新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制
5月17日，中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文，揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制，为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。 在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪，对于理解它们的生物学功能和揭示其机制至关重要。目前，荧光点亮RNA适配体(FLAP)被认为是强有力的活细胞RNA荧光成像工具。其中，RhoBAST是一种表现优异的FLAP成像工具，可以结合并激活一种接触淬灭型罗丹明衍生物TMR-DN，并在RNA的超分辨率成像中表现出优异的性能，但其结合和激活荧光染料的结构机制还不清楚。 研究人员首先应用X射线晶体学解析了RhoBAST与TMR-DN复合物的高分辨率结构，发现RhoBAST折叠成一种四分支结构，整体结构类似于不对称的“A”字形。研究发现，RhoBAST的结构刚性以及半开放的结构口袋的......阅读全文
活细胞RNA成像技术获突破
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/509263.shtm
科学家研发新RNA成像工具
发表在《自然―方法学》上的一项报告介绍了一种用于人体活细胞内目标RNA成像的工具。这种针对RNA探针的被命名为Spinach2的工具，拓宽了可标记RNA的范围，从而更有利于动态定位那些与疾病有关的“有毒RNA”。 Spinach是一种经过设计的RNA复合物，其可以与小型合成分子结
研究人员合成高性能荧光RNA实现活细胞RNA成像
2019年11月5日，华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室杨弋教授等在Nature Biotechnology（《自然—生物技术》）杂志上发表了封面学术论文，题为“Visualizing RNA dynamics in live cells with bright and stable fl
新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制
5月17日，中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文，揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制，为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。 在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪
新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制
5月17日，中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文，揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制，为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪，对于理
新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制
5月17日，中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文，揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制，为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪，对于理
新研究“点亮”荧光RNA成像的结构机制
5月17日，中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《自然-通讯》上发表研究论文，揭示荧光点亮RNA适配体RhoBAST结合与激活荧光团TMR-DN的机制，为理性设计和优化这一重要的FLAP系统提供了机制见解。在活细胞中对生物大分子如蛋白质和RNA等进行时空定位和追踪，对于理
细胞RNA实时成像或将“成为可能”？！
结合并激活荧光染料的适体荧光 RNA（FR）已用于对丰富的细胞 RNA 种类进行成像。然而，诸如低亮度和具有不同光谱特性的染料 / 适体组合的有限可用性的局限性，限制了这些工具在活的哺乳动物细胞和体内的使用。 2019 年 9 月 23 日，华东理工大学朱麟勇及杨弋共同通讯在 Nature B
新成像法能对大脑进行三维RNA分析
瑞典卡罗琳斯卡医学院等机构研究人员开发出一种突破性的显微镜方法，能够以细胞级分辨率对完整的小鼠大脑进行详细的三维RNA分析。发表在最新一期《科学》杂志上的这种名为TRISCO的新方法，有可能改变人们对正常和疾病状态下大脑功能的理解。小鼠大脑图像。图片来源：美国《科学》杂志尽管RNA分析取得了巨大进步
科学家首次实现活细胞RNA标记与无背景成像
图为《自然—生物技术》11月期封面图片。它显示了利用荧光RNA可对单细胞中mRNA的翻译过程进行定量研究。癌细胞中mRNA水平与其编码蛋白质水平之间存在较低相关性，提示癌细胞的翻译调控显著失调，这为癌症的诊疗提供一种全新的思路。 华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室的杨弋、朱麟勇等教授历经7年
Nature子刊：首次实现活细胞RNA标记与无背景成像
生物大分子标记技术是生物分子成像的关键。在科学历史上，人们利用荧光蛋白“点亮”细胞内蛋白质, 实现了生命动态过程中蛋白质分子的可视化。荧光蛋白技术是当代生物科学研究中最重要的研究工具之一；在短短十余年内，其研究即被授予诺贝尔奖。RNA同样具有独特的结构、种类繁多的生物学功能以及复杂的时间空间分
国际首次|我国学者实现活细胞RNA标记与无背景成像
华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室的杨弋、朱麟勇等教授历经7年合作研究，在荧光RNA及活细胞RNA成像领域获突破性进展。他们原创的系列高性能荧光RNA，在国际上首次实现了不同种类RNA在动物细胞内的荧光标记与无背景成像。11月5日，该成果以封面论文形式发表于《自然—生物技术》。 荧光蛋白
Nat－Commun：科学家们首次对心脏中的RNA结构进行成像！
近日，一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中，来自洛斯阿拉莫斯国家实验室等机构的科学家们通过研究揭示了一种特殊类型RNA分子的3-D图像，其对于干细胞重编程至关重要，被称之为基因组中的“暗物质”。图片来源：Los Alamos National Laborat
我国科学家在RNA成像工具研发方面取得突破性进展
在生物大分子中，核糖核酸（RNA）具有重要的生物学功能，也与人类重大疾病的发生和发展密切相关。人们利用荧光蛋白“点亮”细胞内蛋白质，实现了生命动态过程中蛋白质分子的可视化。与蛋白质相比，大部分种类的RNA结构和功能尚未被鉴定，被称为基因组中的“暗物质”。科学家们一直试图发展人工合成的荧光RNA，
曾经被全球唾弃的韩春雨，默默地发明了RNA成像系统
近日，韩春雨在预印本网站BioRxiv发表了一篇关于基因编辑的新论文：Background free tracking of single RNA in living cells using catalytically inactive CasE.该研究开发了一种新型的活细胞RNA追踪成像工具—
RNA“缓冲荧光探针”用于细胞核核仁成像和核仁应激试剂筛选
近日，我所生物技术研究部分子探针与荧光成像研究组（1818组）乔庆龙副研究员和徐兆超研究员团队发展了能够与RNA特异性可逆结合，在活细胞内对细胞核核仁稳定成像的“缓冲荧光探针”Nu-AN，实现了对核仁动态轮廓的成像，并通过活细胞内药物诱导下核仁特定形态的可视化，为核仁应激试剂的筛选提供可视化的工具。
研究实现活细胞及线虫体内DNA和RNA的同步荧光成像
近期，中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所智能微纳器件研究室研究员张忠平和王振洋领导的团队在生物体核酸结构的同步原位影像分析方面取得新进展，合成了一种具有高效生物膜穿透能力的阳离子碳量子点，实现了对活细胞及线虫体内DNA和RNA的同步荧光成像。相关研究成果发表在国际化学期刊《德国应用化学》
华东理工杨弋教授发文：这种合成方法实现活细胞RNA成像
2019年11月5日，华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室杨弋教授等在Nature Biotechnology（《自然—生物技术》）杂志上发表了封面学术论文，题为“Visualizing RNA dynamics in live cells with bright and stable fl
利用新的RNA成像技术开发的冠状病毒检测试剂盒
西蒙弗雷泽大学的研究人员将使用他们的先进成像技术--Mango（因为它明亮的颜色）--来开发冠状病毒测试工具。他们是对加拿大卫生研究院(CIHR)最近宣布的帮助解决COVID-19的快速资助机会做出反应的一小部分加拿大研究人员之一。 SFU的博士后研究员Lena Dolgosheina和分子生
微循环成像系统成像是通过什么成像
视微MicroSense成像。1、改善组织灌注，纠正细胞代谢异常，实现以微循环复苏为导向的血流动力学治疗策略，需要监测微循环指标。2、包含微循环的治疗目标会有效减少危重病人死亡率。3、总血管密度TVD，灌注血管比例PPV，灌注血管密度PVD，流动性指数MFI，异质性指数HI。
RNA提取时RNA降解原因
1 ) 新鲜细胞： 裂解液的量不足，使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织： 某些含有内源性核酸酶的样品，很难避免RNA酶的降解，建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎，并且，匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品： 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放，然后转移到-70℃冰箱存
RNA干涉(RNA－Interference，RNAi)（1）
基因沉默（gene silencing）是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面，基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物（genetically modified organisms）的障碍，另一方面，它又是植物抵抗外来核酸入侵（如病毒）的一种反应，为植物抗病毒的遗传育
RNA干扰技术(RNA－interference，RNAi)
1995年，康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫（C. elegans）中的par-1基因时，发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达，而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA（sense RNA）以期观察到基因表达的增强。但得到的结果
RNA干涉(RNA－Interference，RNAi)（2）
早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上，但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释，使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足，Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动，将目的基因之标的序列以反向重复的方式，由
诺奖团队最新论文：利用CRISPR系统，实现活细胞内单分子RNA成像
要了解单细胞中单个 RNA 分子的多种动态行为，就需要实时以高分辨率对其进行可视化。然而，目前还没有能够以通用的方式实现对未经修饰的内源性 RNA 进行单分子活细胞成像。2025年2月18日，诺贝尔化学奖得主、CRISPR 基因编辑技术先驱 Jennifer Doudna 教授团队在 Nature
我所发展RNA“缓冲荧光探针”用于细胞核核仁成像和核仁应激试剂筛选
原文地址：http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202403/t20240320_7046923.html近日，我所生物技术研究部分子探针与荧光成像研究组（1818组）乔庆龙副研究员和徐兆超研究员团队发展了能够与RNA特异性可逆结合，在活细胞内对细胞核核仁稳定成像的“缓冲
阿贝成像的成像过程
阿贝成像原理将成像过程分为两步:由阿贝的观点来看,许多成像光学仪器就是一个低通滤波器,物平面包含从低频到高频的信息,透镜口径限制了高频信息通过,只许一定的低频通过,因此,丢失了高频信息的光束再合成,图像的细节变模糊. 孔径越大,丢失的信息越少,图像越清晰.阿贝成像原理的意义在于：它以一种新的频谱语言
RNA提取心得（组织RNA提取和培养细胞的RNA提取）
一.组织RNA提取 1.最好新鲜组织，这样RNA提取的效果比较好，这是肯定的。 2. 如果不是新鲜的（最好在半年之内，-80℃或者液氮中冻存的）组织，注意不要反复冻融，从冰冻状态拿到0-4℃，注意不要拿到常温，待组织解冻后，用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织，称重后，放到预冷的匀浆器中，然后
RNA干扰相关知识RNARITS）
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing（RITS）：是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质，通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。
RNA干扰相关知识RNARISC
RNA-induced silencing complex（RISC）：一种RNA-蛋白质复合物，通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC，miRNA组装miRISC。RISCs（无论siRISC还是miRISC）包括两种类型：切割型和不切割型。