸钾（potassium acetate）：溶解78.5g乙酸钾于足量的水中，加水定容到100ml。