细胞RNA实时成像或将“成为可能”?!

结合并激活荧光染料的适体荧光 RNA(FR)已用于对丰富的细胞 RNA 种类进行成像。然而,诸如低亮度和具有不同光谱特性的染料 / 适体组合的有限可用性的局限性,限制了这些工具在活的哺乳动物细胞和体内的使用。 2019 年 9 月 23 日,华东理工大学朱麟勇及杨弋共同通讯在 Nature Biotechnology 在线发表题为 Visualizing RNA dynamics in live cells with bright and stable fluorescent RNAs 的研究论文,该研究开发了 Peppers,一系列单体,明亮且稳定的具有荧光 RNA,其最大发射范围从青色到红色。Peppers 可以对活细胞中的各种 RNA 进行简单而强大的成像,而对目标 RNA 的转录,定位和翻译的干扰影响非常小。 定量分析单个细胞中蛋白质及其信使 RNA 的水平表明,翻译受正常的酶动力学控制,但具有明显的异质性。该研......阅读全文

细胞化学词汇RNA运输

中文名称:RNA运输英文名称:RNA trafficking定  义:将RNA引导到细胞的特定区域。细胞内的RNA运输对细胞的生理功能至关重要。核内RNA运输影响RNA的加工成熟和核输出;胞质RNA运输影响RNA的定位、运输和基因表达的水平。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二

细胞化学词汇RNA复制

中文名称:RNA复制外文名称:RNA replication定       义:RNA复制是以RNA为模板合成RNA的过程,是除了逆转录病毒以外的其他RNA病毒的复制方式。有些生物,像某些病毒的遗传信息贮存在RNA分子中,当它们进入宿主细胞后,靠复制而传代,当它们以RNA模板时,在RNA复制酶作用下

细胞化学词汇RNA构象

中文名称:RNA构象英文名称:RNA conformation定  义:RNA分子的空间结构,构象改变并不导致共价键的断裂和生成。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

培养细胞中RNA检测

实验概要掌握培养细胞中RNA的检测方法。实验步骤1.制胶(1%):  琼脂糖 2.5g    10×Mops缓冲液 25.0ml    H2O 192.0ml2.在微波炉中加热煮沸使胶完全溶于水并灭菌。3.取出胶冷却到60℃,于通风柜中加45ml甲醛,混匀。4.加20μl溴化乙锭,混匀。5.令胶液再

细胞化学词汇​RNA折叠

中文名称:RNA折叠英文名称:RNA folding定  义:新合成的或变性的RNA转变为特定的、成熟的三维结构构象的过程。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学基础信使RNA

信使RNA(mRNA)最早发现于1960年,在蛋白质合成过程中负责传递遗传信息、直接指导蛋白质合成,具有以下特点。 1.含量低,占细胞总RNA的1%~5%。 2.种类多,可达105种。不同基因表达不同的mRNA。 3.寿命短,不同mRNA指导合成不同的蛋白质,完成使命后即被降解。细菌mRNA的平均半

细胞化学词汇RNA干扰

中文名称:RNA干扰外文名称:RNA interference定       义:RNA干扰(RNA interference,RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。分       类:基因沉

细胞化学词汇RNA靶向

中文名称:RNA靶向英文名称:RNA targeting定  义:(1)针对RNA分子设计的一种定向作用技术。包括一些小分子化合物(如抗生素)、反义核酸、反式作用核酶、适配体、干扰小RNA等的应用。(2)由于RNA分子本身具有较大的柔性,能专一地与RNA、DNA和蛋白质相互作用,而成为一种特异的靶向

细胞化学基础转移RNA

转移RNA(tRNA)在蛋白质合成过程中负责转运氨基酸、解读mRNA遗传密码。tRNA占细胞总RNA的10%~15%,绝大多数位于细胞质中。tRNA由Crick于1955年提出其存在,Zamecnik和 Hoagland于1957年鉴定。1.tRNA一级结构具有以下特点:①是一类单链小分子RNA,长

组织/细胞RNA快速提取

 操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)提示: 第一次使用前请先在漂洗液RW瓶和70%乙醇瓶中加入指定量无水乙醇! 操作前在裂解液RLT中加入β-巯基乙醇至终浓度1%,如1 ml RLT 中加入10μl β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的RLT 4℃可放置一个月。1. 组织培养细胞a. 收

细胞化学词汇RNA输出

中文名称:RNA输出英文名称:RNA export定  义:真核生物RNA从细胞核输送到细胞质的过程。游离RNA及其前体是不能直接通过核孔的,需要与许多RNA结合蛋白生成核糖核蛋白复合体,才能输出到细胞质行使功能。不同种类RNA需要不同的结合蛋白。核内的信使核糖核酸在切除内含子后才能输出。应用学科:

细胞RNA的提取方法

(一)细胞总RNA的提取1、6孔板细胞汇合度为90-100%时,取出无菌室,去其上清,用PBS洗两次后,每孔加TRIZOL试剂 1 ml,摇匀,无菌罩内消化3-5 min。2、将各孔内消化好的细胞裂解液吸到一DEPC处理过的1.5 ml EP管中,加新开的氯仿0.2 ml,轻摇15 s。3、室温静置

脂肪细胞RNA提取原理

氯仿是分子量比较大的有机溶剂,在提取RNA时,氯仿可以有效的使有机相和无机相迅速分离。DNA提取过程 有机相中主要是酚和蛋白结合,从而使得蛋白和DNA脱离,DNA进入水相。但是在RNA的提取过程就要避免蛋白和DNA脱离,否则DNA会释放到水相。不管有酚也好,没有酚也好,氯仿本身也对蛋白有变性作用,剧

细胞化学词汇RNA转运

中文名称:RNA转运英文名称:RNA transport定  义:RNA分子从一个细胞区室或区域移动到另一个细胞区室或区域的过程。各类不同RNA(如信使RNA、核小RNA、核糖体RNA和转移RNA)的转运遵循不同的机制。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

真核细胞总RNA的制备(Total-RNA-Isolation)2

Total RNA Isolation Guanidine-based isolation Objective:  To obtain total RNA from zebrafish embryos. Required Materials  Denaturing Solution

真核细胞总RNA的制备(Total-RNA-Isolation)1

从细胞中分离RNA的纯度于完整性对于许多分子生物学实验至关重要。如Northern印迹与杂交分析、寡聚(dT)纤维素选择分离 mRNA,cDNA合成及体外翻译等实验的成败,在很大程度上决定于RNA的质量。RNA分离的最关键因素是尽量减少RNA酶的污染。快速一步法提取总RNA组织及有核细胞在匀浆过程中

新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制

  5月17日,中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文,揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制,为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。  在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪

新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制

5月17日,中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文,揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制,为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪,对于理

新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制

5月17日,中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文,揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制,为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪,对于理

新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制

5月17日,中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文,揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制,为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪,对于理

纯化RNA实验——从培养的细胞中纯化总RNA

实验材料细胞试剂、试剂盒RNA 提取缓冲液变性液水饱和酚仪器、耗材培养皿Falcon 2063 管实验步骤1. 取 1 个细胞已长满的 100 ml 培养皿,吸出培养液,加 2 ml RNA 提取缓冲液,用橡胶刮棒刮下细胞。RNA 提取缓冲液:变性液,20 mlβ-巯基乙醇,0.144 ml2 mo

细胞化学词汇转移信使RNA

中文名称:转移-信使RNA英文名称:ransfer-messenger RNA;tmRNA定  义:一类兼有接受(携带)氨基酸和编码氨基酸的双功能RNA分子。其主要功能是在特定情况下可提前终止蛋白质的生物合成,以免产生不良产物。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇转移信使RNA

中文名称:信使RNA外文名称:Messenger RNA 定       义:信使RNA,中文译名“信使核糖核酸”,是由DNA的一条链作为模板转录而来的、携带遗传信息能指导蛋白质合成的一类单链核糖核酸。以细胞中基因为模板,依据碱基互补配对原则转录生成mRNA后,mRNA就含有与DNA分子中某些功能片

细胞化学词汇双义RNA

中文名称:双义RNA定       义:部分基因的表达需要先进行转录合成出亚基因组RNA,作为mRNA翻译出蛋白质

细胞化学词汇核小RNA

中文名称:核小RNA外文名称:small nuclearRNA定       义:核小RNA是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。

细胞化学词汇时序小RNA

中文名称:时序小RNA英文名称:small temporal RNA;stRNA定  义:一类长度约为22核苷酸的非编码RNA,是微RNA大家族的成员。与生物发育时间顺序调控有关,如早期报道的线虫lin-4和let-7时序小RNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇反式作用RNA

中文名称:反式作用RNA英文名称:trans-acting RNA定  义:通过分子间反应机制起作用的RNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇​RNA衣壳化

中文名称:RNA衣壳化英文名称:RNA encapsidation定  义:RNA被蛋白质衣壳包裹生成RNA病毒的过程。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

总细胞RNA的提取方法

实验概要总细胞RNA的提取在建库过程中,由于cDNA合成这一步将使用通用引物oligo dT,因此在总RNA提取这一步中,提取纯化mRNA不是非常必要的。提取高纯度的总细胞RNA足可以被用作cDNA合成的模板,目前提取RNA的方法很多,也有不少商业化的试剂盒。实验步骤1. TRIZOL法   1)

细胞化学词汇单链RNA

中文名称:单链RNA英文名称:single-stranded RNA;ssRNA定  义:只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA,形成二级结构时,是既有单链、又有双链结构域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科)